MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pneumoniae TIGR4 chromosome

Total Repeats: 44298

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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44002	NC_003028	GTT	2	6	2147344	2147349	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15902032
44003	NC_003028	CAT	2	6	2147399	2147404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15902032
44004	NC_003028	T	6	6	2147418	2147423	0 %	100 %	0 %	0 %	15902032
44005	NC_003028	TCTT	2	8	2147467	2147474	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
44006	NC_003028	TATC	2	8	2147500	2147507	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
44007	NC_003028	TAAA	2	8	2147545	2147552	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
44008	NC_003028	A	6	6	2147550	2147555	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44009	NC_003028	TTC	2	6	2147563	2147568	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44010	NC_003028	ACC	2	6	2147806	2147811	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15902033
44011	NC_003028	TCT	2	6	2147852	2147857	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15902033
44012	NC_003028	GAC	2	6	2147859	2147864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15902033
44013	NC_003028	GATCTG	2	12	2147931	2147942	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	15902033
44014	NC_003028	T	6	6	2147959	2147964	0 %	100 %	0 %	0 %	15902033
44015	NC_003028	CAT	2	6	2147979	2147984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15902033
44016	NC_003028	TAAA	2	8	2147989	2147996	75 %	25 %	0 %	0 %	15902033
44017	NC_003028	ATT	2	6	2148001	2148006	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15902033
44018	NC_003028	CT	3	6	2148057	2148062	0 %	50 %	0 %	50 %	15902033
44019	NC_003028	GAAC	2	8	2148125	2148132	50 %	0 %	25 %	25 %	15902033
44020	NC_003028	GCT	2	6	2148212	2148217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15902033
44021	NC_003028	ATA	2	6	2148334	2148339	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15902033
44022	NC_003028	ATCCA	2	10	2148400	2148409	40 %	20 %	0 %	40 %	15902033
44023	NC_003028	TTG	2	6	2148487	2148492	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15902033
44024	NC_003028	TAA	2	6	2148535	2148540	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15902033
44025	NC_003028	AAT	2	6	2148610	2148615	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15902033
44026	NC_003028	T	7	7	2148665	2148671	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44027	NC_003028	AAAT	2	8	2148695	2148702	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
44028	NC_003028	TAG	2	6	2148795	2148800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44029	NC_003028	AATA	2	8	2148801	2148808	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
44030	NC_003028	TGA	2	6	2148883	2148888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15902034
44031	NC_003028	CTA	2	6	2148990	2148995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15902034
44032	NC_003028	TC	3	6	2149005	2149010	0 %	50 %	0 %	50 %	15902034
44033	NC_003028	TC	3	6	2149027	2149032	0 %	50 %	0 %	50 %	15902034
44034	NC_003028	TTC	2	6	2149035	2149040	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15902034
44035	NC_003028	CAT	2	6	2149114	2149119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15902034
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44037	NC_003028	GAAG	2	8	2149144	2149151	50 %	0 %	50 %	0 %	15902034
44038	NC_003028	TGC	2	6	2149177	2149182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15902034
44039	NC_003028	AG	3	6	2149225	2149230	50 %	0 %	50 %	0 %	15902034
44040	NC_003028	ACT	2	6	2149243	2149248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15902034
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44049	NC_003028	TCT	2	6	2149559	2149564	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15902034
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44053	NC_003028	TTG	2	6	2149635	2149640	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15902034
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44055	NC_003028	AGA	2	6	2149714	2149719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15902034
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44062	NC_003028	CAA	2	6	2150226	2150231	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15902034
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44064	NC_003028	ATCT	2	8	2150248	2150255	25 %	50 %	0 %	25 %	15902034
44065	NC_003028	ATG	2	6	2150265	2150270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15902034
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44067	NC_003028	GCCA	2	8	2150303	2150310	25 %	0 %	25 %	50 %	15902034
44068	NC_003028	TAAA	2	8	2150453	2150460	75 %	25 %	0 %	0 %	15902034
44069	NC_003028	TATTT	2	10	2150547	2150556	20 %	80 %	0 %	0 %	15902035
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44078	NC_003028	GATT	2	8	2150857	2150864	25 %	50 %	25 %	0 %	15902035
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44090	NC_003028	AT	3	6	2151471	2151476	50 %	50 %	0 %	0 %	15902035
44091	NC_003028	GCAT	2	8	2151541	2151548	25 %	25 %	25 %	25 %	15902035
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44098	NC_003028	TTTA	2	8	2151839	2151846	25 %	75 %	0 %	0 %	15902035
44099	NC_003028	AT	3	6	2151965	2151970	50 %	50 %	0 %	0 %	15902035
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44104	NC_003028	CT	3	6	2152271	2152276	0 %	50 %	0 %	50 %	15902035
44105	NC_003028	ATG	2	6	2152309	2152314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15902035
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44108	NC_003028	A	6	6	2152417	2152422	100 %	0 %	0 %	0 %	15902035
44109	NC_003028	TGATT	2	10	2152436	2152445	20 %	60 %	20 %	0 %	15902035
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44113	NC_003028	AAG	2	6	2152560	2152565	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15902035
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44117	NC_003028	A	7	7	2152650	2152656	100 %	0 %	0 %	0 %	15902035
44118	NC_003028	A	6	6	2152756	2152761	100 %	0 %	0 %	0 %	15902035
44119	NC_003028	AAC	2	6	2152768	2152773	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15902035
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.