MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. CT18

Total Repeats: 101023

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_003198	GGC	2	6	306333	306338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759254
6502	NC_003198	AAT	2	6	306430	306435	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6503	NC_003198	GC	3	6	306479	306484	0 %	0 %	50 %	50 %	16759255
6504	NC_003198	GGC	2	6	306603	306608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759255
6505	NC_003198	GC	3	6	306637	306642	0 %	0 %	50 %	50 %	16759255
6506	NC_003198	CATA	2	8	306677	306684	50 %	25 %	0 %	25 %	16759255
6507	NC_003198	GCG	2	6	306698	306703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759255
6508	NC_003198	CGC	3	9	306726	306734	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759255
6509	NC_003198	GA	3	6	306793	306798	50 %	0 %	50 %	0 %	16759255
6510	NC_003198	CGA	2	6	306802	306807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759255
6511	NC_003198	CA	3	6	306875	306880	50 %	0 %	0 %	50 %	16759255
6512	NC_003198	GCA	2	6	306899	306904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759255
6513	NC_003198	GGT	2	6	306905	306910	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16759255
6514	NC_003198	CAG	2	6	306983	306988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759256
6515	NC_003198	GGT	2	6	307040	307045	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16759256
6516	NC_003198	CAG	2	6	307184	307189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759256
6517	NC_003198	GCG	2	6	307210	307215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759256
6518	NC_003198	AGCG	2	8	307221	307228	25 %	0 %	50 %	25 %	16759256
6519	NC_003198	CGC	2	6	307258	307263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759256
6520	NC_003198	TCGC	2	8	307305	307312	0 %	25 %	25 %	50 %	16759256
6521	NC_003198	GCC	2	6	307325	307330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759256
6522	NC_003198	GCCC	2	8	307339	307346	0 %	0 %	25 %	75 %	16759256
6523	NC_003198	GCC	2	6	307419	307424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759256
6524	NC_003198	AGA	2	6	307455	307460	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16759256
6525	NC_003198	GTT	2	6	307471	307476	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16759256
6526	NC_003198	GCA	2	6	307508	307513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759256
6527	NC_003198	CCT	2	6	307537	307542	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16759256
6528	NC_003198	GCGCCC	2	12	307588	307599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759256
6529	NC_003198	CA	4	8	307610	307617	50 %	0 %	0 %	50 %	16759256
6530	NC_003198	GGC	2	6	307636	307641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759256
6531	NC_003198	CTG	2	6	307670	307675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759256
6532	NC_003198	AGC	2	6	307716	307721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759256
6533	NC_003198	T	7	7	307750	307756	0 %	100 %	0 %	0 %	16759256
6534	NC_003198	AAT	2	6	307815	307820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16759257
6535	NC_003198	CGG	2	6	307831	307836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759257
6536	NC_003198	C	7	7	307872	307878	0 %	0 %	0 %	100 %	16759257
6537	NC_003198	GCCA	2	8	307924	307931	25 %	0 %	25 %	50 %	16759257
6538	NC_003198	GC	3	6	307988	307993	0 %	0 %	50 %	50 %	16759257
6539	NC_003198	CCA	2	6	307997	308002	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16759257
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6541	NC_003198	CTG	2	6	308130	308135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759257
6542	NC_003198	AAT	2	6	308211	308216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16759257
6543	NC_003198	TGT	3	9	308242	308250	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16759257
6544	NC_003198	GAAAC	2	10	308309	308318	60 %	0 %	20 %	20 %	16759257
6545	NC_003198	CGGGA	2	10	308321	308330	20 %	0 %	60 %	20 %	16759257
6546	NC_003198	TCA	2	6	308332	308337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16759257
6547	NC_003198	CAT	2	6	308387	308392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16759257
6548	NC_003198	TGA	2	6	308407	308412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16759257
6549	NC_003198	GCACA	2	10	308437	308446	40 %	0 %	20 %	40 %	16759257
6550	NC_003198	CCA	2	6	308469	308474	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16759257
6551	NC_003198	GCG	2	6	308548	308553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759257
6552	NC_003198	ATGT	2	8	308566	308573	25 %	50 %	25 %	0 %	16759257
6553	NC_003198	TATT	2	8	308664	308671	25 %	75 %	0 %	0 %	16759258
6554	NC_003198	GGA	2	6	308677	308682	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16759258
6555	NC_003198	ATAA	2	8	308705	308712	75 %	25 %	0 %	0 %	16759258
6556	NC_003198	ATT	2	6	308737	308742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6557	NC_003198	TAT	2	6	308757	308762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6558	NC_003198	TCG	2	6	308765	308770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6559	NC_003198	TTG	2	6	308779	308784	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6560	NC_003198	T	6	6	308799	308804	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6561	NC_003198	ATT	2	6	308810	308815	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6562	NC_003198	TTG	2	6	308846	308851	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6563	NC_003198	ATT	2	6	308859	308864	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6564	NC_003198	TTGTT	2	10	308909	308918	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
6565	NC_003198	TAA	2	6	308940	308945	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6566	NC_003198	TA	3	6	308955	308960	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6567	NC_003198	ATT	2	6	308978	308983	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6568	NC_003198	GGCC	2	8	309057	309064	0 %	0 %	50 %	50 %	16759259
6569	NC_003198	CAG	2	6	309157	309162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759259
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6573	NC_003198	TGC	2	6	309368	309373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759259
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6575	NC_003198	GC	3	6	309422	309427	0 %	0 %	50 %	50 %	16759259
6576	NC_003198	TGA	2	6	309447	309452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16759259
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6579	NC_003198	GC	3	6	309628	309633	0 %	0 %	50 %	50 %	16759259
6580	NC_003198	CTG	2	6	309694	309699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759259
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6584	NC_003198	CGG	2	6	309752	309757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759259
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6596	NC_003198	CCCG	2	8	310258	310265	0 %	0 %	25 %	75 %	16759259
6597	NC_003198	CCG	2	6	310301	310306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759259
6598	NC_003198	CGC	2	6	310334	310339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759259
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6601	NC_003198	A	6	6	310412	310417	100 %	0 %	0 %	0 %	16759259
6602	NC_003198	TCAG	2	8	310425	310432	25 %	25 %	25 %	25 %	16759259
6603	NC_003198	ACTG	2	8	310482	310489	25 %	25 %	25 %	25 %	16759259
6604	NC_003198	CTGATG	2	12	310559	310570	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16759259
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6607	NC_003198	GCCA	2	8	310720	310727	25 %	0 %	25 %	50 %	16759259
6608	NC_003198	CTGC	2	8	310738	310745	0 %	25 %	25 %	50 %	16759259
6609	NC_003198	GC	3	6	310778	310783	0 %	0 %	50 %	50 %	16759259
6610	NC_003198	GGCCG	2	10	310863	310872	0 %	0 %	60 %	40 %	16759259
6611	NC_003198	CGCTGG	2	12	310898	310909	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	16759259
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6622	NC_003198	TCA	2	6	311225	311230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16759259
6623	NC_003198	TG	3	6	311237	311242	0 %	50 %	50 %	0 %	16759259
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