MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. CT18

Total Repeats: 101023

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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100002	NC_003198	GCT	2	6	4757185	4757190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16763339
100003	NC_003198	CGC	2	6	4757214	4757219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16763339
100004	NC_003198	CTG	2	6	4757281	4757286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16763339
100005	NC_003198	CGC	2	6	4757295	4757300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16763339
100006	NC_003198	TTG	2	6	4757318	4757323	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16763339
100007	NC_003198	GAC	2	6	4757383	4757388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16763339
100008	NC_003198	TTG	2	6	4757426	4757431	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16763339
100009	NC_003198	CGT	2	6	4757493	4757498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16763339
100010	NC_003198	GTG	2	6	4757545	4757550	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16763339
100011	NC_003198	TTC	2	6	4757612	4757617	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16763339
100012	NC_003198	TCA	2	6	4757624	4757629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16763339
100013	NC_003198	TCG	2	6	4757639	4757644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16763339
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100015	NC_003198	GAT	2	6	4757712	4757717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16763339
100016	NC_003198	GAA	2	6	4757836	4757841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16763339
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100018	NC_003198	GC	3	6	4757982	4757987	0 %	0 %	50 %	50 %	16763339
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100020	NC_003198	CAG	2	6	4758205	4758210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16763339
100021	NC_003198	CAG	2	6	4758217	4758222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16763339
100022	NC_003198	ATG	2	6	4758235	4758240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16763339
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100024	NC_003198	GTA	2	6	4758261	4758266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16763339
100025	NC_003198	GC	3	6	4758276	4758281	0 %	0 %	50 %	50 %	16763339
100026	NC_003198	AT	3	6	4758326	4758331	50 %	50 %	0 %	0 %	16763339
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100032	NC_003198	AG	3	6	4758538	4758543	50 %	0 %	50 %	0 %	16763339
100033	NC_003198	A	6	6	4758594	4758599	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
100034	NC_003198	TGC	2	6	4758629	4758634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100035	NC_003198	TAA	2	6	4758640	4758645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100036	NC_003198	T	6	6	4758688	4758693	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
100037	NC_003198	TAA	2	6	4758722	4758727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100038	NC_003198	TGC	2	6	4758860	4758865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16763340
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100042	NC_003198	TCCTGC	2	12	4758992	4759003	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	16763340
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100044	NC_003198	CGG	2	6	4759104	4759109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16763340
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100050	NC_003198	CGC	2	6	4759264	4759269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16763340
100051	NC_003198	GCA	2	6	4759270	4759275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16763340
100052	NC_003198	CGT	2	6	4759328	4759333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100053	NC_003198	ACG	2	6	4759522	4759527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16763341
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100055	NC_003198	TCG	2	6	4759586	4759591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16763341
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100058	NC_003198	GCA	3	9	4759719	4759727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16763341
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100100	NC_003198	CAG	2	6	4761673	4761678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16763344
100101	NC_003198	GAC	2	6	4761718	4761723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16763344
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100111	NC_003198	ATG	2	6	4762046	4762051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16763344
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100114	NC_003198	ACGCA	2	10	4762099	4762108	40 %	0 %	20 %	40 %	16763344
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100116	NC_003198	ATG	2	6	4762227	4762232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100117	NC_003198	AGC	2	6	4762283	4762288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100118	NC_003198	ATGG	2	8	4762342	4762349	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
100119	NC_003198	TTG	2	6	4762359	4762364	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100120	NC_003198	ATGA	2	8	4762390	4762397	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
100121	NC_003198	ATG	2	6	4762428	4762433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100122	NC_003198	TTAAT	2	10	4762468	4762477	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
100123	NC_003198	CAAT	2	8	4762550	4762557	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
100124	NC_003198	TAAT	2	8	4762585	4762592	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100125	NC_003198	TTA	2	6	4762636	4762641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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100127	NC_003198	GGA	2	6	4762673	4762678	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
100128	NC_003198	TGC	2	6	4762683	4762688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16763345
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100143	NC_003198	ACCT	2	8	4763337	4763344	25 %	25 %	0 %	50 %	16763345
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100231	NC_003198	GCG	2	6	4768094	4768099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16763351
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100233	NC_003198	CAG	3	9	4768165	4768173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16763351
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100469	NC_003198	GAT	2	6	4779227	4779232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16763363
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100476	NC_003198	GAC	2	6	4779771	4779776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16763363
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100480	NC_003198	CGT	2	6	4780005	4780010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16763363
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100485	NC_003198	ATT	2	6	4780240	4780245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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100495	NC_003198	TGC	2	6	4780996	4781001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16763364
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100499	NC_003198	CCG	2	6	4781249	4781254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16763364
100500	NC_003198	TGG	2	6	4781275	4781280	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16763364

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