MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sulfolobus solfataricus P2 chromosome

Total Repeats: 64915

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002754	CTT	2	6	8	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_002754	GCA	2	6	28	33	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_002754	CT	3	6	51	56	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_002754	ATT	2	6	63	68	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_002754	TTCG	2	8	123	130	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_002754	TAA	2	6	182	187	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_002754	AAG	2	6	216	221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_002754	GAT	2	6	248	253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15896973
9	NC_002754	AGA	2	6	281	286	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15896973
10	NC_002754	AT	3	6	318	323	50 %	50 %	0 %	0 %	15896973
11	NC_002754	AGA	2	6	348	353	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15896973
12	NC_002754	TC	3	6	388	393	0 %	50 %	0 %	50 %	15896973
13	NC_002754	GA	3	6	494	499	50 %	0 %	50 %	0 %	15896973
14	NC_002754	AAT	2	6	548	553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15896973
15	NC_002754	TCA	2	6	626	631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15896973
16	NC_002754	AT	3	6	648	653	50 %	50 %	0 %	0 %	15896973
17	NC_002754	GATAG	2	10	702	711	40 %	20 %	40 %	0 %	15896973
18	NC_002754	CAA	2	6	745	750	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15896973
19	NC_002754	AAT	2	6	773	778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15896973
20	NC_002754	TAAAAT	2	12	855	866	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15896973
21	NC_002754	AGT	2	6	903	908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15896974
22	NC_002754	GGA	2	6	934	939	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15896974
23	NC_002754	ACA	2	6	994	999	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15896974
24	NC_002754	ATA	2	6	1000	1005	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15896974
25	NC_002754	AG	3	6	1174	1179	50 %	0 %	50 %	0 %	15896974
26	NC_002754	ATT	2	6	1230	1235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15896974
27	NC_002754	A	6	6	1263	1268	100 %	0 %	0 %	0 %	15896974
28	NC_002754	AGG	2	6	1277	1282	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15896974
29	NC_002754	ATA	2	6	1285	1290	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15896974
30	NC_002754	ATA	2	6	1318	1323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15896974
31	NC_002754	GAT	2	6	1348	1353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15896974
32	NC_002754	TGT	2	6	1395	1400	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15896974
33	NC_002754	GAA	2	6	1444	1449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15896974
34	NC_002754	TAA	2	6	1562	1567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15896974
35	NC_002754	A	6	6	1573	1578	100 %	0 %	0 %	0 %	15896974
36	NC_002754	AGG	3	9	1614	1622	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15896974
37	NC_002754	AG	3	6	1667	1672	50 %	0 %	50 %	0 %	15896974
38	NC_002754	AAG	2	6	1673	1678	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15896974
39	NC_002754	GAA	2	6	1679	1684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15896974
40	NC_002754	ACTT	2	8	1697	1704	25 %	50 %	0 %	25 %	15896974
41	NC_002754	AT	3	6	1773	1778	50 %	50 %	0 %	0 %	15896974
42	NC_002754	ATG	2	6	1790	1795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15896974
43	NC_002754	GGA	2	6	1810	1815	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15896974
44	NC_002754	TAA	2	6	1817	1822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15896974
45	NC_002754	TAA	2	6	1860	1865	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15896974
46	NC_002754	GA	3	6	1893	1898	50 %	0 %	50 %	0 %	15896974
47	NC_002754	ATT	2	6	1923	1928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15896974
48	NC_002754	TAAAA	2	10	1968	1977	80 %	20 %	0 %	0 %	15896974
49	NC_002754	TAAA	2	8	1979	1986	75 %	25 %	0 %	0 %	15896974
50	NC_002754	TAC	2	6	2009	2014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15896974
51	NC_002754	ATA	2	6	2018	2023	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15896974
52	NC_002754	ATTA	2	8	2028	2035	50 %	50 %	0 %	0 %	15896974
53	NC_002754	AAGGAT	2	12	2041	2052	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	15896974
54	NC_002754	TAA	2	6	2057	2062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15896974
55	NC_002754	GTA	2	6	2097	2102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15896975
56	NC_002754	TAA	2	6	2135	2140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15896975
57	NC_002754	TGA	2	6	2171	2176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15896975
58	NC_002754	AAT	2	6	2249	2254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15896975
59	NC_002754	GAT	2	6	2268	2273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15896975
60	NC_002754	AT	4	8	2366	2373	50 %	50 %	0 %	0 %	15896975
61	NC_002754	GAA	2	6	2389	2394	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15896975
62	NC_002754	TTG	2	6	2401	2406	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15896975
63	NC_002754	AGA	2	6	2435	2440	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15896975
64	NC_002754	ATA	2	6	2449	2454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15896975
65	NC_002754	ATT	2	6	2471	2476	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15896975
66	NC_002754	GCA	2	6	2514	2519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15896975
67	NC_002754	TAG	2	6	2590	2595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15896975
68	NC_002754	AAAG	2	8	2675	2682	75 %	0 %	25 %	0 %	15896975
69	NC_002754	A	6	6	2684	2689	100 %	0 %	0 %	0 %	15896975
70	NC_002754	A	6	6	2744	2749	100 %	0 %	0 %	0 %	15896975
71	NC_002754	GGT	2	6	2933	2938	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15896975
72	NC_002754	GAA	2	6	2949	2954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15896975
73	NC_002754	AGA	2	6	2988	2993	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_002754	TCTAG	2	10	3090	3099	20 %	40 %	20 %	20 %	15896976
75	NC_002754	ATTA	2	8	3125	3132	50 %	50 %	0 %	0 %	15896976
76	NC_002754	CTT	2	6	3144	3149	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15896976
77	NC_002754	AGA	2	6	3179	3184	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15896976
78	NC_002754	CT	3	6	3205	3210	0 %	50 %	0 %	50 %	15896976
79	NC_002754	TTA	2	6	3211	3216	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15896976
80	NC_002754	ATA	2	6	3352	3357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15896976
81	NC_002754	AT	3	6	3369	3374	50 %	50 %	0 %	0 %	15896976
82	NC_002754	AT	3	6	3414	3419	50 %	50 %	0 %	0 %	15896976
83	NC_002754	TAT	2	6	3484	3489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15896976
84	NC_002754	TTGAT	2	10	3544	3553	20 %	60 %	20 %	0 %	15896976
85	NC_002754	AAC	2	6	3563	3568	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15896976
86	NC_002754	GTA	2	6	3583	3588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15896976
87	NC_002754	AC	3	6	3651	3656	50 %	0 %	0 %	50 %	15896976
88	NC_002754	GAA	2	6	3672	3677	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15896976
89	NC_002754	A	6	6	3676	3681	100 %	0 %	0 %	0 %	15896976
90	NC_002754	TAA	2	6	3682	3687	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15896976
91	NC_002754	TAA	3	9	3695	3703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15896976
92	NC_002754	AATA	2	8	3704	3711	75 %	25 %	0 %	0 %	15896976
93	NC_002754	TAA	2	6	3797	3802	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15896977
94	NC_002754	GATG	2	8	3847	3854	25 %	25 %	50 %	0 %	15896977
95	NC_002754	TAT	2	6	3901	3906	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15896977
96	NC_002754	AGA	2	6	3912	3917	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15896977
97	NC_002754	AT	3	6	3922	3927	50 %	50 %	0 %	0 %	15896977
98	NC_002754	TAG	2	6	4098	4103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15896977
99	NC_002754	AGA	2	6	4155	4160	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15896977
100	NC_002754	AG	3	6	4176	4181	50 %	0 %	50 %	0 %	15896977
101	NC_002754	TTA	2	6	4263	4268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15896977
102	NC_002754	AAG	2	6	4273	4278	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15896977
103	NC_002754	ATT	2	6	4304	4309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15896977
104	NC_002754	ATA	2	6	4310	4315	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15896977
105	NC_002754	TA	3	6	4358	4363	50 %	50 %	0 %	0 %	15896977
106	NC_002754	TCA	2	6	4387	4392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15896977
107	NC_002754	TAT	2	6	4443	4448	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15896977
108	NC_002754	ATTT	2	8	4492	4499	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_002754	AAAG	2	8	4601	4608	75 %	0 %	25 %	0 %	15896978
110	NC_002754	ACCC	2	8	4627	4634	25 %	0 %	0 %	75 %	15896978
111	NC_002754	GGA	2	6	4674	4679	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15896978
112	NC_002754	TTAG	2	8	4710	4717	25 %	50 %	25 %	0 %	15896978
113	NC_002754	ATG	2	6	4720	4725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15896978
114	NC_002754	TAG	2	6	4795	4800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15896978
115	NC_002754	TTTA	2	8	4825	4832	25 %	75 %	0 %	0 %	15896978
116	NC_002754	GA	3	6	4840	4845	50 %	0 %	50 %	0 %	15896978
117	NC_002754	TAA	2	6	4885	4890	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15896978
118	NC_002754	TTG	2	6	4894	4899	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15896978
119	NC_002754	TGA	2	6	4937	4942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15896978
120	NC_002754	ATT	2	6	4992	4997	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15896978
121	NC_002754	AGA	2	6	5003	5008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15896978
122	NC_002754	ATT	2	6	5031	5036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15896978
123	NC_002754	AGT	2	6	5075	5080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15896978
124	NC_002754	GAA	2	6	5164	5169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15896978
125	NC_002754	GCA	2	6	5307	5312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15896978
126	NC_002754	TTA	2	6	5333	5338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15896978
127	NC_002754	AAT	2	6	5362	5367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15896979
128	NC_002754	TTC	2	6	5379	5384	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15896979
129	NC_002754	T	6	6	5438	5443	0 %	100 %	0 %	0 %	15896979
130	NC_002754	TTA	2	6	5494	5499	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15896979
131	NC_002754	C	6	6	5514	5519	0 %	0 %	0 %	100 %	15896979
132	NC_002754	TTA	2	6	5547	5552	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15896979
133	NC_002754	CAG	2	6	5632	5637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15896979
134	NC_002754	CTG	2	6	5650	5655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15896979
135	NC_002754	AATT	2	8	5690	5697	50 %	50 %	0 %	0 %	15896979
136	NC_002754	AGG	2	6	5723	5728	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15896979
137	NC_002754	GATA	2	8	5797	5804	50 %	25 %	25 %	0 %	15896979
138	NC_002754	ATC	2	6	5846	5851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15896979
139	NC_002754	A	6	6	5854	5859	100 %	0 %	0 %	0 %	15896979
140	NC_002754	AAT	2	6	5897	5902	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15896979
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282	NC_002754	GAT	2	6	12449	12454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15896985
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288	NC_002754	A	6	6	12695	12700	100 %	0 %	0 %	0 %	15896986
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