MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pneumoniae TIGR4 chromosome

Total Repeats: 44298

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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43003	NC_003028	AGCTC	2	10	2101588	2101597	20 %	20 %	20 %	40 %	15901990
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43005	NC_003028	CTA	2	6	2101682	2101687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15901990
43006	NC_003028	TTGC	2	8	2101750	2101757	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
43007	NC_003028	TGCT	2	8	2101761	2101768	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
43008	NC_003028	GCC	2	6	2101773	2101778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
43009	NC_003028	T	6	6	2101779	2101784	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43010	NC_003028	TTG	2	6	2101797	2101802	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43011	NC_003028	ATG	2	6	2101850	2101855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43012	NC_003028	TAT	2	6	2101861	2101866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43013	NC_003028	T	6	6	2101883	2101888	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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43018	NC_003028	CCTG	2	8	2102271	2102278	0 %	25 %	25 %	50 %	15901991
43019	NC_003028	CAAAG	2	10	2102294	2102303	60 %	0 %	20 %	20 %	15901991
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43032	NC_003028	T	6	6	2102823	2102828	0 %	100 %	0 %	0 %	15901992
43033	NC_003028	GTT	2	6	2102843	2102848	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15901992
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43102	NC_003028	T	7	7	2106281	2106287	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43103	NC_003028	A	7	7	2106295	2106301	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43104	NC_003028	GAG	2	6	2106305	2106310	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43105	NC_003028	TG	3	6	2106313	2106318	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
43106	NC_003028	A	6	6	2106327	2106332	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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43233	NC_003028	TA	3	6	2112154	2112159	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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43361	NC_003028	ATG	2	6	2118064	2118069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15902002
43362	NC_003028	CCA	2	6	2118110	2118115	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15902002
43363	NC_003028	AAC	2	6	2118187	2118192	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15902002
43364	NC_003028	CT	4	8	2118312	2118319	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43365	NC_003028	ACCTTG	2	12	2118324	2118335	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
43366	NC_003028	TAT	2	6	2118342	2118347	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43367	NC_003028	CCT	2	6	2118574	2118579	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15902003
43368	NC_003028	TGA	2	6	2118592	2118597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15902003
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43372	NC_003028	TTC	2	6	2118950	2118955	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15902003
43373	NC_003028	CTGA	2	8	2118976	2118983	25 %	25 %	25 %	25 %	15902003
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43389	NC_003028	GA	3	6	2119776	2119781	50 %	0 %	50 %	0 %	15902004
43390	NC_003028	CAA	2	6	2119803	2119808	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15902004
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43398	NC_003028	CTTTT	2	10	2120166	2120175	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
43399	NC_003028	ATTCTA	2	12	2120184	2120195	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	15902005
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43414	NC_003028	CCT	2	6	2121210	2121215	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43415	NC_003028	A	7	7	2121234	2121240	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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43417	NC_003028	TA	3	6	2121378	2121383	50 %	50 %	0 %	0 %	15902007
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43424	NC_003028	ACT	2	6	2121760	2121765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15902008
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43479	NC_003028	CTC	3	9	2123904	2123912	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15902010
43480	NC_003028	TGT	2	6	2123922	2123927	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15902010
43481	NC_003028	GCGA	2	8	2123984	2123991	25 %	0 %	50 %	25 %	15902010
43482	NC_003028	ATCA	2	8	2124069	2124076	50 %	25 %	0 %	25 %	15902010
43483	NC_003028	AAT	2	6	2124096	2124101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15902010
43484	NC_003028	TCA	2	6	2124103	2124108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15902010
43485	NC_003028	ACG	2	6	2124165	2124170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15902010
43486	NC_003028	CAA	2	6	2124188	2124193	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15902010
43487	NC_003028	ATA	2	6	2124201	2124206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15902010
43488	NC_003028	CCA	2	6	2124262	2124267	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15902010
43489	NC_003028	GTT	2	6	2124310	2124315	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15902010
43490	NC_003028	CAC	2	6	2124329	2124334	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15902010
43491	NC_003028	A	6	6	2124384	2124389	100 %	0 %	0 %	0 %	15902010
43492	NC_003028	TCA	2	6	2124433	2124438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15902010
43493	NC_003028	CTTCC	2	10	2124520	2124529	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
43494	NC_003028	AAG	2	6	2124545	2124550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43495	NC_003028	CTT	2	6	2124564	2124569	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15902011
43496	NC_003028	GATT	2	8	2124579	2124586	25 %	50 %	25 %	0 %	15902011
43497	NC_003028	ATCA	2	8	2124622	2124629	50 %	25 %	0 %	25 %	15902011
43498	NC_003028	AACC	2	8	2124630	2124637	50 %	0 %	0 %	50 %	15902011
43499	NC_003028	TTC	2	6	2124703	2124708	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15902011
43500	NC_003028	TCT	2	6	2124714	2124719	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15902011

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