MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. CT18

Total Repeats: 101023

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_003198	ATCACC	2	12	610998	611009	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	16759529
13002	NC_003198	GCG	2	6	611037	611042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759529
13003	NC_003198	GTT	2	6	611058	611063	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16759529
13004	NC_003198	GCA	2	6	611215	611220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759529
13005	NC_003198	AAC	2	6	611283	611288	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16759529
13006	NC_003198	CTG	2	6	611297	611302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759529
13007	NC_003198	CTG	2	6	611345	611350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759529
13008	NC_003198	GGC	2	6	611363	611368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759529
13009	NC_003198	GCG	3	9	611395	611403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759529
13010	NC_003198	CGT	2	6	611450	611455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759529
13011	NC_003198	CAC	2	6	611540	611545	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16759529
13012	NC_003198	GCG	2	6	611643	611648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759529
13013	NC_003198	CGC	2	6	611665	611670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759529
13014	NC_003198	ATTT	2	8	611757	611764	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13015	NC_003198	A	6	6	611866	611871	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13016	NC_003198	T	6	6	611896	611901	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13017	NC_003198	TTAT	2	8	611906	611913	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13018	NC_003198	AGA	2	6	611951	611956	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16759530
13019	NC_003198	ATT	2	6	611977	611982	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16759530
13020	NC_003198	GGC	2	6	612009	612014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759530
13021	NC_003198	GCG	2	6	612169	612174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759530
13022	NC_003198	T	6	6	612183	612188	0 %	100 %	0 %	0 %	16759530
13023	NC_003198	AAC	2	6	612372	612377	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16759530
13024	NC_003198	CTA	2	6	612406	612411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16759530
13025	NC_003198	GGC	2	6	612448	612453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759530
13026	NC_003198	AGC	2	6	612519	612524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759530
13027	NC_003198	GC	3	6	612671	612676	0 %	0 %	50 %	50 %	16759530
13028	NC_003198	CTG	2	6	612691	612696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759530
13029	NC_003198	GGCT	2	8	612723	612730	0 %	25 %	50 %	25 %	16759530
13030	NC_003198	GAAC	2	8	612759	612766	50 %	0 %	25 %	25 %	16759530
13031	NC_003198	GCG	2	6	612767	612772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759530
13032	NC_003198	ATC	2	6	612775	612780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16759530
13033	NC_003198	GAT	2	6	612784	612789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16759530
13034	NC_003198	CGG	2	6	612803	612808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759530
13035	NC_003198	GAT	2	6	612868	612873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16759530
13036	NC_003198	CGC	3	9	612959	612967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759530
13037	NC_003198	TC	3	6	612968	612973	0 %	50 %	0 %	50 %	16759530
13038	NC_003198	GAA	2	6	612988	612993	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16759530
13039	NC_003198	GCG	2	6	613007	613012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759530
13040	NC_003198	GGT	2	6	613023	613028	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16759530
13041	NC_003198	GGC	2	6	613041	613046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759530
13042	NC_003198	ATGA	2	8	613066	613073	50 %	25 %	25 %	0 %	16759530
13043	NC_003198	TGAG	2	8	613241	613248	25 %	25 %	50 %	0 %	16759530
13044	NC_003198	TCTCT	2	10	613260	613269	0 %	60 %	0 %	40 %	16759530
13045	NC_003198	ATAA	2	8	613285	613292	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13046	NC_003198	T	8	8	613314	613321	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13047	NC_003198	GAAA	2	8	613368	613375	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
13048	NC_003198	TAT	2	6	613397	613402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13049	NC_003198	ATT	2	6	613467	613472	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16759531
13050	NC_003198	TCCGCC	2	12	613492	613503	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	16759531
13051	NC_003198	AT	3	6	613524	613529	50 %	50 %	0 %	0 %	16759531
13052	NC_003198	CGT	2	6	613604	613609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759531
13053	NC_003198	ATA	2	6	613637	613642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16759531
13054	NC_003198	TA	3	6	613664	613669	50 %	50 %	0 %	0 %	16759531
13055	NC_003198	ACT	2	6	613779	613784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16759532
13056	NC_003198	T	6	6	613848	613853	0 %	100 %	0 %	0 %	16759532
13057	NC_003198	GAA	2	6	613867	613872	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16759532
13058	NC_003198	GGA	2	6	613911	613916	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16759532
13059	NC_003198	AAT	2	6	613936	613941	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16759532
13060	NC_003198	GTG	2	6	613969	613974	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16759532
13061	NC_003198	GGCG	2	8	614031	614038	0 %	0 %	75 %	25 %	16759532
13062	NC_003198	CAC	2	6	614085	614090	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16759532
13063	NC_003198	GGC	2	6	614156	614161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759532
13064	NC_003198	TGA	2	6	614198	614203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16759532
13065	NC_003198	CGTT	2	8	614221	614228	0 %	50 %	25 %	25 %	16759532
13066	NC_003198	CT	3	6	614259	614264	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13067	NC_003198	TCG	2	6	614277	614282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13068	NC_003198	TGA	2	6	614312	614317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13069	NC_003198	ATG	2	6	614318	614323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13070	NC_003198	GCC	2	6	614448	614453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759533
13071	NC_003198	TGCG	2	8	614504	614511	0 %	25 %	50 %	25 %	16759533
13072	NC_003198	CAT	2	6	614566	614571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16759533
13073	NC_003198	CG	3	6	614605	614610	0 %	0 %	50 %	50 %	16759533
13074	NC_003198	GCC	2	6	614615	614620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759533
13075	NC_003198	CAT	2	6	614656	614661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16759533
13076	NC_003198	TTTC	2	8	614673	614680	0 %	75 %	0 %	25 %	16759533
13077	NC_003198	GGC	2	6	614712	614717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759533
13078	NC_003198	CTG	3	9	614800	614808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759534
13079	NC_003198	GTC	2	6	614866	614871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759534
13080	NC_003198	CTG	3	9	614935	614943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759534
13081	NC_003198	CG	3	6	614970	614975	0 %	0 %	50 %	50 %	16759534
13082	NC_003198	GGC	2	6	614977	614982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759534
13083	NC_003198	CTG	2	6	614998	615003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759534
13084	NC_003198	AAAT	2	8	615036	615043	75 %	25 %	0 %	0 %	16759534
13085	NC_003198	GCAG	2	8	615045	615052	25 %	0 %	50 %	25 %	16759534
13086	NC_003198	TCA	2	6	615144	615149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16759534
13087	NC_003198	GAT	2	6	615165	615170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16759534
13088	NC_003198	TCG	2	6	615185	615190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759534
13089	NC_003198	GGC	2	6	615268	615273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759534
13090	NC_003198	GGC	2	6	615322	615327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759534
13091	NC_003198	CGA	2	6	615353	615358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759534
13092	NC_003198	GCT	2	6	615423	615428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759534
13093	NC_003198	TGA	2	6	615486	615491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16759534
13094	NC_003198	A	6	6	615574	615579	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13095	NC_003198	CTTTT	2	10	615682	615691	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
13096	NC_003198	T	7	7	615708	615714	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13097	NC_003198	TAACGT	2	12	615721	615732	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
13098	NC_003198	GAA	2	6	615877	615882	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16759535
13099	NC_003198	GCG	2	6	615939	615944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759535
13100	NC_003198	TTG	2	6	616007	616012	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16759535
13101	NC_003198	CGG	2	6	616200	616205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759535
13102	NC_003198	GCG	2	6	616253	616258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759535
13103	NC_003198	T	6	6	616262	616267	0 %	100 %	0 %	0 %	16759535
13104	NC_003198	GCT	2	6	616381	616386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759535
13105	NC_003198	CGG	2	6	616399	616404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759535
13106	NC_003198	TTC	2	6	616445	616450	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16759535
13107	NC_003198	GCG	2	6	616532	616537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759535
13108	NC_003198	GC	3	6	616541	616546	0 %	0 %	50 %	50 %	16759535
13109	NC_003198	A	6	6	616554	616559	100 %	0 %	0 %	0 %	16759535
13110	NC_003198	GGT	2	6	616582	616587	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16759535
13111	NC_003198	TGG	2	6	616620	616625	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16759535
13112	NC_003198	AGC	2	6	616667	616672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759535
13113	NC_003198	TGA	2	6	616680	616685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16759535
13114	NC_003198	TGG	2	6	616710	616715	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16759535
13115	NC_003198	GTCGC	2	10	616742	616751	0 %	20 %	40 %	40 %	16759535
13116	NC_003198	GCG	2	6	616767	616772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759535
13117	NC_003198	TGG	2	6	616899	616904	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16759535
13118	NC_003198	CG	3	6	617015	617020	0 %	0 %	50 %	50 %	16759535
13119	NC_003198	CGT	2	6	617027	617032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759535
13120	NC_003198	CCG	2	6	617070	617075	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759535
13121	NC_003198	TGC	2	6	617157	617162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759535
13122	NC_003198	T	6	6	617223	617228	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13123	NC_003198	GC	3	6	617286	617291	0 %	0 %	50 %	50 %	16759536
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13248	NC_003198	GTCGC	2	10	622894	622903	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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13351	NC_003198	TA	3	6	628087	628092	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13352	NC_003198	ATA	2	6	628101	628106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13491	NC_003198	TTA	2	6	634034	634039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13492	NC_003198	GCT	2	6	634059	634064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13493	NC_003198	GAA	2	6	634066	634071	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13494	NC_003198	TTC	2	6	634080	634085	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13495	NC_003198	GC	3	6	634112	634117	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13496	NC_003198	A	6	6	634163	634168	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13497	NC_003198	CGT	2	6	634208	634213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13498	NC_003198	CGT	2	6	634220	634225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13499	NC_003198	GAA	2	6	634255	634260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13500	NC_003198	TGGC	2	8	634274	634281	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding

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