MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sulfolobus tokodaii str. 7 chromosome

Total Repeats: 65471

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9001	NC_003106	TCC	2	6	369680	369685	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15920549
9002	NC_003106	AGTA	2	8	369704	369711	50 %	25 %	25 %	0 %	15920549
9003	NC_003106	TA	3	6	369722	369727	50 %	50 %	0 %	0 %	15920549
9004	NC_003106	T	6	6	369816	369821	0 %	100 %	0 %	0 %	15920549
9005	NC_003106	TTC	2	6	369893	369898	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15920549
9006	NC_003106	CTTT	2	8	369912	369919	0 %	75 %	0 %	25 %	15920549
9007	NC_003106	AAT	2	6	369955	369960	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15920549
9008	NC_003106	TCTTAA	2	12	369998	370009	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	15920549
9009	NC_003106	T	6	6	370077	370082	0 %	100 %	0 %	0 %	15920549
9010	NC_003106	ATA	2	6	370102	370107	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15920549
9011	NC_003106	TAC	3	9	370142	370150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15920549
9012	NC_003106	TGA	2	6	370181	370186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15920549
9013	NC_003106	TTA	2	6	370260	370265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15920549
9014	NC_003106	TCT	3	9	370302	370310	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15920549
9015	NC_003106	CCA	2	6	370326	370331	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15920549
9016	NC_003106	ATT	2	6	370365	370370	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15920549
9017	NC_003106	TTC	2	6	370440	370445	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15920549
9018	NC_003106	ACA	2	6	370524	370529	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15920549
9019	NC_003106	CT	3	6	370566	370571	0 %	50 %	0 %	50 %	15920549
9020	NC_003106	TAAA	2	8	370654	370661	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9021	NC_003106	AT	3	6	370698	370703	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9022	NC_003106	TAAT	2	8	370706	370713	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9023	NC_003106	AAT	3	9	370711	370719	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9024	NC_003106	A	6	6	370725	370730	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9025	NC_003106	ATA	2	6	370746	370751	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9026	NC_003106	TTGA	2	8	370793	370800	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
9027	NC_003106	TAT	2	6	370838	370843	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9028	NC_003106	CTT	2	6	370844	370849	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9029	NC_003106	TTACT	2	10	370919	370928	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
9030	NC_003106	T	6	6	370928	370933	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9031	NC_003106	TA	3	6	370972	370977	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9032	NC_003106	TATAT	2	10	371058	371067	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
9033	NC_003106	TTAA	2	8	371068	371075	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9034	NC_003106	TAC	2	6	371162	371167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9035	NC_003106	TTA	2	6	371175	371180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9036	NC_003106	TAT	2	6	371244	371249	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15920550
9037	NC_003106	GAA	2	6	371262	371267	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15920550
9038	NC_003106	ATA	2	6	371288	371293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15920550
9039	NC_003106	ATAG	2	8	371306	371313	50 %	25 %	25 %	0 %	15920550
9040	NC_003106	TAC	2	6	371367	371372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15920550
9041	NC_003106	AGT	2	6	371406	371411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15920550
9042	NC_003106	AT	3	6	371485	371490	50 %	50 %	0 %	0 %	15920550
9043	NC_003106	ATATT	2	10	371492	371501	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
9044	NC_003106	TCT	2	6	371534	371539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9045	NC_003106	TA	4	8	371565	371572	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9046	NC_003106	GGT	2	6	371622	371627	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9047	NC_003106	TAA	2	6	371642	371647	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15920551
9048	NC_003106	TCC	2	6	371672	371677	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15920551
9049	NC_003106	TGA	2	6	371693	371698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15920551
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9051	NC_003106	AGA	2	6	371789	371794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15920551
9052	NC_003106	AAG	2	6	371804	371809	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15920551
9053	NC_003106	ATTG	2	8	371865	371872	25 %	50 %	25 %	0 %	15920551
9054	NC_003106	AAAGAC	2	12	371874	371885	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	15920551
9055	NC_003106	TCT	2	6	371967	371972	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15920551
9056	NC_003106	ATAG	2	8	371973	371980	50 %	25 %	25 %	0 %	15920551
9057	NC_003106	AATG	2	8	371996	372003	50 %	25 %	25 %	0 %	15920551
9058	NC_003106	AG	3	6	372008	372013	50 %	0 %	50 %	0 %	15920551
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9061	NC_003106	GCA	2	6	372126	372131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15920551
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9064	NC_003106	AAG	2	6	372211	372216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15920551
9065	NC_003106	ATT	2	6	372348	372353	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15920551
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9068	NC_003106	TA	3	6	372420	372425	50 %	50 %	0 %	0 %	15920551
9069	NC_003106	CTTA	2	8	372431	372438	25 %	50 %	0 %	25 %	15920551
9070	NC_003106	ATG	2	6	372439	372444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15920551
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9074	NC_003106	TCTT	2	8	372595	372602	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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9082	NC_003106	T	6	6	372816	372821	0 %	100 %	0 %	0 %	15920552
9083	NC_003106	TTTTAT	2	12	372826	372837	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	15920552
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9088	NC_003106	TAT	2	6	372981	372986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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9094	NC_003106	GGT	2	6	373213	373218	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15920554
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9097	NC_003106	ATA	2	6	373270	373275	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15920554
9098	NC_003106	TCCA	2	8	373347	373354	25 %	25 %	0 %	50 %	15920554
9099	NC_003106	T	6	6	373373	373378	0 %	100 %	0 %	0 %	15920554
9100	NC_003106	TC	3	6	373415	373420	0 %	50 %	0 %	50 %	15920554
9101	NC_003106	TAA	2	6	373428	373433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15920554
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9105	NC_003106	TAT	3	9	373689	373697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15920554
9106	NC_003106	TTC	2	6	373736	373741	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15920554
9107	NC_003106	TCT	2	6	373750	373755	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15920554
9108	NC_003106	TAC	2	6	373773	373778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15920554
9109	NC_003106	CAT	2	6	373787	373792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15920554
9110	NC_003106	CT	3	6	373857	373862	0 %	50 %	0 %	50 %	15920554
9111	NC_003106	ACT	2	6	373899	373904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15920554
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9113	NC_003106	CTA	2	6	373972	373977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15920554
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9122	NC_003106	TAGA	2	8	374403	374410	50 %	25 %	25 %	0 %	15920555
9123	NC_003106	TGG	2	6	374446	374451	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15920555
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9125	NC_003106	TAC	2	6	374488	374493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15920555
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