MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Rhizobium sp. IRBG74 linear chromosome

Total Repeats: 4077

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_022545	GGA	2	6	1448210	1448215	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3002	NC_022545	CTC	2	6	1449139	1449144	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3003	NC_022545	GCGGGG	2	12	1449167	1449178	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
3004	NC_022545	GAG	2	6	1449195	1449200	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3005	NC_022545	GCG	2	6	1452459	1452464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3006	NC_022545	CGC	2	6	1452484	1452489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3007	NC_022545	GAT	2	6	1452509	1452514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3008	NC_022545	GAG	2	6	1452522	1452527	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3009	NC_022545	ATC	2	6	1454165	1454170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3010	NC_022545	ACA	2	6	1454934	1454939	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3011	NC_022545	GCT	2	6	1454940	1454945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3012	NC_022545	A	6	6	1454971	1454976	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3013	NC_022545	TTG	2	6	1456554	1456559	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3014	NC_022545	GCGGGG	2	12	1456645	1456656	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
3015	NC_022545	AACG	2	8	1456669	1456676	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3016	NC_022545	TGG	2	6	1456706	1456711	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3017	NC_022545	CCT	2	6	1457021	1457026	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3018	NC_022545	GGA	2	6	1458125	1458130	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3019	NC_022545	CGA	2	6	1460426	1460431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3020	NC_022545	GCC	2	6	1460477	1460482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3021	NC_022545	CT	3	6	1463231	1463236	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3022	NC_022545	CGT	2	6	1463302	1463307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3023	NC_022545	AAAT	2	8	1463348	1463355	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3024	NC_022545	T	6	6	1463377	1463382	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3025	NC_022545	AG	4	8	1463426	1463433	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3026	NC_022545	GAG	2	6	1463480	1463485	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3027	NC_022545	ATC	2	6	1463491	1463496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3028	NC_022545	ACGC	2	8	1463551	1463558	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3029	NC_022545	GCC	2	6	1463559	1463564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3030	NC_022545	CG	3	6	1463577	1463582	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3031	NC_022545	GA	4	8	1463630	1463637	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3032	NC_022545	CGC	2	6	1466628	1466633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3033	NC_022545	GCCGC	2	10	1470138	1470147	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
3034	NC_022545	CTC	2	6	1470148	1470153	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3035	NC_022545	ATG	2	6	1471106	1471111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3036	NC_022545	T	6	6	1471817	1471822	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3037	NC_022545	A	6	6	1471833	1471838	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3038	NC_022545	AAG	2	6	1471876	1471881	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3039	NC_022545	CGAC	2	8	1475932	1475939	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3040	NC_022545	GTGC	2	8	1475999	1476006	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3041	NC_022545	TGA	2	6	1476451	1476456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3042	NC_022545	GTC	2	6	1478528	1478533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3043	NC_022545	ATG	2	6	1478548	1478553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3044	NC_022545	CTG	2	6	1478600	1478605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3045	NC_022545	TTG	2	6	1478628	1478633	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3046	NC_022545	GGAG	2	8	1478728	1478735	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
3047	NC_022545	CGGG	2	8	1479994	1480001	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3048	NC_022545	CGC	2	6	1480103	1480108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3049	NC_022545	ATTTC	2	10	1480125	1480134	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
3050	NC_022545	CAGGG	2	10	1483460	1483469	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
3051	NC_022545	C	6	6	1483479	1483484	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3052	NC_022545	TCA	2	6	1483504	1483509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3053	NC_022545	TCT	2	6	1483518	1483523	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3054	NC_022545	ATA	2	6	1484480	1484485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3055	NC_022545	AGG	2	6	1485669	1485674	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3056	NC_022545	GATG	2	8	1485690	1485697	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3057	NC_022545	GTTTT	2	10	1485722	1485731	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
3058	NC_022545	TGA	2	6	1485737	1485742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3059	NC_022545	GAA	2	6	1488708	1488713	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3060	NC_022545	GAT	2	6	1488783	1488788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3061	NC_022545	TGT	2	6	1488847	1488852	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3062	NC_022545	ATG	2	6	1488856	1488861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3063	NC_022545	CGTC	2	8	1488896	1488903	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3064	NC_022545	AGG	2	6	1493931	1493936	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3065	NC_022545	GGA	2	6	1497087	1497092	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3066	NC_022545	CGGCG	2	10	1498383	1498392	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
3067	NC_022545	GCCGC	2	10	1498396	1498405	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
3068	NC_022545	AGG	2	6	1498416	1498421	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3069	NC_022545	GGA	2	6	1500440	1500445	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3070	NC_022545	CAC	2	6	1501545	1501550	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3071	NC_022545	CATC	2	8	1504109	1504116	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3072	NC_022545	A	6	6	1507230	1507235	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3073	NC_022545	A	6	6	1507252	1507257	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3074	NC_022545	CTTCA	2	10	1515241	1515250	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
3075	NC_022545	GGGCG	2	10	1517988	1517997	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
3076	NC_022545	GA	3	6	1518005	1518010	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3077	NC_022545	A	6	6	1518978	1518983	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3078	NC_022545	CGG	2	6	1519004	1519009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3079	NC_022545	TGTCCT	2	12	1519989	1520000	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
3080	NC_022545	ATA	2	6	1520050	1520055	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3081	NC_022545	CGG	2	6	1525984	1525989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3082	NC_022545	ATT	2	6	1526012	1526017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3083	NC_022545	CCT	2	6	1527548	1527553	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3084	NC_022545	GCC	2	6	1527557	1527562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3085	NC_022545	GCC	2	6	1527571	1527576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3086	NC_022545	GGC	2	6	1527588	1527593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3087	NC_022545	GAA	2	6	1527622	1527627	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3088	NC_022545	CGGC	2	8	1527639	1527646	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3089	NC_022545	CGAG	2	8	1527777	1527784	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3090	NC_022545	CT	4	8	1527820	1527827	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3091	NC_022545	CAT	2	6	1527839	1527844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3092	NC_022545	CAC	2	6	1527857	1527862	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3093	NC_022545	GAA	2	6	1527879	1527884	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3094	NC_022545	AATA	2	8	1527911	1527918	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3095	NC_022545	ATT	2	6	1527945	1527950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3096	NC_022545	GAG	2	6	1527965	1527970	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3097	NC_022545	GCG	2	6	1527974	1527979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3098	NC_022545	GGC	2	6	1528009	1528014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3099	NC_022545	GGA	2	6	1528027	1528032	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3100	NC_022545	GCC	2	6	1528973	1528978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3101	NC_022545	TGT	2	6	1529109	1529114	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3102	NC_022545	GGA	2	6	1529197	1529202	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3103	NC_022545	GC	3	6	1530750	1530755	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3104	NC_022545	GAG	2	6	1530767	1530772	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3105	NC_022545	TCC	3	9	1531814	1531822	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3106	NC_022545	T	6	6	1531854	1531859	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3107	NC_022545	GCG	2	6	1531870	1531875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3108	NC_022545	CAG	2	6	1531883	1531888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3109	NC_022545	GGC	2	6	1532649	1532654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3110	NC_022545	CCG	2	6	1532684	1532689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3111	NC_022545	CCT	2	6	1532715	1532720	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3112	NC_022545	GAA	2	6	1532785	1532790	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3113	NC_022545	GCAG	2	8	1532911	1532918	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3114	NC_022545	GGA	2	6	1532931	1532936	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3115	NC_022545	CGG	3	9	1534051	1534059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3116	NC_022545	TGT	2	6	1534100	1534105	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3117	NC_022545	ACA	2	6	1534127	1534132	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3118	NC_022545	TCA	2	6	1534281	1534286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3119	NC_022545	AGA	2	6	1534287	1534292	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3120	NC_022545	CG	3	6	1536546	1536551	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3121	NC_022545	TCC	2	6	1536575	1536580	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3122	NC_022545	CGCA	2	8	1536627	1536634	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3123	NC_022545	GGC	2	6	1536723	1536728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3124	NC_022545	TC	3	6	1539024	1539029	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3125	NC_022545	AATG	2	8	1539044	1539051	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3126	NC_022545	GCG	2	6	1539080	1539085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3127	NC_022545	GCC	2	6	1539134	1539139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3128	NC_022545	ATT	2	6	1539197	1539202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3129	NC_022545	CCAT	2	8	1539248	1539255	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3130	NC_022545	ATC	2	6	1541095	1541100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3131	NC_022545	GC	3	6	1541132	1541137	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3132	NC_022545	GCC	2	6	1546188	1546193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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3264	NC_022545	GAT	2	6	1598947	1598952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3274	NC_022545	GCCG	2	8	1620395	1620402	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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3396	NC_022545	CTG	2	6	1696582	1696587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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