MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. CT18

Total Repeats: 101023

< Previous12...2627282930313233343536...202203Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_003198	GCC	2	6	701011	701016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759611
15002	NC_003198	GCTG	2	8	701081	701088	0 %	25 %	50 %	25 %	16759611
15003	NC_003198	ATT	2	6	701126	701131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16759611
15004	NC_003198	ATA	2	6	701146	701151	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16759611
15005	NC_003198	TAT	3	9	701277	701285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15006	NC_003198	TGA	2	6	701313	701318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16759612
15007	NC_003198	TGG	2	6	701346	701351	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16759612
15008	NC_003198	AGCG	2	8	701360	701367	25 %	0 %	50 %	25 %	16759612
15009	NC_003198	TGG	2	6	701400	701405	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16759612
15010	NC_003198	GC	3	6	701411	701416	0 %	0 %	50 %	50 %	16759612
15011	NC_003198	CG	3	6	701469	701474	0 %	0 %	50 %	50 %	16759612
15012	NC_003198	AG	3	6	701515	701520	50 %	0 %	50 %	0 %	16759612
15013	NC_003198	TCT	2	6	701535	701540	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16759612
15014	NC_003198	AG	3	6	701554	701559	50 %	0 %	50 %	0 %	16759612
15015	NC_003198	CAC	2	6	701633	701638	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16759612
15016	NC_003198	GTG	2	6	701660	701665	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16759612
15017	NC_003198	ATC	2	6	701700	701705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16759612
15018	NC_003198	TGC	2	6	701727	701732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759612
15019	NC_003198	GCG	2	6	701883	701888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15020	NC_003198	GCG	2	6	701960	701965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15021	NC_003198	TCA	3	9	701969	701977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15022	NC_003198	GCG	2	6	702045	702050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15023	NC_003198	CGT	2	6	702159	702164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15024	NC_003198	TTC	2	6	702225	702230	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15025	NC_003198	GTA	2	6	702245	702250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16759613
15026	NC_003198	ATA	2	6	702338	702343	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16759613
15027	NC_003198	CCA	2	6	702346	702351	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16759613
15028	NC_003198	CCAAC	2	10	702390	702399	40 %	0 %	0 %	60 %	16759613
15029	NC_003198	GGT	2	6	702407	702412	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16759613
15030	NC_003198	CAG	2	6	702428	702433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759613
15031	NC_003198	GCG	2	6	702460	702465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759613
15032	NC_003198	AGA	2	6	702505	702510	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16759613
15033	NC_003198	AGT	2	6	702516	702521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16759613
15034	NC_003198	TCG	2	6	702532	702537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759613
15035	NC_003198	CGG	2	6	702574	702579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759613
15036	NC_003198	CAC	2	6	702620	702625	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16759613
15037	NC_003198	CGC	2	6	702718	702723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759613
15038	NC_003198	CAG	3	9	702773	702781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759613
15039	NC_003198	CGC	2	6	702976	702981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759613
15040	NC_003198	GCA	2	6	703024	703029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759613
15041	NC_003198	TCT	2	6	703042	703047	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16759613
15042	NC_003198	CGG	2	6	703063	703068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759613
15043	NC_003198	GGCGAG	2	12	703103	703114	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	16759613
15044	NC_003198	TCA	2	6	703131	703136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16759613
15045	NC_003198	CAAT	2	8	703149	703156	50 %	25 %	0 %	25 %	16759613
15046	NC_003198	AAT	3	9	703154	703162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16759613
15047	NC_003198	GAA	2	6	703240	703245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15048	NC_003198	GC	3	6	703261	703266	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15049	NC_003198	GC	3	6	703277	703282	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15050	NC_003198	GAA	2	6	703345	703350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16759614
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15052	NC_003198	CGA	2	6	703371	703376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759614
15053	NC_003198	CAC	2	6	703441	703446	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16759614
15054	NC_003198	CAT	2	6	703447	703452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16759614
15055	NC_003198	TTCG	2	8	703462	703469	0 %	50 %	25 %	25 %	16759614
15056	NC_003198	CATA	2	8	703558	703565	50 %	25 %	0 %	25 %	16759614
15057	NC_003198	GC	3	6	703566	703571	0 %	0 %	50 %	50 %	16759614
15058	NC_003198	GCT	3	9	703587	703595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759614
15059	NC_003198	CCG	2	6	703598	703603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759614
15060	NC_003198	TTG	2	6	703622	703627	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16759614
15061	NC_003198	CAG	2	6	703654	703659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759614
15062	NC_003198	GCG	2	6	703679	703684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759614
15063	NC_003198	GAT	2	6	703732	703737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16759614
15064	NC_003198	T	7	7	703809	703815	0 %	100 %	0 %	0 %	16759614
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15067	NC_003198	T	6	6	703939	703944	0 %	100 %	0 %	0 %	16759614
15068	NC_003198	ACCAT	2	10	703981	703990	40 %	20 %	0 %	40 %	16759614
15069	NC_003198	TTC	2	6	704029	704034	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16759615
15070	NC_003198	ACG	2	6	704051	704056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759615
15071	NC_003198	GAA	2	6	704148	704153	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16759615
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15073	NC_003198	CAGCGC	2	12	704289	704300	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	16759615
15074	NC_003198	AAT	2	6	704343	704348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16759615
15075	NC_003198	TAG	2	6	704356	704361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16759615
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15078	NC_003198	TGA	2	6	704624	704629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16759615
15079	NC_003198	CAG	2	6	704640	704645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759615
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15081	NC_003198	TGCC	2	8	704833	704840	0 %	25 %	25 %	50 %	16759616
15082	NC_003198	GCC	2	6	704844	704849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759616
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15086	NC_003198	GCA	2	6	704947	704952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759616
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15088	NC_003198	GC	3	6	705036	705041	0 %	0 %	50 %	50 %	16759616
15089	NC_003198	GCG	2	6	705060	705065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759616
15090	NC_003198	CAGA	2	8	705077	705084	50 %	0 %	25 %	25 %	16759616
15091	NC_003198	GAG	2	6	705090	705095	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16759616
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15094	NC_003198	AGCC	2	8	705357	705364	25 %	0 %	25 %	50 %	16759616
15095	NC_003198	GGT	2	6	705371	705376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16759616
15096	NC_003198	A	7	7	705399	705405	100 %	0 %	0 %	0 %	16759616
15097	NC_003198	ACAT	2	8	705427	705434	50 %	25 %	0 %	25 %	16759616
15098	NC_003198	A	8	8	705443	705450	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15099	NC_003198	AGC	2	6	705455	705460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15100	NC_003198	TTG	2	6	705475	705480	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15101	NC_003198	GTCCC	2	10	705568	705577	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
15102	NC_003198	TTTAGT	2	12	705579	705590	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	16759617
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15104	NC_003198	GC	3	6	705858	705863	0 %	0 %	50 %	50 %	16759617
15105	NC_003198	CAG	2	6	705872	705877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759617
15106	NC_003198	CATC	2	8	705883	705890	25 %	25 %	0 %	50 %	16759617
15107	NC_003198	TAA	2	6	705952	705957	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16759617
15108	NC_003198	GCA	2	6	705994	705999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759617
15109	NC_003198	GTC	2	6	706011	706016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759617
15110	NC_003198	GAC	3	9	706025	706033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759617
15111	NC_003198	CGC	2	6	706069	706074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759617
15112	NC_003198	T	6	6	706076	706081	0 %	100 %	0 %	0 %	16759617
15113	NC_003198	CAG	2	6	706085	706090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759617
15114	NC_003198	CGA	3	9	706099	706107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759617
15115	NC_003198	GGC	2	6	706124	706129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759617
15116	NC_003198	GTT	2	6	706148	706153	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16759617
15117	NC_003198	T	6	6	706263	706268	0 %	100 %	0 %	0 %	16759617
15118	NC_003198	AGT	2	6	706291	706296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16759617
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15120	NC_003198	TAA	2	6	706332	706337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16759617
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15122	NC_003198	CGA	3	9	706366	706374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759617
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15491	NC_003198	GGCCT	2	10	723752	723761	0 %	20 %	40 %	40 %	16759630
15492	NC_003198	TGA	2	6	723766	723771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16759630
15493	NC_003198	GAA	2	6	723854	723859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16759630
15494	NC_003198	A	6	6	723876	723881	100 %	0 %	0 %	0 %	16759630
15495	NC_003198	CGG	2	6	723889	723894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759630
15496	NC_003198	GC	3	6	723919	723924	0 %	0 %	50 %	50 %	16759630
15497	NC_003198	CAT	2	6	723995	724000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16759630
15498	NC_003198	GTG	2	6	724015	724020	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16759630
15499	NC_003198	CGT	2	6	724112	724117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759630
15500	NC_003198	ACA	2	6	724137	724142	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16759630

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