MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sulfolobus tokodaii str. 7 chromosome

Total Repeats: 65471

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
54501	NC_003106	ATA	2	6	2237010	2237015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54502	NC_003106	TTA	2	6	2237026	2237031	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54503	NC_003106	AAT	2	6	2237044	2237049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54504	NC_003106	AG	3	6	2237076	2237081	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
54505	NC_003106	TAT	3	9	2237137	2237145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54506	NC_003106	TAA	2	6	2237191	2237196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54507	NC_003106	GAA	2	6	2237261	2237266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15922557
54508	NC_003106	GGA	2	6	2237278	2237283	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15922557
54509	NC_003106	TATAT	2	10	2237366	2237375	40 %	60 %	0 %	0 %	15922557
54510	NC_003106	ATT	2	6	2237387	2237392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15922557
54511	NC_003106	TGA	2	6	2237395	2237400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15922557
54512	NC_003106	CTT	2	6	2237442	2237447	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54513	NC_003106	GTA	2	6	2237558	2237563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15922558
54514	NC_003106	GGA	2	6	2237596	2237601	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15922558
54515	NC_003106	GGA	2	6	2237736	2237741	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15922558
54516	NC_003106	AAG	2	6	2237753	2237758	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15922558
54517	NC_003106	CTC	2	6	2237814	2237819	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54518	NC_003106	TGTT	2	8	2237878	2237885	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
54519	NC_003106	ATT	2	6	2237910	2237915	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54520	NC_003106	AT	3	6	2237959	2237964	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54521	NC_003106	ATG	2	6	2237982	2237987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54522	NC_003106	AAAT	2	8	2237992	2237999	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
54523	NC_003106	CTTT	2	8	2238040	2238047	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
54524	NC_003106	CTC	2	6	2238053	2238058	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54525	NC_003106	TCCT	2	8	2238116	2238123	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
54526	NC_003106	TCA	2	6	2238192	2238197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54527	NC_003106	TCT	2	6	2238202	2238207	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54528	NC_003106	CTC	2	6	2238215	2238220	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54529	NC_003106	AT	3	6	2238331	2238336	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54530	NC_003106	TGA	2	6	2238372	2238377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54531	NC_003106	GAC	2	6	2238380	2238385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54532	NC_003106	ATG	2	6	2238396	2238401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54533	NC_003106	CTT	2	6	2238431	2238436	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54534	NC_003106	TAA	2	6	2238450	2238455	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54535	NC_003106	CTT	2	6	2238578	2238583	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54536	NC_003106	GAAAT	2	10	2238611	2238620	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
54537	NC_003106	CT	3	6	2238640	2238645	0 %	50 %	0 %	50 %	15922559
54538	NC_003106	ATT	2	6	2238650	2238655	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15922559
54539	NC_003106	CAA	2	6	2238739	2238744	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15922559
54540	NC_003106	TCT	2	6	2238783	2238788	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15922559
54541	NC_003106	GAG	2	6	2238810	2238815	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15922559
54542	NC_003106	TAT	2	6	2238892	2238897	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15922559
54543	NC_003106	TAA	2	6	2238903	2238908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15922559
54544	NC_003106	AAATT	2	10	2238975	2238984	60 %	40 %	0 %	0 %	15922559
54545	NC_003106	TAA	3	9	2239023	2239031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15922559
54546	NC_003106	TTC	2	6	2239093	2239098	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15922559
54547	NC_003106	TAACG	2	10	2239161	2239170	40 %	20 %	20 %	20 %	15922559
54548	NC_003106	CTT	2	6	2239255	2239260	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54549	NC_003106	TCA	2	6	2239262	2239267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54550	NC_003106	AGT	2	6	2239306	2239311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54551	NC_003106	GT	3	6	2239310	2239315	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
54552	NC_003106	ATT	2	6	2239321	2239326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54553	NC_003106	GAA	2	6	2239375	2239380	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54554	NC_003106	GA	3	6	2239408	2239413	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
54555	NC_003106	TTA	2	6	2239444	2239449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54556	NC_003106	ATA	2	6	2239494	2239499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54557	NC_003106	GAG	2	6	2239601	2239606	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15922560
54558	NC_003106	GAT	2	6	2239616	2239621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15922560
54559	NC_003106	ACTT	2	8	2239673	2239680	25 %	50 %	0 %	25 %	15922560
54560	NC_003106	AG	3	6	2239709	2239714	50 %	0 %	50 %	0 %	15922560
54561	NC_003106	CTC	2	6	2239847	2239852	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15922560
54562	NC_003106	AGA	2	6	2239862	2239867	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15922560
54563	NC_003106	GAA	3	9	2239883	2239891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15922560
54564	NC_003106	CAT	2	6	2239904	2239909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15922560
54565	NC_003106	CTA	2	6	2239910	2239915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15922560
54566	NC_003106	AAG	2	6	2239982	2239987	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15922560
54567	NC_003106	GATT	2	8	2240032	2240039	25 %	50 %	25 %	0 %	15922560
54568	NC_003106	TGCT	2	8	2240061	2240068	0 %	50 %	25 %	25 %	15922560
54569	NC_003106	TGA	2	6	2240074	2240079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15922560
54570	NC_003106	GAG	2	6	2240090	2240095	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15922560
54571	NC_003106	G	6	6	2240177	2240182	0 %	0 %	100 %	0 %	15922560
54572	NC_003106	TCT	2	6	2240201	2240206	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15922560
54573	NC_003106	AGTT	2	8	2240232	2240239	25 %	50 %	25 %	0 %	15922560
54574	NC_003106	GGTAA	2	10	2240318	2240327	40 %	20 %	40 %	0 %	15922560
54575	NC_003106	GAG	2	6	2240356	2240361	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15922560
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54577	NC_003106	TG	3	6	2240521	2240526	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
54578	NC_003106	TC	3	6	2240545	2240550	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
54579	NC_003106	ATT	2	6	2240576	2240581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54580	NC_003106	TAA	2	6	2240594	2240599	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54581	NC_003106	TAT	2	6	2240610	2240615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54582	NC_003106	T	6	6	2240657	2240662	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54583	NC_003106	TTTA	2	8	2240675	2240682	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
54584	NC_003106	ATTA	2	8	2240692	2240699	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54585	NC_003106	TGA	2	6	2240729	2240734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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54587	NC_003106	CGG	2	6	2240909	2240914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
54588	NC_003106	T	6	6	2240922	2240927	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54589	NC_003106	A	7	7	2240976	2240982	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54590	NC_003106	A	6	6	2241019	2241024	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54591	NC_003106	AGT	2	6	2241058	2241063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54592	NC_003106	ATT	2	6	2241076	2241081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54593	NC_003106	A	6	6	2241108	2241113	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54594	NC_003106	C	6	6	2241149	2241154	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
54595	NC_003106	T	6	6	2241168	2241173	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54596	NC_003106	ATA	2	6	2241256	2241261	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54597	NC_003106	TAA	2	6	2241271	2241276	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15922561
54598	NC_003106	TAT	2	6	2241323	2241328	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15922561
54599	NC_003106	ACC	2	6	2241446	2241451	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15922561
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54601	NC_003106	CTT	2	6	2241568	2241573	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54602	NC_003106	TAAT	3	12	2241683	2241694	50 %	50 %	0 %	0 %	15922562
54603	NC_003106	TA	3	6	2241789	2241794	50 %	50 %	0 %	0 %	15922562
54604	NC_003106	TA	3	6	2241840	2241845	50 %	50 %	0 %	0 %	15922562
54605	NC_003106	TA	3	6	2241882	2241887	50 %	50 %	0 %	0 %	15922562
54606	NC_003106	ATATG	2	10	2241895	2241904	40 %	40 %	20 %	0 %	15922562
54607	NC_003106	TAG	2	6	2241927	2241932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15922562
54608	NC_003106	TTGG	2	8	2241957	2241964	0 %	50 %	50 %	0 %	15922562
54609	NC_003106	T	7	7	2241977	2241983	0 %	100 %	0 %	0 %	15922562
54610	NC_003106	TAC	2	6	2242020	2242025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15922562
54611	NC_003106	TAAC	2	8	2242094	2242101	50 %	25 %	0 %	25 %	15922562
54612	NC_003106	GGT	2	6	2242121	2242126	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15922562
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54616	NC_003106	CTA	2	6	2242272	2242277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15922562
54617	NC_003106	ATC	2	6	2242332	2242337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54618	NC_003106	ATTTT	2	10	2242345	2242354	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
54619	NC_003106	ATA	2	6	2242358	2242363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54620	NC_003106	AT	3	6	2242372	2242377	50 %	50 %	0 %	0 %	15922563
54621	NC_003106	TAT	3	9	2242412	2242420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15922563
54622	NC_003106	AGA	2	6	2242428	2242433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15922563
54623	NC_003106	AGG	2	6	2242434	2242439	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15922563
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54625	NC_003106	AAG	2	6	2242505	2242510	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15922563
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