MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus COL chromosome

Total Repeats: 67321

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_002951	AGA	2	6	138984	138989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57651144
3502	NC_002951	CAGATT	2	12	139067	139078	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	57651144
3503	NC_002951	AT	4	8	139083	139090	50 %	50 %	0 %	0 %	57651144
3504	NC_002951	AGT	2	6	139293	139298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57651145
3505	NC_002951	AAC	2	6	139310	139315	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	57651145
3506	NC_002951	ATACT	2	10	139323	139332	40 %	40 %	0 %	20 %	57651145
3507	NC_002951	CAA	2	6	139450	139455	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	57651145
3508	NC_002951	GAA	2	6	139459	139464	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57651145
3509	NC_002951	GTT	2	6	139480	139485	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	57651145
3510	NC_002951	TGC	2	6	139593	139598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57651145
3511	NC_002951	AGA	2	6	139620	139625	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57651145
3512	NC_002951	TAT	2	6	139689	139694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	57651145
3513	NC_002951	GGT	2	6	139801	139806	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	57651145
3514	NC_002951	ATG	2	6	139808	139813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57651145
3515	NC_002951	ATG	2	6	139844	139849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57651145
3516	NC_002951	TGA	2	6	139907	139912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57651145
3517	NC_002951	AAGA	2	8	139921	139928	75 %	0 %	25 %	0 %	57651145
3518	NC_002951	CTT	2	6	139944	139949	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	57651145
3519	NC_002951	TAG	2	6	139955	139960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57651145
3520	NC_002951	TCG	2	6	139983	139988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57651145
3521	NC_002951	GAT	2	6	140026	140031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57651145
3522	NC_002951	AGA	2	6	140061	140066	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57651145
3523	NC_002951	ATT	2	6	140077	140082	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	57651145
3524	NC_002951	CAG	2	6	140084	140089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57651145
3525	NC_002951	GA	3	6	140130	140135	50 %	0 %	50 %	0 %	57651145
3526	NC_002951	AT	3	6	140136	140141	50 %	50 %	0 %	0 %	57651145
3527	NC_002951	GGT	2	6	140173	140178	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	57651145
3528	NC_002951	TAC	2	6	140196	140201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57651145
3529	NC_002951	CAG	2	6	140313	140318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3530	NC_002951	CTG	2	6	140349	140354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3531	NC_002951	TAT	2	6	140359	140364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3532	NC_002951	CTT	2	6	140390	140395	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3533	NC_002951	TAATA	2	10	140489	140498	60 %	40 %	0 %	0 %	57651146
3534	NC_002951	GTG	2	6	140539	140544	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	57651146
3535	NC_002951	ACC	2	6	140552	140557	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	57651146
3536	NC_002951	AGGC	2	8	140629	140636	25 %	0 %	50 %	25 %	57651146
3537	NC_002951	CAC	2	6	140683	140688	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	57651146
3538	NC_002951	AAAT	2	8	140869	140876	75 %	25 %	0 %	0 %	57651146
3539	NC_002951	ATT	2	6	140912	140917	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	57651146
3540	NC_002951	GCG	2	6	140952	140957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	57651146
3541	NC_002951	TAA	2	6	141005	141010	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57651146
3542	NC_002951	TA	3	6	141026	141031	50 %	50 %	0 %	0 %	57651146
3543	NC_002951	AAT	2	6	141054	141059	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57651146
3544	NC_002951	GAT	2	6	141134	141139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57651146
3545	NC_002951	GAC	2	6	141149	141154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57651146
3546	NC_002951	TG	3	6	141190	141195	0 %	50 %	50 %	0 %	57651146
3547	NC_002951	TG	3	6	141200	141205	0 %	50 %	50 %	0 %	57651146
3548	NC_002951	GAC	3	9	141274	141282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57651147
3549	NC_002951	TAAA	2	8	141294	141301	75 %	25 %	0 %	0 %	57651147
3550	NC_002951	ATA	2	6	141423	141428	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57651147
3551	NC_002951	ACA	2	6	141461	141466	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	57651147
3552	NC_002951	ATTTT	2	10	141480	141489	20 %	80 %	0 %	0 %	57651147
3553	NC_002951	ATA	2	6	141552	141557	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57651147
3554	NC_002951	AAT	2	6	141565	141570	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57651147
3555	NC_002951	TGC	2	6	141640	141645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57651147
3556	NC_002951	TAA	2	6	141646	141651	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57651147
3557	NC_002951	TGA	2	6	141713	141718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57651147
3558	NC_002951	ATA	2	6	141735	141740	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57651147
3559	NC_002951	TGT	2	6	141824	141829	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	57651147
3560	NC_002951	TTTG	2	8	141855	141862	0 %	75 %	25 %	0 %	57651147
3561	NC_002951	TCT	2	6	142056	142061	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	57651148
3562	NC_002951	AT	3	6	142076	142081	50 %	50 %	0 %	0 %	57651148
3563	NC_002951	CAT	2	6	142120	142125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57651148
3564	NC_002951	ATG	2	6	142152	142157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57651148
3565	NC_002951	CAA	2	6	142183	142188	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	57651148
3566	NC_002951	ATTA	2	8	142196	142203	50 %	50 %	0 %	0 %	57651148
3567	NC_002951	ATC	2	6	142241	142246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57651148
3568	NC_002951	AAT	2	6	142301	142306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57651148
3569	NC_002951	GTT	3	9	142345	142353	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	57651148
3570	NC_002951	TCA	2	6	142368	142373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57651148
3571	NC_002951	TCT	2	6	142437	142442	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	57651148
3572	NC_002951	TAA	2	6	142577	142582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57651148
3573	NC_002951	TGAT	2	8	142603	142610	25 %	50 %	25 %	0 %	57651148
3574	NC_002951	TAA	2	6	142667	142672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57651148
3575	NC_002951	CTTT	2	8	142817	142824	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3576	NC_002951	AT	3	6	142957	142962	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3577	NC_002951	ATT	2	6	143020	143025	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	57651149
3578	NC_002951	CT	3	6	143051	143056	0 %	50 %	0 %	50 %	57651149
3579	NC_002951	TAA	2	6	143116	143121	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57651149
3580	NC_002951	CTT	2	6	143131	143136	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	57651149
3581	NC_002951	T	6	6	143162	143167	0 %	100 %	0 %	0 %	57651149
3582	NC_002951	GT	3	6	143251	143256	0 %	50 %	50 %	0 %	57651149
3583	NC_002951	TGGT	2	8	143270	143277	0 %	50 %	50 %	0 %	57651149
3584	NC_002951	T	6	6	143279	143284	0 %	100 %	0 %	0 %	57651149
3585	NC_002951	GCA	2	6	143316	143321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57651149
3586	NC_002951	TAA	2	6	143336	143341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57651149
3587	NC_002951	T	6	6	143415	143420	0 %	100 %	0 %	0 %	57651149
3588	NC_002951	CAG	2	6	143446	143451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57651149
3589	NC_002951	T	6	6	143519	143524	0 %	100 %	0 %	0 %	57651149
3590	NC_002951	TCT	2	6	143577	143582	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	57651149
3591	NC_002951	TAA	3	9	143606	143614	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57651149
3592	NC_002951	GCT	2	6	143619	143624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57651149
3593	NC_002951	TGG	2	6	143654	143659	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	57651149
3594	NC_002951	T	6	6	143678	143683	0 %	100 %	0 %	0 %	57651149
3595	NC_002951	CAA	2	6	143698	143703	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	57651149
3596	NC_002951	TTGTA	2	10	143704	143713	20 %	60 %	20 %	0 %	57651149
3597	NC_002951	TCC	2	6	143849	143854	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	57651149
3598	NC_002951	TGC	3	9	143918	143926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57651149
3599	NC_002951	TAA	2	6	144087	144092	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3600	NC_002951	CTTT	2	8	144093	144100	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3601	NC_002951	ATTT	2	8	144180	144187	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3602	NC_002951	A	7	7	144209	144215	100 %	0 %	0 %	0 %	57651150
3603	NC_002951	TA	3	6	144216	144221	50 %	50 %	0 %	0 %	57651150
3604	NC_002951	TTG	2	6	144243	144248	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	57651150
3605	NC_002951	TAT	2	6	144327	144332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	57651150
3606	NC_002951	TGC	2	6	144361	144366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57651150
3607	NC_002951	GCA	2	6	144536	144541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57651150
3608	NC_002951	TGT	2	6	144571	144576	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	57651150
3609	NC_002951	AATG	2	8	144637	144644	50 %	25 %	25 %	0 %	57651150
3610	NC_002951	AGA	2	6	144691	144696	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57651150
3611	NC_002951	A	6	6	144696	144701	100 %	0 %	0 %	0 %	57651150
3612	NC_002951	TGCAA	2	10	144709	144718	40 %	20 %	20 %	20 %	57651150
3613	NC_002951	TTC	2	6	144808	144813	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	57651150
3614	NC_002951	AAAG	2	8	144815	144822	75 %	0 %	25 %	0 %	57651150
3615	NC_002951	ATGC	2	8	144857	144864	25 %	25 %	25 %	25 %	57651150
3616	NC_002951	AGC	2	6	145036	145041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57651150
3617	NC_002951	TCA	2	6	145055	145060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57651150
3618	NC_002951	AGA	2	6	145093	145098	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57651150
3619	NC_002951	AGA	2	6	145110	145115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57651150
3620	NC_002951	ATG	2	6	145122	145127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57651150
3621	NC_002951	ATA	2	6	145161	145166	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57651150
3622	NC_002951	ATG	2	6	145191	145196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57651150
3623	NC_002951	CCG	2	6	145304	145309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	57651150
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3625	NC_002951	AC	3	6	145389	145394	50 %	0 %	0 %	50 %	57651150
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3997	NC_002951	ATT	2	6	161052	161057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	57651160
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3999	NC_002951	AATA	2	8	161072	161079	75 %	25 %	0 %	0 %	57651160
4000	NC_002951	AGC	2	6	161093	161098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57651160

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