MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pneumoniae TIGR4 chromosome

Total Repeats: 44298

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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10002	NC_003028	CTT	2	6	484703	484708	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15900416
10003	NC_003028	CAT	2	6	484799	484804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15900416
10004	NC_003028	AAAAT	2	10	485014	485023	80 %	20 %	0 %	0 %	15900416
10005	NC_003028	GAA	2	6	485043	485048	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15900416
10006	NC_003028	CAT	2	6	485057	485062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15900416
10007	NC_003028	CAG	2	6	485065	485070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15900416
10008	NC_003028	AGA	2	6	485138	485143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15900416
10009	NC_003028	GCT	2	6	485157	485162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15900416
10010	NC_003028	CGAAT	2	10	485202	485211	40 %	20 %	20 %	20 %	15900416
10011	NC_003028	ATT	2	6	485254	485259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15900416
10012	NC_003028	TACTAA	2	12	485268	485279	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	15900416
10013	NC_003028	AGA	2	6	485283	485288	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10014	NC_003028	CA	3	6	485312	485317	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10015	NC_003028	TATT	2	8	485370	485377	25 %	75 %	0 %	0 %	15900417
10016	NC_003028	ATC	2	6	485417	485422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15900417
10017	NC_003028	AGA	2	6	485431	485436	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15900417
10018	NC_003028	T	6	6	485565	485570	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10019	NC_003028	AT	3	6	485577	485582	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10020	NC_003028	CTA	2	6	485688	485693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10021	NC_003028	TAT	2	6	485694	485699	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10022	NC_003028	ATG	3	9	485708	485716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10023	NC_003028	TGTTT	2	10	485722	485731	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
10024	NC_003028	GAA	2	6	485764	485769	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15900418
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10030	NC_003028	TA	3	6	486114	486119	50 %	50 %	0 %	0 %	15900419
10031	NC_003028	A	6	6	486140	486145	100 %	0 %	0 %	0 %	15900419
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10057	NC_003028	TCAG	2	8	487172	487179	25 %	25 %	25 %	25 %	15900419
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10096	NC_003028	ATT	2	6	488592	488597	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15900421
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10099	NC_003028	TA	3	6	488680	488685	50 %	50 %	0 %	0 %	15900421
10100	NC_003028	GAGC	2	8	488705	488712	25 %	0 %	50 %	25 %	15900421
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10110	NC_003028	AT	3	6	489277	489282	50 %	50 %	0 %	0 %	15900422
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10119	NC_003028	GCATA	2	10	489471	489480	40 %	20 %	20 %	20 %	15900422
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10122	NC_003028	TAT	2	6	489537	489542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15900422
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10125	NC_003028	G	6	6	489617	489622	0 %	0 %	100 %	0 %	15900422
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10130	NC_003028	T	6	6	489892	489897	0 %	100 %	0 %	0 %	15900422
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10373	NC_003028	TCT	2	6	500878	500883	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15900433
10374	NC_003028	AAG	2	6	500991	500996	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15900433
10375	NC_003028	GTA	2	6	501007	501012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15900433
10376	NC_003028	GCT	2	6	501126	501131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15900433
10377	NC_003028	A	6	6	501156	501161	100 %	0 %	0 %	0 %	15900433
10378	NC_003028	CTT	2	6	501164	501169	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15900433
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10380	NC_003028	TTGCC	2	10	501238	501247	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
10381	NC_003028	TA	3	6	501249	501254	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10382	NC_003028	TGAC	2	8	501257	501264	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10383	NC_003028	AGC	2	6	501303	501308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10384	NC_003028	T	6	6	501347	501352	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10385	NC_003028	GACG	2	8	501371	501378	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10386	NC_003028	CCT	2	6	501386	501391	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10387	NC_003028	TTC	2	6	501529	501534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10388	NC_003028	ATG	2	6	501723	501728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10389	NC_003028	AT	4	8	501742	501749	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10390	NC_003028	ATTCA	2	10	501840	501849	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
10391	NC_003028	A	6	6	501870	501875	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10392	NC_003028	CTAGT	2	10	501931	501940	20 %	40 %	20 %	20 %	15900434
10393	NC_003028	AAGTC	2	10	501973	501982	40 %	20 %	20 %	20 %	15900434
10394	NC_003028	ATA	2	6	502041	502046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15900434
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10400	NC_003028	CATC	2	8	502438	502445	25 %	25 %	0 %	50 %	15900435
10401	NC_003028	GT	3	6	502485	502490	0 %	50 %	50 %	0 %	15900435
10402	NC_003028	GA	3	6	502504	502509	50 %	0 %	50 %	0 %	15900435
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10406	NC_003028	ATATA	2	10	502630	502639	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
10407	NC_003028	ATGTTC	2	12	502699	502710	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	15900436
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10413	NC_003028	CGG	2	6	503248	503253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15900436
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10433	NC_003028	CTT	2	6	504494	504499	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10437	NC_003028	CGT	2	6	504572	504577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10447	NC_003028	AGG	2	6	505204	505209	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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10475	NC_003028	CTTT	2	8	506422	506429	0 %	75 %	0 %	25 %	15900441
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10487	NC_003028	CTA	2	6	506824	506829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15900441
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10489	NC_003028	T	7	7	506851	506857	0 %	100 %	0 %	0 %	15900441
10490	NC_003028	TCAA	2	8	506875	506882	50 %	25 %	0 %	25 %	15900441
10491	NC_003028	T	6	6	506921	506926	0 %	100 %	0 %	0 %	15900441
10492	NC_003028	GA	3	6	506975	506980	50 %	0 %	50 %	0 %	15900441
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10498	NC_003028	ATC	2	6	507452	507457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15900441
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10500	NC_003028	TCT	2	6	507498	507503	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15900441

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