MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus Mu50 chromosome

Total Repeats: 68619

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_002758	TGG	2	6	20176	20181	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15923004
502	NC_002758	TGC	2	6	20200	20205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15923004
503	NC_002758	ACA	2	6	20251	20256	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15923004
504	NC_002758	TAAAGG	2	12	20319	20330	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	15923005
505	NC_002758	A	6	6	20332	20337	100 %	0 %	0 %	0 %	15923005
506	NC_002758	AAG	2	6	20348	20353	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15923005
507	NC_002758	CTT	2	6	20376	20381	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15923005
508	NC_002758	A	6	6	20443	20448	100 %	0 %	0 %	0 %	15923005
509	NC_002758	CAA	2	6	20467	20472	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15923005
510	NC_002758	TTGAAG	2	12	20516	20527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15923005
511	NC_002758	GGT	2	6	20548	20553	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15923005
512	NC_002758	AGTA	2	8	20568	20575	50 %	25 %	25 %	0 %	15923005
513	NC_002758	ATTC	2	8	20653	20660	25 %	50 %	0 %	25 %	15923005
514	NC_002758	AAG	2	6	20696	20701	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15923005
515	NC_002758	AC	3	6	20721	20726	50 %	0 %	0 %	50 %	15923005
516	NC_002758	GTCT	2	8	20824	20831	0 %	50 %	25 %	25 %	15923006
517	NC_002758	ATT	2	6	20840	20845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15923006
518	NC_002758	TAC	2	6	20866	20871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15923006
519	NC_002758	ATG	2	6	20933	20938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15923006
520	NC_002758	ATA	2	6	20952	20957	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15923006
521	NC_002758	TGT	2	6	20968	20973	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15923006
522	NC_002758	TGAA	2	8	21009	21016	50 %	25 %	25 %	0 %	15923006
523	NC_002758	ACG	2	6	21062	21067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15923006
524	NC_002758	TAT	2	6	21080	21085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15923006
525	NC_002758	GCAT	2	8	21103	21110	25 %	25 %	25 %	25 %	15923006
526	NC_002758	GATT	2	8	21120	21127	25 %	50 %	25 %	0 %	15923006
527	NC_002758	ATG	2	6	21150	21155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15923006
528	NC_002758	ATG	2	6	21162	21167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15923006
529	NC_002758	ATC	2	6	21220	21225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15923006
530	NC_002758	CAG	2	6	21360	21365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15923006
531	NC_002758	GGTA	2	8	21610	21617	25 %	25 %	50 %	0 %	15923006
532	NC_002758	TGA	2	6	21643	21648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15923006
533	NC_002758	GTC	2	6	21687	21692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15923006
534	NC_002758	TGATTG	2	12	21720	21731	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	15923006
535	NC_002758	ACT	2	6	21732	21737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15923006
536	NC_002758	ACA	2	6	21781	21786	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15923006
537	NC_002758	TC	3	6	21801	21806	0 %	50 %	0 %	50 %	15923006
538	NC_002758	GTG	2	6	21870	21875	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15923006
539	NC_002758	AAC	2	6	21879	21884	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15923006
540	NC_002758	ATG	2	6	21902	21907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15923006
541	NC_002758	TGA	2	6	21970	21975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15923006
542	NC_002758	GGC	2	6	21989	21994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15923006
543	NC_002758	GAT	2	6	22001	22006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15923006
544	NC_002758	GAT	2	6	22010	22015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15923006
545	NC_002758	GGT	2	6	22016	22021	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15923006
546	NC_002758	ATG	2	6	22038	22043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15923006
547	NC_002758	TGAAAT	2	12	22051	22062	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	15923006
548	NC_002758	AGTTA	2	10	22099	22108	40 %	40 %	20 %	0 %	15923006
549	NC_002758	ATA	2	6	22125	22130	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15923006
550	NC_002758	ATG	2	6	22163	22168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15923006
551	NC_002758	A	6	6	22170	22175	100 %	0 %	0 %	0 %	15923006
552	NC_002758	AAT	2	6	22188	22193	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_002758	GAT	2	6	22200	22205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
554	NC_002758	AT	3	6	22243	22248	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_002758	TCA	2	6	22452	22457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15923007
556	NC_002758	GTA	2	6	22461	22466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15923007
557	NC_002758	AAGGAA	2	12	22489	22500	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15923007
558	NC_002758	CG	3	6	22538	22543	0 %	0 %	50 %	50 %	15923007
559	NC_002758	GGT	2	6	22551	22556	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15923007
560	NC_002758	AAT	2	6	22557	22562	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15923007
561	NC_002758	GTT	2	6	22665	22670	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15923007
562	NC_002758	GAA	2	6	22794	22799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15923007
563	NC_002758	A	6	6	22833	22838	100 %	0 %	0 %	0 %	15923007
564	NC_002758	ATT	2	6	22922	22927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15923007
565	NC_002758	CAT	2	6	22987	22992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15923007
566	NC_002758	TGA	2	6	22994	22999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15923007
567	NC_002758	GAA	2	6	23007	23012	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15923007
568	NC_002758	TGC	2	6	23018	23023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15923007
569	NC_002758	ATT	2	6	23288	23293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15923007
570	NC_002758	CAT	2	6	23307	23312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15923007
571	NC_002758	ACA	3	9	23340	23348	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15923007
572	NC_002758	CGT	2	6	23358	23363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15923007
573	NC_002758	GGTT	2	8	23367	23374	0 %	50 %	50 %	0 %	15923007
574	NC_002758	TCG	2	6	23399	23404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15923007
575	NC_002758	AGA	2	6	23579	23584	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15923007
576	NC_002758	AGA	2	6	23606	23611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15923007
577	NC_002758	ATGTA	2	10	23657	23666	40 %	40 %	20 %	0 %	15923007
578	NC_002758	TCT	2	6	23677	23682	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15923007
579	NC_002758	AACA	2	8	23701	23708	75 %	0 %	0 %	25 %	15923007
580	NC_002758	TA	3	6	23738	23743	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
581	NC_002758	AGG	2	6	23792	23797	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
582	NC_002758	TTTG	2	8	23805	23812	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
583	NC_002758	TCGAT	2	10	23821	23830	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
584	NC_002758	GAT	2	6	23891	23896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
585	NC_002758	AAG	2	6	23910	23915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
586	NC_002758	TAA	2	6	23929	23934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
587	NC_002758	ATT	2	6	24022	24027	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
588	NC_002758	ATA	2	6	24028	24033	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
589	NC_002758	TTC	2	6	24073	24078	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
590	NC_002758	A	6	6	24079	24084	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
591	NC_002758	A	6	6	24102	24107	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
592	NC_002758	ATCT	2	8	24140	24147	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
593	NC_002758	CGG	2	6	24198	24203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
594	NC_002758	T	6	6	24236	24241	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
595	NC_002758	GCCT	2	8	24268	24275	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
596	NC_002758	T	7	7	24344	24350	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
597	NC_002758	ATATT	2	10	24358	24367	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
598	NC_002758	AT	3	6	24376	24381	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
599	NC_002758	TTA	2	6	24493	24498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
600	NC_002758	TTC	2	6	24530	24535	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
601	NC_002758	CCA	2	6	24547	24552	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
602	NC_002758	TCC	2	6	24554	24559	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
603	NC_002758	AAT	2	6	24591	24596	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
604	NC_002758	ATTT	2	8	24600	24607	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
605	NC_002758	TAT	2	6	24652	24657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
606	NC_002758	TCA	2	6	24671	24676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
607	NC_002758	CCG	2	6	24702	24707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
608	NC_002758	TAA	2	6	24716	24721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
609	NC_002758	A	6	6	24720	24725	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_002758	AT	3	6	24731	24736	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_002758	TA	3	6	24782	24787	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
612	NC_002758	T	6	6	24856	24861	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
613	NC_002758	A	6	6	24886	24891	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
614	NC_002758	ATA	2	6	24899	24904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_002758	GTT	2	6	24947	24952	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15923008
616	NC_002758	TGA	3	9	24958	24966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15923008
617	NC_002758	A	7	7	25000	25006	100 %	0 %	0 %	0 %	15923008
618	NC_002758	ATG	2	6	25041	25046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15923008
619	NC_002758	GAA	3	9	25064	25072	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15923008
620	NC_002758	A	6	6	25142	25147	100 %	0 %	0 %	0 %	15923008
621	NC_002758	AAT	3	9	25159	25167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15923008
622	NC_002758	CGT	2	6	25286	25291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15923008
623	NC_002758	A	6	6	25382	25387	100 %	0 %	0 %	0 %	15923008
624	NC_002758	TGAATT	2	12	25417	25428	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	15923008
625	NC_002758	ATT	2	6	25434	25439	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15923008
626	NC_002758	TTA	2	6	25478	25483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15923008
627	NC_002758	GTAC	2	8	25517	25524	25 %	25 %	25 %	25 %	15923008
628	NC_002758	TCG	2	6	25540	25545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15923008
629	NC_002758	GAT	2	6	25565	25570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15923008
630	NC_002758	AT	3	6	25585	25590	50 %	50 %	0 %	0 %	15923008
631	NC_002758	TCC	2	6	25617	25622	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15923008
632	NC_002758	AAC	2	6	25623	25628	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15923008
633	NC_002758	AAC	2	6	25662	25667	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15923009
634	NC_002758	AAT	2	6	25751	25756	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15923009
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762	NC_002758	CAC	2	6	31410	31415	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	57634612
763	NC_002758	TGC	2	6	31423	31428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57634612
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