MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Roseburia intestinalis M50/1 draft genome

Total Repeats: 20945

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_021040	AAT	2	6	2990578	2990583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15002	NC_021040	GGA	2	6	2992334	2992339	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15003	NC_021040	ATC	2	6	2993280	2993285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15004	NC_021040	TGG	2	6	2993291	2993296	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15005	NC_021040	T	6	6	2993357	2993362	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15006	NC_021040	GAA	2	6	2993373	2993378	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15007	NC_021040	TA	3	6	2994522	2994527	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15008	NC_021040	CGG	2	6	2994617	2994622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15009	NC_021040	TA	3	6	2994708	2994713	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15010	NC_021040	CTGA	2	8	2994734	2994741	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
15011	NC_021040	TGA	2	6	2994819	2994824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15012	NC_021040	TCA	2	6	2994864	2994869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15013	NC_021040	TCA	2	6	2994927	2994932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15014	NC_021040	GTGA	2	8	2994944	2994951	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
15015	NC_021040	ATT	2	6	2995025	2995030	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15016	NC_021040	TC	3	6	2995050	2995055	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15017	NC_021040	TTTA	2	8	2995077	2995084	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15018	NC_021040	CTTG	2	8	2995092	2995099	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
15019	NC_021040	T	6	6	2995129	2995134	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15020	NC_021040	TAG	2	6	2995145	2995150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15021	NC_021040	ATTT	2	8	2995175	2995182	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15022	NC_021040	A	6	6	2995189	2995194	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15023	NC_021040	T	6	6	2995222	2995227	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15024	NC_021040	AACC	2	8	2999385	2999392	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15025	NC_021040	A	6	6	2999480	2999485	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15026	NC_021040	TTTC	2	8	3000958	3000965	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
15027	NC_021040	GGGT	2	8	3000969	3000976	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
15028	NC_021040	AAC	2	6	3000991	3000996	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15029	NC_021040	GAA	2	6	3001041	3001046	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15030	NC_021040	TTA	2	6	3001380	3001385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15031	NC_021040	A	7	7	3001398	3001404	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15032	NC_021040	AGTA	2	8	3001406	3001413	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15033	NC_021040	AT	3	6	3001421	3001426	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15034	NC_021040	AT	4	8	3001585	3001592	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15035	NC_021040	ATT	2	6	3001604	3001609	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15036	NC_021040	ATT	2	6	3001707	3001712	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15037	NC_021040	A	6	6	3001718	3001723	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15038	NC_021040	ACAAT	2	10	3001846	3001855	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
15039	NC_021040	GCT	2	6	3001856	3001861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15040	NC_021040	ATA	2	6	3001921	3001926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15041	NC_021040	T	6	6	3001952	3001957	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15042	NC_021040	TTA	2	6	3001992	3001997	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15043	NC_021040	ATT	2	6	3002071	3002076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15044	NC_021040	CGCC	2	8	3002172	3002179	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
15045	NC_021040	AC	3	6	3002181	3002186	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15046	NC_021040	AT	3	6	3002260	3002265	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15047	NC_021040	TC	3	6	3002272	3002277	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15048	NC_021040	CTTT	2	8	3002349	3002356	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
15049	NC_021040	N	748	748	3002400	3003147	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15050	NC_021040	GTT	2	6	3003189	3003194	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15051	NC_021040	T	6	6	3003193	3003198	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15052	NC_021040	AAT	2	6	3003211	3003216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15053	NC_021040	T	6	6	3003248	3003253	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15054	NC_021040	TTAT	2	8	3003275	3003282	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15055	NC_021040	CGT	2	6	3003304	3003309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15056	NC_021040	T	6	6	3003370	3003375	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15057	NC_021040	ATA	2	6	3003376	3003381	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15058	NC_021040	T	6	6	3003397	3003402	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15059	NC_021040	A	6	6	3003407	3003412	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15060	NC_021040	A	7	7	3003427	3003433	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15061	NC_021040	TGT	2	6	3003460	3003465	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15062	NC_021040	A	6	6	3003481	3003486	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15063	NC_021040	AGG	2	6	3003495	3003500	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15064	NC_021040	GA	3	6	3003687	3003692	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15065	NC_021040	CTGA	2	8	3003705	3003712	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
15066	NC_021040	AGA	2	6	3003714	3003719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15067	NC_021040	TAA	2	6	3004538	3004543	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15068	NC_021040	AT	3	6	3004547	3004552	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15069	NC_021040	AGG	2	6	3004569	3004574	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15070	NC_021040	GAA	2	6	3004584	3004589	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15071	NC_021040	TTGCAG	3	18	3004635	3004652	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
15072	NC_021040	GACA	2	8	3004682	3004689	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
15073	NC_021040	AAT	2	6	3004690	3004695	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15074	NC_021040	CAG	2	6	3004697	3004702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15075	NC_021040	TAA	2	6	3004829	3004834	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15076	NC_021040	GGA	2	6	3004839	3004844	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15077	NC_021040	TAT	2	6	3006270	3006275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15078	NC_021040	AG	3	6	3006334	3006339	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15079	NC_021040	TTG	2	6	3006340	3006345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15080	NC_021040	TGC	2	6	3006405	3006410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15081	NC_021040	GGA	2	6	3006421	3006426	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15082	NC_021040	AAAT	2	8	3006467	3006474	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15083	NC_021040	TGA	2	6	3006477	3006482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15084	NC_021040	GCA	2	6	3006544	3006549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15085	NC_021040	T	7	7	3006569	3006575	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15086	NC_021040	ATA	2	6	3006578	3006583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15088	NC_021040	AAG	2	6	3006602	3006607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15089	NC_021040	AGA	2	6	3006609	3006614	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15090	NC_021040	A	8	8	3006622	3006629	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15091	NC_021040	TGT	2	6	3006642	3006647	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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15093	NC_021040	TAA	2	6	3006747	3006752	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15094	NC_021040	GAA	2	6	3006790	3006795	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15095	NC_021040	TAT	2	6	3006960	3006965	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15096	NC_021040	AAT	2	6	3007009	3007014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15097	NC_021040	TG	3	6	3007070	3007075	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15098	NC_021040	CAT	2	6	3007121	3007126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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15100	NC_021040	AGA	2	6	3007200	3007205	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15101	NC_021040	AAC	2	6	3007224	3007229	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15102	NC_021040	TGG	2	6	3007241	3007246	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15103	NC_021040	AG	3	6	3007268	3007273	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15104	NC_021040	TAAA	2	8	3007340	3007347	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15105	NC_021040	AAG	2	6	3007379	3007384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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15107	NC_021040	GAA	2	6	3007391	3007396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15108	NC_021040	A	6	6	3007428	3007433	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15109	NC_021040	T	8	8	3007435	3007442	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15110	NC_021040	ATTT	2	8	3007444	3007451	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15111	NC_021040	GTA	2	6	3007504	3007509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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15113	NC_021040	AATTT	2	10	3007564	3007573	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
15114	NC_021040	AT	3	6	3007589	3007594	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15115	NC_021040	ATT	2	6	3007635	3007640	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15117	NC_021040	TAA	2	6	3007720	3007725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15118	NC_021040	TCT	2	6	3007735	3007740	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15119	NC_021040	TTGA	2	8	3007754	3007761	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
15120	NC_021040	T	6	6	3010961	3010966	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15121	NC_021040	TAT	2	6	3010984	3010989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15122	NC_021040	ATT	2	6	3011011	3011016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15123	NC_021040	A	6	6	3011031	3011036	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15124	NC_021040	AG	3	6	3011044	3011049	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15125	NC_021040	CAT	2	6	3011056	3011061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15126	NC_021040	ATT	2	6	3011076	3011081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15127	NC_021040	TATG	2	8	3011083	3011090	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
15128	NC_021040	ATA	2	6	3011116	3011121	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15129	NC_021040	TCC	2	6	3011123	3011128	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15130	NC_021040	TAT	2	6	3011187	3011192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15131	NC_021040	CAA	2	6	3011193	3011198	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15132	NC_021040	ATATG	2	10	3011277	3011286	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
15133	NC_021040	TCT	2	6	3012457	3012462	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15134	NC_021040	A	6	6	3012567	3012572	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15135	NC_021040	AGC	2	6	3013008	3013013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15138	NC_021040	TAT	3	9	3014395	3014403	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15139	NC_021040	A	6	6	3014405	3014410	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15142	NC_021040	A	6	6	3016167	3016172	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15152	NC_021040	TAT	2	6	3018653	3018658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15161	NC_021040	GA	3	6	3019073	3019078	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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15166	NC_021040	A	6	6	3019234	3019239	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15242	NC_021040	AAGGA	2	10	3034112	3034121	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
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15246	NC_021040	AAG	2	6	3034688	3034693	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15247	NC_021040	ATG	2	6	3034743	3034748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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15249	NC_021040	GAA	2	6	3034811	3034816	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15250	NC_021040	A	6	6	3034956	3034961	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15251	NC_021040	TTAG	2	8	3034971	3034978	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
15252	NC_021040	TA	3	6	3034979	3034984	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15253	NC_021040	CGTC	2	8	3035049	3035056	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
15254	NC_021040	GCA	2	6	3035111	3035116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15255	NC_021040	TTC	2	6	3035155	3035160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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15261	NC_021040	T	7	7	3035361	3035367	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15262	NC_021040	GT	3	6	3035425	3035430	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15263	NC_021040	TAAAA	2	10	3035446	3035455	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15381	NC_021040	T	6	6	3070420	3070425	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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