MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. CT18

Total Repeats: 101023

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_003198	T	7	7	539711	539717	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11502	NC_003198	GGC	2	6	539799	539804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11503	NC_003198	GCA	2	6	539870	539875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11504	NC_003198	TTC	2	6	539881	539886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11505	NC_003198	CAA	2	6	539912	539917	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11506	NC_003198	GGC	2	6	539933	539938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11507	NC_003198	CTG	2	6	539964	539969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759468
11508	NC_003198	GTG	2	6	540048	540053	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16759468
11509	NC_003198	CTC	2	6	540058	540063	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16759468
11510	NC_003198	CTG	2	6	540066	540071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759468
11511	NC_003198	TGG	2	6	540072	540077	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16759468
11512	NC_003198	GCT	2	6	540080	540085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759468
11513	NC_003198	CGC	2	6	540112	540117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759468
11514	NC_003198	ATCT	2	8	540137	540144	25 %	50 %	0 %	25 %	16759468
11515	NC_003198	GGAT	2	8	540145	540152	25 %	25 %	50 %	0 %	16759468
11516	NC_003198	CGC	2	6	540160	540165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759468
11517	NC_003198	TA	3	6	540172	540177	50 %	50 %	0 %	0 %	16759468
11518	NC_003198	CG	3	6	540203	540208	0 %	0 %	50 %	50 %	16759468
11519	NC_003198	TCG	2	6	540304	540309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759468
11520	NC_003198	TGC	2	6	540310	540315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759468
11521	NC_003198	CGT	2	6	540390	540395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759468
11522	NC_003198	GC	3	6	540463	540468	0 %	0 %	50 %	50 %	16759468
11523	NC_003198	GCC	2	6	540611	540616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759468
11524	NC_003198	ATG	2	6	540627	540632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16759468
11525	NC_003198	GCGG	2	8	540810	540817	0 %	0 %	75 %	25 %	16759468
11526	NC_003198	A	6	6	540819	540824	100 %	0 %	0 %	0 %	16759468
11527	NC_003198	TGATA	2	10	540866	540875	40 %	40 %	20 %	0 %	16759468
11528	NC_003198	AAG	2	6	540927	540932	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16759469
11529	NC_003198	TCG	2	6	540954	540959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759469
11530	NC_003198	TCA	2	6	540967	540972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16759469
11531	NC_003198	GCT	2	6	541030	541035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759469
11532	NC_003198	GCA	2	6	541057	541062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759469
11533	NC_003198	TCA	2	6	541071	541076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16759469
11534	NC_003198	GGC	2	6	541113	541118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759469
11535	NC_003198	CG	3	6	541123	541128	0 %	0 %	50 %	50 %	16759469
11536	NC_003198	TTA	2	6	541137	541142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16759469
11537	NC_003198	CGC	2	6	541237	541242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759469
11538	NC_003198	CGG	2	6	541251	541256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759469
11539	NC_003198	GC	3	6	541345	541350	0 %	0 %	50 %	50 %	16759469
11540	NC_003198	TCC	2	6	541398	541403	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16759469
11541	NC_003198	GA	3	6	541432	541437	50 %	0 %	50 %	0 %	16759469
11542	NC_003198	TTC	2	6	541460	541465	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16759469
11543	NC_003198	GCG	2	6	541489	541494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759469
11544	NC_003198	AAT	2	6	541501	541506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16759469
11545	NC_003198	CAG	2	6	541541	541546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759469
11546	NC_003198	CCG	3	9	541590	541598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759469
11547	NC_003198	GCG	2	6	541633	541638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759469
11548	NC_003198	GTT	2	6	541650	541655	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16759469
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11550	NC_003198	AAG	2	6	541733	541738	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16759469
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11552	NC_003198	G	6	6	541781	541786	0 %	0 %	100 %	0 %	16759469
11553	NC_003198	ACG	2	6	541809	541814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759469
11554	NC_003198	ATTTT	2	10	541851	541860	20 %	80 %	0 %	0 %	16759469
11555	NC_003198	A	6	6	541901	541906	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11556	NC_003198	TCG	2	6	541929	541934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11557	NC_003198	CGTC	2	8	541954	541961	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11558	NC_003198	GC	3	6	541962	541967	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11559	NC_003198	GTT	2	6	542082	542087	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16759470
11560	NC_003198	CAA	2	6	542089	542094	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16759470
11561	NC_003198	CCT	2	6	542120	542125	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16759470
11562	NC_003198	GTC	2	6	542128	542133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759470
11563	NC_003198	TGG	2	6	542150	542155	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16759470
11564	NC_003198	TTA	2	6	542183	542188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16759470
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11566	NC_003198	GGC	2	6	542296	542301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759470
11567	NC_003198	GCA	2	6	542372	542377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759470
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11571	NC_003198	AAG	3	9	542786	542794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16759470
11572	NC_003198	GCT	2	6	542823	542828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759470
11573	NC_003198	GGC	2	6	542829	542834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759470
11574	NC_003198	CCG	2	6	542873	542878	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759470
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11576	NC_003198	CTG	2	6	542944	542949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759470
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11578	NC_003198	A	6	6	543065	543070	100 %	0 %	0 %	0 %	16759470
11579	NC_003198	GC	3	6	543098	543103	0 %	0 %	50 %	50 %	16759470
11580	NC_003198	GGC	2	6	543105	543110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759470
11581	NC_003198	GCT	2	6	543111	543116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759470
11582	NC_003198	TCG	2	6	543196	543201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759470
11583	NC_003198	GT	3	6	543211	543216	0 %	50 %	50 %	0 %	16759470
11584	NC_003198	GC	3	6	543349	543354	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11585	NC_003198	CGA	2	6	543384	543389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759471
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11588	NC_003198	AT	3	6	543482	543487	50 %	50 %	0 %	0 %	16759471
11589	NC_003198	TCA	3	9	543494	543502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16759471
11590	NC_003198	GC	3	6	543507	543512	0 %	0 %	50 %	50 %	16759471
11591	NC_003198	T	6	6	543537	543542	0 %	100 %	0 %	0 %	16759471
11592	NC_003198	CAGC	2	8	543598	543605	25 %	0 %	25 %	50 %	16759471
11593	NC_003198	TTC	2	6	543637	543642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16759471
11594	NC_003198	GCG	2	6	543647	543652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759471
11595	NC_003198	ACC	2	6	543719	543724	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16759471
11596	NC_003198	CGC	2	6	543736	543741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759471
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11598	NC_003198	CAG	2	6	543787	543792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759471
11599	NC_003198	CTTCT	2	10	543823	543832	0 %	60 %	0 %	40 %	16759471
11600	NC_003198	CAG	2	6	543892	543897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759471
11601	NC_003198	GCA	2	6	543969	543974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759471
11602	NC_003198	GGC	2	6	544036	544041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759471
11603	NC_003198	CGAT	2	8	544098	544105	25 %	25 %	25 %	25 %	16759471
11604	NC_003198	AAC	2	6	544175	544180	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16759471
11605	NC_003198	A	6	6	544195	544200	100 %	0 %	0 %	0 %	16759471
11606	NC_003198	GCC	2	6	544241	544246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759471
11607	NC_003198	GAA	2	6	544285	544290	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16759471
11608	NC_003198	CGCCAG	2	12	544348	544359	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	16759471
11609	NC_003198	CG	3	6	544380	544385	0 %	0 %	50 %	50 %	16759471
11610	NC_003198	GGC	2	6	544393	544398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759471
11611	NC_003198	GGC	2	6	544425	544430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759471
11612	NC_003198	CAT	2	6	544441	544446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16759471
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11618	NC_003198	CTC	2	6	544639	544644	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16759471
11619	NC_003198	GC	4	8	544647	544654	0 %	0 %	50 %	50 %	16759471
11620	NC_003198	GAC	2	6	544660	544665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759471
11621	NC_003198	AGAC	2	8	544678	544685	50 %	0 %	25 %	25 %	16759471
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11993	NC_003198	GCT	3	9	562679	562687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759486
11994	NC_003198	GCG	2	6	562696	562701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759486
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11998	NC_003198	AAT	2	6	562772	562777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12000	NC_003198	TAG	2	6	562843	562848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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