MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Rhizobium etli bv. mimosae str. Mim1 plasmid pRetMIM1e

Total Repeats: 2748

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_021909	T	7	7	227525	227531	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_021909	ATG	2	6	227595	227600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_021909	TGC	2	6	227622	227627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1004	NC_021909	CCA	2	6	227725	227730	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1005	NC_021909	GGC	2	6	227797	227802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1006	NC_021909	GCAC	2	8	228018	228025	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1007	NC_021909	CGT	2	6	228040	228045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1008	NC_021909	CA	3	6	228071	228076	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1009	NC_021909	GCC	2	6	228111	228116	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1010	NC_021909	AAG	3	9	228209	228217	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_021909	CCGG	2	8	228269	228276	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1012	NC_021909	GCT	2	6	228298	228303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1013	NC_021909	A	6	6	228342	228347	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_021909	CCGA	2	8	228438	228445	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1015	NC_021909	TCG	2	6	228456	228461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1016	NC_021909	CAT	2	6	228472	228477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1017	NC_021909	CG	3	6	228508	228513	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1018	NC_021909	GAC	2	6	228604	228609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1019	NC_021909	TCT	2	6	228624	228629	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1020	NC_021909	CTCG	2	8	228641	228648	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1021	NC_021909	GGT	2	6	228653	228658	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_021909	CAC	2	6	228681	228686	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1023	NC_021909	GTC	2	6	228698	228703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1024	NC_021909	AGC	2	6	228751	228756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1025	NC_021909	TCC	2	6	228860	228865	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1026	NC_021909	TGC	2	6	228931	228936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1027	NC_021909	CCT	2	6	229921	229926	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1028	NC_021909	CT	3	6	230007	230012	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1029	NC_021909	GCC	2	6	230019	230024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1030	NC_021909	GCA	2	6	230067	230072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1031	NC_021909	GCC	2	6	230110	230115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1032	NC_021909	AGC	2	6	230144	230149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1033	NC_021909	ATT	2	6	230150	230155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_021909	TCC	2	6	231144	231149	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1035	NC_021909	GCC	2	6	231161	231166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1036	NC_021909	GCTC	2	8	231199	231206	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1037	NC_021909	GATCAG	2	12	231234	231245	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
1038	NC_021909	CAA	2	6	231252	231257	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1039	NC_021909	CG	3	6	231280	231285	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1040	NC_021909	T	7	7	231302	231308	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_021909	CGG	2	6	231348	231353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1042	NC_021909	CAA	2	6	231378	231383	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1043	NC_021909	TGG	2	6	231418	231423	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_021909	GCC	2	6	233965	233970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1045	NC_021909	ACG	2	6	234052	234057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1046	NC_021909	AGATG	2	10	234070	234079	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_021909	CGA	2	6	235506	235511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1048	NC_021909	TTC	2	6	235523	235528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1049	NC_021909	CGC	2	6	235535	235540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1050	NC_021909	T	6	6	235587	235592	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_021909	GCG	2	6	235610	235615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1052	NC_021909	CGA	2	6	235670	235675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1053	NC_021909	TTG	2	6	235689	235694	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_021909	AAG	2	6	235695	235700	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_021909	GCT	2	6	235716	235721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1056	NC_021909	GCG	2	6	235730	235735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1057	NC_021909	GC	3	6	235756	235761	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1058	NC_021909	CTTCA	2	10	236501	236510	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
1059	NC_021909	GCG	2	6	236571	236576	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1060	NC_021909	CGT	2	6	236588	236593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1061	NC_021909	TGA	2	6	236603	236608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_021909	TGA	2	6	236623	236628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_021909	TCT	2	6	236697	236702	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1064	NC_021909	CGA	2	6	236754	236759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1065	NC_021909	AAC	2	6	236789	236794	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1066	NC_021909	CTT	2	6	236808	236813	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1067	NC_021909	GCG	2	6	236865	236870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1068	NC_021909	GCCA	2	8	236898	236905	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1069	NC_021909	TGAC	2	8	236908	236915	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1070	NC_021909	CCG	2	6	236936	236941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1071	NC_021909	CG	3	6	237553	237558	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1072	NC_021909	CCAT	2	8	237600	237607	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1073	NC_021909	AGAA	2	8	237611	237618	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_021909	CGA	2	6	237662	237667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1075	NC_021909	GAA	2	6	237669	237674	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_021909	CATT	2	8	237694	237701	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1077	NC_021909	TC	3	6	237732	237737	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1078	NC_021909	TTC	2	6	237802	237807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1079	NC_021909	CGC	2	6	237816	237821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1080	NC_021909	TGC	2	6	239529	239534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1081	NC_021909	CGC	2	6	239795	239800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1082	NC_021909	TGCG	2	8	239892	239899	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1083	NC_021909	GGCA	2	8	239933	239940	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1084	NC_021909	CAG	2	6	241200	241205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1085	NC_021909	TCTTGA	2	12	241237	241248	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1086	NC_021909	TCAC	2	8	241249	241256	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1087	NC_021909	TGA	2	6	241261	241266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_021909	GCA	2	6	241291	241296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1089	NC_021909	CGT	2	6	241465	241470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1090	NC_021909	TGGCG	2	10	241579	241588	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
1091	NC_021909	CGCT	2	8	241589	241596	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1092	NC_021909	GCC	2	6	241616	241621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1093	NC_021909	ACA	2	6	241674	241679	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1094	NC_021909	GTCTT	2	10	244704	244713	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
1095	NC_021909	CGG	2	6	244778	244783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1096	NC_021909	ACC	2	6	244902	244907	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1097	NC_021909	TCC	2	6	244998	245003	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1098	NC_021909	TCG	2	6	245029	245034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1099	NC_021909	ATCG	2	8	245035	245042	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1100	NC_021909	CAC	2	6	245102	245107	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1101	NC_021909	CA	3	6	245130	245135	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1102	NC_021909	TGC	2	6	245172	245177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1103	NC_021909	G	6	6	245239	245244	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_021909	CGGC	2	8	245272	245279	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1105	NC_021909	GA	3	6	245320	245325	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_021909	GAT	2	6	245371	245376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_021909	CGGC	2	8	245397	245404	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1108	NC_021909	ACG	2	6	245441	245446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1109	NC_021909	GCG	2	6	245460	245465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1110	NC_021909	GAT	2	6	245488	245493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_021909	CGA	2	6	245506	245511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1112	NC_021909	TCG	2	6	245520	245525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1113	NC_021909	GC	3	6	245582	245587	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1114	NC_021909	GAG	2	6	245594	245599	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_021909	GCTG	2	8	245613	245620	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1116	NC_021909	GCC	2	6	245624	245629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1117	NC_021909	GGC	2	6	245635	245640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1118	NC_021909	CG	3	6	245656	245661	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1119	NC_021909	GC	3	6	245743	245748	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1120	NC_021909	AGACC	2	10	245773	245782	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
1121	NC_021909	GC	3	6	245893	245898	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1122	NC_021909	GCC	2	6	245906	245911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1123	NC_021909	GAA	2	6	245915	245920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_021909	TGG	2	6	245962	245967	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_021909	GCC	2	6	245979	245984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1126	NC_021909	CTG	2	6	246018	246023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1127	NC_021909	CGA	2	6	246047	246052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1128	NC_021909	GGC	3	9	246053	246061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1129	NC_021909	GCC	2	6	246186	246191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1130	NC_021909	TCG	2	6	246193	246198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1131	NC_021909	GCA	2	6	246212	246217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1132	NC_021909	CCCG	2	8	246242	246249	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1133	NC_021909	CGAGC	2	10	246281	246290	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1134	NC_021909	GCT	2	6	246299	246304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1135	NC_021909	CAGA	2	8	246341	246348	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1136	NC_021909	CGC	2	6	246380	246385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1137	NC_021909	CGG	2	6	246404	246409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1138	NC_021909	CTA	2	6	246419	246424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1142	NC_021909	ATA	2	6	246514	246519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1143	NC_021909	CGG	2	6	246562	246567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1144	NC_021909	GCA	2	6	246578	246583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1145	NC_021909	CGA	2	6	246608	246613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1147	NC_021909	GCT	2	6	246644	246649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1148	NC_021909	CTT	2	6	246654	246659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1149	NC_021909	CGG	2	6	246666	246671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1150	NC_021909	TTCC	2	8	246690	246697	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1151	NC_021909	CTGG	2	8	246714	246721	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1152	NC_021909	CCG	3	9	246743	246751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1155	NC_021909	TTC	2	6	246910	246915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1161	NC_021909	GCT	2	6	247136	247141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1164	NC_021909	GCC	2	6	247234	247239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1165	NC_021909	AGA	2	6	247270	247275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1166	NC_021909	TCG	2	6	247387	247392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1168	NC_021909	CG	3	6	247423	247428	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1169	NC_021909	TCC	2	6	247432	247437	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1170	NC_021909	CAC	2	6	247502	247507	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1172	NC_021909	CCA	2	6	247600	247605	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1173	NC_021909	GCACC	2	10	247616	247625	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
1174	NC_021909	GA	3	6	247662	247667	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1175	NC_021909	GAACC	2	10	247670	247679	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
1176	NC_021909	CTA	2	6	247706	247711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1187	NC_021909	CGT	3	9	250738	250746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1232	NC_021909	GTA	2	6	267634	267639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1251	NC_021909	TCGA	2	8	272655	272662	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1252	NC_021909	GTG	2	6	272671	272676	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1262	NC_021909	GCA	2	6	274451	274456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1263	NC_021909	A	6	6	274479	274484	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1264	NC_021909	ACC	2	6	274521	274526	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1265	NC_021909	TGT	2	6	274561	274566	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1266	NC_021909	TGCT	2	8	274638	274645	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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1403	NC_021909	CAAG	2	8	297507	297514	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1404	NC_021909	ACG	2	6	297515	297520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1425	NC_021909	GC	3	6	298978	298983	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1426	NC_021909	GTC	2	6	299011	299016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1428	NC_021909	GAT	2	6	299029	299034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1433	NC_021909	GACC	2	8	299755	299762	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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1436	NC_021909	TGGT	2	8	299843	299850	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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