MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pneumoniae TIGR4 chromosome

Total Repeats: 44298

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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41002	NC_003028	CTC	2	6	2004667	2004672	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15901911
41003	NC_003028	ATCT	2	8	2004728	2004735	25 %	50 %	0 %	25 %	15901911
41004	NC_003028	TCC	2	6	2004737	2004742	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41005	NC_003028	T	6	6	2004781	2004786	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41006	NC_003028	TTACAA	2	12	2004791	2004802	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	15901912
41007	NC_003028	T	6	6	2004829	2004834	0 %	100 %	0 %	0 %	15901912
41008	NC_003028	ATA	2	6	2004861	2004866	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15901912
41009	NC_003028	CTA	2	6	2004883	2004888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15901912
41010	NC_003028	CTG	2	6	2004925	2004930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15901912
41011	NC_003028	CTGCAC	2	12	2005051	2005062	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	15901912
41012	NC_003028	T	6	6	2005074	2005079	0 %	100 %	0 %	0 %	15901912
41013	NC_003028	CCA	2	6	2005095	2005100	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15901912
41014	NC_003028	CAT	2	6	2005166	2005171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15901912
41015	NC_003028	ACA	2	6	2005290	2005295	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15901912
41016	NC_003028	AAG	2	6	2005322	2005327	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15901912
41017	NC_003028	ACA	2	6	2005374	2005379	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15901912
41018	NC_003028	CAG	2	6	2005390	2005395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15901912
41019	NC_003028	TTTTC	2	10	2005432	2005441	0 %	80 %	0 %	20 %	15901912
41020	NC_003028	CCT	2	6	2005501	2005506	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41021	NC_003028	A	6	6	2005535	2005540	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41022	NC_003028	T	6	6	2005582	2005587	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41023	NC_003028	AAGC	2	8	2005619	2005626	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
41024	NC_003028	CTTT	2	8	2005732	2005739	0 %	75 %	0 %	25 %	15901913
41025	NC_003028	CTT	2	6	2005742	2005747	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15901913
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41030	NC_003028	AGA	2	6	2005845	2005850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15901913
41031	NC_003028	GA	3	6	2005849	2005854	50 %	0 %	50 %	0 %	15901913
41032	NC_003028	ACC	2	6	2005879	2005884	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15901913
41033	NC_003028	A	6	6	2005921	2005926	100 %	0 %	0 %	0 %	15901913
41034	NC_003028	AAAG	2	8	2005941	2005948	75 %	0 %	25 %	0 %	15901913
41035	NC_003028	AAAC	2	8	2006025	2006032	75 %	0 %	0 %	25 %	15901913
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41038	NC_003028	GCG	2	6	2006153	2006158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15901913
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41040	NC_003028	TAA	2	6	2006297	2006302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15901913
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41043	NC_003028	A	6	6	2006369	2006374	100 %	0 %	0 %	0 %	15901913
41044	NC_003028	AAG	2	6	2006539	2006544	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15901913
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41046	NC_003028	ATTG	2	8	2006675	2006682	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
41047	NC_003028	GAA	3	9	2006717	2006725	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15901914
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41054	NC_003028	CACTA	2	10	2006995	2007004	40 %	20 %	0 %	40 %	15901914
41055	NC_003028	AAAGC	2	10	2007011	2007020	60 %	0 %	20 %	20 %	15901914
41056	NC_003028	TTA	2	6	2007089	2007094	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15901914
41057	NC_003028	AATG	2	8	2007116	2007123	50 %	25 %	25 %	0 %	15901914
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41060	NC_003028	CAATC	2	10	2007219	2007228	40 %	20 %	0 %	40 %	15901914
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41093	NC_003028	CT	3	6	2008805	2008810	0 %	50 %	0 %	50 %	15901914
41094	NC_003028	CCGTC	2	10	2008824	2008833	0 %	20 %	20 %	60 %	15901914
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41101	NC_003028	T	7	7	2009102	2009108	0 %	100 %	0 %	0 %	15901914
41102	NC_003028	TAT	2	6	2009185	2009190	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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41105	NC_003028	A	6	6	2009299	2009304	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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41481	NC_003028	AAG	2	6	2027177	2027182	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15901928
41482	NC_003028	AAACC	2	10	2027300	2027309	60 %	0 %	0 %	40 %	15901928
41483	NC_003028	CAC	2	6	2027352	2027357	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15901928
41484	NC_003028	ACTGCT	2	12	2027393	2027404	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	15901928
41485	NC_003028	A	6	6	2027408	2027413	100 %	0 %	0 %	0 %	15901928
41486	NC_003028	AG	3	6	2027423	2027428	50 %	0 %	50 %	0 %	15901928
41487	NC_003028	TCT	2	6	2027436	2027441	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15901928
41488	NC_003028	CAT	2	6	2027442	2027447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15901928
41489	NC_003028	GA	3	6	2027457	2027462	50 %	0 %	50 %	0 %	15901928
41490	NC_003028	GCG	2	6	2027503	2027508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15901928
41491	NC_003028	ATA	2	6	2027512	2027517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15901928
41492	NC_003028	TGTT	2	8	2027539	2027546	0 %	75 %	25 %	0 %	15901928
41493	NC_003028	TCT	3	9	2027550	2027558	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15901928
41494	NC_003028	GTT	2	6	2027581	2027586	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15901929
41495	NC_003028	TTG	2	6	2027631	2027636	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15901929
41496	NC_003028	TCT	2	6	2027670	2027675	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15901929
41497	NC_003028	AGCA	2	8	2027678	2027685	50 %	0 %	25 %	25 %	15901929
41498	NC_003028	ACC	2	6	2027717	2027722	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15901929
41499	NC_003028	GTG	2	6	2027725	2027730	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15901929
41500	NC_003028	AAG	2	6	2027753	2027758	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15901929

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