MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. LT2 chromosome

Total Repeats: 102725

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_003197	CT	3	6	519748	519753	0 %	50 %	0 %	50 %	16763842
11002	NC_003197	ATC	2	6	519756	519761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16763842
11003	NC_003197	GC	3	6	519905	519910	0 %	0 %	50 %	50 %	16763842
11004	NC_003197	TGGCGC	2	12	519984	519995	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	16763842
11005	NC_003197	TGA	2	6	520030	520035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16763842
11006	NC_003197	CAG	2	6	520076	520081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16763842
11007	NC_003197	GGC	2	6	520087	520092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16763842
11008	NC_003197	CAC	2	6	520105	520110	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16763842
11009	NC_003197	TGG	2	6	520113	520118	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16763842
11010	NC_003197	CAA	2	6	520205	520210	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16763842
11011	NC_003197	GGC	2	6	520216	520221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16763842
11012	NC_003197	AGTT	2	8	520254	520261	25 %	50 %	25 %	0 %	16763842
11013	NC_003197	GAG	2	6	520265	520270	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16763842
11014	NC_003197	GCC	2	6	520274	520279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16763842
11015	NC_003197	GAA	2	6	520289	520294	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16763842
11016	NC_003197	GCG	2	6	520304	520309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16763842
11017	NC_003197	CAT	2	6	520342	520347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11018	NC_003197	CGT	2	6	520352	520357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11019	NC_003197	TTTC	2	8	520366	520373	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
11020	NC_003197	CG	3	6	520408	520413	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11021	NC_003197	CTCG	2	8	520429	520436	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11022	NC_003197	AGA	2	6	520471	520476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11023	NC_003197	GCG	2	6	520485	520490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11024	NC_003197	GGA	2	6	520562	520567	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16763843
11025	NC_003197	TTC	2	6	520583	520588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16763843
11026	NC_003197	CGCGG	2	10	520662	520671	0 %	0 %	60 %	40 %	16763843
11027	NC_003197	CGA	2	6	520721	520726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16763843
11028	NC_003197	ATC	2	6	520749	520754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16763843
11029	NC_003197	TCG	2	6	520798	520803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16763843
11030	NC_003197	AGC	2	6	520850	520855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16763843
11031	NC_003197	CA	3	6	520870	520875	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11032	NC_003197	A	6	6	520889	520894	100 %	0 %	0 %	0 %	16763844
11033	NC_003197	GAT	2	6	520905	520910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16763844
11034	NC_003197	GCT	2	6	520935	520940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16763844
11035	NC_003197	CGG	2	6	520964	520969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16763844
11036	NC_003197	ATG	2	6	520996	521001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16763844
11037	NC_003197	CGG	2	6	521055	521060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16763844
11038	NC_003197	GTG	2	6	521137	521142	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16763844
11039	NC_003197	T	6	6	521178	521183	0 %	100 %	0 %	0 %	16763844
11040	NC_003197	GAA	2	6	521208	521213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16763844
11041	NC_003197	CGG	2	6	521225	521230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16763844
11042	NC_003197	GC	3	6	521309	521314	0 %	0 %	50 %	50 %	16763844
11043	NC_003197	CGG	2	6	521336	521341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16763844
11044	NC_003197	GTG	2	6	521356	521361	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16763844
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11046	NC_003197	GCG	2	6	521405	521410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16763844
11047	NC_003197	CTG	2	6	521413	521418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16763844
11048	NC_003197	GCT	2	6	521419	521424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16763844
11049	NC_003197	GC	3	6	521429	521434	0 %	0 %	50 %	50 %	16763844
11050	NC_003197	TGG	2	6	521445	521450	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16763844
11051	NC_003197	GTG	2	6	521455	521460	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16763844
11052	NC_003197	CGC	2	6	521469	521474	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16763844
11053	NC_003197	GCTGG	2	10	521479	521488	0 %	20 %	60 %	20 %	16763844
11054	NC_003197	GAAG	2	8	521526	521533	50 %	0 %	50 %	0 %	16763844
11055	NC_003197	AGC	2	6	521637	521642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16763844
11056	NC_003197	GTG	2	6	521662	521667	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16763844
11057	NC_003197	CCG	3	9	521672	521680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16763844
11058	NC_003197	CTG	2	6	521731	521736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16763844
11059	NC_003197	GTTGGC	2	12	521794	521805	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	16763844
11060	NC_003197	GC	3	6	521807	521812	0 %	0 %	50 %	50 %	16763844
11061	NC_003197	GAT	2	6	521884	521889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16763844
11062	NC_003197	GCC	2	6	521956	521961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16763844
11063	NC_003197	GCG	2	6	521972	521977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16763844
11064	NC_003197	GTC	2	6	522046	522051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16763844
11065	NC_003197	TTG	2	6	522071	522076	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16763844
11066	NC_003197	TTG	2	6	522098	522103	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16763844
11067	NC_003197	GCGCT	2	10	522200	522209	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
11068	NC_003197	TCA	2	6	522244	522249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11069	NC_003197	CGC	2	6	522259	522264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11070	NC_003197	T	6	6	522276	522281	0 %	100 %	0 %	0 %	16763845
11071	NC_003197	GC	3	6	522327	522332	0 %	0 %	50 %	50 %	16763845
11072	NC_003197	CGC	2	6	522351	522356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16763845
11073	NC_003197	CATT	2	8	522410	522417	25 %	50 %	0 %	25 %	16763845
11074	NC_003197	GGAA	2	8	522515	522522	50 %	0 %	50 %	0 %	16763845
11075	NC_003197	GCG	2	6	522617	522622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16763845
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11081	NC_003197	GAAT	2	8	522961	522968	50 %	25 %	25 %	0 %	16763845
11082	NC_003197	GGC	2	6	523000	523005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16763845
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11085	NC_003197	T	6	6	523092	523097	0 %	100 %	0 %	0 %	16763845
11086	NC_003197	AAT	2	6	523106	523111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16763845
11087	NC_003197	ATT	2	6	523120	523125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16763845
11088	NC_003197	CATA	2	8	523138	523145	50 %	25 %	0 %	25 %	16763845
11089	NC_003197	CGG	2	6	523308	523313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11090	NC_003197	G	6	6	523312	523317	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
11091	NC_003197	CTG	2	6	523324	523329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11092	NC_003197	TGA	2	6	523336	523341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11093	NC_003197	TGAA	2	8	523352	523359	50 %	25 %	25 %	0 %	16763846
11094	NC_003197	GGC	2	6	523402	523407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16763846
11095	NC_003197	CTA	2	6	523479	523484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16763846
11096	NC_003197	GCC	2	6	523537	523542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16763846
11097	NC_003197	GCTG	2	8	523579	523586	0 %	25 %	50 %	25 %	16763846
11098	NC_003197	GTAC	2	8	523619	523626	25 %	25 %	25 %	25 %	16763846
11099	NC_003197	CG	3	6	523690	523695	0 %	0 %	50 %	50 %	16763846
11100	NC_003197	TCC	2	6	523698	523703	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16763846
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11102	NC_003197	TATT	2	8	523737	523744	25 %	75 %	0 %	0 %	16763846
11103	NC_003197	TAA	2	6	523768	523773	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16763846
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11105	NC_003197	CGG	2	6	523818	523823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16763846
11106	NC_003197	GGT	2	6	523841	523846	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16763846
11107	NC_003197	CGA	3	9	523848	523856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16763846
11108	NC_003197	TCT	2	6	523892	523897	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16763846
11109	NC_003197	ACC	2	6	524006	524011	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16763847
11110	NC_003197	CAC	2	6	524086	524091	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16763847
11111	NC_003197	TGC	2	6	524109	524114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16763847
11112	NC_003197	CCG	2	6	524138	524143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16763847
11113	NC_003197	CGC	2	6	524152	524157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16763847
11114	NC_003197	CGA	2	6	524223	524228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16763847
11115	NC_003197	ATA	2	6	524267	524272	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16763847
11116	NC_003197	G	6	6	524310	524315	0 %	0 %	100 %	0 %	16763847
11117	NC_003197	CAGGT	2	10	524463	524472	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
11118	NC_003197	GGAA	2	8	524475	524482	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11119	NC_003197	CCCA	2	8	524530	524537	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
11120	NC_003197	CTG	2	6	524564	524569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11121	NC_003197	AAT	2	6	524742	524747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16763848
11122	NC_003197	GCG	2	6	524750	524755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16763848
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11247	NC_003197	AAGA	2	8	530706	530713	75 %	0 %	25 %	0 %	16763855
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11253	NC_003197	TCG	2	6	530911	530916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16763855
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11363	NC_003197	TGA	2	6	535865	535870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16763858
11364	NC_003197	GCA	2	6	535902	535907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16763858
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11369	NC_003197	GCC	3	9	536128	536136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16763858
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11494	NC_003197	CGG	2	6	541939	541944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16763864
11495	NC_003197	CGC	2	6	542015	542020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16763864
11496	NC_003197	CGG	2	6	542048	542053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16763864
11497	NC_003197	CGC	3	9	542060	542068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16763864
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