MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. CT18

Total Repeats: 101023

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
95501	NC_003198	CAA	2	6	4541631	4541636	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95502	NC_003198	GCC	2	6	4541668	4541673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16763142
95503	NC_003198	ACC	2	6	4541728	4541733	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16763142
95504	NC_003198	CAT	2	6	4541738	4541743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16763142
95505	NC_003198	CGC	2	6	4541783	4541788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16763142
95506	NC_003198	TTG	2	6	4541940	4541945	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16763142
95507	NC_003198	TGAG	2	8	4541975	4541982	25 %	25 %	50 %	0 %	16763142
95508	NC_003198	CAG	2	6	4542032	4542037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16763142
95509	NC_003198	TTC	2	6	4542111	4542116	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16763142
95510	NC_003198	CAG	2	6	4542275	4542280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16763142
95511	NC_003198	ACG	2	6	4542336	4542341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16763142
95512	NC_003198	CTG	2	6	4542380	4542385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16763142
95513	NC_003198	CCCG	2	8	4542424	4542431	0 %	0 %	25 %	75 %	16763142
95514	NC_003198	TCG	2	6	4542453	4542458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16763142
95515	NC_003198	CAGG	2	8	4542542	4542549	25 %	0 %	50 %	25 %	16763142
95516	NC_003198	TCT	2	6	4542570	4542575	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16763142
95517	NC_003198	CGG	2	6	4542643	4542648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16763142
95518	NC_003198	CAG	2	6	4542692	4542697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16763142
95519	NC_003198	CGC	2	6	4542704	4542709	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16763142
95520	NC_003198	TGG	2	6	4542820	4542825	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16763142
95521	NC_003198	CGCGG	2	10	4542884	4542893	0 %	0 %	60 %	40 %	16763142
95522	NC_003198	GTCA	2	8	4542902	4542909	25 %	25 %	25 %	25 %	16763142
95523	NC_003198	TGAA	2	8	4542937	4542944	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
95524	NC_003198	TACA	2	8	4543029	4543036	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
95525	NC_003198	A	6	6	4543060	4543065	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
95526	NC_003198	GGT	2	6	4543071	4543076	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
95527	NC_003198	GTC	2	6	4543180	4543185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95528	NC_003198	A	6	6	4543200	4543205	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
95529	NC_003198	GC	3	6	4543215	4543220	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
95530	NC_003198	CTGC	2	8	4543224	4543231	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
95531	NC_003198	CG	3	6	4543468	4543473	0 %	0 %	50 %	50 %	16763143
95532	NC_003198	TTG	2	6	4543477	4543482	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16763143
95533	NC_003198	TGGGT	2	10	4543505	4543514	0 %	40 %	60 %	0 %	16763143
95534	NC_003198	GGC	2	6	4543531	4543536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16763143
95535	NC_003198	TTA	2	6	4543562	4543567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16763143
95536	NC_003198	GC	3	6	4543584	4543589	0 %	0 %	50 %	50 %	16763143
95537	NC_003198	CAG	2	6	4543614	4543619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16763143
95538	NC_003198	TCA	2	6	4543628	4543633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16763143
95539	NC_003198	AGA	2	6	4543634	4543639	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16763143
95540	NC_003198	CTG	2	6	4543663	4543668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16763143
95541	NC_003198	CTT	2	6	4543701	4543706	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16763143
95542	NC_003198	CCA	2	6	4543758	4543763	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16763143
95543	NC_003198	GTA	2	6	4543772	4543777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16763143
95544	NC_003198	TCC	2	6	4543847	4543852	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
95545	NC_003198	GC	3	6	4543899	4543904	0 %	0 %	50 %	50 %	16763144
95546	NC_003198	GGC	2	6	4543912	4543917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16763144
95547	NC_003198	TGG	2	6	4543980	4543985	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16763144
95548	NC_003198	CTG	2	6	4544080	4544085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16763144
95549	NC_003198	GCC	2	6	4544303	4544308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16763144
95550	NC_003198	AAAG	2	8	4544377	4544384	75 %	0 %	25 %	0 %	16763144
95551	NC_003198	CAG	2	6	4544392	4544397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16763144
95552	NC_003198	AAT	2	6	4544428	4544433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16763144
95553	NC_003198	CCG	2	6	4544591	4544596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16763144
95554	NC_003198	CCG	2	6	4544705	4544710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16763144
95555	NC_003198	GCC	2	6	4544716	4544721	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16763144
95556	NC_003198	GAG	2	6	4544762	4544767	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16763144
95557	NC_003198	TGC	2	6	4544849	4544854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16763144
95558	NC_003198	GCC	2	6	4544858	4544863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16763144
95559	NC_003198	CGC	2	6	4544878	4544883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16763144
95560	NC_003198	CGA	2	6	4544886	4544891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16763144
95561	NC_003198	CAG	3	9	4544944	4544952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16763144
95562	NC_003198	GC	3	6	4544954	4544959	0 %	0 %	50 %	50 %	16763144
95563	NC_003198	C	6	6	4544981	4544986	0 %	0 %	0 %	100 %	16763144
95564	NC_003198	GCG	2	6	4545089	4545094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16763144
95565	NC_003198	CAG	2	6	4545123	4545128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16763144
95566	NC_003198	GGCGT	2	10	4545134	4545143	0 %	20 %	60 %	20 %	16763144
95567	NC_003198	CGG	2	6	4545187	4545192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16763144
95568	NC_003198	GCC	3	9	4545248	4545256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16763144
95569	NC_003198	GCG	2	6	4545353	4545358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16763144
95570	NC_003198	TCG	2	6	4545369	4545374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16763144
95571	NC_003198	GTA	2	6	4545403	4545408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16763144
95572	NC_003198	AAAC	2	8	4545465	4545472	75 %	0 %	0 %	25 %	16763144
95573	NC_003198	GCGA	2	8	4545495	4545502	25 %	0 %	50 %	25 %	16763144
95574	NC_003198	AAT	2	6	4545515	4545520	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16763144
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95579	NC_003198	AGT	2	6	4545740	4545745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16763145
95580	NC_003198	GAG	2	6	4545765	4545770	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16763145
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95587	NC_003198	GGT	2	6	4546100	4546105	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16763146
95588	NC_003198	CATC	2	8	4546142	4546149	25 %	25 %	0 %	50 %	16763146
95589	NC_003198	CCG	2	6	4546154	4546159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16763146
95590	NC_003198	CGG	2	6	4546202	4546207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16763146
95591	NC_003198	GAAG	2	8	4546209	4546216	50 %	0 %	50 %	0 %	16763146
95592	NC_003198	GA	3	6	4546232	4546237	50 %	0 %	50 %	0 %	16763146
95593	NC_003198	CAGCGC	2	12	4546242	4546253	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	16763146
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95598	NC_003198	GCCAC	2	10	4546409	4546418	20 %	0 %	20 %	60 %	16763146
95599	NC_003198	AATACA	2	12	4546425	4546436	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	16763146
95600	NC_003198	TGG	2	6	4546502	4546507	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16763146
95601	NC_003198	ATG	2	6	4546528	4546533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16763146
95602	NC_003198	TGG	2	6	4546547	4546552	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16763146
95603	NC_003198	TCA	2	6	4546556	4546561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16763146
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95606	NC_003198	T	6	6	4546651	4546656	0 %	100 %	0 %	0 %	16763146
95607	NC_003198	CAC	2	6	4546685	4546690	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16763146
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95609	NC_003198	GTC	2	6	4546734	4546739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16763146
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95612	NC_003198	CAG	2	6	4546821	4546826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16763146
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95614	NC_003198	CGG	2	6	4546925	4546930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16763146
95615	NC_003198	GCA	2	6	4547084	4547089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16763146
95616	NC_003198	TCTG	2	8	4547095	4547102	0 %	50 %	25 %	25 %	16763146
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