MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Rhizobium sp. IRBG74 linear chromosome

Total Repeats: 4077

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_022545	ACC	2	6	482477	482482	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1002	NC_022545	GCCT	2	8	482500	482507	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1003	NC_022545	A	9	9	482512	482520	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_022545	CGG	2	6	482525	482530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1005	NC_022545	AAGG	2	8	482542	482549	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_022545	TTA	2	6	482556	482561	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_022545	GGA	3	9	482575	482583	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_022545	TCC	2	6	486116	486121	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1009	NC_022545	GGC	2	6	486263	486268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1010	NC_022545	GCG	2	6	486273	486278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1011	NC_022545	TTC	2	6	486279	486284	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1012	NC_022545	AAG	2	6	486293	486298	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_022545	CTG	2	6	486386	486391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1014	NC_022545	GGA	2	6	486399	486404	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_022545	ACC	3	9	487868	487876	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1016	NC_022545	GCAA	2	8	488973	488980	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1017	NC_022545	GA	3	6	488995	489000	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_022545	ACC	2	6	489835	489840	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1019	NC_022545	CA	3	6	491178	491183	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1020	NC_022545	AAT	2	6	491295	491300	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_022545	AT	4	8	491299	491306	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_022545	TTG	2	6	491311	491316	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_022545	CG	3	6	493851	493856	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1024	NC_022545	TGC	2	6	493866	493871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1025	NC_022545	CG	3	6	493872	493877	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1026	NC_022545	ACG	2	6	493878	493883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1027	NC_022545	GGA	2	6	495408	495413	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_022545	CGG	2	6	495432	495437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1029	NC_022545	CCG	2	6	495446	495451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1030	NC_022545	TGA	2	6	495486	495491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_022545	TTC	2	6	495508	495513	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1032	NC_022545	TCT	2	6	495514	495519	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1033	NC_022545	CG	3	6	495654	495659	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1034	NC_022545	GAG	2	6	495729	495734	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_022545	CTC	2	6	499291	499296	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1036	NC_022545	TCC	2	6	499308	499313	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1037	NC_022545	AAC	2	6	499323	499328	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1038	NC_022545	TCC	2	6	500631	500636	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1039	NC_022545	T	6	6	500702	500707	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_022545	CAA	2	6	500728	500733	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1041	NC_022545	TCATA	2	10	500738	500747	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1042	NC_022545	GGA	2	6	501252	501257	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_022545	GCT	2	6	501265	501270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1044	NC_022545	GGA	3	9	501293	501301	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_022545	CAGG	2	8	507792	507799	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1046	NC_022545	GT	3	6	507800	507805	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_022545	GCGG	2	8	509648	509655	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1048	NC_022545	CGT	2	6	509682	509687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1049	NC_022545	CGAT	2	8	509719	509726	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1050	NC_022545	GCAG	2	8	509737	509744	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1051	NC_022545	GT	3	6	509788	509793	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_022545	C	6	6	509808	509813	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1053	NC_022545	TCC	2	6	513329	513334	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1054	NC_022545	CCT	2	6	513370	513375	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1055	NC_022545	TCAA	2	8	513411	513418	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1056	NC_022545	GTT	2	6	513468	513473	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_022545	AAT	2	6	513498	513503	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_022545	AGG	2	6	513511	513516	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_022545	GGA	2	6	514389	514394	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_022545	C	6	6	515447	515452	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1061	NC_022545	G	6	6	515481	515486	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_022545	C	6	6	515546	515551	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1063	NC_022545	GGCAG	2	10	515569	515578	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
1064	NC_022545	G	9	9	515580	515588	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_022545	TCACT	2	10	515595	515604	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
1066	NC_022545	ACCG	2	8	515609	515616	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1067	NC_022545	TGT	2	6	521823	521828	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_022545	CAA	2	6	521871	521876	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1069	NC_022545	AAT	3	9	521881	521889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_022545	GAAT	2	8	521893	521900	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_022545	AAT	3	9	521913	521921	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_022545	GC	3	6	522018	522023	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1073	NC_022545	AAAC	2	8	522052	522059	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1074	NC_022545	GTC	2	6	522817	522822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1075	NC_022545	CGC	2	6	522824	522829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1076	NC_022545	GCC	2	6	522927	522932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1077	NC_022545	AT	4	8	525472	525479	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_022545	CGTTTC	2	12	525848	525859	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
1079	NC_022545	CCG	2	6	525876	525881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1080	NC_022545	CCGGG	2	10	525962	525971	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
1081	NC_022545	CCG	2	6	525978	525983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1082	NC_022545	CAT	2	6	525993	525998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1083	NC_022545	TTC	2	6	527462	527467	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1084	NC_022545	CGC	2	6	527471	527476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1085	NC_022545	GAG	2	6	527577	527582	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_022545	ATCA	2	8	531571	531578	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1087	NC_022545	CCG	2	6	531599	531604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1088	NC_022545	GCGG	2	8	532655	532662	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1089	NC_022545	AAC	2	6	532680	532685	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1090	NC_022545	GGA	2	6	532697	532702	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_022545	ATA	2	6	532724	532729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_022545	CCT	2	6	533865	533870	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1093	NC_022545	CGTT	2	8	533879	533886	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1094	NC_022545	GGC	2	6	533897	533902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1095	NC_022545	GCA	2	6	534001	534006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1096	NC_022545	CATC	2	8	535339	535346	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1097	NC_022545	TTC	2	6	535401	535406	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1098	NC_022545	GCA	2	6	535414	535419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1099	NC_022545	G	6	6	535507	535512	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_022545	TCC	2	6	537631	537636	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1101	NC_022545	GCA	2	6	539960	539965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1102	NC_022545	GA	3	6	540035	540040	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_022545	CTT	2	6	540408	540413	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1104	NC_022545	GGC	2	6	543053	543058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1105	NC_022545	GCC	2	6	543065	543070	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1106	NC_022545	A	6	6	544000	544005	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_022545	CAT	2	6	544054	544059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1108	NC_022545	C	7	7	544063	544069	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1109	NC_022545	CGC	2	6	546911	546916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1110	NC_022545	TTG	3	9	546980	546988	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_022545	ATC	2	6	547021	547026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1112	NC_022545	TGC	2	6	547037	547042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1113	NC_022545	CCA	2	6	547956	547961	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1114	NC_022545	GAG	2	6	548010	548015	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_022545	AAT	2	6	549261	549266	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_022545	GGA	2	6	551979	551984	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_022545	TCC	2	6	551996	552001	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1118	NC_022545	TCC	2	6	552684	552689	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1119	NC_022545	CCCGC	2	10	552706	552715	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
1120	NC_022545	TTA	2	6	552771	552776	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_022545	ACC	2	6	553248	553253	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1122	NC_022545	CGC	2	6	553282	553287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1123	NC_022545	T	6	6	553378	553383	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_022545	CGCC	2	8	553542	553549	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1125	NC_022545	CTT	2	6	553577	553582	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1126	NC_022545	ACG	2	6	554872	554877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1127	NC_022545	GCG	2	6	554883	554888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1128	NC_022545	GCT	2	6	554931	554936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1129	NC_022545	ATGAT	2	10	554943	554952	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_022545	CGA	2	6	554987	554992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1131	NC_022545	CG	3	6	554998	555003	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1132	NC_022545	GGA	2	6	555008	555013	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_022545	AAC	2	6	555417	555422	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1134	NC_022545	CGC	2	6	556110	556115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1135	NC_022545	CGGG	2	8	556187	556194	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1136	NC_022545	ACA	2	6	557071	557076	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1398	NC_022545	AATC	2	8	690351	690358	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1399	NC_022545	GACA	2	8	692334	692341	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1400	NC_022545	ATA	2	6	692353	692358	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1401	NC_022545	A	6	6	692393	692398	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1409	NC_022545	CGC	2	6	696966	696971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1410	NC_022545	GCG	2	6	697047	697052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1411	NC_022545	CAA	2	6	698983	698988	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1412	NC_022545	GGA	2	6	700280	700285	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1413	NC_022545	CCCTG	2	10	700342	700351	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
1414	NC_022545	TGAA	2	8	701444	701451	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1415	NC_022545	GCC	2	6	701453	701458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1416	NC_022545	GGC	2	6	701465	701470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1420	NC_022545	CAG	2	6	701600	701605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1422	NC_022545	AGA	2	6	701692	701697	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1425	NC_022545	TTC	2	6	703394	703399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1426	NC_022545	TCT	2	6	703413	703418	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1428	NC_022545	GCC	3	9	703488	703496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1429	NC_022545	CTT	2	6	703525	703530	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1430	NC_022545	TAA	2	6	703531	703536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1431	NC_022545	TCG	2	6	703604	703609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1432	NC_022545	GTG	2	6	703622	703627	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1433	NC_022545	T	6	6	704214	704219	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1434	NC_022545	CAA	2	6	704263	704268	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1435	NC_022545	A	6	6	704267	704272	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1436	NC_022545	T	6	6	704290	704295	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1437	NC_022545	TCCG	2	8	704301	704308	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1438	NC_022545	CGGG	2	8	704720	704727	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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1441	NC_022545	TCG	2	6	708299	708304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1442	NC_022545	CGA	2	6	710439	710444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1443	NC_022545	AAG	2	6	710487	710492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1444	NC_022545	A	6	6	710558	710563	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1445	NC_022545	CTG	2	6	710575	710580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1447	NC_022545	GGCA	2	8	711436	711443	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1448	NC_022545	ATT	2	6	711448	711453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1449	NC_022545	TTGAA	2	10	711457	711466	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1450	NC_022545	CG	3	6	711491	711496	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1451	NC_022545	GAC	2	6	713337	713342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1453	NC_022545	A	6	6	714195	714200	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1454	NC_022545	GCA	2	6	714207	714212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1455	NC_022545	CGC	2	6	714219	714224	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1456	NC_022545	CCG	2	6	714245	714250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1458	NC_022545	TGA	2	6	714626	714631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1459	NC_022545	CAGG	2	8	716539	716546	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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1462	NC_022545	GC	3	6	716593	716598	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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