MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. LT2 chromosome

Total Repeats: 102725

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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14002	NC_003197	CTG	2	6	656825	656830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16763972
14003	NC_003197	TGC	2	6	656847	656852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16763972
14004	NC_003197	CTG	2	6	656948	656953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16763972
14005	NC_003197	GCA	2	6	657021	657026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16763972
14006	NC_003197	CAC	2	6	657061	657066	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16763972
14007	NC_003197	CTG	2	6	657143	657148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16763972
14008	NC_003197	TCA	2	6	657178	657183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16763972
14009	NC_003197	GGC	2	6	657236	657241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16763972
14010	NC_003197	CT	3	6	657395	657400	0 %	50 %	0 %	50 %	16763972
14011	NC_003197	GAT	2	6	657436	657441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16763973
14012	NC_003197	CCG	2	6	657478	657483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16763973
14013	NC_003197	CGG	2	6	657558	657563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16763973
14014	NC_003197	GC	3	6	657577	657582	0 %	0 %	50 %	50 %	16763973
14015	NC_003197	GGA	2	6	657844	657849	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16763973
14016	NC_003197	GTG	2	6	657890	657895	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16763973
14017	NC_003197	ACG	3	9	657906	657914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16763973
14018	NC_003197	GGC	2	6	657946	657951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16763973
14019	NC_003197	CTG	2	6	657978	657983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16763973
14020	NC_003197	CGG	2	6	658009	658014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16763973
14021	NC_003197	TAC	2	6	658015	658020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16763973
14022	NC_003197	TAC	2	6	658061	658066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16763973
14023	NC_003197	GCA	2	6	658077	658082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16763973
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14026	NC_003197	TCTT	2	8	658176	658183	0 %	75 %	0 %	25 %	16763973
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14039	NC_003197	GATCT	2	10	658682	658691	20 %	40 %	20 %	20 %	16763973
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14049	NC_003197	TGCGT	2	10	658964	658973	0 %	40 %	40 %	20 %	16763973
14050	NC_003197	A	6	6	659006	659011	100 %	0 %	0 %	0 %	16763973
14051	NC_003197	AG	3	6	659058	659063	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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14054	NC_003197	GCT	2	6	659159	659164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16763974
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14057	NC_003197	CAT	2	6	659271	659276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16763974
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14102	NC_003197	TGTAA	2	10	661154	661163	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
14103	NC_003197	A	6	6	661162	661167	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14104	NC_003197	TGT	3	9	661191	661199	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14105	NC_003197	GTT	2	6	661200	661205	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14106	NC_003197	TC	3	6	661243	661248	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14107	NC_003197	ACA	2	6	661265	661270	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14108	NC_003197	GTG	2	6	661385	661390	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16763977
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14122	NC_003197	TGG	2	6	662052	662057	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16763977
14123	NC_003197	CGG	2	6	662073	662078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16763977
14124	NC_003197	GCT	3	9	662092	662100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16763977
14125	NC_003197	CGC	2	6	662103	662108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16763977
14126	NC_003197	CT	3	6	662117	662122	0 %	50 %	0 %	50 %	16763977
14127	NC_003197	TTG	2	6	662211	662216	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16763977
14128	NC_003197	ACCGG	2	10	662222	662231	20 %	0 %	40 %	40 %	16763977
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14135	NC_003197	TCG	2	6	662391	662396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16763977
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14144	NC_003197	TCC	2	6	662868	662873	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16763977
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14150	NC_003197	TGG	3	9	663231	663239	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16763977
14151	NC_003197	GTG	2	6	663242	663247	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16763977
14152	NC_003197	TCT	2	6	663255	663260	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16763977
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14160	NC_003197	TGC	2	6	663632	663637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16763978
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14163	NC_003197	CGG	2	6	663798	663803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16763979
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14187	NC_003197	GCCGG	2	10	664727	664736	0 %	0 %	60 %	40 %	16763979
14188	NC_003197	ACG	2	6	664739	664744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16763979
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14191	NC_003197	GTT	2	6	664793	664798	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14192	NC_003197	GT	3	6	664853	664858	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14193	NC_003197	CAA	2	6	664859	664864	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14194	NC_003197	GC	3	6	664961	664966	0 %	0 %	50 %	50 %	16763980
14195	NC_003197	CGG	2	6	665129	665134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16763980
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14201	NC_003197	CGC	2	6	665402	665407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16763980
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14204	NC_003197	TCA	2	6	665673	665678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16763980
14205	NC_003197	CTGGCG	2	12	665713	665724	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	16763980
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14209	NC_003197	A	6	6	665779	665784	100 %	0 %	0 %	0 %	16763980
14210	NC_003197	TGC	2	6	665828	665833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16763980
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14213	NC_003197	CT	3	6	665944	665949	0 %	50 %	0 %	50 %	16763980
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14224	NC_003197	CGG	2	6	666469	666474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16763981
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14227	NC_003197	AG	3	6	666628	666633	50 %	0 %	50 %	0 %	16763981
14228	NC_003197	CGTT	2	8	666703	666710	0 %	50 %	25 %	25 %	16763982
14229	NC_003197	ACG	2	6	666803	666808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16763982
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14231	NC_003197	TGC	2	6	666835	666840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16763982
14232	NC_003197	T	6	6	666864	666869	0 %	100 %	0 %	0 %	16763982
14233	NC_003197	TTA	2	6	666898	666903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16763982
14234	NC_003197	AGC	2	6	666946	666951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16763982
14235	NC_003197	TCC	2	6	667032	667037	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16763982
14236	NC_003197	GCC	2	6	667069	667074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16763982
14237	NC_003197	GTT	2	6	667118	667123	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16763982
14238	NC_003197	GATA	2	8	667262	667269	50 %	25 %	25 %	0 %	16763982
14239	NC_003197	TCG	2	6	667312	667317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16763982
14240	NC_003197	TCG	2	6	667369	667374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16763982
14241	NC_003197	CGAA	2	8	667435	667442	50 %	0 %	25 %	25 %	16763982
14242	NC_003197	A	7	7	667475	667481	100 %	0 %	0 %	0 %	16763982
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14496	NC_003197	CTG	2	6	679501	679506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16763993
14497	NC_003197	GAC	2	6	679593	679598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16763993
14498	NC_003197	GC	3	6	679631	679636	0 %	0 %	50 %	50 %	16763993
14499	NC_003197	AGA	2	6	679696	679701	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16763993
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