MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pneumoniae TIGR4 chromosome

Total Repeats: 44298

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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27002	NC_003028	CTT	2	6	1309213	1309218	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15901238
27003	NC_003028	CAT	2	6	1309317	1309322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15901238
27004	NC_003028	A	6	6	1309348	1309353	100 %	0 %	0 %	0 %	15901238
27005	NC_003028	TTTG	2	8	1309428	1309435	0 %	75 %	25 %	0 %	15901238
27006	NC_003028	TCA	2	6	1309449	1309454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15901238
27007	NC_003028	ACC	2	6	1309510	1309515	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27008	NC_003028	TTCA	2	8	1309516	1309523	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
27009	NC_003028	GCA	2	6	1309596	1309601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27010	NC_003028	TTA	2	6	1309650	1309655	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27011	NC_003028	T	7	7	1309661	1309667	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27012	NC_003028	AT	3	6	1309740	1309745	50 %	50 %	0 %	0 %	15901239
27013	NC_003028	T	6	6	1309745	1309750	0 %	100 %	0 %	0 %	15901239
27014	NC_003028	CTA	2	6	1309801	1309806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15901239
27015	NC_003028	AT	3	6	1309841	1309846	50 %	50 %	0 %	0 %	15901239
27016	NC_003028	GTT	2	6	1309854	1309859	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15901239
27017	NC_003028	T	7	7	1309939	1309945	0 %	100 %	0 %	0 %	15901239
27018	NC_003028	A	6	6	1309947	1309952	100 %	0 %	0 %	0 %	15901239
27019	NC_003028	ATT	2	6	1309965	1309970	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15901239
27020	NC_003028	GGCAA	2	10	1310053	1310062	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
27021	NC_003028	TAC	2	6	1310096	1310101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27022	NC_003028	GCAA	2	8	1310105	1310112	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
27023	NC_003028	TAGAA	2	10	1310130	1310139	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
27024	NC_003028	TCT	2	6	1310201	1310206	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27025	NC_003028	T	7	7	1310553	1310559	0 %	100 %	0 %	0 %	15901240
27026	NC_003028	TGGC	2	8	1310568	1310575	0 %	25 %	50 %	25 %	15901240
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27029	NC_003028	TTA	2	6	1310898	1310903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15901240
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27031	NC_003028	TCT	2	6	1311120	1311125	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15901240
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27033	NC_003028	TGCT	2	8	1311289	1311296	0 %	50 %	25 %	25 %	15901240
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27039	NC_003028	CATT	2	8	1311600	1311607	25 %	50 %	0 %	25 %	15901241
27040	NC_003028	TAGA	2	8	1311666	1311673	50 %	25 %	25 %	0 %	15901241
27041	NC_003028	AAG	2	6	1311719	1311724	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15901241
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27045	NC_003028	T	6	6	1312051	1312056	0 %	100 %	0 %	0 %	15901241
27046	NC_003028	TC	3	6	1312063	1312068	0 %	50 %	0 %	50 %	15901242
27047	NC_003028	TGA	2	6	1312091	1312096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15901242
27048	NC_003028	CCATA	2	10	1312133	1312142	40 %	20 %	0 %	40 %	15901242
27049	NC_003028	CCA	2	6	1312201	1312206	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15901242
27050	NC_003028	ATAG	2	8	1312279	1312286	50 %	25 %	25 %	0 %	15901242
27051	NC_003028	ATGAC	2	10	1312294	1312303	40 %	20 %	20 %	20 %	15901242
27052	NC_003028	TGA	2	6	1312346	1312351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15901242
27053	NC_003028	ATT	2	6	1312353	1312358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15901242
27054	NC_003028	TGT	2	6	1312456	1312461	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15901242
27055	NC_003028	AGGA	2	8	1312560	1312567	50 %	0 %	50 %	0 %	15901242
27056	NC_003028	AACTG	2	10	1312739	1312748	40 %	20 %	20 %	20 %	15901242
27057	NC_003028	TAC	2	6	1312830	1312835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15901242
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27059	NC_003028	TCC	2	6	1312868	1312873	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15901242
27060	NC_003028	CTT	2	6	1312896	1312901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15901243
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27063	NC_003028	ATG	2	6	1312967	1312972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15901243
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27092	NC_003028	ACGA	2	8	1314794	1314801	50 %	0 %	25 %	25 %	15901244
27093	NC_003028	TTGC	2	8	1314807	1314814	0 %	50 %	25 %	25 %	15901244
27094	NC_003028	TTGG	2	8	1314845	1314852	0 %	50 %	50 %	0 %	15901244
27095	NC_003028	AAT	2	6	1314901	1314906	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15901244
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27100	NC_003028	T	6	6	1315127	1315132	0 %	100 %	0 %	0 %	15901245
27101	NC_003028	AAG	2	6	1315248	1315253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15901245
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27105	NC_003028	CCA	2	6	1315521	1315526	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15901245
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27108	NC_003028	TGC	2	6	1315622	1315627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15901245
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27116	NC_003028	TCT	2	6	1315876	1315881	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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27122	NC_003028	CAT	2	6	1316272	1316277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15901246
27123	NC_003028	TGTC	2	8	1316308	1316315	0 %	50 %	25 %	25 %	15901246
27124	NC_003028	CTGG	2	8	1316407	1316414	0 %	25 %	50 %	25 %	15901246
27125	NC_003028	CAAT	2	8	1316455	1316462	50 %	25 %	0 %	25 %	15901246
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27133	NC_003028	GAA	2	6	1316758	1316763	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15901247
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27175	NC_003028	T	6	6	1318952	1318957	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27176	NC_003028	A	7	7	1318963	1318969	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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27230	NC_003028	CTTT	2	8	1322168	1322175	0 %	75 %	0 %	25 %	15901253
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27241	NC_003028	TCC	2	6	1322860	1322865	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15901253
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27244	NC_003028	AAAG	2	8	1322963	1322970	75 %	0 %	25 %	0 %	15901253
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27263	NC_003028	T	6	6	1323976	1323981	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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27267	NC_003028	CCT	2	6	1324074	1324079	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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27274	NC_003028	AGT	2	6	1324408	1324413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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27336	NC_003028	AT	4	8	1327428	1327435	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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27338	NC_003028	CTTTC	2	10	1327461	1327470	0 %	60 %	0 %	40 %	15901260
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27342	NC_003028	GAG	2	6	1327529	1327534	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15901260
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27345	NC_003028	ATC	2	6	1327607	1327612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15901260
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27352	NC_003028	TAGA	2	8	1327952	1327959	50 %	25 %	25 %	0 %	15901260
27353	NC_003028	GGAGAG	2	12	1328033	1328044	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15901260
27354	NC_003028	TCA	2	6	1328083	1328088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15901260
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27358	NC_003028	ATG	2	6	1328293	1328298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15901261
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27364	NC_003028	TTG	2	6	1328719	1328724	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15901261
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27453	NC_003028	TAT	2	6	1333352	1333357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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27467	NC_003028	T	6	6	1333763	1333768	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27468	NC_003028	TAAGC	2	10	1333779	1333788	40 %	20 %	20 %	20 %	15901269
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27471	NC_003028	AAT	2	6	1333917	1333922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15901269
27472	NC_003028	TTGGG	2	10	1333965	1333974	0 %	40 %	60 %	0 %	15901269
27473	NC_003028	AAG	2	6	1333993	1333998	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15901269
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27477	NC_003028	CTTT	2	8	1334200	1334207	0 %	75 %	0 %	25 %	15901269
27478	NC_003028	TCA	2	6	1334287	1334292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15901269
27479	NC_003028	CAA	2	6	1334333	1334338	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15901269
27480	NC_003028	TAA	2	6	1334462	1334467	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15901269
27481	NC_003028	TCC	2	6	1334482	1334487	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27482	NC_003028	TATT	2	8	1334499	1334506	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
27483	NC_003028	A	7	7	1334553	1334559	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27484	NC_003028	AGAA	2	8	1334606	1334613	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
27485	NC_003028	AT	3	6	1334621	1334626	50 %	50 %	0 %	0 %	15901270
27486	NC_003028	TGATTT	2	12	1334636	1334647	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	15901270
27487	NC_003028	ATTG	2	8	1334663	1334670	25 %	50 %	25 %	0 %	15901270
27488	NC_003028	CTC	2	6	1334706	1334711	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15901270
27489	NC_003028	TAT	2	6	1334759	1334764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15901270
27490	NC_003028	AGG	2	6	1334849	1334854	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15901270
27491	NC_003028	TCC	2	6	1334869	1334874	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15901270
27492	NC_003028	GCC	2	6	1334962	1334967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15901270
27493	NC_003028	AGA	2	6	1334984	1334989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15901270
27494	NC_003028	CTG	2	6	1335145	1335150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15901270
27495	NC_003028	CTG	2	6	1335160	1335165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15901270
27496	NC_003028	CTTCA	2	10	1335168	1335177	20 %	40 %	0 %	40 %	15901270
27497	NC_003028	CTG	2	6	1335186	1335191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15901270
27498	NC_003028	GCT	2	6	1335327	1335332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15901270
27499	NC_003028	A	8	8	1335351	1335358	100 %	0 %	0 %	0 %	15901270
27500	NC_003028	TGG	2	6	1335359	1335364	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15901270

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