MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. CT18

Total Repeats: 101023

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
95001	NC_003198	CTG	2	6	4517107	4517112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16763118
95002	NC_003198	AGA	2	6	4517134	4517139	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16763118
95003	NC_003198	TA	3	6	4517169	4517174	50 %	50 %	0 %	0 %	16763118
95004	NC_003198	CA	3	6	4517227	4517232	50 %	0 %	0 %	50 %	16763118
95005	NC_003198	GTT	2	6	4517236	4517241	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16763118
95006	NC_003198	AG	3	6	4517283	4517288	50 %	0 %	50 %	0 %	16763118
95007	NC_003198	ACC	2	6	4517321	4517326	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16763118
95008	NC_003198	CAAT	2	8	4517370	4517377	50 %	25 %	0 %	25 %	16763118
95009	NC_003198	ATC	2	6	4517390	4517395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16763118
95010	NC_003198	GA	3	6	4517420	4517425	50 %	0 %	50 %	0 %	16763118
95011	NC_003198	AC	3	6	4517479	4517484	50 %	0 %	0 %	50 %	16763118
95012	NC_003198	CGG	2	6	4517485	4517490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16763118
95013	NC_003198	TTC	2	6	4517587	4517592	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16763118
95014	NC_003198	CTT	2	6	4517598	4517603	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16763118
95015	NC_003198	AAT	2	6	4517644	4517649	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16763118
95016	NC_003198	TTC	2	6	4517662	4517667	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16763118
95017	NC_003198	GCC	2	6	4517677	4517682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16763118
95018	NC_003198	AGCC	2	8	4517722	4517729	25 %	0 %	25 %	50 %	16763118
95019	NC_003198	CAC	2	6	4517748	4517753	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16763118
95020	NC_003198	GAC	2	6	4517784	4517789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16763118
95021	NC_003198	AAT	2	6	4517857	4517862	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16763118
95022	NC_003198	TTAT	2	8	4517924	4517931	25 %	75 %	0 %	0 %	16763118
95023	NC_003198	AAT	2	6	4517940	4517945	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16763118
95024	NC_003198	T	6	6	4517953	4517958	0 %	100 %	0 %	0 %	16763118
95025	NC_003198	TAT	2	6	4518015	4518020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16763118
95026	NC_003198	ACG	2	6	4518025	4518030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16763118
95027	NC_003198	TCA	2	6	4518050	4518055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16763118
95028	NC_003198	CAT	2	6	4518111	4518116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16763118
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95030	NC_003198	T	7	7	4518130	4518136	0 %	100 %	0 %	0 %	16763118
95031	NC_003198	CTT	2	6	4518205	4518210	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16763118
95032	NC_003198	TTC	2	6	4518256	4518261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16763118
95033	NC_003198	TGC	2	6	4518389	4518394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16763119
95034	NC_003198	GCCA	2	8	4518483	4518490	25 %	0 %	25 %	50 %	16763119
95035	NC_003198	CAC	2	6	4518505	4518510	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16763119
95036	NC_003198	CAG	2	6	4518523	4518528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16763119
95037	NC_003198	CAA	2	6	4518579	4518584	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16763119
95038	NC_003198	CAGC	2	8	4518616	4518623	25 %	0 %	25 %	50 %	16763119
95039	NC_003198	T	6	6	4518730	4518735	0 %	100 %	0 %	0 %	16763119
95040	NC_003198	GCGG	2	8	4518774	4518781	0 %	0 %	75 %	25 %	16763119
95041	NC_003198	CGG	2	6	4518911	4518916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16763120
95042	NC_003198	CAC	2	6	4518933	4518938	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16763120
95043	NC_003198	AGG	2	6	4518956	4518961	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16763120
95044	NC_003198	CAT	2	6	4519006	4519011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95045	NC_003198	GCA	2	6	4519031	4519036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95046	NC_003198	T	7	7	4519069	4519075	0 %	100 %	0 %	0 %	16763121
95047	NC_003198	TGCAT	2	10	4519183	4519192	20 %	40 %	20 %	20 %	16763121
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95049	NC_003198	T	6	6	4519245	4519250	0 %	100 %	0 %	0 %	16763121
95050	NC_003198	AAT	2	6	4519312	4519317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16763121
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95053	NC_003198	AATCA	2	10	4519533	4519542	60 %	20 %	0 %	20 %	16763121
95054	NC_003198	TGT	2	6	4519556	4519561	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16763121
95055	NC_003198	TGC	2	6	4519574	4519579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16763121
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95058	NC_003198	ATC	2	6	4519899	4519904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16763121
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95060	NC_003198	TGA	2	6	4519987	4519992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16763121
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95063	NC_003198	GCAT	2	8	4520104	4520111	25 %	25 %	25 %	25 %	16763121
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95071	NC_003198	CAT	2	6	4520397	4520402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16763121
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95087	NC_003198	TAA	2	6	4521060	4521065	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16763121
95088	NC_003198	CAG	2	6	4521120	4521125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16763121
95089	NC_003198	A	6	6	4521186	4521191	100 %	0 %	0 %	0 %	16763121
95090	NC_003198	ATTT	2	8	4521216	4521223	25 %	75 %	0 %	0 %	16763121
95091	NC_003198	TCT	3	9	4521248	4521256	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16763121
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95093	NC_003198	CTG	2	6	4521387	4521392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16763121
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95097	NC_003198	AGT	2	6	4521564	4521569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16763122
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95099	NC_003198	GAAA	2	8	4521660	4521667	75 %	0 %	25 %	0 %	16763122
95100	NC_003198	CGTCAC	2	12	4521706	4521717	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	16763122
95101	NC_003198	GTTC	2	8	4521751	4521758	0 %	50 %	25 %	25 %	16763122
95102	NC_003198	ATA	2	6	4521788	4521793	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16763122
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95105	NC_003198	TA	3	6	4521902	4521907	50 %	50 %	0 %	0 %	16763122
95106	NC_003198	TTG	2	6	4521922	4521927	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16763122
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95110	NC_003198	TC	3	6	4522227	4522232	0 %	50 %	0 %	50 %	16763122
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95113	NC_003198	TGG	2	6	4522326	4522331	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16763122
95114	NC_003198	CAGT	2	8	4522365	4522372	25 %	25 %	25 %	25 %	16763122
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95116	NC_003198	CTC	2	6	4522418	4522423	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16763122
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95118	NC_003198	CGT	2	6	4522441	4522446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16763122
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