MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sulfolobus tokodaii str. 7 chromosome

Total Repeats: 65471

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
53501	NC_003106	CTA	2	6	2196019	2196024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15922523
53502	NC_003106	ACT	2	6	2196104	2196109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15922523
53503	NC_003106	AT	3	6	2196191	2196196	50 %	50 %	0 %	0 %	15922523
53504	NC_003106	AAC	2	6	2196224	2196229	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15922523
53505	NC_003106	ATA	2	6	2196242	2196247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15922523
53506	NC_003106	AGG	3	9	2196313	2196321	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15922523
53507	NC_003106	GAT	3	9	2196327	2196335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15922523
53508	NC_003106	AGA	2	6	2196350	2196355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15922523
53509	NC_003106	GTA	2	6	2196356	2196361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15922523
53510	NC_003106	ACTT	2	8	2196365	2196372	25 %	50 %	0 %	25 %	15922523
53511	NC_003106	TGA	2	6	2196401	2196406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15922523
53512	NC_003106	AAC	2	6	2196407	2196412	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15922523
53513	NC_003106	TGG	2	6	2196443	2196448	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15922523
53514	NC_003106	TGA	2	6	2196476	2196481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15922523
53515	NC_003106	TAC	2	6	2196490	2196495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15922523
53516	NC_003106	ATA	2	6	2196522	2196527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15922523
53517	NC_003106	TAG	2	6	2196553	2196558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15922523
53518	NC_003106	GTG	2	6	2196592	2196597	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15922523
53519	NC_003106	GTAC	2	8	2196635	2196642	25 %	25 %	25 %	25 %	15922523
53520	NC_003106	TAAT	2	8	2196687	2196694	50 %	50 %	0 %	0 %	15922523
53521	NC_003106	AT	3	6	2196693	2196698	50 %	50 %	0 %	0 %	15922523
53522	NC_003106	TGT	2	6	2196755	2196760	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15922523
53523	NC_003106	AAT	2	6	2196820	2196825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15922523
53524	NC_003106	CTA	2	6	2196826	2196831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15922523
53525	NC_003106	AGT	2	6	2196839	2196844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15922523
53526	NC_003106	ATA	2	6	2196875	2196880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15922523
53527	NC_003106	TAA	2	6	2196911	2196916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15922523
53528	NC_003106	AGT	2	6	2197010	2197015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15922523
53529	NC_003106	TA	3	6	2197081	2197086	50 %	50 %	0 %	0 %	15922523
53530	NC_003106	TTA	2	6	2197111	2197116	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15922523
53531	NC_003106	GAG	2	6	2197128	2197133	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15922523
53532	NC_003106	AAC	2	6	2197136	2197141	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15922523
53533	NC_003106	TACA	2	8	2197145	2197152	50 %	25 %	0 %	25 %	15922523
53534	NC_003106	TGTC	2	8	2197154	2197161	0 %	50 %	25 %	25 %	15922523
53535	NC_003106	TGT	2	6	2197208	2197213	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15922523
53536	NC_003106	TGTAA	2	10	2197227	2197236	40 %	40 %	20 %	0 %	15922523
53537	NC_003106	AGT	2	6	2197238	2197243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15922523
53538	NC_003106	CAA	2	6	2197282	2197287	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15922523
53539	NC_003106	TAAA	2	8	2197297	2197304	75 %	25 %	0 %	0 %	15922523
53540	NC_003106	AGT	2	6	2197316	2197321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15922523
53541	NC_003106	CAG	2	6	2197330	2197335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15922523
53542	NC_003106	TAC	2	6	2197340	2197345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15922523
53543	NC_003106	TA	3	6	2197346	2197351	50 %	50 %	0 %	0 %	15922523
53544	NC_003106	ATA	2	6	2197361	2197366	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15922523
53545	NC_003106	TAGT	2	8	2197411	2197418	25 %	50 %	25 %	0 %	15922523
53546	NC_003106	A	6	6	2197420	2197425	100 %	0 %	0 %	0 %	15922523
53547	NC_003106	TAA	2	6	2197435	2197440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15922523
53548	NC_003106	CTT	2	6	2197488	2197493	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15922523
53549	NC_003106	TTA	2	6	2197530	2197535	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53550	NC_003106	TAT	2	6	2197566	2197571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53551	NC_003106	TA	3	6	2197589	2197594	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53552	NC_003106	CTT	2	6	2197616	2197621	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53553	NC_003106	TCTA	2	8	2197661	2197668	25 %	50 %	0 %	25 %	15922524
53554	NC_003106	AAC	2	6	2197709	2197714	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15922524
53555	NC_003106	AGC	2	6	2197718	2197723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15922524
53556	NC_003106	TATT	2	8	2197757	2197764	25 %	75 %	0 %	0 %	15922524
53557	NC_003106	AT	4	8	2197787	2197794	50 %	50 %	0 %	0 %	15922524
53558	NC_003106	ATA	2	6	2197825	2197830	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15922524
53559	NC_003106	TAA	2	6	2197843	2197848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15922524
53560	NC_003106	TAG	2	6	2197984	2197989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15922524
53561	NC_003106	GTA	2	6	2197992	2197997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15922524
53562	NC_003106	GTAA	2	8	2198007	2198014	50 %	25 %	25 %	0 %	15922524
53563	NC_003106	AGT	3	9	2198069	2198077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15922524
53564	NC_003106	TTTATG	2	12	2198131	2198142	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	15922524
53565	NC_003106	AAC	2	6	2198144	2198149	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15922524
53566	NC_003106	GAA	2	6	2198163	2198168	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15922524
53567	NC_003106	TAA	2	6	2198171	2198176	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15922524
53568	NC_003106	TA	4	8	2198177	2198184	50 %	50 %	0 %	0 %	15922524
53569	NC_003106	ACT	2	6	2198218	2198223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15922524
53570	NC_003106	CCA	2	6	2198334	2198339	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15922524
53571	NC_003106	TTC	2	6	2198370	2198375	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15922524
53572	NC_003106	AAAT	2	8	2198386	2198393	75 %	25 %	0 %	0 %	15922524
53573	NC_003106	CAAT	2	8	2198415	2198422	50 %	25 %	0 %	25 %	15922524
53574	NC_003106	AT	3	6	2198438	2198443	50 %	50 %	0 %	0 %	15922524
53575	NC_003106	TAAT	2	8	2198458	2198465	50 %	50 %	0 %	0 %	15922524
53576	NC_003106	AGC	2	6	2198576	2198581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15922524
53577	NC_003106	CTTAT	2	10	2198612	2198621	20 %	60 %	0 %	20 %	15922524
53578	NC_003106	CTT	2	6	2198645	2198650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15922524
53579	NC_003106	TGA	2	6	2198663	2198668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15922524
53580	NC_003106	TTGC	2	8	2198760	2198767	0 %	50 %	25 %	25 %	15922524
53581	NC_003106	CTA	2	6	2198846	2198851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15922524
53582	NC_003106	TA	3	6	2198854	2198859	50 %	50 %	0 %	0 %	15922524
53583	NC_003106	GTTA	2	8	2198882	2198889	25 %	50 %	25 %	0 %	15922524
53584	NC_003106	CAC	2	6	2198899	2198904	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15922524
53585	NC_003106	CCGG	2	8	2198952	2198959	0 %	0 %	50 %	50 %	15922524
53586	NC_003106	TAG	2	6	2199013	2199018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15922524
53587	NC_003106	CAA	2	6	2199052	2199057	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15922524
53588	NC_003106	TAC	2	6	2199113	2199118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15922524
53589	NC_003106	ACC	2	6	2199137	2199142	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15922524
53590	NC_003106	CAT	2	6	2199196	2199201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15922524
53591	NC_003106	AGCAAC	2	12	2199206	2199217	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	15922524
53592	NC_003106	ATT	2	6	2199224	2199229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15922524
53593	NC_003106	TAA	2	6	2199251	2199256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15922524
53594	NC_003106	ATA	2	6	2199312	2199317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15922524
53595	NC_003106	ATT	2	6	2199536	2199541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15922524
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53599	NC_003106	ACA	2	6	2199708	2199713	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15922524
53600	NC_003106	AAT	2	6	2199866	2199871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15922524
53601	NC_003106	TACA	2	8	2199920	2199927	50 %	25 %	0 %	25 %	15922524
53602	NC_003106	AACT	2	8	2199931	2199938	50 %	25 %	0 %	25 %	15922524
53603	NC_003106	TCA	2	6	2199945	2199950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15922524
53604	NC_003106	GAA	2	6	2199969	2199974	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15922524
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53606	NC_003106	ATT	2	6	2200121	2200126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15922524
53607	NC_003106	AAT	2	6	2200131	2200136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15922524
53608	NC_003106	AT	3	6	2200157	2200162	50 %	50 %	0 %	0 %	15922524
53609	NC_003106	TAT	2	6	2200195	2200200	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15922524
53610	NC_003106	CAC	2	6	2200201	2200206	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15922524
53611	NC_003106	GAA	2	6	2200224	2200229	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15922524
53612	NC_003106	TA	3	6	2200266	2200271	50 %	50 %	0 %	0 %	15922524
53613	NC_003106	AT	3	6	2200372	2200377	50 %	50 %	0 %	0 %	15922524
53614	NC_003106	TA	3	6	2200383	2200388	50 %	50 %	0 %	0 %	15922524
53615	NC_003106	ACT	2	6	2200411	2200416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15922524
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53617	NC_003106	TAT	2	6	2200525	2200530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15922524
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53984	NC_003106	TGAT	2	8	2216548	2216555	25 %	50 %	25 %	0 %	15922535
53985	NC_003106	TTATT	2	10	2216578	2216587	20 %	80 %	0 %	0 %	15922535
53986	NC_003106	TCA	2	6	2216588	2216593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15922535
53987	NC_003106	AAC	2	6	2216601	2216606	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15922535
53988	NC_003106	CTAC	2	8	2216739	2216746	25 %	25 %	0 %	50 %	15922535
53989	NC_003106	TTAT	2	8	2216757	2216764	25 %	75 %	0 %	0 %	15922535
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53992	NC_003106	ATG	2	6	2216884	2216889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15922535
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