MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pneumoniae TIGR4 chromosome

Total Repeats: 44298

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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31005	NC_003028	GCAG	2	8	1508547	1508554	25 %	0 %	50 %	25 %	15901447
31006	NC_003028	T	7	7	1508696	1508702	0 %	100 %	0 %	0 %	15901447
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31011	NC_003028	AGA	2	6	1509069	1509074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15901447
31012	NC_003028	GAT	2	6	1509081	1509086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15901447
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31026	NC_003028	T	6	6	1509471	1509476	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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31103	NC_003028	A	8	8	1513095	1513102	100 %	0 %	0 %	0 %	15901452
31104	NC_003028	T	6	6	1513287	1513292	0 %	100 %	0 %	0 %	15901452
31105	NC_003028	A	7	7	1513293	1513299	100 %	0 %	0 %	0 %	15901452
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31117	NC_003028	AATA	3	12	1513485	1513496	75 %	25 %	0 %	0 %	15901452
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31121	NC_003028	ATG	2	6	1513607	1513612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15901452
31122	NC_003028	TGA	2	6	1513635	1513640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15901452
31123	NC_003028	A	6	6	1513644	1513649	100 %	0 %	0 %	0 %	15901452
31124	NC_003028	A	7	7	1513665	1513671	100 %	0 %	0 %	0 %	15901452
31125	NC_003028	TAC	2	6	1513689	1513694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15901452
31126	NC_003028	TGA	2	6	1513704	1513709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15901452
31127	NC_003028	GAT	2	6	1513723	1513728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15901452
31128	NC_003028	GAA	2	6	1513768	1513773	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15901452
31129	NC_003028	A	6	6	1513811	1513816	100 %	0 %	0 %	0 %	15901452
31130	NC_003028	TA	4	8	1513897	1513904	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31131	NC_003028	AATT	2	8	1513936	1513943	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31132	NC_003028	TTG	3	9	1514007	1514015	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31133	NC_003028	TAA	2	6	1514016	1514021	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31134	NC_003028	TTC	2	6	1514070	1514075	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31135	NC_003028	AAAG	2	8	1514111	1514118	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
31136	NC_003028	CAT	2	6	1514123	1514128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31137	NC_003028	CT	3	6	1514181	1514186	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31138	NC_003028	GAT	2	6	1514194	1514199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31139	NC_003028	TTGT	2	8	1514284	1514291	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
31140	NC_003028	AAGA	2	8	1514314	1514321	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
31141	NC_003028	AAT	2	6	1514330	1514335	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31142	NC_003028	GAA	2	6	1514499	1514504	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31143	NC_003028	TCA	2	6	1514548	1514553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31144	NC_003028	TAG	3	9	1514712	1514720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31145	NC_003028	AGA	3	9	1514748	1514756	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31146	NC_003028	TCTT	2	8	1514797	1514804	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
31147	NC_003028	TCC	2	6	1514816	1514821	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31148	NC_003028	T	6	6	1514843	1514848	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31149	NC_003028	CAA	2	6	1514893	1514898	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31150	NC_003028	AAG	2	6	1514936	1514941	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31151	NC_003028	T	6	6	1515059	1515064	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31152	NC_003028	ATCA	2	8	1515086	1515093	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
31153	NC_003028	ATT	2	6	1515119	1515124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31154	NC_003028	ATTT	2	8	1515133	1515140	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31155	NC_003028	AT	3	6	1515156	1515161	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31156	NC_003028	GAACT	2	10	1515182	1515191	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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31158	NC_003028	ATA	2	6	1515213	1515218	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31159	NC_003028	T	7	7	1515239	1515245	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31160	NC_003028	TCA	2	6	1515269	1515274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31161	NC_003028	T	6	6	1515297	1515302	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31162	NC_003028	TC	3	6	1515317	1515322	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31163	NC_003028	A	6	6	1515331	1515336	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31164	NC_003028	CTA	2	6	1515462	1515467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31165	NC_003028	ATT	2	6	1515484	1515489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31166	NC_003028	ATC	2	6	1515519	1515524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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31202	NC_003028	TAA	2	6	1517571	1517576	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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31231	NC_003028	AATCCA	2	12	1518696	1518707	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	15901454
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31239	NC_003028	TA	3	6	1519058	1519063	50 %	50 %	0 %	0 %	15901454
31240	NC_003028	ACC	2	6	1519076	1519081	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15901454
31241	NC_003028	CAA	3	9	1519117	1519125	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15901454
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31243	NC_003028	ACC	2	6	1519208	1519213	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15901454
31244	NC_003028	ACC	2	6	1519271	1519276	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15901454
31245	NC_003028	C	6	6	1519275	1519280	0 %	0 %	0 %	100 %	15901454
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31251	NC_003028	TTA	2	6	1519746	1519751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15901456
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31486	NC_003028	T	6	6	1530036	1530041	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31487	NC_003028	CT	3	6	1530089	1530094	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31488	NC_003028	T	7	7	1530153	1530159	0 %	100 %	0 %	0 %	15901466
31489	NC_003028	CAT	2	6	1530244	1530249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15901466
31490	NC_003028	AGA	3	9	1530267	1530275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15901466
31491	NC_003028	TGA	2	6	1530320	1530325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15901466
31492	NC_003028	CTA	2	6	1530339	1530344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15901466
31493	NC_003028	TGA	2	6	1530345	1530350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15901466
31494	NC_003028	AC	3	6	1530359	1530364	50 %	0 %	0 %	50 %	15901466
31495	NC_003028	TGG	2	6	1530391	1530396	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15901466
31496	NC_003028	CT	3	6	1530454	1530459	0 %	50 %	0 %	50 %	15901466
31497	NC_003028	AGT	2	6	1530494	1530499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15901466
31498	NC_003028	CTG	2	6	1530500	1530505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31499	NC_003028	A	6	6	1530508	1530513	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31500	NC_003028	ATA	2	6	1530535	1530540	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

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