MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. CT18

Total Repeats: 101023

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8501	NC_003198	CGG	2	6	399801	399806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8502	NC_003198	G	6	6	399833	399838	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
8503	NC_003198	GCC	2	6	399902	399907	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8504	NC_003198	AGCG	2	8	399912	399919	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8505	NC_003198	CCCGT	2	10	399946	399955	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
8506	NC_003198	T	7	7	400051	400057	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8507	NC_003198	TAC	2	6	400138	400143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16759337
8508	NC_003198	GAC	2	6	400162	400167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759337
8509	NC_003198	CAGC	2	8	400203	400210	25 %	0 %	25 %	50 %	16759337
8510	NC_003198	A	8	8	400214	400221	100 %	0 %	0 %	0 %	16759337
8511	NC_003198	CGTTT	2	10	400273	400282	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
8512	NC_003198	TA	3	6	400323	400328	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8513	NC_003198	GGGA	2	8	400332	400339	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
8514	NC_003198	ATT	2	6	400402	400407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16759338
8515	NC_003198	TGG	2	6	400442	400447	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16759338
8516	NC_003198	GCTC	2	8	400490	400497	0 %	25 %	25 %	50 %	16759338
8517	NC_003198	GAAC	2	8	400577	400584	50 %	0 %	25 %	25 %	16759338
8518	NC_003198	TTA	2	6	400627	400632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16759338
8519	NC_003198	TTC	2	6	400654	400659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16759338
8520	NC_003198	CGGGC	2	10	400707	400716	0 %	0 %	60 %	40 %	16759338
8521	NC_003198	TGG	2	6	400739	400744	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16759338
8522	NC_003198	CGT	2	6	400871	400876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759338
8523	NC_003198	GCG	2	6	400906	400911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759338
8524	NC_003198	CCG	2	6	400986	400991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759338
8525	NC_003198	ATGG	2	8	401010	401017	25 %	25 %	50 %	0 %	16759338
8526	NC_003198	GTG	2	6	401023	401028	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16759338
8527	NC_003198	ATTG	2	8	401043	401050	25 %	50 %	25 %	0 %	16759338
8528	NC_003198	CGC	2	6	401097	401102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759338
8529	NC_003198	CGC	2	6	401141	401146	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759338
8530	NC_003198	GTG	2	6	401299	401304	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16759338
8531	NC_003198	TGG	2	6	401324	401329	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16759338
8532	NC_003198	TGA	2	6	401342	401347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16759338
8533	NC_003198	GCTAC	2	10	401373	401382	20 %	20 %	20 %	40 %	16759338
8534	NC_003198	CGC	2	6	401386	401391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759338
8535	NC_003198	GAC	2	6	401472	401477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759338
8536	NC_003198	GTGG	2	8	401496	401503	0 %	25 %	75 %	0 %	16759338
8537	NC_003198	CTG	2	6	401512	401517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759338
8538	NC_003198	CTT	2	6	401577	401582	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16759338
8539	NC_003198	CGG	2	6	401654	401659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759338
8540	NC_003198	ACCG	2	8	401664	401671	25 %	0 %	25 %	50 %	16759338
8541	NC_003198	CG	3	6	401691	401696	0 %	0 %	50 %	50 %	16759338
8542	NC_003198	TAT	2	6	401774	401779	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16759339
8543	NC_003198	GATG	2	8	401807	401814	25 %	25 %	50 %	0 %	16759339
8544	NC_003198	TCA	2	6	401974	401979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16759339
8545	NC_003198	TGG	2	6	402001	402006	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16759339
8546	NC_003198	TGC	2	6	402010	402015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759339
8547	NC_003198	CG	3	6	402075	402080	0 %	0 %	50 %	50 %	16759339
8548	NC_003198	TCG	2	6	402100	402105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759339
8549	NC_003198	GGT	2	6	402149	402154	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16759339
8550	NC_003198	GCG	2	6	402229	402234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759339
8551	NC_003198	GTC	2	6	402243	402248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759339
8552	NC_003198	GCT	2	6	402257	402262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759339
8553	NC_003198	GC	3	6	402316	402321	0 %	0 %	50 %	50 %	16759339
8554	NC_003198	GTT	2	6	402332	402337	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16759339
8555	NC_003198	TTG	2	6	402345	402350	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16759339
8556	NC_003198	G	6	6	402359	402364	0 %	0 %	100 %	0 %	16759339
8557	NC_003198	CGC	2	6	402379	402384	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759339
8558	NC_003198	GAC	2	6	402393	402398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759339
8559	NC_003198	TAC	2	6	402432	402437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16759339
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8561	NC_003198	ATT	2	6	402588	402593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16759339
8562	NC_003198	GCC	3	9	402615	402623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759339
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8564	NC_003198	ATT	2	6	402678	402683	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16759339
8565	NC_003198	CTA	2	6	402704	402709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16759339
8566	NC_003198	A	6	6	402764	402769	100 %	0 %	0 %	0 %	16759340
8567	NC_003198	ATGG	2	8	402787	402794	25 %	25 %	50 %	0 %	16759340
8568	NC_003198	CTG	2	6	402821	402826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759340
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8570	NC_003198	CTGA	2	8	402880	402887	25 %	25 %	25 %	25 %	16759340
8571	NC_003198	TC	3	6	402908	402913	0 %	50 %	0 %	50 %	16759340
8572	NC_003198	TC	3	6	402971	402976	0 %	50 %	0 %	50 %	16759340
8573	NC_003198	ATT	2	6	402996	403001	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8574	NC_003198	CCG	2	6	403114	403119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759341
8575	NC_003198	AGT	2	6	403221	403226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16759341
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8577	NC_003198	ACC	2	6	403317	403322	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16759341
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8579	NC_003198	GCTG	2	8	403376	403383	0 %	25 %	50 %	25 %	16759341
8580	NC_003198	TTG	2	6	403401	403406	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16759341
8581	NC_003198	TGAG	2	8	403435	403442	25 %	25 %	50 %	0 %	16759341
8582	NC_003198	CAG	2	6	403443	403448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759341
8583	NC_003198	CGG	2	6	403514	403519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759341
8584	NC_003198	GCA	2	6	403628	403633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759341
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8588	NC_003198	GAAC	2	8	403820	403827	50 %	0 %	25 %	25 %	16759341
8589	NC_003198	GGC	2	6	403838	403843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759341
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8592	NC_003198	GCA	2	6	403964	403969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759341
8593	NC_003198	GCC	2	6	403971	403976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759341
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8597	NC_003198	T	6	6	404153	404158	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8598	NC_003198	TAA	2	6	404215	404220	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8599	NC_003198	CGG	2	6	404301	404306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759342
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8601	NC_003198	CGC	2	6	404414	404419	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759342
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8603	NC_003198	CAG	2	6	404443	404448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759342
8604	NC_003198	GCGT	2	8	404471	404478	0 %	25 %	50 %	25 %	16759342
8605	NC_003198	ATG	2	6	404605	404610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16759342
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8607	NC_003198	GGT	2	6	404670	404675	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16759342
8608	NC_003198	GGC	2	6	404716	404721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759342
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8615	NC_003198	TGG	2	6	405122	405127	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16759342
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8620	NC_003198	TAT	2	6	405394	405399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16759342
8621	NC_003198	CCG	2	6	405409	405414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759342
8622	NC_003198	ATTAC	2	10	405452	405461	40 %	40 %	0 %	20 %	16759342
8623	NC_003198	AAC	2	6	405622	405627	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16759342
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