MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Roseburia intestinalis M50/1 draft genome

Total Repeats: 20945

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18001	NC_021040	GTAAA	2	10	3562994	3563003	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
18002	NC_021040	GAA	2	6	3563007	3563012	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18003	NC_021040	T	6	6	3563490	3563495	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18004	NC_021040	TAAA	2	8	3563510	3563517	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
18005	NC_021040	TTG	2	6	3565212	3565217	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18006	NC_021040	T	6	6	3565383	3565388	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18007	NC_021040	GAA	2	6	3565426	3565431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18008	NC_021040	A	6	6	3565438	3565443	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18009	NC_021040	A	6	6	3565486	3565491	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18010	NC_021040	GGA	2	6	3565493	3565498	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18011	NC_021040	A	6	6	3565524	3565529	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18012	NC_021040	A	7	7	3565531	3565537	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18013	NC_021040	A	6	6	3565539	3565544	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18014	NC_021040	AAAC	2	8	3565550	3565557	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
18015	NC_021040	TAAAA	2	10	3566898	3566907	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
18016	NC_021040	A	6	6	3566904	3566909	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18017	NC_021040	T	7	7	3566948	3566954	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18018	NC_021040	ATTT	2	8	3568660	3568667	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
18019	NC_021040	A	6	6	3568681	3568686	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18020	NC_021040	CAG	2	6	3568687	3568692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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18022	NC_021040	TTA	2	6	3568746	3568751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18023	NC_021040	A	6	6	3568751	3568756	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18024	NC_021040	CGA	2	6	3568822	3568827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18025	NC_021040	GACA	2	8	3568939	3568946	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
18026	NC_021040	GGAACA	2	12	3568950	3568961	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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18031	NC_021040	AGT	2	6	3569149	3569154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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18033	NC_021040	T	7	7	3569195	3569201	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18034	NC_021040	T	6	6	3569232	3569237	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18035	NC_021040	CAA	2	6	3569247	3569252	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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18038	NC_021040	ATGAT	2	10	3569330	3569339	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
18039	NC_021040	A	6	6	3569464	3569469	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18040	NC_021040	T	6	6	3569490	3569495	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18041	NC_021040	ATA	2	6	3569506	3569511	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18042	NC_021040	GC	3	6	3569525	3569530	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18043	NC_021040	TAT	2	6	3569535	3569540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18044	NC_021040	AT	3	6	3569578	3569583	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18045	NC_021040	AGA	2	6	3569584	3569589	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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18049	NC_021040	TG	3	6	3569906	3569911	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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18051	NC_021040	TAAT	2	8	3569927	3569934	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18052	NC_021040	A	8	8	3569949	3569956	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18053	NC_021040	CAT	2	6	3569984	3569989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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18056	NC_021040	TCTG	2	8	3570091	3570098	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
18057	NC_021040	N	469	469	3570108	3570576	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18058	NC_021040	CAA	2	6	3570609	3570614	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18059	NC_021040	T	6	6	3570616	3570621	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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18061	NC_021040	T	6	6	3570672	3570677	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18062	NC_021040	A	6	6	3570683	3570688	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18063	NC_021040	TAA	2	6	3570693	3570698	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18064	NC_021040	TA	3	6	3570707	3570712	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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18071	NC_021040	A	6	6	3576278	3576283	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18072	NC_021040	TG	3	6	3576291	3576296	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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18096	NC_021040	GA	3	6	3577585	3577590	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18097	NC_021040	CAG	2	6	3577617	3577622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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18099	NC_021040	A	6	6	3577662	3577667	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18100	NC_021040	AAT	2	6	3577696	3577701	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18101	NC_021040	TAA	2	6	3577709	3577714	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18102	NC_021040	GCA	2	6	3577745	3577750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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18104	NC_021040	TGA	2	6	3577821	3577826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18105	NC_021040	TGC	2	6	3577907	3577912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18106	NC_021040	CA	3	6	3577977	3577982	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
18107	NC_021040	CAGA	2	8	3578018	3578025	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
18108	NC_021040	AAG	2	6	3578060	3578065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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18112	NC_021040	CAT	2	6	3580066	3580071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18113	NC_021040	A	8	8	3580098	3580105	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18114	NC_021040	AGT	2	6	3580108	3580113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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18116	NC_021040	CTT	2	6	3580153	3580158	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18117	NC_021040	ATA	2	6	3580169	3580174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18118	NC_021040	GGA	2	6	3580236	3580241	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18119	NC_021040	GTC	2	6	3580254	3580259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18120	NC_021040	AGAAA	2	10	3580260	3580269	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
18121	NC_021040	CTG	2	6	3580307	3580312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18122	NC_021040	GCA	2	6	3580348	3580353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18123	NC_021040	A	7	7	3580476	3580482	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18124	NC_021040	TGG	2	6	3580494	3580499	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18125	NC_021040	TGA	2	6	3580522	3580527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18126	NC_021040	ATT	2	6	3580620	3580625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18127	NC_021040	AT	3	6	3580662	3580667	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18128	NC_021040	AG	3	6	3580721	3580726	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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18130	NC_021040	CGA	2	6	3580743	3580748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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18135	NC_021040	GGT	2	6	3580928	3580933	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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18139	NC_021040	CAGT	2	8	3581055	3581062	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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18142	NC_021040	A	7	7	3582543	3582549	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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18253	NC_021040	GAAA	2	8	3596887	3596894	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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18256	NC_021040	A	7	7	3597027	3597033	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18257	NC_021040	CA	3	6	3597034	3597039	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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18393	NC_021040	C	6	6	3641181	3641186	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
18394	NC_021040	ACC	2	6	3641190	3641195	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18395	NC_021040	CAT	2	6	3641227	3641232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18396	NC_021040	ATTA	2	8	3641331	3641338	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18397	NC_021040	A	6	6	3641366	3641371	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18398	NC_021040	AAAACA	2	12	3641379	3641390	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18399	NC_021040	A	6	6	3641480	3641485	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18400	NC_021040	A	6	6	3641495	3641500	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18401	NC_021040	AATTA	2	10	3641514	3641523	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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18412	NC_021040	GGA	2	6	3647578	3647583	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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18422	NC_021040	TTA	3	9	3654906	3654914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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18427	NC_021040	ATG	2	6	3655962	3655967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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18431	NC_021040	ATT	2	6	3656702	3656707	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18432	NC_021040	T	6	6	3656726	3656731	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18433	NC_021040	A	6	6	3656830	3656835	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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