MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. LT2 chromosome

Total Repeats: 102725

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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10502	NC_003197	GTT	2	6	496752	496757	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16763823
10503	NC_003197	GGAAAG	2	12	496760	496771	50 %	0 %	50 %	0 %	16763823
10504	NC_003197	CG	4	8	496778	496785	0 %	0 %	50 %	50 %	16763823
10505	NC_003197	ACC	2	6	496801	496806	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16763823
10506	NC_003197	TCA	2	6	496811	496816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16763823
10507	NC_003197	GAA	2	6	496842	496847	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16763823
10508	NC_003197	GTG	2	6	496887	496892	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16763823
10509	NC_003197	CGG	2	6	496893	496898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16763823
10510	NC_003197	CTG	2	6	496932	496937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16763823
10511	NC_003197	CAT	2	6	496944	496949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16763823
10512	NC_003197	CGA	2	6	496988	496993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16763823
10513	NC_003197	ATG	2	6	497002	497007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16763823
10514	NC_003197	TAGG	2	8	497049	497056	25 %	25 %	50 %	0 %	16763823
10515	NC_003197	AAGT	2	8	497068	497075	50 %	25 %	25 %	0 %	16763823
10516	NC_003197	CGA	2	6	497102	497107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16763823
10517	NC_003197	ATCTT	2	10	497179	497188	20 %	60 %	0 %	20 %	16763823
10518	NC_003197	TAA	2	6	497313	497318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16763824
10519	NC_003197	TTG	2	6	497363	497368	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16763824
10520	NC_003197	CGC	2	6	497398	497403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16763824
10521	NC_003197	TCAT	2	8	497408	497415	25 %	50 %	0 %	25 %	16763824
10522	NC_003197	TGG	2	6	497472	497477	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16763824
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10527	NC_003197	GCGT	2	8	497810	497817	0 %	25 %	50 %	25 %	16763824
10528	NC_003197	ATG	2	6	497846	497851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16763824
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10533	NC_003197	TAT	2	6	498403	498408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10534	NC_003197	AAATTT	2	12	498433	498444	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10535	NC_003197	AAT	2	6	498490	498495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10536	NC_003197	AT	3	6	498527	498532	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10537	NC_003197	T	6	6	498532	498537	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10538	NC_003197	TTA	2	6	498577	498582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10539	NC_003197	AAT	2	6	498591	498596	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10540	NC_003197	CAG	2	6	498603	498608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16763825
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10543	NC_003197	CGCT	2	8	498835	498842	0 %	25 %	25 %	50 %	16763825
10544	NC_003197	CGG	2	6	498899	498904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16763825
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10558	NC_003197	CGA	2	6	499439	499444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16763825
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10591	NC_003197	TGT	2	6	500916	500921	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10592	NC_003197	GGA	2	6	500988	500993	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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10602	NC_003197	TA	3	6	501528	501533	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10603	NC_003197	GAT	2	6	501547	501552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10604	NC_003197	GAC	2	6	501556	501561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10606	NC_003197	T	6	6	501648	501653	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10607	NC_003197	GCC	2	6	501699	501704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16763828
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10614	NC_003197	GC	3	6	501927	501932	0 %	0 %	50 %	50 %	16763828
10615	NC_003197	GTT	2	6	502049	502054	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16763828
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10618	NC_003197	GAAA	2	8	502117	502124	75 %	0 %	25 %	0 %	16763828
10619	NC_003197	GCT	2	6	502133	502138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16763828
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10989	NC_003197	CAG	2	6	519182	519187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16763842
10990	NC_003197	CAG	2	6	519194	519199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16763842
10991	NC_003197	GC	3	6	519200	519205	0 %	0 %	50 %	50 %	16763842
10992	NC_003197	GCT	2	6	519292	519297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16763842
10993	NC_003197	TTG	2	6	519329	519334	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16763842
10994	NC_003197	ACC	2	6	519434	519439	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16763842
10995	NC_003197	CAG	2	6	519455	519460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16763842
10996	NC_003197	CGA	2	6	519523	519528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16763842
10997	NC_003197	ATTGAT	2	12	519551	519562	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	16763842
10998	NC_003197	CGA	2	6	519583	519588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16763842
10999	NC_003197	TGG	2	6	519645	519650	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16763842
11000	NC_003197	TTA	2	6	519686	519691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16763842

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