MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. CT18

Total Repeats: 101023

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12002	NC_003198	ACA	2	6	562869	562874	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12003	NC_003198	TTA	2	6	562893	562898	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12004	NC_003198	CTAT	2	8	562925	562932	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12005	NC_003198	GGC	2	6	562969	562974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759487
12006	NC_003198	ATCG	2	8	562975	562982	25 %	25 %	25 %	25 %	16759487
12007	NC_003198	CGC	2	6	563185	563190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759487
12008	NC_003198	ATT	2	6	563193	563198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16759487
12009	NC_003198	TGA	2	6	563206	563211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16759487
12010	NC_003198	AACAG	2	10	563364	563373	60 %	0 %	20 %	20 %	16759487
12011	NC_003198	TTA	2	6	563377	563382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16759487
12012	NC_003198	TGG	2	6	563388	563393	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16759487
12013	NC_003198	CGA	2	6	563548	563553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759487
12014	NC_003198	GGC	2	6	563591	563596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759487
12015	NC_003198	CGA	2	6	563626	563631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759487
12016	NC_003198	CGGCAA	2	12	563677	563688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759487
12017	NC_003198	GGC	2	6	563759	563764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759487
12018	NC_003198	GAC	2	6	563785	563790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759487
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12020	NC_003198	AC	3	6	564152	564157	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12021	NC_003198	GCCT	2	8	564166	564173	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
12022	NC_003198	AC	3	6	564187	564192	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12023	NC_003198	CAT	2	6	564200	564205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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12025	NC_003198	CAG	2	6	564222	564227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12029	NC_003198	A	6	6	564714	564719	100 %	0 %	0 %	0 %	16759488
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12118	NC_003198	TTA	2	6	569548	569553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12119	NC_003198	CTT	2	6	569719	569724	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12120	NC_003198	GAC	2	6	569800	569805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759493
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12124	NC_003198	TGG	2	6	570018	570023	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16759493
12125	NC_003198	TGC	2	6	570115	570120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759493
12126	NC_003198	GC	3	6	570211	570216	0 %	0 %	50 %	50 %	16759493
12127	NC_003198	GTC	2	6	570226	570231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759493
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12138	NC_003198	T	6	6	570633	570638	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12231	NC_003198	ATTT	2	8	575585	575592	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12232	NC_003198	AAC	2	6	575614	575619	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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12237	NC_003198	T	7	7	575800	575806	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12243	NC_003198	GC	3	6	575955	575960	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12244	NC_003198	ATT	2	6	575971	575976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12245	NC_003198	GCT	2	6	576097	576102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12246	NC_003198	T	6	6	576138	576143	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12247	NC_003198	GGT	2	6	576173	576178	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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12374	NC_003198	CGA	2	6	582474	582479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759502
12375	NC_003198	CGA	2	6	582547	582552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759502
12376	NC_003198	GAC	2	6	582560	582565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759502
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12378	NC_003198	AGCG	2	8	582647	582654	25 %	0 %	50 %	25 %	16759502
12379	NC_003198	GCG	2	6	582657	582662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759502
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12382	NC_003198	CTT	2	6	582799	582804	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16759502
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12497	NC_003198	AG	3	6	587500	587505	50 %	0 %	50 %	0 %	16759505
12498	NC_003198	ATCC	2	8	587521	587528	25 %	25 %	0 %	50 %	16759506
12499	NC_003198	CGG	2	6	587549	587554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759506
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