MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sulfolobus tokodaii str. 7 chromosome

Total Repeats: 65471

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12502	NC_003106	ATT	2	6	509481	509486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15920728
12503	NC_003106	T	6	6	509516	509521	0 %	100 %	0 %	0 %	15920728
12504	NC_003106	TCT	2	6	509551	509556	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15920728
12505	NC_003106	AATT	2	8	509582	509589	50 %	50 %	0 %	0 %	15920728
12506	NC_003106	AT	3	6	509636	509641	50 %	50 %	0 %	0 %	15920729
12507	NC_003106	AAT	2	6	509672	509677	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15920729
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12509	NC_003106	GAT	2	6	509749	509754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15920729
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12511	NC_003106	ATG	2	6	509808	509813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15920729
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12514	NC_003106	ATTT	2	8	509900	509907	25 %	75 %	0 %	0 %	15920729
12515	NC_003106	AGA	2	6	509928	509933	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15920729
12516	NC_003106	TCT	2	6	509949	509954	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15920729
12517	NC_003106	CAT	2	6	510013	510018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15920729
12518	NC_003106	GAC	2	6	510028	510033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12519	NC_003106	TTA	2	6	510067	510072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12520	NC_003106	GCA	2	6	510150	510155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12521	NC_003106	ATA	2	6	510164	510169	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12522	NC_003106	CTT	2	6	510223	510228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12523	NC_003106	AT	4	8	510248	510255	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12524	NC_003106	T	6	6	510255	510260	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12525	NC_003106	AGA	2	6	510288	510293	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12526	NC_003106	CAA	2	6	510322	510327	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12527	NC_003106	TC	3	6	510377	510382	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12528	NC_003106	A	6	6	510384	510389	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12533	NC_003106	ATTT	2	8	510485	510492	25 %	75 %	0 %	0 %	15920730
12534	NC_003106	TGC	2	6	510510	510515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15920730
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12538	NC_003106	TCTT	2	8	510579	510586	0 %	75 %	0 %	25 %	15920730
12539	NC_003106	TAC	2	6	510636	510641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12540	NC_003106	CTG	2	6	510659	510664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12541	NC_003106	CTT	2	6	510674	510679	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12542	NC_003106	CCA	2	6	510725	510730	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12543	NC_003106	ATT	2	6	510738	510743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12544	NC_003106	T	6	6	510742	510747	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12545	NC_003106	TAA	2	6	510772	510777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15920731
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12557	NC_003106	GTA	2	6	511047	511052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15920731
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12564	NC_003106	CT	3	6	511414	511419	0 %	50 %	0 %	50 %	15920731
12565	NC_003106	TG	3	6	511431	511436	0 %	50 %	50 %	0 %	15920731
12566	NC_003106	T	6	6	511528	511533	0 %	100 %	0 %	0 %	15920731
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12606	NC_003106	T	7	7	513060	513066	0 %	100 %	0 %	0 %	15920732
12607	NC_003106	TTCT	2	8	513090	513097	0 %	75 %	0 %	25 %	15920732
12608	NC_003106	TCTAA	2	10	513104	513113	40 %	40 %	0 %	20 %	15920732
12609	NC_003106	TAA	2	6	513184	513189	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15920732
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12612	NC_003106	TTA	2	6	513215	513220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15920732
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12618	NC_003106	TG	3	6	513478	513483	0 %	50 %	50 %	0 %	15920733
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12750	NC_003106	ATATT	2	10	519010	519019	40 %	60 %	0 %	0 %	15920739
12751	NC_003106	AAT	2	6	519065	519070	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15920739
12752	NC_003106	TAA	2	6	519104	519109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15920739
12753	NC_003106	ATGG	2	8	519135	519142	25 %	25 %	50 %	0 %	15920739
12754	NC_003106	AGA	2	6	519180	519185	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15920739
12755	NC_003106	TTC	2	6	519203	519208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15920739
12756	NC_003106	TAA	2	6	519214	519219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15920739
12757	NC_003106	TAT	2	6	519271	519276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15920739
12758	NC_003106	GCT	2	6	519285	519290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15920739
12759	NC_003106	ACA	2	6	519360	519365	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15920739
12760	NC_003106	AGA	2	6	519419	519424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15920739
12761	NC_003106	GGA	2	6	519486	519491	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15920739
12762	NC_003106	ATA	2	6	519552	519557	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15920739
12763	NC_003106	GTT	2	6	519558	519563	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15920739
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12765	NC_003106	TAT	2	6	519592	519597	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15920739
12766	NC_003106	ACT	2	6	519630	519635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15920739
12767	NC_003106	AATG	2	8	519674	519681	50 %	25 %	25 %	0 %	15920739
12768	NC_003106	ATG	2	6	519714	519719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15920739
12769	NC_003106	ATT	2	6	519770	519775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15920739
12770	NC_003106	GAA	2	6	519778	519783	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15920739
12771	NC_003106	CAA	2	6	519847	519852	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15920739
12772	NC_003106	GAG	2	6	519906	519911	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15920739
12773	NC_003106	AG	3	6	519947	519952	50 %	0 %	50 %	0 %	15920739
12774	NC_003106	GTT	2	6	519971	519976	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15920739
12775	NC_003106	AAAG	2	8	520005	520012	75 %	0 %	25 %	0 %	15920739
12776	NC_003106	GAA	2	6	520025	520030	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15920739
12777	NC_003106	CAG	2	6	520057	520062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15920739
12778	NC_003106	GA	3	6	520070	520075	50 %	0 %	50 %	0 %	15920739
12779	NC_003106	TGG	2	6	520087	520092	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15920739
12780	NC_003106	ACA	2	6	520100	520105	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15920739
12781	NC_003106	ATA	2	6	520112	520117	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15920739
12782	NC_003106	A	6	6	520120	520125	100 %	0 %	0 %	0 %	15920740
12783	NC_003106	ATATT	2	10	520158	520167	40 %	60 %	0 %	0 %	15920740
12784	NC_003106	AGA	2	6	520181	520186	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15920740
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12786	NC_003106	CTT	2	6	520216	520221	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15920740
12787	NC_003106	CTT	2	6	520224	520229	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15920740
12788	NC_003106	ATT	2	6	520333	520338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15920740
12789	NC_003106	TA	3	6	520350	520355	50 %	50 %	0 %	0 %	15920740
12790	NC_003106	AT	3	6	520363	520368	50 %	50 %	0 %	0 %	15920740
12791	NC_003106	ATA	2	6	520398	520403	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15920740
12792	NC_003106	AG	3	6	520444	520449	50 %	0 %	50 %	0 %	15920740
12793	NC_003106	ATAA	2	8	520466	520473	75 %	25 %	0 %	0 %	15920740
12794	NC_003106	GTA	3	9	520551	520559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15920740
12795	NC_003106	TC	3	6	520582	520587	0 %	50 %	0 %	50 %	15920740
12796	NC_003106	ATC	2	6	520603	520608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15920740
12797	NC_003106	TAT	2	6	520636	520641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15920740
12798	NC_003106	TCA	2	6	520643	520648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15920740
12799	NC_003106	AAT	2	6	520676	520681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15920740
12800	NC_003106	TCCA	2	8	520722	520729	25 %	25 %	0 %	50 %	15920740
12801	NC_003106	TTA	2	6	520737	520742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15920740
12802	NC_003106	ATA	2	6	520798	520803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15920740
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12806	NC_003106	TTC	2	6	521092	521097	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15920740
12807	NC_003106	ATC	2	6	521113	521118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15920740
12808	NC_003106	ATAATT	2	12	521123	521134	50 %	50 %	0 %	0 %	15920740
12809	NC_003106	TAAT	2	8	521147	521154	50 %	50 %	0 %	0 %	15920740
12810	NC_003106	TAG	2	6	521158	521163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15920740
12811	NC_003106	T	7	7	521187	521193	0 %	100 %	0 %	0 %	15920740
12812	NC_003106	ATTT	2	8	521238	521245	25 %	75 %	0 %	0 %	15920740
12813	NC_003106	TAA	3	9	521279	521287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15920740
12814	NC_003106	A	6	6	521343	521348	100 %	0 %	0 %	0 %	15920740
12815	NC_003106	CTC	2	6	521408	521413	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15920741
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12817	NC_003106	AAT	2	6	521562	521567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15920741
12818	NC_003106	TCT	2	6	521575	521580	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15920741
12819	NC_003106	CTT	2	6	521582	521587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15920741
12820	NC_003106	GTA	2	6	521639	521644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15920741
12821	NC_003106	TCT	3	9	521686	521694	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15920741
12822	NC_003106	TCTA	2	8	521751	521758	25 %	50 %	0 %	25 %	15920741
12823	NC_003106	ACT	2	6	521764	521769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15920741
12824	NC_003106	TCT	3	9	521770	521778	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15920741
12825	NC_003106	GAT	2	6	521883	521888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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12827	NC_003106	TAA	2	6	521931	521936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15920742
12828	NC_003106	ATT	2	6	521993	521998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15920742
12829	NC_003106	CAT	2	6	522006	522011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15920742
12830	NC_003106	ATGT	2	8	522041	522048	25 %	50 %	25 %	0 %	15920742
12831	NC_003106	AAT	2	6	522113	522118	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15920742
12832	NC_003106	TCC	2	6	522161	522166	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15920742
12833	NC_003106	TCT	2	6	522170	522175	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15920742
12834	NC_003106	TC	3	6	522178	522183	0 %	50 %	0 %	50 %	15920742
12835	NC_003106	AAT	2	6	522233	522238	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15920742
12836	NC_003106	ATA	2	6	522301	522306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15920742
12837	NC_003106	TC	3	6	522345	522350	0 %	50 %	0 %	50 %	15920742
12838	NC_003106	CTC	2	6	522366	522371	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15920742
12839	NC_003106	CTAA	2	8	522389	522396	50 %	25 %	0 %	25 %	15920742
12840	NC_003106	TAA	2	6	522411	522416	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15920742
12841	NC_003106	AT	3	6	522470	522475	50 %	50 %	0 %	0 %	15920743
12842	NC_003106	ATT	2	6	522490	522495	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15920743
12843	NC_003106	TCT	2	6	522505	522510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15920743
12844	NC_003106	TTCCT	2	10	522531	522540	0 %	60 %	0 %	40 %	15920743
12845	NC_003106	TA	3	6	522589	522594	50 %	50 %	0 %	0 %	15920743
12846	NC_003106	TAT	2	6	522600	522605	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15920743
12847	NC_003106	CTAT	2	8	522652	522659	25 %	50 %	0 %	25 %	15920743
12848	NC_003106	CAT	2	6	522668	522673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15920743
12849	NC_003106	TCA	2	6	522706	522711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15920743
12850	NC_003106	TAA	2	6	522722	522727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15920743
12851	NC_003106	TTG	2	6	522755	522760	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15920743
12852	NC_003106	ACT	2	6	522799	522804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15920743
12853	NC_003106	TAT	2	6	522824	522829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15920743
12854	NC_003106	TTA	2	6	522839	522844	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15920743
12855	NC_003106	ATG	2	6	522887	522892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15920743
12856	NC_003106	TTGA	2	8	522914	522921	25 %	50 %	25 %	0 %	15920743
12857	NC_003106	CAA	2	6	522959	522964	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15920743
12858	NC_003106	TCT	2	6	522985	522990	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15920743
12859	NC_003106	TTTATA	2	12	522996	523007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15920743
12860	NC_003106	GAA	2	6	523088	523093	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15920743
12861	NC_003106	TA	3	6	523118	523123	50 %	50 %	0 %	0 %	15920743
12862	NC_003106	T	6	6	523124	523129	0 %	100 %	0 %	0 %	15920743
12863	NC_003106	GT	3	6	523182	523187	0 %	50 %	50 %	0 %	15920743
12864	NC_003106	T	7	7	523189	523195	0 %	100 %	0 %	0 %	15920743
12865	NC_003106	TC	3	6	523203	523208	0 %	50 %	0 %	50 %	15920743
12866	NC_003106	T	6	6	523233	523238	0 %	100 %	0 %	0 %	15920743
12867	NC_003106	CAT	2	6	523241	523246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15920743
12868	NC_003106	AT	3	6	523274	523279	50 %	50 %	0 %	0 %	15920743
12869	NC_003106	TATAT	2	10	523305	523314	40 %	60 %	0 %	0 %	15920743
12870	NC_003106	TAC	2	6	523331	523336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15920743
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12872	NC_003106	GTA	2	6	523414	523419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15920743
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12998	NC_003106	CTT	2	6	528822	528827	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15920749
12999	NC_003106	TA	3	6	528845	528850	50 %	50 %	0 %	0 %	15920749
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