MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sulfolobus tokodaii str. 7 chromosome

Total Repeats: 65471

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
61501	NC_003106	ATT	2	6	2523132	2523137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15922851
61502	NC_003106	AAT	2	6	2523187	2523192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15922851
61503	NC_003106	TAT	2	6	2523252	2523257	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15922851
61504	NC_003106	AT	3	6	2523267	2523272	50 %	50 %	0 %	0 %	15922851
61505	NC_003106	ATAA	2	8	2523313	2523320	75 %	25 %	0 %	0 %	15922851
61506	NC_003106	TAG	2	6	2523322	2523327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15922851
61507	NC_003106	AG	3	6	2523387	2523392	50 %	0 %	50 %	0 %	15922851
61508	NC_003106	GCTAAT	2	12	2523400	2523411	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	15922851
61509	NC_003106	TAA	2	6	2523422	2523427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15922851
61510	NC_003106	AAAG	2	8	2523488	2523495	75 %	0 %	25 %	0 %	15922851
61511	NC_003106	CAG	2	6	2523515	2523520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15922851
61512	NC_003106	TAT	2	6	2523548	2523553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15922851
61513	NC_003106	AGT	2	6	2523592	2523597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15922851
61514	NC_003106	AAAT	2	8	2523599	2523606	75 %	25 %	0 %	0 %	15922851
61515	NC_003106	TAGAA	2	10	2523683	2523692	60 %	20 %	20 %	0 %	15922851
61516	NC_003106	AACC	2	8	2523694	2523701	50 %	0 %	0 %	50 %	15922851
61517	NC_003106	AAT	3	9	2523728	2523736	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15922851
61518	NC_003106	TAA	2	6	2523773	2523778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15922851
61519	NC_003106	AT	3	6	2523784	2523789	50 %	50 %	0 %	0 %	15922851
61520	NC_003106	ATA	2	6	2523898	2523903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15922851
61521	NC_003106	TAA	2	6	2523936	2523941	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15922851
61522	NC_003106	AGT	2	6	2523970	2523975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15922851
61523	NC_003106	TAA	2	6	2524031	2524036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15922851
61524	NC_003106	GAA	2	6	2524082	2524087	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15922851
61525	NC_003106	AG	3	6	2524113	2524118	50 %	0 %	50 %	0 %	15922851
61526	NC_003106	TAA	2	6	2524131	2524136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15922851
61527	NC_003106	TA	3	6	2524157	2524162	50 %	50 %	0 %	0 %	15922851
61528	NC_003106	AT	3	6	2524184	2524189	50 %	50 %	0 %	0 %	15922851
61529	NC_003106	ATA	2	6	2524227	2524232	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15922851
61530	NC_003106	TATT	2	8	2524241	2524248	25 %	75 %	0 %	0 %	15922851
61531	NC_003106	AG	3	6	2524270	2524275	50 %	0 %	50 %	0 %	15922851
61532	NC_003106	AAT	2	6	2524281	2524286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15922851
61533	NC_003106	ATA	2	6	2524386	2524391	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15922852
61534	NC_003106	ATA	2	6	2524400	2524405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15922852
61535	NC_003106	TTA	2	6	2524418	2524423	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15922852
61536	NC_003106	AT	3	6	2524425	2524430	50 %	50 %	0 %	0 %	15922852
61537	NC_003106	TA	3	6	2524446	2524451	50 %	50 %	0 %	0 %	15922852
61538	NC_003106	ATT	3	9	2524513	2524521	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15922852
61539	NC_003106	T	6	6	2524524	2524529	0 %	100 %	0 %	0 %	15922852
61540	NC_003106	T	6	6	2524547	2524552	0 %	100 %	0 %	0 %	15922852
61541	NC_003106	TAT	2	6	2524572	2524577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15922852
61542	NC_003106	TAA	2	6	2524607	2524612	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15922852
61543	NC_003106	AT	3	6	2524626	2524631	50 %	50 %	0 %	0 %	15922852
61544	NC_003106	A	6	6	2524635	2524640	100 %	0 %	0 %	0 %	15922852
61545	NC_003106	TGT	2	6	2524643	2524648	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15922852
61546	NC_003106	TACA	2	8	2524699	2524706	50 %	25 %	0 %	25 %	15922852
61547	NC_003106	ATT	2	6	2524729	2524734	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15922852
61548	NC_003106	TA	3	6	2524750	2524755	50 %	50 %	0 %	0 %	15922852
61549	NC_003106	TCA	2	6	2524803	2524808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15922852
61550	NC_003106	TTC	2	6	2524847	2524852	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61551	NC_003106	A	6	6	2524923	2524928	100 %	0 %	0 %	0 %	15922853
61552	NC_003106	A	6	6	2524936	2524941	100 %	0 %	0 %	0 %	15922853
61553	NC_003106	A	7	7	2524948	2524954	100 %	0 %	0 %	0 %	15922853
61554	NC_003106	TAA	2	6	2524957	2524962	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15922853
61555	NC_003106	AAAAG	2	10	2524970	2524979	80 %	0 %	20 %	0 %	15922853
61556	NC_003106	AAT	2	6	2525002	2525007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15922853
61557	NC_003106	TAT	2	6	2525020	2525025	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15922853
61558	NC_003106	AATA	2	8	2525053	2525060	75 %	25 %	0 %	0 %	15922853
61559	NC_003106	ATT	2	6	2525065	2525070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15922853
61560	NC_003106	ATAA	2	8	2525096	2525103	75 %	25 %	0 %	0 %	15922853
61561	NC_003106	TAT	2	6	2525148	2525153	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15922853
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61563	NC_003106	CTA	2	6	2525247	2525252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15922853
61564	NC_003106	AT	3	6	2525298	2525303	50 %	50 %	0 %	0 %	15922853
61565	NC_003106	ATT	2	6	2525314	2525319	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15922853
61566	NC_003106	TGT	2	6	2525347	2525352	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15922853
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61570	NC_003106	ATT	2	6	2525503	2525508	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15922853
61571	NC_003106	TAG	2	6	2525661	2525666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15922853
61572	NC_003106	TGA	2	6	2525703	2525708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15922853
61573	NC_003106	TAT	2	6	2525709	2525714	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15922853
61574	NC_003106	CATTAA	2	12	2525790	2525801	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	15922853
61575	NC_003106	AT	4	8	2525806	2525813	50 %	50 %	0 %	0 %	15922853
61576	NC_003106	T	7	7	2525881	2525887	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61577	NC_003106	CAA	2	6	2525932	2525937	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61578	NC_003106	ATT	2	6	2525938	2525943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61579	NC_003106	ACTCT	2	10	2525945	2525954	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
61580	NC_003106	TTC	2	6	2525995	2526000	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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61582	NC_003106	CAGCAA	2	12	2526082	2526093	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
61583	NC_003106	CAA	3	9	2526091	2526099	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61584	NC_003106	TAA	2	6	2526137	2526142	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61585	NC_003106	ATGA	2	8	2526193	2526200	50 %	25 %	25 %	0 %	15922854
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61587	NC_003106	TAT	2	6	2526248	2526253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15922854
61588	NC_003106	TTG	2	6	2526365	2526370	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15922854
61589	NC_003106	TAT	2	6	2526413	2526418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15922854
61590	NC_003106	ATG	2	6	2526434	2526439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15922854
61591	NC_003106	CTG	2	6	2526479	2526484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15922854
61592	NC_003106	AT	3	6	2526516	2526521	50 %	50 %	0 %	0 %	15922854
61593	NC_003106	GAA	2	6	2526612	2526617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15922854
61594	NC_003106	ATA	2	6	2526680	2526685	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15922855
61595	NC_003106	GTT	2	6	2526719	2526724	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15922855
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61597	NC_003106	TCT	2	6	2526737	2526742	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15922855
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61600	NC_003106	TTA	2	6	2526770	2526775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15922855
61601	NC_003106	AGTT	2	8	2526786	2526793	25 %	50 %	25 %	0 %	15922855
61602	NC_003106	AGAT	2	8	2526804	2526811	50 %	25 %	25 %	0 %	15922855
61603	NC_003106	CTA	2	6	2526831	2526836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15922855
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61605	NC_003106	TAT	2	6	2526897	2526902	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15922855
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61609	NC_003106	CTAT	2	8	2527011	2527018	25 %	50 %	0 %	25 %	15922855
61610	NC_003106	AT	3	6	2527061	2527066	50 %	50 %	0 %	0 %	15922855
61611	NC_003106	AT	3	6	2527191	2527196	50 %	50 %	0 %	0 %	15922856
61612	NC_003106	CAA	2	6	2527204	2527209	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15922856
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61615	NC_003106	GTAA	2	8	2527291	2527298	50 %	25 %	25 %	0 %	15922856
61616	NC_003106	TAA	2	6	2527323	2527328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15922856
61617	NC_003106	GTA	2	6	2527471	2527476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15922856
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61999	NC_003106	AT	3	6	2543250	2543255	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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