MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. LT2 chromosome

Total Repeats: 102725

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_003197	ACC	3	9	474320	474328	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16763801
10002	NC_003197	TCG	2	6	474329	474334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16763801
10003	NC_003197	GC	3	6	474354	474359	0 %	0 %	50 %	50 %	16763801
10004	NC_003197	GCT	2	6	474376	474381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16763801
10005	NC_003197	A	6	6	474409	474414	100 %	0 %	0 %	0 %	16763801
10006	NC_003197	GCC	2	6	474421	474426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16763801
10007	NC_003197	GC	3	6	474434	474439	0 %	0 %	50 %	50 %	16763801
10008	NC_003197	TGA	2	6	474441	474446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16763801
10009	NC_003197	GCT	2	6	474454	474459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16763801
10010	NC_003197	CT	3	6	474458	474463	0 %	50 %	0 %	50 %	16763801
10011	NC_003197	GCCA	2	8	474634	474641	25 %	0 %	25 %	50 %	16763802
10012	NC_003197	GCG	2	6	474667	474672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16763802
10013	NC_003197	CG	3	6	474687	474692	0 %	0 %	50 %	50 %	16763802
10014	NC_003197	CTT	2	6	474695	474700	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16763802
10015	NC_003197	CGC	2	6	474788	474793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16763802
10016	NC_003197	GCC	2	6	474801	474806	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16763802
10017	NC_003197	TTC	2	6	474819	474824	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16763802
10018	NC_003197	TGC	2	6	474844	474849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16763802
10019	NC_003197	GTC	2	6	474873	474878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16763802
10020	NC_003197	CGC	2	6	474936	474941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16763802
10021	NC_003197	CGT	2	6	475085	475090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16763802
10022	NC_003197	TCG	2	6	475132	475137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16763802
10023	NC_003197	GA	3	6	475180	475185	50 %	0 %	50 %	0 %	16763802
10024	NC_003197	GT	3	6	475200	475205	0 %	50 %	50 %	0 %	16763802
10025	NC_003197	CGAT	2	8	475234	475241	25 %	25 %	25 %	25 %	16763802
10026	NC_003197	AGTAG	2	10	475311	475320	40 %	20 %	40 %	0 %	16763802
10027	NC_003197	ACG	2	6	475327	475332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16763802
10028	NC_003197	GCC	2	6	475341	475346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16763802
10029	NC_003197	GCG	2	6	475360	475365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16763802
10030	NC_003197	TGC	2	6	475378	475383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16763802
10031	NC_003197	CCA	2	6	475433	475438	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16763802
10032	NC_003197	GGC	2	6	475491	475496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16763802
10033	NC_003197	CA	3	6	475502	475507	50 %	0 %	0 %	50 %	16763802
10034	NC_003197	CCG	2	6	475543	475548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16763802
10035	NC_003197	TTC	2	6	475690	475695	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16763802
10036	NC_003197	TTC	2	6	475800	475805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16763802
10037	NC_003197	T	6	6	475852	475857	0 %	100 %	0 %	0 %	16763802
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10039	NC_003197	GTT	2	6	475911	475916	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16763802
10040	NC_003197	GC	3	6	475919	475924	0 %	0 %	50 %	50 %	16763802
10041	NC_003197	CGG	2	6	476021	476026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16763802
10042	NC_003197	CA	3	6	476046	476051	50 %	0 %	0 %	50 %	16763802
10043	NC_003197	GCG	2	6	476058	476063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16763802
10044	NC_003197	CTT	2	6	476072	476077	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16763802
10045	NC_003197	CCG	2	6	476081	476086	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16763802
10046	NC_003197	ATACCG	2	12	476095	476106	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	16763802
10047	NC_003197	TGGAGG	2	12	476114	476125	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	16763802
10048	NC_003197	CGA	2	6	476218	476223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16763802
10049	NC_003197	AGTA	2	8	476374	476381	50 %	25 %	25 %	0 %	16763802
10050	NC_003197	GCG	2	6	476382	476387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16763802
10051	NC_003197	TCG	2	6	476392	476397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16763802
10052	NC_003197	CT	3	6	476413	476418	0 %	50 %	0 %	50 %	16763802
10053	NC_003197	AGGGT	2	10	476461	476470	20 %	20 %	60 %	0 %	16763802
10054	NC_003197	TTTA	2	8	476515	476522	25 %	75 %	0 %	0 %	16763803
10055	NC_003197	GGTA	2	8	476665	476672	25 %	25 %	50 %	0 %	16763803
10056	NC_003197	GCT	2	6	476683	476688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16763803
10057	NC_003197	CAC	2	6	476729	476734	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16763803
10058	NC_003197	AAGGC	2	10	476760	476769	40 %	0 %	40 %	20 %	16763803
10059	NC_003197	CT	3	6	476775	476780	0 %	50 %	0 %	50 %	16763803
10060	NC_003197	CGG	2	6	476848	476853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16763803
10061	NC_003197	GC	3	6	476863	476868	0 %	0 %	50 %	50 %	16763803
10062	NC_003197	GCC	2	6	476925	476930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16763803
10063	NC_003197	CCG	2	6	476946	476951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16763803
10064	NC_003197	ATC	2	6	476991	476996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16763803
10065	NC_003197	CGATCG	2	12	477003	477014	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16763803
10066	NC_003197	ATCGTC	2	12	477137	477148	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16763803
10067	NC_003197	GTC	2	6	477161	477166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16763803
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10069	NC_003197	TAA	2	6	477290	477295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16763803
10070	NC_003197	GCT	2	6	477397	477402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16763803
10071	NC_003197	CTG	2	6	477494	477499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16763804
10072	NC_003197	TGCC	2	8	477506	477513	0 %	25 %	25 %	50 %	16763804
10073	NC_003197	CGC	2	6	477532	477537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16763804
10074	NC_003197	ATTC	2	8	477544	477551	25 %	50 %	0 %	25 %	16763804
10075	NC_003197	CGC	2	6	477574	477579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16763804
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10077	NC_003197	GGCG	2	8	477632	477639	0 %	0 %	75 %	25 %	16763804
10078	NC_003197	TTC	2	6	477648	477653	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16763804
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10081	NC_003197	GTGATA	2	12	477763	477774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10083	NC_003197	GCC	2	6	477862	477867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10084	NC_003197	TGCG	2	8	478189	478196	0 %	25 %	50 %	25 %	16763805
10085	NC_003197	GGC	2	6	478252	478257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16763805
10086	NC_003197	GC	3	6	478282	478287	0 %	0 %	50 %	50 %	16763805
10087	NC_003197	TGGAAG	2	12	478322	478333	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	16763805
10088	NC_003197	CTG	3	9	478342	478350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16763805
10089	NC_003197	CGG	2	6	478422	478427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16763805
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10092	NC_003197	GGC	2	6	478501	478506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16763805
10093	NC_003197	GCG	2	6	478507	478512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16763805
10094	NC_003197	GGT	2	6	478605	478610	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16763805
10095	NC_003197	GAC	2	6	478633	478638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16763805
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10097	NC_003197	ATG	2	6	478666	478671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16763805
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10099	NC_003197	CCAG	2	8	478748	478755	25 %	0 %	25 %	50 %	16763805
10100	NC_003197	GC	3	6	478849	478854	0 %	0 %	50 %	50 %	16763805
10101	NC_003197	GAA	3	9	478954	478962	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16763805
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10106	NC_003197	CAG	2	6	479041	479046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16763805
10107	NC_003197	GGT	2	6	479049	479054	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16763805
10108	NC_003197	ACG	2	6	479087	479092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16763805
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10110	NC_003197	GCT	2	6	479223	479228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16763805
10111	NC_003197	GGC	2	6	479331	479336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10112	NC_003197	TCA	3	9	479398	479406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16763806
10113	NC_003197	GCA	2	6	479407	479412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16763806
10114	NC_003197	CCA	2	6	479422	479427	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16763806
10115	NC_003197	GCGCC	2	10	479440	479449	0 %	0 %	40 %	60 %	16763806
10116	NC_003197	CGGT	2	8	479466	479473	0 %	25 %	50 %	25 %	16763806
10117	NC_003197	CGT	2	6	479498	479503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16763806
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10122	NC_003197	CGACG	2	10	479648	479657	20 %	0 %	40 %	40 %	16763806
10123	NC_003197	CGG	2	6	479668	479673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16763806
10124	NC_003197	CAGCGC	2	12	479888	479899	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	16763806
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10126	NC_003197	AGC	2	6	479916	479921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16763806
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10129	NC_003197	GCC	2	6	480185	480190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16763807
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10131	NC_003197	CAT	2	6	480292	480297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16763807
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10137	NC_003197	CGA	2	6	480696	480701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16763807
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10154	NC_003197	CGG	2	6	481391	481396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16763808
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10160	NC_003197	TGC	2	6	481669	481674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16763808
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10169	NC_003197	CAC	2	6	482034	482039	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16763808
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10196	NC_003197	AAAT	2	8	483244	483251	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10197	NC_003197	GAT	2	6	483264	483269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10199	NC_003197	ATCCAG	2	12	483400	483411	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	16763810
10200	NC_003197	GCA	2	6	483444	483449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16763810
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10202	NC_003197	GCA	2	6	483597	483602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16763810
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10205	NC_003197	GCTGGA	2	12	483702	483713	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	16763810
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10213	NC_003197	T	6	6	484118	484123	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10214	NC_003197	CAC	2	6	484249	484254	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16763811
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10219	NC_003197	CTG	2	6	484388	484393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16763811
10220	NC_003197	GGCAGC	2	12	484397	484408	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	16763811
10221	NC_003197	GGCC	2	8	484504	484511	0 %	0 %	50 %	50 %	16763811
10222	NC_003197	GCG	2	6	484542	484547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16763811
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10224	NC_003197	CCGAC	2	10	484593	484602	20 %	0 %	20 %	60 %	16763811
10225	NC_003197	ACC	2	6	484637	484642	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16763811
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10230	NC_003197	CGCT	2	8	484865	484872	0 %	25 %	25 %	50 %	16763811
10231	NC_003197	GGA	2	6	484906	484911	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16763811
10232	NC_003197	CA	3	6	484942	484947	50 %	0 %	0 %	50 %	16763811
10233	NC_003197	AAG	2	6	484989	484994	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16763811
10234	NC_003197	TCA	2	6	485011	485016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16763811
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10236	NC_003197	GCT	2	6	485077	485082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16763811
10237	NC_003197	CGC	2	6	485162	485167	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16763811
10238	NC_003197	TATC	2	8	485188	485195	25 %	50 %	0 %	25 %	16763811
10239	NC_003197	GCC	2	6	485252	485257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16763811
10240	NC_003197	CTG	2	6	485270	485275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16763811
10241	NC_003197	ATG	2	6	485318	485323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16763812
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10243	NC_003197	ACC	2	6	485360	485365	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16763812
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10491	NC_003197	CGCGCC	2	12	496155	496166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16763823
10492	NC_003197	GAA	2	6	496173	496178	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16763823
10493	NC_003197	GTG	2	6	496179	496184	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16763823
10494	NC_003197	CAGAAT	2	12	496305	496316	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	16763823
10495	NC_003197	CAT	3	9	496359	496367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16763823
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10499	NC_003197	CGT	2	6	496575	496580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16763823
10500	NC_003197	GCG	2	6	496655	496660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16763823

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