MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sinorhizobium fredii NGR234 plasmid pNGR234a

Total Repeats: 10803

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_000914	CGCTT	2	10	348235	348244	0 %	40 %	20 %	40 %	16519843
7002	NC_000914	GC	3	6	348255	348260	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7003	NC_000914	ACC	2	6	348267	348272	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7004	NC_000914	TCA	2	6	348298	348303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7005	NC_000914	GCT	2	6	348311	348316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7006	NC_000914	GA	3	6	348328	348333	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7007	NC_000914	GCC	2	6	348400	348405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7008	NC_000914	GC	3	6	348414	348419	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7009	NC_000914	CCACT	2	10	348509	348518	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
7010	NC_000914	TATT	2	8	348633	348640	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7011	NC_000914	GCT	2	6	348648	348653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7012	NC_000914	CAT	2	6	348733	348738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7013	NC_000914	CAT	2	6	348846	348851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16519842
7014	NC_000914	ATG	2	6	348887	348892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16519842
7015	NC_000914	TTC	2	6	348953	348958	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16519842
7016	NC_000914	GGACAT	2	12	348984	348995	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	16519842
7017	NC_000914	GAG	2	6	349015	349020	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16519842
7018	NC_000914	GAG	2	6	349030	349035	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16519842
7019	NC_000914	CGG	2	6	349163	349168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16519842
7020	NC_000914	GCG	2	6	349171	349176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16519842
7021	NC_000914	CAT	2	6	349195	349200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16519842
7022	NC_000914	TGA	2	6	349344	349349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16519842
7023	NC_000914	GGC	2	6	349422	349427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16519842
7024	NC_000914	GGAG	2	8	349431	349438	25 %	0 %	75 %	0 %	16519842
7025	NC_000914	GCC	2	6	349462	349467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16519842
7026	NC_000914	GAT	2	6	349525	349530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16519842
7027	NC_000914	CGC	2	6	349531	349536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16519842
7028	NC_000914	CGA	2	6	349587	349592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16519842
7029	NC_000914	TGA	2	6	349601	349606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16519842
7030	NC_000914	CGA	2	6	349632	349637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16519842
7031	NC_000914	CCG	2	6	349676	349681	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16519842
7032	NC_000914	GGC	2	6	349686	349691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16519842
7033	NC_000914	CGG	2	6	349809	349814	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16519842
7034	NC_000914	CAC	2	6	349954	349959	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16519842
7035	NC_000914	ATG	2	6	349970	349975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16519842
7036	NC_000914	GAG	2	6	350011	350016	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16519842
7037	NC_000914	CTG	3	9	350128	350136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16519842
7038	NC_000914	CGA	2	6	350202	350207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16519842
7039	NC_000914	GTC	2	6	350212	350217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16519842
7040	NC_000914	GCA	2	6	350262	350267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16519842
7041	NC_000914	CCG	2	6	350387	350392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16519842
7042	NC_000914	CGG	3	9	350418	350426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16519842
7043	NC_000914	GA	3	6	350608	350613	50 %	0 %	50 %	0 %	16519842
7044	NC_000914	C	6	6	350722	350727	0 %	0 %	0 %	100 %	16519842
7045	NC_000914	CGA	2	6	350931	350936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16519842
7046	NC_000914	GCC	2	6	351064	351069	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16519842
7047	NC_000914	TAT	2	6	351087	351092	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16519842
7048	NC_000914	CAC	2	6	351093	351098	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16519842
7049	NC_000914	GGC	2	6	351178	351183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16519842
7050	NC_000914	GAT	2	6	351248	351253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16519842
7051	NC_000914	ATC	2	6	351282	351287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7052	NC_000914	CGG	2	6	351291	351296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7053	NC_000914	CGG	2	6	351332	351337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7054	NC_000914	GCG	2	6	351382	351387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7055	NC_000914	GCG	2	6	351397	351402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7056	NC_000914	CGC	2	6	351458	351463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7057	NC_000914	GC	3	6	351483	351488	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7058	NC_000914	CGA	2	6	351548	351553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16519841
7059	NC_000914	CTT	2	6	351587	351592	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16519841
7060	NC_000914	TTCA	2	8	351708	351715	25 %	50 %	0 %	25 %	16519841
7061	NC_000914	TCA	2	6	351740	351745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16519841
7062	NC_000914	GCAG	2	8	351795	351802	25 %	0 %	50 %	25 %	16519841
7063	NC_000914	GAC	2	6	351904	351909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7064	NC_000914	GGC	2	6	351956	351961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7065	NC_000914	TCGTC	2	10	352092	352101	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
7066	NC_000914	TGG	2	6	352190	352195	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7067	NC_000914	CGT	2	6	352322	352327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16519840
7068	NC_000914	CGA	2	6	352337	352342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16519840
7069	NC_000914	ATC	2	6	352386	352391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16519840
7070	NC_000914	TCG	2	6	352408	352413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16519840
7071	NC_000914	GGCG	2	8	352439	352446	0 %	0 %	75 %	25 %	16519840
7072	NC_000914	TCG	2	6	352462	352467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16519840
7073	NC_000914	GGCT	2	8	352505	352512	0 %	25 %	50 %	25 %	16519840
7074	NC_000914	GA	3	6	352514	352519	50 %	0 %	50 %	0 %	16519840
7075	NC_000914	CTC	2	6	352575	352580	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16519840
7076	NC_000914	CGG	2	6	352604	352609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16519840
7077	NC_000914	TTTG	2	8	352618	352625	0 %	75 %	25 %	0 %	16519840
7078	NC_000914	GC	3	6	352744	352749	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7079	NC_000914	GTA	2	6	352777	352782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7080	NC_000914	TGC	2	6	352813	352818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7081	NC_000914	CCGA	2	8	352822	352829	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7082	NC_000914	CGA	2	6	352860	352865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7083	NC_000914	GT	3	6	352891	352896	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7084	NC_000914	CAC	2	6	352964	352969	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7085	NC_000914	GCG	2	6	353005	353010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7086	NC_000914	TCGA	2	8	353153	353160	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7087	NC_000914	GCC	2	6	353172	353177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7088	NC_000914	GA	3	6	353248	353253	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7089	NC_000914	AAG	2	6	353306	353311	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7090	NC_000914	CGG	2	6	353409	353414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16519839
7091	NC_000914	AAG	2	6	353416	353421	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16519839
7092	NC_000914	AAG	2	6	353545	353550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16519839
7093	NC_000914	GGT	2	6	353559	353564	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16519838
7094	NC_000914	TGC	2	6	353612	353617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16519838
7095	NC_000914	CG	3	6	353731	353736	0 %	0 %	50 %	50 %	16519838
7096	NC_000914	CTT	2	6	353748	353753	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16519838
7097	NC_000914	AT	3	6	353832	353837	50 %	50 %	0 %	0 %	16519838
7098	NC_000914	ACC	2	6	353882	353887	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16519838
7099	NC_000914	AGG	2	6	353906	353911	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16519838
7100	NC_000914	CGA	2	6	354036	354041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16519838
7101	NC_000914	GCG	2	6	354092	354097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16519838
7102	NC_000914	GGC	2	6	354111	354116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16519838
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7104	NC_000914	CTTCGT	2	12	354142	354153	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	16519837
7105	NC_000914	CG	3	6	354221	354226	0 %	0 %	50 %	50 %	16519837
7106	NC_000914	GAT	2	6	354270	354275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16519837
7107	NC_000914	GCTC	2	8	354289	354296	0 %	25 %	25 %	50 %	16519837
7108	NC_000914	GAAA	2	8	354471	354478	75 %	0 %	25 %	0 %	16519837
7109	NC_000914	TCGT	2	8	354532	354539	0 %	50 %	25 %	25 %	16519837
7110	NC_000914	GGCGC	2	10	354558	354567	0 %	0 %	60 %	40 %	16519837
7111	NC_000914	CGG	2	6	354668	354673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16519836
7112	NC_000914	CTT	2	6	354677	354682	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16519836
7113	NC_000914	ACG	2	6	354713	354718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16519836
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7115	NC_000914	TCG	2	6	354751	354756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16519836
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7121	NC_000914	TCGC	2	8	354948	354955	0 %	25 %	25 %	50 %	16519836
7122	NC_000914	GAA	2	6	354978	354983	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16519836
7123	NC_000914	CGTGT	2	10	355002	355011	0 %	40 %	40 %	20 %	16519836
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7125	NC_000914	CGC	2	6	355098	355103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16519836
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7240	NC_000914	GC	3	6	359486	359491	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7241	NC_000914	CAGC	2	8	359501	359508	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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7250	NC_000914	CG	3	6	359852	359857	0 %	0 %	50 %	50 %	16519834
7251	NC_000914	CG	3	6	359898	359903	0 %	0 %	50 %	50 %	16519834
7252	NC_000914	TCG	2	6	359906	359911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16519834
7253	NC_000914	GC	3	6	359914	359919	0 %	0 %	50 %	50 %	16519834
7254	NC_000914	GAC	2	6	360031	360036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16519834
7255	NC_000914	CGC	2	6	360048	360053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16519834
7256	NC_000914	CGC	2	6	360108	360113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16519834
7257	NC_000914	ACG	3	9	360218	360226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16519834
7258	NC_000914	TGC	2	6	360275	360280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16519834
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7261	NC_000914	CTG	2	6	360299	360304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16519834
7262	NC_000914	CGC	2	6	360372	360377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16519834
7263	NC_000914	TCG	2	6	360392	360397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16519834
7264	NC_000914	CTGCG	2	10	360406	360415	0 %	20 %	40 %	40 %	16519834
7265	NC_000914	GCG	2	6	360473	360478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16519834
7266	NC_000914	GAA	2	6	360489	360494	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16519834
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7268	NC_000914	CGAC	2	8	360602	360609	25 %	0 %	25 %	50 %	16519834
7269	NC_000914	GC	3	6	360706	360711	0 %	0 %	50 %	50 %	16519834
7270	NC_000914	AGC	2	6	360734	360739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16519834
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7273	NC_000914	AG	3	6	360845	360850	50 %	0 %	50 %	0 %	16519834
7274	NC_000914	GGT	2	6	360859	360864	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16519834
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7277	NC_000914	CGC	2	6	361091	361096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16519833
7278	NC_000914	GCCA	2	8	361110	361117	25 %	0 %	25 %	50 %	16519833
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7281	NC_000914	CGG	2	6	361198	361203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16519833
7282	NC_000914	GCG	2	6	361218	361223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16519833
7283	NC_000914	AGG	2	6	361241	361246	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16519833
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7285	NC_000914	CCGGCG	2	12	361286	361297	0 %	0 %	50 %	50 %	16519832
7286	NC_000914	CG	4	8	361329	361336	0 %	0 %	50 %	50 %	16519832
7287	NC_000914	GGC	2	6	361339	361344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16519832
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7290	NC_000914	TGGCCA	2	12	361424	361435	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16519832
7291	NC_000914	GCAG	2	8	361452	361459	25 %	0 %	50 %	25 %	16519832
7292	NC_000914	CGG	2	6	361478	361483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16519832
7293	NC_000914	CTG	2	6	361507	361512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16519832
7294	NC_000914	AAC	2	6	361516	361521	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16519832
7295	NC_000914	CG	3	6	361544	361549	0 %	0 %	50 %	50 %	16519832
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7297	NC_000914	GACCTG	2	12	361564	361575	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16519832
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7300	NC_000914	GAT	2	6	361647	361652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16519832
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7302	NC_000914	GTC	2	6	361683	361688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16519832
7303	NC_000914	GGC	2	6	361740	361745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16519832
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7319	NC_000914	TGA	2	6	362275	362280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16519831
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7322	NC_000914	GGC	2	6	362426	362431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16519831
7323	NC_000914	ACT	2	6	362630	362635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16519831
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7330	NC_000914	CG	3	6	362756	362761	0 %	0 %	50 %	50 %	16519831
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7345	NC_000914	TGC	2	6	363486	363491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7348	NC_000914	AAC	2	6	363579	363584	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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7352	NC_000914	GC	3	6	363654	363659	0 %	0 %	50 %	50 %	16519830
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7357	NC_000914	CGA	2	6	363872	363877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16519830
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7362	NC_000914	CGC	2	6	363957	363962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16519830
7363	NC_000914	GTGC	2	8	364221	364228	0 %	25 %	50 %	25 %	16519830
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7365	NC_000914	ACGCT	2	10	364276	364285	20 %	20 %	20 %	40 %	16519830
7366	NC_000914	GGT	2	6	364334	364339	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16519830
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7370	NC_000914	TGT	2	6	364471	364476	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16519830
7371	NC_000914	TGC	2	6	364534	364539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16519830
7372	NC_000914	GC	3	6	364584	364589	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7373	NC_000914	CGGC	2	8	364625	364632	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7374	NC_000914	CATG	2	8	364639	364646	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7375	NC_000914	CGC	2	6	364677	364682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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7377	NC_000914	GCG	2	6	364733	364738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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7499	NC_000914	CCT	2	6	370026	370031	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7500	NC_000914	CCTG	2	8	370119	370126	0 %	25 %	25 %	50 %	16519822

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