MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Roseburia intestinalis M50/1 draft genome

Total Repeats: 20945

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_021040	AG	3	6	549828	549833	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3002	NC_021040	ATT	2	6	549837	549842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3003	NC_021040	TGG	2	6	549850	549855	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3004	NC_021040	ACC	2	6	550850	550855	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3005	NC_021040	T	6	6	550856	550861	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3006	NC_021040	GCC	2	6	551519	551524	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3007	NC_021040	AAT	2	6	551542	551547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3008	NC_021040	TAT	2	6	551548	551553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3009	NC_021040	AAG	2	6	551555	551560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3010	NC_021040	TGTC	2	8	552073	552080	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3011	NC_021040	GGA	2	6	552098	552103	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3012	NC_021040	GAT	2	6	554047	554052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3013	NC_021040	A	6	6	554101	554106	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3014	NC_021040	A	7	7	554109	554115	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3015	NC_021040	GCAA	2	8	554149	554156	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3016	NC_021040	A	6	6	554158	554163	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3017	NC_021040	GAAT	2	8	554178	554185	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3018	NC_021040	AGA	2	6	554218	554223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3019	NC_021040	AGG	2	6	554285	554290	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3020	NC_021040	GAG	2	6	555205	555210	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3021	NC_021040	AGG	2	6	555298	555303	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3022	NC_021040	CAA	2	6	556051	556056	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3023	NC_021040	AATG	2	8	556066	556073	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3024	NC_021040	ATT	2	6	556657	556662	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3025	NC_021040	CAGT	2	8	556691	556698	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3026	NC_021040	GA	3	6	560523	560528	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3027	NC_021040	TCAAA	2	10	560535	560544	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
3028	NC_021040	A	7	7	560638	560644	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3029	NC_021040	ATT	2	6	561685	561690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3030	NC_021040	ATT	2	6	561777	561782	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3031	NC_021040	CAA	2	6	561846	561851	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3032	NC_021040	TAA	2	6	563215	563220	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3033	NC_021040	TCT	2	6	563226	563231	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3034	NC_021040	ATA	2	6	563313	563318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3035	NC_021040	AT	3	6	563326	563331	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3036	NC_021040	GAA	2	6	567057	567062	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3037	NC_021040	ACC	2	6	567108	567113	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3038	NC_021040	GAT	2	6	567123	567128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3039	NC_021040	ACA	2	6	567151	567156	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3040	NC_021040	CTG	2	6	567179	567184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3041	NC_021040	ACT	2	6	567212	567217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3042	NC_021040	A	6	6	567227	567232	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3043	NC_021040	CCTTCG	2	12	567455	567466	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
3044	NC_021040	AGC	2	6	567507	567512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3045	NC_021040	ATCAA	2	10	567562	567571	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
3046	NC_021040	TC	3	6	567613	567618	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3047	NC_021040	GAA	2	6	567645	567650	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3048	NC_021040	TTA	2	6	567677	567682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3049	NC_021040	TGT	2	6	567694	567699	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3050	NC_021040	ATT	2	6	567704	567709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3051	NC_021040	GCT	2	6	567726	567731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3052	NC_021040	ACT	2	6	567776	567781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3053	NC_021040	CTC	2	6	567818	567823	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3054	NC_021040	TA	3	6	567870	567875	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3055	NC_021040	CTCATC	2	12	567938	567949	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
3056	NC_021040	GGC	2	6	567950	567955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3057	NC_021040	CGG	2	6	567967	567972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3058	NC_021040	A	6	6	568001	568006	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3059	NC_021040	A	6	6	568036	568041	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3060	NC_021040	TGTA	2	8	568066	568073	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3061	NC_021040	T	6	6	568080	568085	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3062	NC_021040	ATT	2	6	568110	568115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3063	NC_021040	GAAA	2	8	568117	568124	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3064	NC_021040	ATG	2	6	568146	568151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3065	NC_021040	TGAT	2	8	568155	568162	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3066	NC_021040	CAC	2	6	568179	568184	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3067	NC_021040	GAA	2	6	568277	568282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3068	NC_021040	N	741	741	568292	569032	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3069	NC_021040	ATT	2	6	569037	569042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3070	NC_021040	GTA	2	6	569082	569087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3071	NC_021040	TAT	2	6	569106	569111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3072	NC_021040	AG	3	6	570669	570674	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3073	NC_021040	AAGG	2	8	570749	570756	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3074	NC_021040	TAA	2	6	572061	572066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3075	NC_021040	AAC	2	6	572069	572074	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3076	NC_021040	TGA	2	6	572193	572198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3077	NC_021040	GAAG	2	8	572237	572244	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3078	NC_021040	AGG	2	6	572260	572265	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3079	NC_021040	TGA	2	6	572340	572345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3080	NC_021040	ATT	2	6	572365	572370	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3081	NC_021040	TA	3	6	572373	572378	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3082	NC_021040	AAC	2	6	572426	572431	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3083	NC_021040	A	6	6	572459	572464	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3084	NC_021040	ATT	2	6	572486	572491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3085	NC_021040	GTT	2	6	572515	572520	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3086	NC_021040	GAT	2	6	572570	572575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3087	NC_021040	AT	3	6	572574	572579	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3088	NC_021040	ATG	2	6	572589	572594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3089	NC_021040	TAT	2	6	572631	572636	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3090	NC_021040	A	6	6	572667	572672	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3091	NC_021040	TAT	2	6	572677	572682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3092	NC_021040	A	6	6	572761	572766	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3093	NC_021040	ATAA	2	8	572840	572847	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3094	NC_021040	GTA	2	6	572865	572870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3095	NC_021040	GGT	2	6	572882	572887	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3096	NC_021040	A	7	7	572898	572904	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3097	NC_021040	ATTA	2	8	572914	572921	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3098	NC_021040	TAG	2	6	572937	572942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3099	NC_021040	GAG	2	6	572952	572957	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3100	NC_021040	A	6	6	572989	572994	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3101	NC_021040	AT	3	6	573026	573031	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3102	NC_021040	TA	4	8	573097	573104	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3103	NC_021040	ATT	2	6	573139	573144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3104	NC_021040	TCC	2	6	573190	573195	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3105	NC_021040	TAA	2	6	573208	573213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3106	NC_021040	CAAAAT	2	12	573218	573229	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3107	NC_021040	ATT	2	6	573253	573258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3108	NC_021040	ATT	2	6	573261	573266	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3109	NC_021040	AT	3	6	573312	573317	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3110	NC_021040	GTT	2	6	573346	573351	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3111	NC_021040	GAA	2	6	573352	573357	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3112	NC_021040	AG	3	6	573492	573497	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3113	NC_021040	CTT	2	6	573555	573560	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3114	NC_021040	ATA	2	6	573606	573611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3115	NC_021040	ATA	2	6	573654	573659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3116	NC_021040	ACA	2	6	573685	573690	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3117	NC_021040	AATG	2	8	573719	573726	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3118	NC_021040	AGT	2	6	573806	573811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3119	NC_021040	ATTAC	2	10	573849	573858	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
3120	NC_021040	TTCTT	2	10	573882	573891	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
3121	NC_021040	CAT	2	6	573938	573943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3122	NC_021040	ATT	2	6	574047	574052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3123	NC_021040	GAT	2	6	574070	574075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3124	NC_021040	ATT	2	6	574080	574085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3125	NC_021040	TTA	2	6	574112	574117	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3126	NC_021040	GAAAT	2	10	574209	574218	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
3127	NC_021040	TTGG	2	8	574226	574233	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3128	NC_021040	TGA	2	6	574276	574281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3129	NC_021040	AT	3	6	574295	574300	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3130	NC_021040	TGT	2	6	574417	574422	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3131	NC_021040	AGG	2	6	574490	574495	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3132	NC_021040	AGT	2	6	574956	574961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3133	NC_021040	ACA	2	6	575021	575026	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3134	NC_021040	N	580	580	575060	575639	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3135	NC_021040	GTAAT	2	10	575646	575655	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
3136	NC_021040	TGA	2	6	577170	577175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3276	NC_021040	TTC	2	6	599493	599498	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3278	NC_021040	TTC	2	6	599841	599846	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3279	NC_021040	TA	3	6	599850	599855	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3398	NC_021040	CAATA	2	10	625710	625719	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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3402	NC_021040	TGCC	2	8	629485	629492	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3403	NC_021040	ACG	2	6	629504	629509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3411	NC_021040	GAAA	2	8	630848	630855	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3412	NC_021040	AGA	2	6	630878	630883	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3413	NC_021040	AG	3	6	630910	630915	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3414	NC_021040	GAA	2	6	639972	639977	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3415	NC_021040	AATG	2	8	640020	640027	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3416	NC_021040	CAT	2	6	640451	640456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3417	NC_021040	AAG	2	6	640468	640473	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3418	NC_021040	A	7	7	640483	640489	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3419	NC_021040	GGC	2	6	640499	640504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3420	NC_021040	GCA	2	6	640509	640514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3422	NC_021040	TTG	2	6	641598	641603	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3423	NC_021040	TGA	2	6	641634	641639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3425	NC_021040	CTG	2	6	641792	641797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3427	NC_021040	ATC	2	6	641831	641836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3429	NC_021040	TGA	2	6	641887	641892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3430	NC_021040	TCTGG	2	10	641957	641966	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
3431	NC_021040	TCA	2	6	642036	642041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3432	NC_021040	CAGA	2	8	642106	642113	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3433	NC_021040	TAT	2	6	642137	642142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3434	NC_021040	GGAA	2	8	642238	642245	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3435	NC_021040	ATG	2	6	642284	642289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3438	NC_021040	GAT	2	6	642473	642478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3441	NC_021040	ATG	2	6	642611	642616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3442	NC_021040	ATGG	2	8	642623	642630	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3443	NC_021040	GGA	2	6	642664	642669	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3444	NC_021040	CACT	2	8	642696	642703	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3445	NC_021040	GAAT	2	8	642747	642754	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3446	NC_021040	GATT	2	8	642772	642779	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3447	NC_021040	AGG	3	9	642843	642851	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3448	NC_021040	CTT	2	6	642860	642865	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3449	NC_021040	GAT	2	6	642869	642874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3450	NC_021040	CT	3	6	642875	642880	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3451	NC_021040	GAG	2	6	642926	642931	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3452	NC_021040	GCA	2	6	642956	642961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3453	NC_021040	TGA	2	6	642963	642968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3454	NC_021040	GCA	2	6	643118	643123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3455	NC_021040	A	6	6	643173	643178	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3456	NC_021040	A	6	6	643210	643215	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3457	NC_021040	GAAG	2	8	643237	643244	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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3480	NC_021040	TGTA	2	8	644229	644236	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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3492	NC_021040	TCC	2	6	649220	649225	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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