MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. CT18

Total Repeats: 101023

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_003198	AAG	2	6	655077	655082	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16759567
14002	NC_003198	CGT	2	6	655135	655140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14003	NC_003198	GCGTTG	2	12	655157	655168	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
14004	NC_003198	ACTT	2	8	655185	655192	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14005	NC_003198	GCC	2	6	655221	655226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14006	NC_003198	CATTT	2	10	655282	655291	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
14007	NC_003198	ATG	3	9	655342	655350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14008	NC_003198	AG	3	6	655356	655361	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14009	NC_003198	GAA	3	9	655363	655371	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16759568
14010	NC_003198	CGG	2	6	655468	655473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759568
14011	NC_003198	CTG	2	6	655485	655490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759568
14012	NC_003198	AGA	2	6	655529	655534	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16759568
14013	NC_003198	CAG	2	6	655587	655592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759568
14014	NC_003198	CGG	2	6	655661	655666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759568
14015	NC_003198	AAG	2	6	655678	655683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16759568
14016	NC_003198	GCT	2	6	655691	655696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759568
14017	NC_003198	TTA	2	6	655739	655744	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16759568
14018	NC_003198	GGC	2	6	655836	655841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759568
14019	NC_003198	AACGT	2	10	655864	655873	40 %	20 %	20 %	20 %	16759568
14020	NC_003198	CGG	2	6	655885	655890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759568
14021	NC_003198	GCG	2	6	655977	655982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759568
14022	NC_003198	CCGGC	2	10	656029	656038	0 %	0 %	40 %	60 %	16759568
14023	NC_003198	GCG	4	12	656043	656054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759568
14024	NC_003198	GC	3	6	656064	656069	0 %	0 %	50 %	50 %	16759568
14025	NC_003198	CGG	2	6	656105	656110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759568
14026	NC_003198	GGCG	2	8	656177	656184	0 %	0 %	75 %	25 %	16759568
14027	NC_003198	ACG	2	6	656209	656214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759568
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14029	NC_003198	GC	3	6	656313	656318	0 %	0 %	50 %	50 %	16759568
14030	NC_003198	ATC	3	9	656322	656330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16759568
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14032	NC_003198	GTG	2	6	656640	656645	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16759568
14033	NC_003198	GCG	2	6	656671	656676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759568
14034	NC_003198	CTGG	2	8	656738	656745	0 %	25 %	50 %	25 %	16759568
14035	NC_003198	ATT	2	6	656781	656786	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16759568
14036	NC_003198	CGC	2	6	656822	656827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759568
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14038	NC_003198	ATC	2	6	656862	656867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16759568
14039	NC_003198	AAG	2	6	656938	656943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14040	NC_003198	TTC	2	6	657052	657057	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14041	NC_003198	TAA	2	6	657084	657089	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14042	NC_003198	T	6	6	657097	657102	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14043	NC_003198	TTA	2	6	657162	657167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14044	NC_003198	CAA	2	6	657220	657225	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14045	NC_003198	GA	3	6	657337	657342	50 %	0 %	50 %	0 %	16759569
14046	NC_003198	GCA	2	6	657358	657363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759569
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14051	NC_003198	AGT	2	6	657498	657503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16759569
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14053	NC_003198	AG	3	6	657758	657763	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14054	NC_003198	GGA	2	6	657800	657805	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14055	NC_003198	TATT	2	8	657806	657813	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14057	NC_003198	A	6	6	657851	657856	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14058	NC_003198	TCT	2	6	657858	657863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14059	NC_003198	T	7	7	657888	657894	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14060	NC_003198	AAAG	2	8	657898	657905	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
14061	NC_003198	T	6	6	657935	657940	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14062	NC_003198	TTAT	2	8	657970	657977	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14063	NC_003198	A	6	6	658014	658019	100 %	0 %	0 %	0 %	16759570
14064	NC_003198	T	7	7	658039	658045	0 %	100 %	0 %	0 %	16759570
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14067	NC_003198	TCG	2	6	658161	658166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759570
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14072	NC_003198	A	6	6	658440	658445	100 %	0 %	0 %	0 %	16759570
14073	NC_003198	TA	3	6	658473	658478	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14074	NC_003198	TTATT	2	10	658493	658502	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
14075	NC_003198	TGA	2	6	658507	658512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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14086	NC_003198	GC	3	6	659235	659240	0 %	0 %	50 %	50 %	16759571
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14096	NC_003198	CGG	2	6	659579	659584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759571
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14099	NC_003198	TGC	2	6	659698	659703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759571
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14104	NC_003198	CCG	2	6	659853	659858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759571
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14109	NC_003198	TGC	2	6	660001	660006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759571
14110	NC_003198	ACC	2	6	660012	660017	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16759571
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14244	NC_003198	GCGCC	2	10	666597	666606	0 %	0 %	40 %	60 %	16759578
14245	NC_003198	CAT	2	6	666646	666651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16759578
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14248	NC_003198	GCG	2	6	666711	666716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759578
14249	NC_003198	CCG	2	6	666746	666751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759578
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14500	NC_003198	TAT	2	6	677069	677074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16759588

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