MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. LT2 chromosome

Total Repeats: 102725

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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18502	NC_003197	GCC	2	6	861268	861273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16764158
18503	NC_003197	GCTG	2	8	861301	861308	0 %	25 %	50 %	25 %	16764158
18504	NC_003197	ATT	2	6	861378	861383	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16764158
18505	NC_003197	GCG	2	6	861424	861429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16764158
18506	NC_003197	AGG	2	6	861475	861480	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16764158
18507	NC_003197	CG	3	6	861507	861512	0 %	0 %	50 %	50 %	16764158
18508	NC_003197	CTG	2	6	861513	861518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16764158
18509	NC_003197	GCG	2	6	861534	861539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16764158
18510	NC_003197	A	8	8	861567	861574	100 %	0 %	0 %	0 %	16764158
18511	NC_003197	CTG	2	6	861612	861617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16764158
18512	NC_003197	CGC	2	6	861648	861653	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16764158
18513	NC_003197	GCA	2	6	861671	861676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16764158
18514	NC_003197	TGG	2	6	861718	861723	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16764158
18515	NC_003197	GC	3	6	861757	861762	0 %	0 %	50 %	50 %	16764158
18516	NC_003197	CAT	2	6	861795	861800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16764158
18517	NC_003197	GTTG	2	8	861809	861816	0 %	50 %	50 %	0 %	16764158
18518	NC_003197	ATG	2	6	861817	861822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16764158
18519	NC_003197	GGGGC	2	10	861851	861860	0 %	0 %	80 %	20 %	16764158
18520	NC_003197	CTG	2	6	861863	861868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16764158
18521	NC_003197	G	6	6	861874	861879	0 %	0 %	100 %	0 %	16764158
18522	NC_003197	TGG	2	6	861895	861900	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16764158
18523	NC_003197	GCG	2	6	861928	861933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16764158
18524	NC_003197	TGCTC	2	10	861940	861949	0 %	40 %	20 %	40 %	16764158
18525	NC_003197	CTG	2	6	861969	861974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16764158
18526	NC_003197	GCC	2	6	862010	862015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16764158
18527	NC_003197	CAGGCG	2	12	862020	862031	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	16764158
18528	NC_003197	GGT	2	6	862068	862073	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16764158
18529	NC_003197	CGC	2	6	862091	862096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16764158
18530	NC_003197	CAA	2	6	862224	862229	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16764158
18531	NC_003197	CGCC	2	8	862251	862258	0 %	0 %	25 %	75 %	16764158
18532	NC_003197	GC	3	6	862278	862283	0 %	0 %	50 %	50 %	16764158
18533	NC_003197	TTAACG	2	12	862290	862301	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	16764158
18534	NC_003197	CTG	2	6	862332	862337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16764158
18535	NC_003197	TGC	2	6	862342	862347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16764158
18536	NC_003197	GCG	3	9	862375	862383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16764159
18537	NC_003197	GGCCG	2	10	862387	862396	0 %	0 %	60 %	40 %	16764159
18538	NC_003197	GCA	2	6	862425	862430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16764159
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18553	NC_003197	CGG	2	6	863382	863387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16764160
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18555	NC_003197	GCGG	2	8	863447	863454	0 %	0 %	75 %	25 %	16764160
18556	NC_003197	CT	3	6	863468	863473	0 %	50 %	0 %	50 %	16764160
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18565	NC_003197	CTT	2	6	863800	863805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18566	NC_003197	CTG	2	6	863822	863827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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18569	NC_003197	T	9	9	863941	863949	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18570	NC_003197	GGC	2	6	863986	863991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18571	NC_003197	TA	3	6	864146	864151	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18572	NC_003197	AAGG	2	8	864167	864174	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18573	NC_003197	TCA	2	6	864197	864202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18574	NC_003197	A	6	6	864221	864226	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18575	NC_003197	CTG	2	6	864254	864259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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18577	NC_003197	T	6	6	864360	864365	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18578	NC_003197	CGT	2	6	864496	864501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16764161
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18582	NC_003197	ACT	2	6	864713	864718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16764161
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18590	NC_003197	CGC	2	6	865184	865189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16764161
18591	NC_003197	AAT	2	6	865261	865266	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16764161
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18595	NC_003197	CGGGC	2	10	865380	865389	0 %	0 %	60 %	40 %	16764161
18596	NC_003197	CCG	2	6	865393	865398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16764161
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18598	NC_003197	CTG	2	6	865432	865437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16764161
18599	NC_003197	TGA	2	6	865443	865448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16764161
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18601	NC_003197	GAG	2	6	865570	865575	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16764161
18602	NC_003197	CTAT	2	8	865598	865605	25 %	50 %	0 %	25 %	16764161
18603	NC_003197	TGA	2	6	865647	865652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16764161
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18609	NC_003197	GCGT	2	8	865847	865854	0 %	25 %	50 %	25 %	16764161
18610	NC_003197	ATC	2	6	865894	865899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16764161
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18621	NC_003197	AGTC	2	8	866529	866536	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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18991	NC_003197	CGGTA	2	10	884163	884172	20 %	20 %	40 %	20 %	16764181
18992	NC_003197	CGCCTG	2	12	884206	884217	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	16764181
18993	NC_003197	CG	3	6	884220	884225	0 %	0 %	50 %	50 %	16764181
18994	NC_003197	GGC	2	6	884317	884322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16764181
18995	NC_003197	CGG	4	12	884337	884348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16764181
18996	NC_003197	CGAC	2	8	884406	884413	25 %	0 %	25 %	50 %	16764181
18997	NC_003197	TCA	2	6	884501	884506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16764181
18998	NC_003197	GCC	2	6	884527	884532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16764181
18999	NC_003197	ACC	2	6	884610	884615	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16764181
19000	NC_003197	CGA	2	6	884637	884642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16764181

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