MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sulfolobus tokodaii str. 7 chromosome

Total Repeats: 65471

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_003106	TTG	2	6	152862	152867	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15920310
3502	NC_003106	AGC	3	9	153010	153018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15920310
3503	NC_003106	T	6	6	153038	153043	0 %	100 %	0 %	0 %	15920310
3504	NC_003106	ATA	2	6	153099	153104	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3505	NC_003106	A	6	6	153119	153124	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3506	NC_003106	TAG	2	6	153140	153145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15920311
3507	NC_003106	A	6	6	153156	153161	100 %	0 %	0 %	0 %	15920311
3508	NC_003106	ATA	2	6	153188	153193	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15920311
3509	NC_003106	TGC	2	6	153199	153204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15920311
3510	NC_003106	CAG	2	6	153210	153215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15920311
3511	NC_003106	AGA	2	6	153238	153243	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15920311
3512	NC_003106	A	6	6	153274	153279	100 %	0 %	0 %	0 %	15920311
3513	NC_003106	TAA	2	6	153298	153303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15920311
3514	NC_003106	A	6	6	153396	153401	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3515	NC_003106	TGC	2	6	153410	153415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3516	NC_003106	TAA	2	6	153431	153436	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3517	NC_003106	ATG	2	6	153462	153467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15920312
3518	NC_003106	ACC	2	6	153469	153474	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15920312
3519	NC_003106	AGT	2	6	153502	153507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15920312
3520	NC_003106	CTTT	2	8	153531	153538	0 %	75 %	0 %	25 %	15920312
3521	NC_003106	AAT	3	9	153539	153547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15920312
3522	NC_003106	TTC	2	6	153562	153567	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15920312
3523	NC_003106	ATGA	2	8	153606	153613	50 %	25 %	25 %	0 %	15920312
3524	NC_003106	ATTC	2	8	153637	153644	25 %	50 %	0 %	25 %	15920312
3525	NC_003106	AGTA	2	8	153718	153725	50 %	25 %	25 %	0 %	15920312
3526	NC_003106	GCT	2	6	153728	153733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15920312
3527	NC_003106	CCATG	2	10	153734	153743	20 %	20 %	20 %	40 %	15920312
3528	NC_003106	AGC	2	6	153793	153798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15920312
3529	NC_003106	ACC	2	6	153844	153849	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15920312
3530	NC_003106	TGG	2	6	153865	153870	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15920312
3531	NC_003106	TGG	2	6	153886	153891	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15920312
3532	NC_003106	CCA	2	6	153953	153958	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15920312
3533	NC_003106	ATT	2	6	154021	154026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15920312
3534	NC_003106	AAT	2	6	154150	154155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15920312
3535	NC_003106	ACCAAT	2	12	154237	154248	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	15920312
3536	NC_003106	CT	3	6	154269	154274	0 %	50 %	0 %	50 %	15920312
3537	NC_003106	TA	3	6	154314	154319	50 %	50 %	0 %	0 %	15920312
3538	NC_003106	TCCC	2	8	154325	154332	0 %	25 %	0 %	75 %	15920312
3539	NC_003106	TTTA	2	8	154333	154340	25 %	75 %	0 %	0 %	15920312
3540	NC_003106	CTC	2	6	154373	154378	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15920312
3541	NC_003106	GTC	2	6	154411	154416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15920312
3542	NC_003106	CT	3	6	154445	154450	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3543	NC_003106	AT	3	6	154473	154478	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3544	NC_003106	T	6	6	154500	154505	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3545	NC_003106	TTA	2	6	154512	154517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3546	NC_003106	TTAT	2	8	154557	154564	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3547	NC_003106	TAC	2	6	154596	154601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3548	NC_003106	ACT	2	6	154602	154607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3549	NC_003106	TTA	2	6	154637	154642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3550	NC_003106	AAT	2	6	154645	154650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3551	NC_003106	TAT	2	6	154670	154675	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3552	NC_003106	TAG	2	6	154744	154749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15920313
3553	NC_003106	TGGA	2	8	154760	154767	25 %	25 %	50 %	0 %	15920313
3554	NC_003106	AT	3	6	154770	154775	50 %	50 %	0 %	0 %	15920313
3555	NC_003106	TAT	2	6	154858	154863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15920313
3556	NC_003106	TCC	2	6	154877	154882	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15920313
3557	NC_003106	GTT	2	6	154902	154907	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15920313
3558	NC_003106	TAG	2	6	154918	154923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15920313
3559	NC_003106	TAA	2	6	154966	154971	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15920313
3560	NC_003106	TAA	2	6	155020	155025	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15920313
3561	NC_003106	AT	3	6	155094	155099	50 %	50 %	0 %	0 %	15920313
3562	NC_003106	A	6	6	155197	155202	100 %	0 %	0 %	0 %	15920313
3563	NC_003106	A	7	7	155264	155270	100 %	0 %	0 %	0 %	15920314
3564	NC_003106	GTA	2	6	155271	155276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15920314
3565	NC_003106	CTG	2	6	155350	155355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15920314
3566	NC_003106	ACTT	2	8	155370	155377	25 %	50 %	0 %	25 %	15920314
3567	NC_003106	CTA	2	6	155414	155419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15920314
3568	NC_003106	GCT	2	6	155472	155477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15920314
3569	NC_003106	AAT	3	9	155483	155491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15920314
3570	NC_003106	AGT	2	6	155519	155524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15920314
3571	NC_003106	AGA	2	6	155529	155534	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15920314
3572	NC_003106	TCC	2	6	155618	155623	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15920314
3573	NC_003106	AGA	2	6	155633	155638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15920314
3574	NC_003106	ATG	2	6	155679	155684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15920314
3575	NC_003106	GCT	2	6	155688	155693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15920314
3576	NC_003106	GTGCTT	2	12	155716	155727	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	15920314
3577	NC_003106	GCT	2	6	155856	155861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15920314
3578	NC_003106	CAG	2	6	155875	155880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15920314
3579	NC_003106	AGT	2	6	155954	155959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15920314
3580	NC_003106	TAT	2	6	155997	156002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15920314
3581	NC_003106	CAC	2	6	156096	156101	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15920314
3582	NC_003106	TAC	2	6	156157	156162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15920314
3583	NC_003106	TGG	2	6	156284	156289	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15920314
3584	NC_003106	GTA	2	6	156330	156335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15920314
3585	NC_003106	ATAC	2	8	156340	156347	50 %	25 %	0 %	25 %	15920314
3586	NC_003106	TTG	2	6	156352	156357	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15920314
3587	NC_003106	AAG	2	6	156557	156562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15920314
3588	NC_003106	CCA	2	6	156576	156581	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15920314
3589	NC_003106	ATGG	2	8	156597	156604	25 %	25 %	50 %	0 %	15920314
3590	NC_003106	TAA	2	6	156643	156648	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15920314
3591	NC_003106	TA	3	6	156672	156677	50 %	50 %	0 %	0 %	15920314
3592	NC_003106	GGA	2	6	156779	156784	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15920315
3593	NC_003106	GA	3	6	156783	156788	50 %	0 %	50 %	0 %	15920315
3594	NC_003106	AG	3	6	156791	156796	50 %	0 %	50 %	0 %	15920315
3595	NC_003106	AGA	2	6	156800	156805	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15920315
3596	NC_003106	ACA	3	9	156806	156814	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15920315
3597	NC_003106	AAG	2	6	156816	156821	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15920315
3598	NC_003106	T	6	6	156828	156833	0 %	100 %	0 %	0 %	15920315
3599	NC_003106	CAC	2	6	156868	156873	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15920315
3600	NC_003106	GGA	2	6	156918	156923	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15920315
3601	NC_003106	TAG	2	6	156925	156930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15920315
3602	NC_003106	CTC	2	6	156972	156977	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15920315
3603	NC_003106	CAA	2	6	157002	157007	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15920315
3604	NC_003106	ACAA	2	8	157010	157017	75 %	0 %	0 %	25 %	15920315
3605	NC_003106	TAAT	2	8	157018	157025	50 %	50 %	0 %	0 %	15920315
3606	NC_003106	TTC	2	6	157116	157121	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15920315
3607	NC_003106	A	6	6	157134	157139	100 %	0 %	0 %	0 %	15920315
3608	NC_003106	GA	3	6	157142	157147	50 %	0 %	50 %	0 %	15920315
3609	NC_003106	TAG	2	6	157216	157221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15920315
3610	NC_003106	CTTA	2	8	157262	157269	25 %	50 %	0 %	25 %	15920315
3611	NC_003106	CTA	2	6	157291	157296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15920315
3612	NC_003106	AGT	2	6	157298	157303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15920315
3613	NC_003106	GGCT	2	8	157305	157312	0 %	25 %	50 %	25 %	15920315
3614	NC_003106	CAG	2	6	157351	157356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15920315
3615	NC_003106	TTC	2	6	157368	157373	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15920315
3616	NC_003106	ATA	2	6	157395	157400	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15920315
3617	NC_003106	GA	3	6	157449	157454	50 %	0 %	50 %	0 %	15920315
3618	NC_003106	AAAAG	2	10	157475	157484	80 %	0 %	20 %	0 %	15920315
3619	NC_003106	TAC	2	6	157500	157505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15920315
3620	NC_003106	GTG	2	6	157535	157540	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15920315
3621	NC_003106	TA	3	6	157555	157560	50 %	50 %	0 %	0 %	15920315
3622	NC_003106	TAAT	2	8	157651	157658	50 %	50 %	0 %	0 %	15920315
3623	NC_003106	CAC	2	6	157669	157674	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15920315
3624	NC_003106	AAT	2	6	157695	157700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15920315
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