MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus Mu50 plasmid VRSAp

Total Repeats: 698

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002774	TA	3	6	86	91	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_002774	TAA	2	6	166	171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_002774	GTTT	2	8	186	193	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_002774	AT	3	6	194	199	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_002774	T	7	7	199	205	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_002774	TAT	2	6	214	219	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_002774	AT	4	8	218	225	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_002774	ATC	2	6	229	234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_002774	TTA	2	6	276	281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_002774	TAT	2	6	311	316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14141824
11	NC_002774	ATTT	2	8	382	389	25 %	75 %	0 %	0 %	14141824
12	NC_002774	TATG	2	8	431	438	25 %	50 %	25 %	0 %	14141824
13	NC_002774	TTA	2	6	441	446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14141824
14	NC_002774	AATG	2	8	474	481	50 %	25 %	25 %	0 %	14141824
15	NC_002774	ATA	3	9	493	501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14141824
16	NC_002774	TAA	2	6	518	523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14141824
17	NC_002774	TG	3	6	529	534	0 %	50 %	50 %	0 %	14141824
18	NC_002774	A	6	6	556	561	100 %	0 %	0 %	0 %	14141824
19	NC_002774	A	7	7	572	578	100 %	0 %	0 %	0 %	14141824
20	NC_002774	TAA	2	6	583	588	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14141824
21	NC_002774	AATTT	2	10	589	598	40 %	60 %	0 %	0 %	14141824
22	NC_002774	TAA	2	6	623	628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14141824
23	NC_002774	ACT	2	6	889	894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14141824
24	NC_002774	ATG	2	6	907	912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14141824
25	NC_002774	GAA	2	6	936	941	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14141824
26	NC_002774	TTA	2	6	997	1002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14141824
27	NC_002774	TTA	2	6	1011	1016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14141824
28	NC_002774	CAA	2	6	1034	1039	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	14141824
29	NC_002774	ATT	2	6	1054	1059	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14141824
30	NC_002774	AGA	2	6	1064	1069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14141824
31	NC_002774	A	7	7	1123	1129	100 %	0 %	0 %	0 %	14141824
32	NC_002774	TAA	2	6	1202	1207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14141824
33	NC_002774	ACG	2	6	1208	1213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	14141824
34	NC_002774	CTT	2	6	1231	1236	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14141824
35	NC_002774	AAT	2	6	1246	1251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14141824
36	NC_002774	TAA	2	6	1258	1263	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_002774	CAA	2	6	1266	1271	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_002774	TAAT	2	8	1343	1350	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_002774	TAAG	2	8	1351	1358	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_002774	CTTTT	2	10	1370	1379	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_002774	T	6	6	1376	1381	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_002774	ATT	3	9	1401	1409	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_002774	TAC	2	6	1416	1421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_002774	T	6	6	1431	1436	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_002774	CTT	2	6	1478	1483	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_002774	TATT	2	8	1488	1495	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_002774	TTC	2	6	1538	1543	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_002774	TCA	2	6	1548	1553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_002774	CTTT	2	8	1620	1627	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_002774	TCTA	2	8	1628	1635	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_002774	T	6	6	1638	1643	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_002774	ATTT	2	8	1682	1689	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_002774	T	7	7	1687	1693	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_002774	TCAT	2	8	1707	1714	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_002774	TCT	2	6	1744	1749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14141825
56	NC_002774	TGC	2	6	1772	1777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14141825
57	NC_002774	TTA	2	6	1795	1800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14141825
58	NC_002774	TCA	2	6	1837	1842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14141825
59	NC_002774	TTTA	2	8	1869	1876	25 %	75 %	0 %	0 %	14141825
60	NC_002774	A	6	6	1876	1881	100 %	0 %	0 %	0 %	14141825
61	NC_002774	ACC	2	6	1884	1889	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	14141825
62	NC_002774	TTA	2	6	1894	1899	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14141825
63	NC_002774	GTT	2	6	1904	1909	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	14141825
64	NC_002774	CTT	2	6	1910	1915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14141825
65	NC_002774	T	6	6	1917	1922	0 %	100 %	0 %	0 %	14141825
66	NC_002774	TGTT	2	8	1980	1987	0 %	75 %	25 %	0 %	14141825
67	NC_002774	A	6	6	2002	2007	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_002774	TA	3	6	2023	2028	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_002774	TATAA	2	10	2069	2078	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_002774	ACTGC	2	10	2093	2102	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
71	NC_002774	A	7	7	2179	2185	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_002774	AG	3	6	2192	2197	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_002774	CAA	2	6	2255	2260	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	14141826
74	NC_002774	A	6	6	2259	2264	100 %	0 %	0 %	0 %	14141826
75	NC_002774	TGA	2	6	2292	2297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14141826
76	NC_002774	TA	3	6	2303	2308	50 %	50 %	0 %	0 %	14141826
77	NC_002774	A	6	6	2324	2329	100 %	0 %	0 %	0 %	14141826
78	NC_002774	CTC	2	6	2375	2380	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14141826
79	NC_002774	AAT	2	6	2446	2451	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14141826
80	NC_002774	A	6	6	2460	2465	100 %	0 %	0 %	0 %	14141826
81	NC_002774	TTA	2	6	2488	2493	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14141826
82	NC_002774	AG	3	6	2515	2520	50 %	0 %	50 %	0 %	14141826
83	NC_002774	GAT	2	6	2602	2607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14141826
84	NC_002774	AAC	2	6	2611	2616	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	14141826
85	NC_002774	TACT	2	8	2633	2640	25 %	50 %	0 %	25 %	14141826
86	NC_002774	ATG	2	6	2699	2704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14141826
87	NC_002774	TAAA	2	8	2723	2730	75 %	25 %	0 %	0 %	14141826
88	NC_002774	TAA	2	6	2736	2741	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14141826
89	NC_002774	AAG	2	6	2780	2785	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14141826
90	NC_002774	AATTAA	2	12	2801	2812	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14141826
91	NC_002774	A	6	6	2882	2887	100 %	0 %	0 %	0 %	14141826
92	NC_002774	AGA	2	6	2910	2915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14141826
93	NC_002774	GAAA	2	8	2935	2942	75 %	0 %	25 %	0 %	14141826
94	NC_002774	TTA	2	6	2982	2987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14141826
95	NC_002774	AGA	2	6	3010	3015	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14141826
96	NC_002774	ATT	2	6	3039	3044	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14141826
97	NC_002774	AGAA	2	8	3056	3063	75 %	0 %	25 %	0 %	14141826
98	NC_002774	ATT	2	6	3084	3089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14141826
99	NC_002774	AAGT	2	8	3110	3117	50 %	25 %	25 %	0 %	14141826
100	NC_002774	TATTT	2	10	3138	3147	20 %	80 %	0 %	0 %	14141826
101	NC_002774	GATA	2	8	3148	3155	50 %	25 %	25 %	0 %	14141826
102	NC_002774	GAAA	2	8	3183	3190	75 %	0 %	25 %	0 %	14141826
103	NC_002774	ATG	2	6	3299	3304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14141826
104	NC_002774	AGAAA	2	10	3319	3328	80 %	0 %	20 %	0 %	14141826
105	NC_002774	CAA	2	6	3349	3354	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	14141826
106	NC_002774	ACTA	2	8	3376	3383	50 %	25 %	0 %	25 %	14141826
107	NC_002774	GAA	2	6	3402	3407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14141826
108	NC_002774	AG	3	6	3421	3426	50 %	0 %	50 %	0 %	14141826
109	NC_002774	ATCA	2	8	3446	3453	50 %	25 %	0 %	25 %	14141826
110	NC_002774	A	7	7	3482	3488	100 %	0 %	0 %	0 %	14141826
111	NC_002774	TCA	3	9	3522	3530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14141826
112	NC_002774	ATG	2	6	3539	3544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14141826
113	NC_002774	TTG	2	6	3557	3562	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	14141826
114	NC_002774	CAAA	2	8	3615	3622	75 %	0 %	0 %	25 %	14141826
115	NC_002774	ATG	2	6	3638	3643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14141826
116	NC_002774	AGA	2	6	3651	3656	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14141826
117	NC_002774	A	6	6	3664	3669	100 %	0 %	0 %	0 %	14141826
118	NC_002774	GAAAAA	2	12	3760	3771	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	14141826
119	NC_002774	TGA	3	9	3798	3806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14141826
120	NC_002774	AAG	3	9	3914	3922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14141826
121	NC_002774	TAGA	2	8	3947	3954	50 %	25 %	25 %	0 %	14141826
122	NC_002774	CGAA	2	8	4049	4056	50 %	0 %	25 %	25 %	14141826
123	NC_002774	ATC	2	6	4079	4084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14141826
124	NC_002774	AGA	3	9	4091	4099	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14141826
125	NC_002774	AG	3	6	4104	4109	50 %	0 %	50 %	0 %	14141826
126	NC_002774	TAA	3	9	4164	4172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_002774	TA	3	6	4221	4226	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_002774	TAT	2	6	4249	4254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_002774	A	6	6	4328	4333	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_002774	A	6	6	4359	4364	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_002774	AT	3	6	4375	4380	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_002774	AAT	2	6	4399	4404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_002774	AAGT	2	8	4523	4530	50 %	25 %	25 %	0 %	14141827
134	NC_002774	ATT	2	6	4566	4571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14141827
135	NC_002774	AATT	2	8	4589	4596	50 %	50 %	0 %	0 %	14141827
136	NC_002774	TAA	2	6	4620	4625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14141827
137	NC_002774	T	6	6	4648	4653	0 %	100 %	0 %	0 %	14141827
138	NC_002774	AGG	2	6	4656	4661	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14141827
139	NC_002774	AAAAAT	2	12	4690	4701	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	14141827
140	NC_002774	CTT	2	6	4705	4710	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14141827
141	NC_002774	TTG	2	6	4722	4727	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	14141827
142	NC_002774	AAAT	2	8	4808	4815	75 %	25 %	0 %	0 %	14141827
143	NC_002774	T	8	8	4847	4854	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_002774	ATG	2	6	4877	4882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
145	NC_002774	AGA	2	6	4933	4938	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14141828
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285	NC_002774	TCT	2	6	9854	9859	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14141838
286	NC_002774	ATC	2	6	9919	9924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14141838
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288	NC_002774	ATC	2	6	9955	9960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14141838
289	NC_002774	GTG	2	6	9975	9980	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	14141838
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298	NC_002774	ATA	2	6	10290	10295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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