MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sulfolobus tokodaii str. 7 chromosome

Total Repeats: 65471

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
54001	NC_003106	CAC	2	6	2217310	2217315	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15922535
54002	NC_003106	TAT	2	6	2217327	2217332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15922535
54003	NC_003106	TA	3	6	2217360	2217365	50 %	50 %	0 %	0 %	15922535
54004	NC_003106	TTC	2	6	2217368	2217373	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15922535
54005	NC_003106	TAT	2	6	2217377	2217382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15922535
54006	NC_003106	AAG	2	6	2217453	2217458	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15922535
54007	NC_003106	AAC	2	6	2217477	2217482	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15922535
54008	NC_003106	TTG	2	6	2217576	2217581	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15922535
54009	NC_003106	ATATT	2	10	2217604	2217613	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
54010	NC_003106	TTA	2	6	2217655	2217660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15922536
54011	NC_003106	AG	3	6	2217709	2217714	50 %	0 %	50 %	0 %	15922536
54012	NC_003106	TGT	2	6	2217716	2217721	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15922536
54013	NC_003106	ATA	2	6	2217762	2217767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15922536
54014	NC_003106	TTA	2	6	2217795	2217800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15922536
54015	NC_003106	CCA	2	6	2217831	2217836	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15922536
54016	NC_003106	GTA	2	6	2217882	2217887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15922536
54017	NC_003106	AGT	2	6	2217896	2217901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15922536
54018	NC_003106	GTAA	2	8	2217927	2217934	50 %	25 %	25 %	0 %	15922536
54019	NC_003106	TTG	2	6	2217982	2217987	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15922536
54020	NC_003106	AGAGA	2	10	2218020	2218029	60 %	0 %	40 %	0 %	15922536
54021	NC_003106	AAG	2	6	2218169	2218174	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15922536
54022	NC_003106	GA	4	8	2218198	2218205	50 %	0 %	50 %	0 %	15922536
54023	NC_003106	AGC	2	6	2218208	2218213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15922536
54024	NC_003106	AT	3	6	2218216	2218221	50 %	50 %	0 %	0 %	15922536
54025	NC_003106	AAT	2	6	2218248	2218253	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15922536
54026	NC_003106	TAG	2	6	2218321	2218326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15922536
54027	NC_003106	CT	3	6	2218356	2218361	0 %	50 %	0 %	50 %	15922536
54028	NC_003106	AAT	2	6	2218393	2218398	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15922536
54029	NC_003106	TCA	2	6	2218440	2218445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54030	NC_003106	T	7	7	2218454	2218460	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54031	NC_003106	TA	3	6	2218472	2218477	50 %	50 %	0 %	0 %	15922537
54032	NC_003106	TGAA	2	8	2218478	2218485	50 %	25 %	25 %	0 %	15922537
54033	NC_003106	TAA	2	6	2218499	2218504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15922537
54034	NC_003106	ACC	2	6	2218674	2218679	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15922537
54035	NC_003106	A	7	7	2218741	2218747	100 %	0 %	0 %	0 %	15922537
54036	NC_003106	AGA	2	6	2218800	2218805	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15922537
54037	NC_003106	AG	3	6	2218839	2218844	50 %	0 %	50 %	0 %	15922537
54038	NC_003106	ATG	2	6	2218876	2218881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15922537
54039	NC_003106	GTT	2	6	2218921	2218926	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15922537
54040	NC_003106	GGT	2	6	2218933	2218938	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15922537
54041	NC_003106	CAA	2	6	2218952	2218957	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15922537
54042	NC_003106	AAT	2	6	2219024	2219029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15922537
54043	NC_003106	T	6	6	2219041	2219046	0 %	100 %	0 %	0 %	15922538
54044	NC_003106	GTA	2	6	2219055	2219060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15922538
54045	NC_003106	TGT	2	6	2219072	2219077	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15922538
54046	NC_003106	TAT	2	6	2219085	2219090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15922538
54047	NC_003106	AT	4	8	2219108	2219115	50 %	50 %	0 %	0 %	15922538
54048	NC_003106	ATT	2	6	2219144	2219149	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15922538
54049	NC_003106	TC	3	6	2219150	2219155	0 %	50 %	0 %	50 %	15922538
54050	NC_003106	TCT	2	6	2219183	2219188	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15922538
54051	NC_003106	TTC	2	6	2219212	2219217	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15922538
54052	NC_003106	GTTA	2	8	2219227	2219234	25 %	50 %	25 %	0 %	15922538
54053	NC_003106	TTTC	2	8	2219245	2219252	0 %	75 %	0 %	25 %	15922538
54054	NC_003106	TAA	2	6	2219287	2219292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15922538
54055	NC_003106	AT	3	6	2219308	2219313	50 %	50 %	0 %	0 %	15922538
54056	NC_003106	C	6	6	2219338	2219343	0 %	0 %	0 %	100 %	15922538
54057	NC_003106	TAT	2	6	2219365	2219370	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15922538
54058	NC_003106	ACAT	2	8	2219378	2219385	50 %	25 %	0 %	25 %	15922538
54059	NC_003106	GA	3	6	2219398	2219403	50 %	0 %	50 %	0 %	15922538
54060	NC_003106	TCA	2	6	2219460	2219465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15922538
54061	NC_003106	T	7	7	2219505	2219511	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54062	NC_003106	A	6	6	2219586	2219591	100 %	0 %	0 %	0 %	15922539
54063	NC_003106	TAA	2	6	2219633	2219638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15922539
54064	NC_003106	ATG	2	6	2219650	2219655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15922539
54065	NC_003106	ATT	2	6	2219692	2219697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15922539
54066	NC_003106	TGT	2	6	2219717	2219722	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15922539
54067	NC_003106	AGA	2	6	2219738	2219743	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15922539
54068	NC_003106	TAA	2	6	2219806	2219811	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15922539
54069	NC_003106	GA	3	6	2219951	2219956	50 %	0 %	50 %	0 %	15922539
54070	NC_003106	GAAA	2	8	2219977	2219984	75 %	0 %	25 %	0 %	15922539
54071	NC_003106	GTT	2	6	2219988	2219993	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15922539
54072	NC_003106	TTA	2	6	2220045	2220050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15922539
54073	NC_003106	AG	3	6	2220142	2220147	50 %	0 %	50 %	0 %	15922539
54074	NC_003106	AGG	2	6	2220190	2220195	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15922539
54075	NC_003106	GAT	2	6	2220212	2220217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15922539
54076	NC_003106	AT	3	6	2220216	2220221	50 %	50 %	0 %	0 %	15922539
54077	NC_003106	TGA	2	6	2220224	2220229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15922539
54078	NC_003106	TGA	2	6	2220284	2220289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15922539
54079	NC_003106	TCTAA	2	10	2220294	2220303	40 %	40 %	0 %	20 %	15922539
54080	NC_003106	ATT	2	6	2220355	2220360	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15922539
54081	NC_003106	TTACC	2	10	2220394	2220403	20 %	40 %	0 %	40 %	15922539
54082	NC_003106	TAG	2	6	2220446	2220451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15922539
54083	NC_003106	ATT	2	6	2220456	2220461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15922539
54084	NC_003106	AGA	2	6	2220484	2220489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15922539
54085	NC_003106	TG	3	6	2220508	2220513	0 %	50 %	50 %	0 %	15922539
54086	NC_003106	GTTT	3	12	2220538	2220549	0 %	75 %	25 %	0 %	15922539
54087	NC_003106	TA	3	6	2220592	2220597	50 %	50 %	0 %	0 %	15922539
54088	NC_003106	GGT	2	6	2220690	2220695	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15922539
54089	NC_003106	CAC	2	6	2220704	2220709	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15922539
54090	NC_003106	AGT	2	6	2220712	2220717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15922539
54091	NC_003106	TCA	2	6	2220726	2220731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54092	NC_003106	TTC	2	6	2220766	2220771	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54093	NC_003106	TCA	2	6	2220777	2220782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54094	NC_003106	AAC	2	6	2220823	2220828	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54095	NC_003106	ATC	2	6	2220829	2220834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54096	NC_003106	AATTT	2	10	2220848	2220857	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
54097	NC_003106	GAA	2	6	2220912	2220917	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15922540
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54100	NC_003106	ATG	2	6	2220965	2220970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15922540
54101	NC_003106	CA	3	6	2220986	2220991	50 %	0 %	0 %	50 %	15922540
54102	NC_003106	ATT	2	6	2221026	2221031	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15922540
54103	NC_003106	A	6	6	2221065	2221070	100 %	0 %	0 %	0 %	15922540
54104	NC_003106	TC	3	6	2221095	2221100	0 %	50 %	0 %	50 %	15922540
54105	NC_003106	TCT	2	6	2221155	2221160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15922540
54106	NC_003106	TAC	2	6	2221206	2221211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15922540
54107	NC_003106	ATA	2	6	2221225	2221230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15922540
54108	NC_003106	TCTA	2	8	2221242	2221249	25 %	50 %	0 %	25 %	15922540
54109	NC_003106	AG	3	6	2221254	2221259	50 %	0 %	50 %	0 %	15922540
54110	NC_003106	AGT	2	6	2221272	2221277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15922540
54111	NC_003106	CTG	2	6	2221319	2221324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15922540
54112	NC_003106	AAT	2	6	2221387	2221392	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15922540
54113	NC_003106	TCT	2	6	2221411	2221416	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15922540
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54115	NC_003106	TCT	2	6	2221620	2221625	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15922541
54116	NC_003106	TTTCT	2	10	2221672	2221681	0 %	80 %	0 %	20 %	15922541
54117	NC_003106	TTA	2	6	2221687	2221692	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15922541
54118	NC_003106	TA	3	6	2221706	2221711	50 %	50 %	0 %	0 %	15922541
54119	NC_003106	AGAA	2	8	2221727	2221734	75 %	0 %	25 %	0 %	15922541
54120	NC_003106	TTTC	2	8	2221786	2221793	0 %	75 %	0 %	25 %	15922541
54121	NC_003106	ATC	3	9	2221799	2221807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15922541
54122	NC_003106	TAT	2	6	2221937	2221942	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15922541
54123	NC_003106	CAA	2	6	2222020	2222025	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15922541
54124	NC_003106	CGA	2	6	2222035	2222040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15922541
54125	NC_003106	TTCT	2	8	2222095	2222102	0 %	75 %	0 %	25 %	15922541
54126	NC_003106	AAT	2	6	2222123	2222128	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15922541
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54128	NC_003106	ATA	2	6	2222232	2222237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15922541
54129	NC_003106	TAT	2	6	2222240	2222245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15922541
54130	NC_003106	ATTA	2	8	2222330	2222337	50 %	50 %	0 %	0 %	15922541
54131	NC_003106	CTT	2	6	2222362	2222367	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15922541
54132	NC_003106	TGT	2	6	2222373	2222378	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15922541
54133	NC_003106	T	6	6	2222411	2222416	0 %	100 %	0 %	0 %	15922541
54134	NC_003106	AT	3	6	2222445	2222450	50 %	50 %	0 %	0 %	15922541
54135	NC_003106	ATCTAA	2	12	2222489	2222500	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	15922541
54136	NC_003106	TCA	2	6	2222625	2222630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15922541
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54138	NC_003106	T	6	6	2222701	2222706	0 %	100 %	0 %	0 %	15922541
54139	NC_003106	ATTT	2	8	2222729	2222736	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
54140	NC_003106	TGA	2	6	2222760	2222765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15922542
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54142	NC_003106	ATT	2	6	2222824	2222829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15922542
54143	NC_003106	CAAA	2	8	2222841	2222848	75 %	0 %	0 %	25 %	15922542
54144	NC_003106	AGT	2	6	2222851	2222856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15922542
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54146	NC_003106	AAAT	2	8	2222898	2222905	75 %	25 %	0 %	0 %	15922542
54147	NC_003106	AGT	2	6	2222920	2222925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15922542
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54150	NC_003106	T	6	6	2223120	2223125	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54151	NC_003106	AATG	2	8	2223155	2223162	50 %	25 %	25 %	0 %	15922543
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54154	NC_003106	TGA	2	6	2223266	2223271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15922543
54155	NC_003106	AGTT	2	8	2223382	2223389	25 %	50 %	25 %	0 %	15922543
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54164	NC_003106	T	6	6	2223935	2223940	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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54239	NC_003106	A	7	7	2227210	2227216	100 %	0 %	0 %	0 %	15922548
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