MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Rhizobium etli bv. mimosae str. Mim1 plasmid pRetMIM1f

Total Repeats: 2866

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_021911	TCA	2	6	575044	575049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1502	NC_021911	TCTT	2	8	575122	575129	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1503	NC_021911	TCG	2	6	575133	575138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1504	NC_021911	GTG	2	6	575895	575900	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_021911	GGA	2	6	575911	575916	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_021911	GGA	2	6	578002	578007	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_021911	GGA	2	6	578450	578455	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_021911	GGT	2	6	579722	579727	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_021911	TCC	2	6	580329	580334	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1510	NC_021911	GTT	2	6	580337	580342	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_021911	TGC	2	6	581077	581082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1512	NC_021911	TGC	2	6	581116	581121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1513	NC_021911	GGA	2	6	581160	581165	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_021911	ATC	2	6	583441	583446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1515	NC_021911	CCG	2	6	585794	585799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1516	NC_021911	ATC	2	6	585809	585814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1517	NC_021911	CGA	2	6	585861	585866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1518	NC_021911	GCC	2	6	585884	585889	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1519	NC_021911	GCT	2	6	585896	585901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1520	NC_021911	T	6	6	585904	585909	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_021911	GCA	2	6	585936	585941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1522	NC_021911	TCG	2	6	585949	585954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1523	NC_021911	GGC	2	6	585967	585972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1524	NC_021911	GAGG	2	8	586040	586047	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_021911	GAGC	2	8	586073	586080	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1526	NC_021911	CG	3	6	586127	586132	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1527	NC_021911	CGA	2	6	586136	586141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1528	NC_021911	CGG	2	6	586143	586148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1529	NC_021911	GTG	2	6	586149	586154	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_021911	CGG	2	6	586204	586209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1531	NC_021911	CAT	2	6	586319	586324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1532	NC_021911	CGACG	2	10	586328	586337	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1533	NC_021911	CGG	2	6	586357	586362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1534	NC_021911	CGT	2	6	586391	586396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1535	NC_021911	GGGC	2	8	586411	586418	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1536	NC_021911	GACGGA	2	12	586445	586456	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
1537	NC_021911	CCG	2	6	586536	586541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1538	NC_021911	CAT	2	6	586623	586628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1539	NC_021911	GGC	2	6	586719	586724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1540	NC_021911	GCC	2	6	586784	586789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1541	NC_021911	TCT	2	6	586794	586799	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1542	NC_021911	CGT	2	6	589546	589551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1543	NC_021911	GA	3	6	591692	591697	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_021911	AAC	2	6	591716	591721	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1545	NC_021911	GAT	2	6	591798	591803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_021911	GCT	2	6	591837	591842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1547	NC_021911	GAAG	2	8	591902	591909	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_021911	CTG	2	6	597829	597834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1549	NC_021911	TCG	2	6	597871	597876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1550	NC_021911	GCCG	2	8	597898	597905	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1551	NC_021911	GGA	2	6	597987	597992	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_021911	AGC	2	6	597998	598003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1553	NC_021911	ACGG	2	8	598023	598030	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1554	NC_021911	AGC	2	6	598079	598084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1555	NC_021911	TGC	2	6	598159	598164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1556	NC_021911	A	7	7	598169	598175	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1557	NC_021911	AAG	2	6	598966	598971	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_021911	AAGCG	2	10	598984	598993	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
1559	NC_021911	GGA	2	6	602548	602553	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_021911	TCT	2	6	604215	604220	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1561	NC_021911	GGCG	2	8	604223	604230	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1562	NC_021911	CGG	2	6	607462	607467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1563	NC_021911	ATC	2	6	607472	607477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1564	NC_021911	CGC	2	6	607525	607530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1565	NC_021911	GACC	2	8	607545	607552	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1566	NC_021911	TGC	2	6	607568	607573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1567	NC_021911	GT	3	6	607576	607581	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_021911	TCC	2	6	610622	610627	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1569	NC_021911	TTCT	2	8	610657	610664	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1570	NC_021911	A	7	7	610710	610716	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_021911	CTT	2	6	610722	610727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1572	NC_021911	GTG	2	6	610735	610740	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_021911	GC	3	6	610763	610768	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1574	NC_021911	TTGC	2	8	610776	610783	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1575	NC_021911	GGA	2	6	611824	611829	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1576	NC_021911	CGC	2	6	612557	612562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1577	NC_021911	GCC	2	6	612591	612596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1578	NC_021911	GCG	2	6	614681	614686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1579	NC_021911	CAG	2	6	614696	614701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1580	NC_021911	CGT	2	6	614724	614729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1581	NC_021911	TTTCC	2	10	619343	619352	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
1582	NC_021911	GCG	2	6	621512	621517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1583	NC_021911	TTG	2	6	621590	621595	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1584	NC_021911	CG	3	6	621627	621632	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1585	NC_021911	CGC	2	6	621691	621696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1586	NC_021911	AGG	2	6	621697	621702	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1587	NC_021911	GGC	2	6	622642	622647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1588	NC_021911	TCGG	2	8	622670	622677	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1589	NC_021911	CCG	2	6	622703	622708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1590	NC_021911	CCG	2	6	622713	622718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1591	NC_021911	ATCG	2	8	622749	622756	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1592	NC_021911	CT	3	6	622795	622800	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1593	NC_021911	CGC	2	6	622801	622806	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1594	NC_021911	CAG	2	6	622860	622865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1595	NC_021911	GA	3	6	622866	622871	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1596	NC_021911	CG	3	6	622916	622921	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1597	NC_021911	CCG	2	6	622945	622950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1598	NC_021911	TA	3	6	623555	623560	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1599	NC_021911	CT	3	6	624516	624521	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1600	NC_021911	CTCA	2	8	624542	624549	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1601	NC_021911	GCC	2	6	625734	625739	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1602	NC_021911	GCCC	2	8	626110	626117	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1603	NC_021911	GAG	2	6	627868	627873	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_021911	TCC	2	6	628243	628248	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1605	NC_021911	ACAA	2	8	628253	628260	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1606	NC_021911	GCTG	2	8	628277	628284	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1607	NC_021911	CG	3	6	628318	628323	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1608	NC_021911	CT	3	6	628387	628392	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1609	NC_021911	CGA	2	6	628395	628400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1610	NC_021911	GTC	2	6	628460	628465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1611	NC_021911	GAGT	2	8	628580	628587	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_021911	CAG	2	6	628886	628891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1613	NC_021911	TGG	3	9	628950	628958	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_021911	GCA	2	6	629426	629431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1615	NC_021911	TGC	2	6	629454	629459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1616	NC_021911	CT	3	6	629464	629469	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1617	NC_021911	TGA	2	6	629535	629540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1618	NC_021911	CG	3	6	630360	630365	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1619	NC_021911	TTC	2	6	630409	630414	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1620	NC_021911	TCG	2	6	633823	633828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1621	NC_021911	TCC	2	6	642061	642066	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1622	NC_021911	TCT	2	6	642075	642080	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1623	NC_021911	CGC	2	6	642114	642119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1624	NC_021911	GGC	2	6	642249	642254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1625	NC_021911	GGA	2	6	642264	642269	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1626	NC_021911	ATG	2	6	644077	644082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1627	NC_021911	GAG	2	6	644105	644110	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1628	NC_021911	TGA	3	9	646553	646561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1629	NC_021911	GCCC	2	8	646596	646603	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1630	NC_021911	TGCA	2	8	646691	646698	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1631	NC_021911	CGC	2	6	648885	648890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1632	NC_021911	G	6	6	648912	648917	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1633	NC_021911	CTTCG	2	10	648988	648997	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1634	NC_021911	GAG	3	9	649009	649017	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1635	NC_021911	TCC	2	6	649907	649912	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1636	NC_021911	GCG	2	6	650812	650817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1763	NC_021911	AGA	2	6	757001	757006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1905	NC_021911	GGGC	2	8	806371	806378	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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1971	NC_021911	TCCT	2	8	833273	833280	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1972	NC_021911	TG	3	6	834692	834697	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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2000	NC_021911	CCG	3	9	837674	837682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding

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