MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sulfolobus tokodaii str. 7 chromosome

Total Repeats: 65471

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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52502	NC_003106	GCT	2	6	2157069	2157074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15922485
52503	NC_003106	ATA	2	6	2157075	2157080	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15922485
52504	NC_003106	ATC	2	6	2157085	2157090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15922485
52505	NC_003106	ATTA	2	8	2157093	2157100	50 %	50 %	0 %	0 %	15922485
52506	NC_003106	TA	5	10	2157099	2157108	50 %	50 %	0 %	0 %	15922485
52507	NC_003106	TTTA	2	8	2157112	2157119	25 %	75 %	0 %	0 %	15922485
52508	NC_003106	GAA	2	6	2157138	2157143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15922485
52509	NC_003106	AGA	2	6	2157144	2157149	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15922485
52510	NC_003106	TATT	2	8	2157286	2157293	25 %	75 %	0 %	0 %	15922485
52511	NC_003106	CAG	2	6	2157295	2157300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15922485
52512	NC_003106	CTAGG	2	10	2157325	2157334	20 %	20 %	40 %	20 %	15922485
52513	NC_003106	TAAT	2	8	2157376	2157383	50 %	50 %	0 %	0 %	15922485
52514	NC_003106	AAT	2	6	2157405	2157410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15922485
52515	NC_003106	AGG	2	6	2157421	2157426	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15922485
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52517	NC_003106	TAA	2	6	2157475	2157480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15922485
52518	NC_003106	ATT	2	6	2157491	2157496	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15922485
52519	NC_003106	GAA	2	6	2157498	2157503	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15922485
52520	NC_003106	ATA	2	6	2157507	2157512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15922485
52521	NC_003106	AAAT	2	8	2157520	2157527	75 %	25 %	0 %	0 %	15922485
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52523	NC_003106	AG	3	6	2157567	2157572	50 %	0 %	50 %	0 %	15922485
52524	NC_003106	ATA	2	6	2157574	2157579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15922485
52525	NC_003106	ATTT	2	8	2157612	2157619	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
52526	NC_003106	CAT	2	6	2157667	2157672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52527	NC_003106	CTC	2	6	2157683	2157688	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52528	NC_003106	TAC	2	6	2157690	2157695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52529	NC_003106	TAC	2	6	2157732	2157737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52530	NC_003106	ATA	2	6	2157777	2157782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52531	NC_003106	CTA	2	6	2157881	2157886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52532	NC_003106	ATA	2	6	2157893	2157898	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52533	NC_003106	TAT	2	6	2157940	2157945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52534	NC_003106	TAC	2	6	2157979	2157984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52535	NC_003106	TCT	2	6	2158033	2158038	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52536	NC_003106	AAT	2	6	2158067	2158072	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52537	NC_003106	AG	3	6	2158088	2158093	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52538	NC_003106	TAA	2	6	2158156	2158161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15922486
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52541	NC_003106	ATT	2	6	2158273	2158278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15922486
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52543	NC_003106	A	6	6	2158341	2158346	100 %	0 %	0 %	0 %	15922486
52544	NC_003106	TAT	3	9	2158347	2158355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15922486
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52551	NC_003106	TTACT	2	10	2158654	2158663	20 %	60 %	0 %	20 %	15922487
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52553	NC_003106	GAA	2	6	2158722	2158727	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15922487
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52556	NC_003106	AGT	2	6	2158820	2158825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15922487
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52558	NC_003106	TAA	2	6	2158871	2158876	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15922487
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52561	NC_003106	TGT	2	6	2159061	2159066	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15922487
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52608	NC_003106	ATT	2	6	2160784	2160789	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15922490
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52611	NC_003106	CT	3	6	2160858	2160863	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
52612	NC_003106	AT	3	6	2160868	2160873	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52613	NC_003106	TAA	2	6	2160953	2160958	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15922491
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52622	NC_003106	TTC	2	6	2161247	2161252	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15922492
52623	NC_003106	ACC	2	6	2161328	2161333	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15922492
52624	NC_003106	TTA	2	6	2161344	2161349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15922492
52625	NC_003106	TAT	2	6	2161364	2161369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15922492
52626	NC_003106	TCT	2	6	2161406	2161411	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15922492
52627	NC_003106	ACA	2	6	2161473	2161478	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15922492
52628	NC_003106	AATGG	2	10	2161516	2161525	40 %	20 %	40 %	0 %	15922492
52629	NC_003106	TCTT	2	8	2161550	2161557	0 %	75 %	0 %	25 %	15922492
52630	NC_003106	TAA	2	6	2161597	2161602	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15922492
52631	NC_003106	GCT	2	6	2161626	2161631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15922492
52632	NC_003106	ATA	2	6	2161636	2161641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15922492
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52634	NC_003106	TAT	2	6	2161705	2161710	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15922492
52635	NC_003106	CAT	2	6	2161711	2161716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15922492
52636	NC_003106	AT	3	6	2161756	2161761	50 %	50 %	0 %	0 %	15922492
52637	NC_003106	GCT	2	6	2161768	2161773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15922492
52638	NC_003106	CAT	2	6	2161777	2161782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15922492
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52642	NC_003106	CAC	3	9	2161918	2161926	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15922492
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52646	NC_003106	TA	3	6	2162003	2162008	50 %	50 %	0 %	0 %	15922492
52647	NC_003106	TCA	2	6	2162040	2162045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15922492
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52651	NC_003106	TTTAC	2	10	2162124	2162133	20 %	60 %	0 %	20 %	15922492
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52653	NC_003106	CTT	2	6	2162278	2162283	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15922492
52654	NC_003106	TCT	2	6	2162292	2162297	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15922492
52655	NC_003106	TAA	2	6	2162353	2162358	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15922492
52656	NC_003106	ACC	2	6	2162369	2162374	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15922492
52657	NC_003106	ATT	2	6	2162436	2162441	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52658	NC_003106	TA	3	6	2162535	2162540	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52659	NC_003106	TA	3	6	2162631	2162636	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52660	NC_003106	ATA	3	9	2162634	2162642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52661	NC_003106	AG	3	6	2162647	2162652	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52662	NC_003106	TATAA	2	10	2162711	2162720	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
52663	NC_003106	A	6	6	2162739	2162744	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52664	NC_003106	TTA	2	6	2162854	2162859	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15922493
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52688	NC_003106	T	6	6	2164030	2164035	0 %	100 %	0 %	0 %	15922493
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52692	NC_003106	A	6	6	2164152	2164157	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52693	NC_003106	TTA	2	6	2164162	2164167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52694	NC_003106	TG	3	6	2164227	2164232	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
52695	NC_003106	TAC	2	6	2164263	2164268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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52702	NC_003106	AATA	2	8	2164489	2164496	75 %	25 %	0 %	0 %	15922494
52703	NC_003106	TAGT	2	8	2164500	2164507	25 %	50 %	25 %	0 %	15922494
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52725	NC_003106	TGGAG	2	10	2165393	2165402	20 %	20 %	60 %	0 %	15922494
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52730	NC_003106	TTG	2	6	2165559	2165564	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15922494
52731	NC_003106	CTT	2	6	2165571	2165576	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15922494
52732	NC_003106	TTA	2	6	2165640	2165645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15922494
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52735	NC_003106	GAA	2	6	2165788	2165793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15922494
52736	NC_003106	TCATTA	2	12	2165804	2165815	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	15922494
52737	NC_003106	TAC	2	6	2165827	2165832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15922494
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52740	NC_003106	GTA	2	6	2165930	2165935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15922494
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52983	NC_003106	TAA	2	6	2174983	2174988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15922501
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