MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pneumoniae TIGR4 chromosome

Total Repeats: 44298

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_003028	CTT	2	6	654199	654204	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15900582
13502	NC_003028	GAT	2	6	654213	654218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15900582
13503	NC_003028	AAG	2	6	654229	654234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15900582
13504	NC_003028	GTATCG	2	12	654352	654363	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	15900582
13505	NC_003028	TTTGG	2	10	654465	654474	0 %	60 %	40 %	0 %	15900582
13506	NC_003028	CGT	2	6	654477	654482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15900582
13507	NC_003028	AAG	2	6	654490	654495	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15900582
13508	NC_003028	CAA	2	6	654632	654637	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15900582
13509	NC_003028	AAG	2	6	654655	654660	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15900582
13510	NC_003028	GAA	2	6	654687	654692	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15900582
13511	NC_003028	GCAG	2	8	654698	654705	25 %	0 %	50 %	25 %	15900582
13512	NC_003028	CGT	2	6	654813	654818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15900582
13513	NC_003028	AGA	2	6	654917	654922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15900582
13514	NC_003028	TGG	2	6	655133	655138	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15900582
13515	NC_003028	GTG	2	6	655147	655152	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15900582
13516	NC_003028	GAA	2	6	655206	655211	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15900582
13517	NC_003028	ATC	2	6	655260	655265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15900582
13518	NC_003028	CGTT	2	8	655328	655335	0 %	50 %	25 %	25 %	15900582
13519	NC_003028	CTA	2	6	655339	655344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15900582
13520	NC_003028	ACG	2	6	655411	655416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15900582
13521	NC_003028	AAG	2	6	655497	655502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15900582
13522	NC_003028	A	6	6	655503	655508	100 %	0 %	0 %	0 %	15900582
13523	NC_003028	AG	3	6	655530	655535	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13524	NC_003028	TCG	2	6	655622	655627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15900583
13525	NC_003028	GTAT	2	8	655633	655640	25 %	50 %	25 %	0 %	15900583
13526	NC_003028	A	7	7	655774	655780	100 %	0 %	0 %	0 %	15900583
13527	NC_003028	AGA	2	6	655786	655791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15900583
13528	NC_003028	A	6	6	655793	655798	100 %	0 %	0 %	0 %	15900583
13529	NC_003028	CT	3	6	655810	655815	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13530	NC_003028	ATT	2	6	655954	655959	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13531	NC_003028	ACT	2	6	655970	655975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13532	NC_003028	ATA	2	6	655978	655983	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13533	NC_003028	A	6	6	656015	656020	100 %	0 %	0 %	0 %	15900584
13534	NC_003028	T	6	6	656026	656031	0 %	100 %	0 %	0 %	15900584
13535	NC_003028	ACA	2	6	656037	656042	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15900584
13536	NC_003028	AAT	2	6	656043	656048	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15900584
13537	NC_003028	A	6	6	656049	656054	100 %	0 %	0 %	0 %	15900584
13538	NC_003028	AG	4	8	656091	656098	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13539	NC_003028	ATTT	2	8	656103	656110	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13540	NC_003028	TTG	2	6	656118	656123	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13541	NC_003028	T	7	7	656136	656142	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13542	NC_003028	GAAA	2	8	656143	656150	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
13543	NC_003028	A	6	6	656148	656153	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13544	NC_003028	A	6	6	656167	656172	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13545	NC_003028	ATT	2	6	656211	656216	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13546	NC_003028	GCT	2	6	656230	656235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13547	NC_003028	GGA	2	6	656251	656256	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15900585
13548	NC_003028	AGG	2	6	656280	656285	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15900585
13549	NC_003028	A	6	6	656317	656322	100 %	0 %	0 %	0 %	15900585
13550	NC_003028	ATT	2	6	656327	656332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15900585
13551	NC_003028	GATGG	2	10	656348	656357	20 %	20 %	60 %	0 %	15900586
13552	NC_003028	CTG	2	6	656381	656386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15900586
13553	NC_003028	CCT	2	6	656392	656397	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15900586
13554	NC_003028	CTA	2	6	656522	656527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15900587
13555	NC_003028	GAA	2	6	656529	656534	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15900587
13556	NC_003028	ATT	2	6	656544	656549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15900587
13557	NC_003028	T	7	7	656556	656562	0 %	100 %	0 %	0 %	15900587
13558	NC_003028	CTT	2	6	656568	656573	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15900587
13559	NC_003028	CTTG	2	8	656575	656582	0 %	50 %	25 %	25 %	15900587
13560	NC_003028	ATT	2	6	656584	656589	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15900587
13561	NC_003028	A	6	6	656650	656655	100 %	0 %	0 %	0 %	15900587
13562	NC_003028	AGA	2	6	656734	656739	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15900587
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13564	NC_003028	AAG	2	6	656819	656824	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15900587
13565	NC_003028	GAAA	2	8	656892	656899	75 %	0 %	25 %	0 %	15900587
13566	NC_003028	TCTT	2	8	657028	657035	0 %	75 %	0 %	25 %	15900587
13567	NC_003028	AGC	2	6	657072	657077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15900587
13568	NC_003028	CT	3	6	657104	657109	0 %	50 %	0 %	50 %	15900587
13569	NC_003028	CAT	2	6	657114	657119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15900587
13570	NC_003028	TCCTT	2	10	657167	657176	0 %	60 %	0 %	40 %	15900587
13571	NC_003028	GTTT	2	8	657209	657216	0 %	75 %	25 %	0 %	15900587
13572	NC_003028	TGT	2	6	657263	657268	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15900587
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13578	NC_003028	GA	3	6	657665	657670	50 %	0 %	50 %	0 %	15900587
13579	NC_003028	GAA	2	6	657853	657858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15900587
13580	NC_003028	TTA	2	6	657867	657872	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15900587
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13582	NC_003028	GTTA	2	8	657928	657935	25 %	50 %	25 %	0 %	15900587
13583	NC_003028	GTTT	2	8	657957	657964	0 %	75 %	25 %	0 %	15900587
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13591	NC_003028	T	6	6	658348	658353	0 %	100 %	0 %	0 %	15900587
13592	NC_003028	CTAG	2	8	658468	658475	25 %	25 %	25 %	25 %	15900587
13593	NC_003028	AGAA	2	8	658505	658512	75 %	0 %	25 %	0 %	15900587
13594	NC_003028	GAT	2	6	658549	658554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15900588
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13596	NC_003028	A	6	6	658574	658579	100 %	0 %	0 %	0 %	15900588
13597	NC_003028	ACA	2	6	658670	658675	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15900588
13598	NC_003028	ATC	2	6	658721	658726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15900588
13599	NC_003028	ATG	2	6	658728	658733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15900588
13600	NC_003028	TGA	2	6	658890	658895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15900588
13601	NC_003028	CT	3	6	658919	658924	0 %	50 %	0 %	50 %	15900588
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13603	NC_003028	AACC	2	8	659031	659038	50 %	0 %	0 %	50 %	15900588
13604	NC_003028	A	6	6	659092	659097	100 %	0 %	0 %	0 %	15900588
13605	NC_003028	ATT	3	9	659111	659119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15900588
13606	NC_003028	GAT	2	6	659187	659192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15900588
13607	NC_003028	AGA	2	6	659209	659214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13608	NC_003028	AC	3	6	659226	659231	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13609	NC_003028	T	6	6	659240	659245	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13610	NC_003028	TAG	2	6	659267	659272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13611	NC_003028	TTG	2	6	659373	659378	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15900589
13612	NC_003028	ATG	2	6	659407	659412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15900589
13613	NC_003028	GAA	2	6	659454	659459	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15900589
13614	NC_003028	ACA	2	6	659545	659550	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15900589
13615	NC_003028	ATT	2	6	659634	659639	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15900589
13616	NC_003028	CTG	3	9	659698	659706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15900589
13617	NC_003028	TCT	2	6	659799	659804	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15900589
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13619	NC_003028	TTA	2	6	659848	659853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15900589
13620	NC_003028	AGC	2	6	659906	659911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15900589
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13622	NC_003028	GACTT	2	10	659985	659994	20 %	40 %	20 %	20 %	15900589
13623	NC_003028	TGT	2	6	660011	660016	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15900589
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