MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Rhizobium etli bv. mimosae str. Mim1 plasmid pRetMIM1f

Total Repeats: 2866

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_021911	TCA	2	6	286427	286432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1002	NC_021911	GAC	2	6	286457	286462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1003	NC_021911	TGA	2	6	286468	286473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_021911	GAG	2	6	286503	286508	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_021911	AG	3	6	287288	287293	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_021911	GAG	2	6	289189	289194	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_021911	GTC	2	6	289201	289206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1008	NC_021911	CTC	2	6	290243	290248	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1009	NC_021911	GGA	3	9	294600	294608	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_021911	ATT	2	6	296803	296808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_021911	TTCA	2	8	296880	296887	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1012	NC_021911	GGC	2	6	297896	297901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1013	NC_021911	CGG	2	6	298490	298495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1014	NC_021911	TAT	2	6	300176	300181	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_021911	TTG	2	6	300187	300192	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_021911	AAG	2	6	300205	300210	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_021911	TTCAC	2	10	300246	300255	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
1018	NC_021911	TGAA	2	8	300273	300280	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_021911	AGA	2	6	301249	301254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_021911	CTT	2	6	301283	301288	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1021	NC_021911	ATTC	2	8	301336	301343	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1022	NC_021911	TCG	2	6	301364	301369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1023	NC_021911	CAG	2	6	301395	301400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1024	NC_021911	GCGA	2	8	301409	301416	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1025	NC_021911	CGC	2	6	302202	302207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1026	NC_021911	TCA	2	6	304528	304533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1027	NC_021911	CGTTTC	2	12	304570	304581	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
1028	NC_021911	TTG	2	6	304635	304640	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_021911	ACCG	2	8	304696	304703	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1030	NC_021911	GGC	2	6	306776	306781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1031	NC_021911	GCC	2	6	306786	306791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1032	NC_021911	TGCAA	2	10	306870	306879	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1033	NC_021911	GGC	2	6	306899	306904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1034	NC_021911	CGT	2	6	306938	306943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1035	NC_021911	TCG	2	6	306974	306979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1036	NC_021911	TTCGA	2	10	307008	307017	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1037	NC_021911	CTT	2	6	307071	307076	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1038	NC_021911	CGC	2	6	307224	307229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1039	NC_021911	TTG	2	6	307241	307246	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_021911	TCA	2	6	307289	307294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1041	NC_021911	GCG	2	6	307345	307350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1042	NC_021911	GAC	2	6	307457	307462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1043	NC_021911	GGA	2	6	308179	308184	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_021911	AT	3	6	309235	309240	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_021911	CAG	2	6	309278	309283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1046	NC_021911	AG	3	6	309282	309287	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_021911	TCG	2	6	309309	309314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1048	NC_021911	ATG	2	6	309360	309365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_021911	TGG	2	6	309477	309482	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_021911	CCG	2	6	309535	309540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1051	NC_021911	GGC	2	6	309777	309782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1052	NC_021911	CTA	2	6	309802	309807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1053	NC_021911	TGC	2	6	309876	309881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1054	NC_021911	GCT	2	6	309887	309892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1055	NC_021911	TGC	2	6	309921	309926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1056	NC_021911	ACG	2	6	309963	309968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1057	NC_021911	CTG	2	6	309990	309995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1058	NC_021911	GAA	2	6	310015	310020	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_021911	AGCC	2	8	310047	310054	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1060	NC_021911	GAT	2	6	310227	310232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_021911	TGA	2	6	311261	311266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_021911	CGG	2	6	311380	311385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1063	NC_021911	CG	3	6	311387	311392	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1064	NC_021911	C	6	6	311429	311434	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1065	NC_021911	GTC	2	6	311548	311553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1066	NC_021911	CG	3	6	311603	311608	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1067	NC_021911	CTC	2	6	315544	315549	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1068	NC_021911	ATG	2	6	315560	315565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_021911	GGC	3	9	315577	315585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1070	NC_021911	TTTCTA	2	12	315608	315619	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1071	NC_021911	CTCTGT	2	12	320317	320328	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
1072	NC_021911	AGTG	2	8	322039	322046	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_021911	GTT	2	6	322068	322073	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_021911	ATT	2	6	322095	322100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_021911	CGC	2	6	322148	322153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1076	NC_021911	GA	3	6	325922	325927	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_021911	ACGCG	2	10	325946	325955	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1078	NC_021911	ATTG	2	8	327180	327187	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_021911	TCT	2	6	327216	327221	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1080	NC_021911	CTT	2	6	327261	327266	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1081	NC_021911	T	7	7	327282	327288	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_021911	CAT	2	6	327426	327431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1083	NC_021911	AAC	2	6	327559	327564	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1084	NC_021911	GA	3	6	327598	327603	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_021911	A	6	6	327623	327628	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_021911	GAT	2	6	327700	327705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_021911	TGC	2	6	327736	327741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1088	NC_021911	GC	3	6	327740	327745	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1089	NC_021911	CTC	2	6	329122	329127	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1090	NC_021911	GATCCG	2	12	329195	329206	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1091	NC_021911	AGA	2	6	329272	329277	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_021911	TTC	2	6	329282	329287	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1093	NC_021911	GCC	2	6	329333	329338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1094	NC_021911	AGAC	2	8	329385	329392	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1095	NC_021911	TCAAA	2	10	329478	329487	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
1096	NC_021911	GTC	2	6	329504	329509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1097	NC_021911	GTC	2	6	329519	329524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1098	NC_021911	CGG	2	6	329586	329591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1099	NC_021911	TC	3	6	329869	329874	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1100	NC_021911	TTTG	2	8	329877	329884	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_021911	ATC	2	6	330170	330175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1102	NC_021911	TCT	2	6	330179	330184	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1103	NC_021911	GCT	2	6	330263	330268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1104	NC_021911	TGGC	2	8	330314	330321	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1105	NC_021911	TCC	2	6	338499	338504	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1106	NC_021911	CAGC	2	8	338514	338521	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1107	NC_021911	GTCT	2	8	338527	338534	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1108	NC_021911	AATTC	2	10	338551	338560	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1109	NC_021911	T	6	6	338612	338617	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_021911	T	6	6	338619	338624	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_021911	CCG	2	6	338628	338633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1112	NC_021911	GCG	2	6	338648	338653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1113	NC_021911	TCC	2	6	338703	338708	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1114	NC_021911	GGC	2	6	339729	339734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1115	NC_021911	GGT	2	6	339735	339740	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_021911	TTG	2	6	339825	339830	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_021911	CGG	2	6	339898	339903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1118	NC_021911	TCA	2	6	339953	339958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1119	NC_021911	CGCGC	2	10	341349	341358	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
1120	NC_021911	ATCTT	2	10	342020	342029	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1121	NC_021911	GC	3	6	347511	347516	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1122	NC_021911	CGC	2	6	347542	347547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1123	NC_021911	AGA	2	6	347548	347553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_021911	GT	3	6	347554	347559	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_021911	GCT	2	6	347722	347727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1126	NC_021911	GCG	2	6	347762	347767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1127	NC_021911	ACGA	2	8	347771	347778	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1128	NC_021911	AGC	2	6	352809	352814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1129	NC_021911	GCC	2	6	352871	352876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1130	NC_021911	CCTC	2	8	352887	352894	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1131	NC_021911	CGT	2	6	352907	352912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1132	NC_021911	CCG	2	6	352919	352924	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1133	NC_021911	CAA	2	6	352926	352931	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1134	NC_021911	AGG	2	6	353323	353328	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1270	NC_021911	CTT	2	6	425243	425248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1405	NC_021911	TCT	2	6	507694	507699	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1406	NC_021911	GTT	2	6	507724	507729	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1407	NC_021911	TCG	2	6	507757	507762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1409	NC_021911	GA	3	6	511174	511179	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1445	NC_021911	CAT	2	6	535290	535295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1459	NC_021911	CCG	2	6	543463	543468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1487	NC_021911	GAG	2	6	566185	566190	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1499	NC_021911	ATT	2	6	574982	574987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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