MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sulfolobus tokodaii str. 7 chromosome

Total Repeats: 65471

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_003106	CTT	2	6	609764	609769	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15920845
15002	NC_003106	GAG	2	6	609885	609890	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15920845
15003	NC_003106	T	6	6	609928	609933	0 %	100 %	0 %	0 %	15920845
15004	NC_003106	AAT	2	6	609934	609939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15920845
15005	NC_003106	TA	3	6	609970	609975	50 %	50 %	0 %	0 %	15920845
15006	NC_003106	AT	3	6	610064	610069	50 %	50 %	0 %	0 %	15920845
15007	NC_003106	TCT	2	6	610105	610110	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15920845
15008	NC_003106	T	7	7	610158	610164	0 %	100 %	0 %	0 %	15920845
15009	NC_003106	ATC	2	6	610210	610215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15920845
15010	NC_003106	AGA	2	6	610222	610227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15920845
15011	NC_003106	AAGT	2	8	610233	610240	50 %	25 %	25 %	0 %	15920845
15012	NC_003106	TCC	2	6	610324	610329	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15920845
15013	NC_003106	ATG	2	6	610393	610398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15920845
15014	NC_003106	ATAG	2	8	610401	610408	50 %	25 %	25 %	0 %	15920845
15015	NC_003106	TCT	2	6	610490	610495	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15920845
15016	NC_003106	TCA	2	6	610532	610537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15920845
15017	NC_003106	AGT	2	6	610583	610588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15920845
15018	NC_003106	TTG	2	6	610638	610643	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15920845
15019	NC_003106	ATT	2	6	610661	610666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15920845
15020	NC_003106	TTTC	2	8	610752	610759	0 %	75 %	0 %	25 %	15920845
15021	NC_003106	TAA	2	6	610854	610859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15920845
15022	NC_003106	ATAG	2	8	610915	610922	50 %	25 %	25 %	0 %	15920845
15023	NC_003106	TCT	2	6	611045	611050	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15920845
15024	NC_003106	TAA	2	6	611178	611183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15920845
15025	NC_003106	AAC	2	6	611260	611265	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15920845
15026	NC_003106	TCT	2	6	611367	611372	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15920845
15027	NC_003106	TCCT	2	8	611374	611381	0 %	50 %	0 %	50 %	15920845
15028	NC_003106	CT	3	6	611380	611385	0 %	50 %	0 %	50 %	15920845
15029	NC_003106	AAG	2	6	611488	611493	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15920845
15030	NC_003106	GCT	2	6	611531	611536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15920845
15031	NC_003106	A	6	6	611539	611544	100 %	0 %	0 %	0 %	15920845
15032	NC_003106	TA	3	6	611674	611679	50 %	50 %	0 %	0 %	15920845
15033	NC_003106	GTA	2	6	611741	611746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15920845
15034	NC_003106	TTCTC	2	10	611749	611758	0 %	60 %	0 %	40 %	15920845
15035	NC_003106	T	6	6	611779	611784	0 %	100 %	0 %	0 %	15920845
15036	NC_003106	TTC	2	6	611792	611797	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15920845
15037	NC_003106	ATT	2	6	611800	611805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15920845
15038	NC_003106	ATT	2	6	611891	611896	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15920845
15039	NC_003106	CT	3	6	611907	611912	0 %	50 %	0 %	50 %	15920845
15040	NC_003106	TTC	2	6	612030	612035	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15920845
15041	NC_003106	TGTC	2	8	612099	612106	0 %	50 %	25 %	25 %	15920845
15042	NC_003106	CATA	2	8	612190	612197	50 %	25 %	0 %	25 %	15920845
15043	NC_003106	TAA	2	6	612202	612207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15044	NC_003106	AT	3	6	612214	612219	50 %	50 %	0 %	0 %	15920846
15045	NC_003106	TAA	2	6	612275	612280	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15920846
15046	NC_003106	TCA	2	6	612352	612357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15920846
15047	NC_003106	TCC	2	6	612414	612419	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15920846
15048	NC_003106	AAT	2	6	612422	612427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15920846
15049	NC_003106	TCA	2	6	612466	612471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15920846
15050	NC_003106	CAC	2	6	612581	612586	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15920846
15051	NC_003106	CTC	2	6	612593	612598	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15920846
15052	NC_003106	A	6	6	612610	612615	100 %	0 %	0 %	0 %	15920846
15053	NC_003106	AAC	2	6	612651	612656	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15920846
15054	NC_003106	CCTT	2	8	612657	612664	0 %	50 %	0 %	50 %	15920846
15055	NC_003106	AAATA	2	10	612677	612686	80 %	20 %	0 %	0 %	15920846
15056	NC_003106	T	6	6	612696	612701	0 %	100 %	0 %	0 %	15920846
15057	NC_003106	TTC	2	6	612732	612737	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15920846
15058	NC_003106	TC	3	6	612747	612752	0 %	50 %	0 %	50 %	15920846
15059	NC_003106	ACA	2	6	612904	612909	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15920846
15060	NC_003106	TCT	2	6	612949	612954	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15920846
15061	NC_003106	GA	3	6	612967	612972	50 %	0 %	50 %	0 %	15920846
15062	NC_003106	TAT	2	6	613061	613066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15920846
15063	NC_003106	AAT	2	6	613220	613225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15920846
15064	NC_003106	GTT	2	6	613249	613254	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15920846
15065	NC_003106	TAA	2	6	613315	613320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15920847
15066	NC_003106	TA	3	6	613330	613335	50 %	50 %	0 %	0 %	15920847
15067	NC_003106	ATA	2	6	613365	613370	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15920847
15068	NC_003106	AT	4	8	613583	613590	50 %	50 %	0 %	0 %	15920847
15069	NC_003106	TCT	2	6	613591	613596	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15920847
15070	NC_003106	ATG	2	6	613664	613669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15920847
15071	NC_003106	TCT	2	6	613789	613794	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15920847
15072	NC_003106	T	6	6	613821	613826	0 %	100 %	0 %	0 %	15920847
15073	NC_003106	CTT	2	6	613829	613834	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15920847
15074	NC_003106	TAA	2	6	613905	613910	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15920847
15075	NC_003106	CATA	2	8	613949	613956	50 %	25 %	0 %	25 %	15920847
15076	NC_003106	ATT	2	6	614034	614039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15920847
15077	NC_003106	TTC	2	6	614109	614114	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15920847
15078	NC_003106	TCT	2	6	614134	614139	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15920847
15079	NC_003106	TCA	2	6	614186	614191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15920847
15080	NC_003106	ATC	2	6	614232	614237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15920847
15081	NC_003106	TTG	2	6	614273	614278	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15920847
15082	NC_003106	T	6	6	614356	614361	0 %	100 %	0 %	0 %	15920847
15083	NC_003106	TTA	2	6	614411	614416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15920847
15084	NC_003106	CAA	2	6	614450	614455	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15920847
15085	NC_003106	CTT	2	6	614468	614473	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15920847
15086	NC_003106	AATT	2	8	614564	614571	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15087	NC_003106	AT	4	8	614631	614638	50 %	50 %	0 %	0 %	15920848
15088	NC_003106	A	6	6	614639	614644	100 %	0 %	0 %	0 %	15920848
15089	NC_003106	TAA	2	6	614775	614780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15920848
15090	NC_003106	A	6	6	614805	614810	100 %	0 %	0 %	0 %	15920848
15091	NC_003106	TGA	2	6	614812	614817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15920848
15092	NC_003106	AG	3	6	614836	614841	50 %	0 %	50 %	0 %	15920848
15093	NC_003106	TAG	2	6	614844	614849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15920848
15094	NC_003106	TAG	2	6	614856	614861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15920848
15095	NC_003106	A	6	6	614888	614893	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15096	NC_003106	TGAT	2	8	614920	614927	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
15097	NC_003106	TAT	2	6	614994	614999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15098	NC_003106	AT	3	6	615028	615033	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15099	NC_003106	AGT	2	6	615129	615134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15100	NC_003106	CTT	2	6	615144	615149	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15101	NC_003106	GTTT	2	8	615187	615194	0 %	75 %	25 %	0 %	15920849
15102	NC_003106	GA	3	6	615213	615218	50 %	0 %	50 %	0 %	15920849
15103	NC_003106	T	6	6	615277	615282	0 %	100 %	0 %	0 %	15920849
15104	NC_003106	AGAC	2	8	615293	615300	50 %	0 %	25 %	25 %	15920849
15105	NC_003106	CCA	2	6	615325	615330	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15920849
15106	NC_003106	T	6	6	615333	615338	0 %	100 %	0 %	0 %	15920849
15107	NC_003106	CTC	2	6	615348	615353	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15920849
15108	NC_003106	TCT	2	6	615442	615447	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15920849
15109	NC_003106	ATAAC	2	10	615577	615586	60 %	20 %	0 %	20 %	15920849
15110	NC_003106	CAG	2	6	615587	615592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15920849
15111	NC_003106	ATC	2	6	615597	615602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15920849
15112	NC_003106	TGTC	2	8	615644	615651	0 %	50 %	25 %	25 %	15920850
15113	NC_003106	TTC	2	6	615737	615742	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15920850
15114	NC_003106	TA	3	6	615749	615754	50 %	50 %	0 %	0 %	15920850
15115	NC_003106	TTTA	2	8	615779	615786	25 %	75 %	0 %	0 %	15920850
15116	NC_003106	CTA	2	6	615796	615801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15920850
15117	NC_003106	CAC	2	6	615871	615876	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15920850
15118	NC_003106	TTTC	2	8	615946	615953	0 %	75 %	0 %	25 %	15920850
15119	NC_003106	TGG	2	6	616004	616009	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15920850
15120	NC_003106	CTT	3	9	616120	616128	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15920850
15121	NC_003106	TCA	2	6	616206	616211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15920850
15122	NC_003106	CT	3	6	616227	616232	0 %	50 %	0 %	50 %	15920850
15123	NC_003106	ATT	2	6	616350	616355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15920850
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15125	NC_003106	CTT	2	6	616379	616384	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15920850
15126	NC_003106	TCT	2	6	616487	616492	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15920850
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15262	NC_003106	AATA	2	8	621954	621961	75 %	25 %	0 %	0 %	15920857
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15269	NC_003106	TTAC	2	8	622216	622223	25 %	50 %	0 %	25 %	15920858
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15373	NC_003106	CAT	2	6	626176	626181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15920861
15374	NC_003106	AGT	2	6	626375	626380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15920861
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15377	NC_003106	AGA	2	6	626440	626445	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15920861
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15402	NC_003106	AGATT	2	10	627706	627715	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
15403	NC_003106	TCT	2	6	627780	627785	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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15497	NC_003106	AGT	2	6	630575	630580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15920865
15498	NC_003106	TAAA	2	8	630796	630803	75 %	25 %	0 %	0 %	15920865
15499	NC_003106	AAAT	2	8	630864	630871	75 %	25 %	0 %	0 %	15920865
15500	NC_003106	TCC	2	6	630907	630912	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15920865

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