MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Roseburia intestinalis M50/1 draft genome

Total Repeats: 20945

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14501	NC_021040	CAA	2	6	2894677	2894682	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14502	NC_021040	T	7	7	2894686	2894692	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14503	NC_021040	TGT	2	6	2894701	2894706	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14504	NC_021040	AAT	2	6	2894765	2894770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14505	NC_021040	T	6	6	2894770	2894775	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14506	NC_021040	AT	3	6	2894811	2894816	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14507	NC_021040	TTG	2	6	2894833	2894838	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14508	NC_021040	TTCT	2	8	2894841	2894848	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
14509	NC_021040	ACTG	2	8	2894960	2894967	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14510	NC_021040	T	6	6	2895043	2895048	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14511	NC_021040	AT	3	6	2895073	2895078	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14512	NC_021040	AT	3	6	2895083	2895088	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14513	NC_021040	ATT	2	6	2895094	2895099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14514	NC_021040	T	6	6	2895132	2895137	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14515	NC_021040	TTG	2	6	2895147	2895152	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14516	NC_021040	ATC	2	6	2895214	2895219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14517	NC_021040	TCT	2	6	2895242	2895247	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14518	NC_021040	A	6	6	2895251	2895256	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14519	NC_021040	CAA	2	6	2895267	2895272	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14520	NC_021040	ATC	2	6	2895334	2895339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14521	NC_021040	TGG	2	6	2895352	2895357	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14522	NC_021040	AT	3	6	2895388	2895393	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14523	NC_021040	TAT	2	6	2895420	2895425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14524	NC_021040	CTT	2	6	2895472	2895477	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14525	NC_021040	CT	3	6	2895494	2895499	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14526	NC_021040	N	410	410	2895506	2895915	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14527	NC_021040	CTT	2	6	2895916	2895921	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14528	NC_021040	CT	3	6	2895938	2895943	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14529	NC_021040	ATTT	2	8	2895979	2895986	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14530	NC_021040	ATT	2	6	2895991	2895996	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14531	NC_021040	CTA	2	6	2896013	2896018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14532	NC_021040	AAC	2	6	2896039	2896044	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14533	NC_021040	TCA	2	6	2896085	2896090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14534	NC_021040	T	6	6	2896119	2896124	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14535	NC_021040	ATA	2	6	2896143	2896148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14536	NC_021040	TAA	2	6	2896340	2896345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14537	NC_021040	TGG	2	6	2896369	2896374	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14538	NC_021040	AT	3	6	2896381	2896386	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14539	NC_021040	ACCTCT	2	12	2896388	2896399	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
14540	NC_021040	TTC	2	6	2896412	2896417	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14541	NC_021040	ATC	2	6	2896432	2896437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14542	NC_021040	TAA	2	6	2896481	2896486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14543	NC_021040	TTC	3	9	2896553	2896561	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14544	NC_021040	TGT	2	6	2896630	2896635	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14545	NC_021040	TGC	2	6	2896696	2896701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14546	NC_021040	ATA	2	6	2896750	2896755	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14547	NC_021040	CAG	2	6	2896764	2896769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14548	NC_021040	T	6	6	2896802	2896807	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14549	NC_021040	CTT	2	6	2896821	2896826	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14550	NC_021040	TA	3	6	2896852	2896857	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14551	NC_021040	T	9	9	2896988	2896996	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14552	NC_021040	TCC	2	6	2897053	2897058	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14553	NC_021040	AAT	2	6	2897088	2897093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14554	NC_021040	AT	3	6	2897112	2897117	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14555	NC_021040	TTG	2	6	2897122	2897127	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14556	NC_021040	ACA	2	6	2897144	2897149	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14557	NC_021040	AAAT	2	8	2897161	2897168	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14558	NC_021040	TAC	2	6	2897238	2897243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14559	NC_021040	TCC	2	6	2898564	2898569	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14560	NC_021040	GTT	2	6	2898579	2898584	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14561	NC_021040	A	6	6	2898814	2898819	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14562	NC_021040	CCT	2	6	2898820	2898825	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14563	NC_021040	AAT	2	6	2898827	2898832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14564	NC_021040	A	6	6	2898889	2898894	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14565	NC_021040	TG	3	6	2898953	2898958	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14566	NC_021040	TAG	2	6	2898967	2898972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14567	NC_021040	N	699	699	2899131	2899829	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14568	NC_021040	TAAT	2	8	2899847	2899854	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14569	NC_021040	CGG	2	6	2899897	2899902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14570	NC_021040	AGA	2	6	2900402	2900407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14571	NC_021040	N	1057	1057	2900437	2901493	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14572	NC_021040	GAA	2	6	2904360	2904365	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14573	NC_021040	TCA	2	6	2904381	2904386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14574	NC_021040	AATT	2	8	2905060	2905067	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14575	NC_021040	TAAA	2	8	2905073	2905080	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14576	NC_021040	T	6	6	2905096	2905101	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14577	NC_021040	ATT	2	6	2905113	2905118	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14578	NC_021040	TTAT	2	8	2905158	2905165	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14579	NC_021040	ATG	2	6	2905200	2905205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14580	NC_021040	GAA	2	6	2905214	2905219	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14581	NC_021040	A	8	8	2905250	2905257	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14582	NC_021040	TTC	2	6	2905281	2905286	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14583	NC_021040	ACA	2	6	2905300	2905305	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14584	NC_021040	GAA	2	6	2905348	2905353	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14585	NC_021040	AG	3	6	2905354	2905359	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14586	NC_021040	GATTA	2	10	2905371	2905380	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
14587	NC_021040	ATC	2	6	2905409	2905414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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14589	NC_021040	GTG	2	6	2905495	2905500	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14590	NC_021040	T	6	6	2905519	2905524	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14591	NC_021040	GCT	2	6	2905536	2905541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14592	NC_021040	GGC	2	6	2905555	2905560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14593	NC_021040	GTG	2	6	2905568	2905573	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14594	NC_021040	AGG	2	6	2905626	2905631	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14595	NC_021040	TGC	2	6	2909179	2909184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14596	NC_021040	CA	3	6	2909186	2909191	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14597	NC_021040	GCA	2	6	2909205	2909210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14598	NC_021040	AGG	2	6	2909234	2909239	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14599	NC_021040	GA	3	6	2909741	2909746	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14600	NC_021040	GTA	2	6	2910816	2910821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14601	NC_021040	T	6	6	2910827	2910832	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14602	NC_021040	AATGA	2	10	2910885	2910894	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
14603	NC_021040	A	6	6	2910899	2910904	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14604	NC_021040	AGG	2	6	2910933	2910938	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14605	NC_021040	TCG	2	6	2912315	2912320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14607	NC_021040	ACA	2	6	2912335	2912340	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14608	NC_021040	AAT	2	6	2912380	2912385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14609	NC_021040	GGA	2	6	2912411	2912416	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14610	NC_021040	GAT	2	6	2914352	2914357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14611	NC_021040	ATG	2	6	2914410	2914415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14612	NC_021040	AGA	2	6	2914423	2914428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14613	NC_021040	TTG	2	6	2914435	2914440	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14614	NC_021040	TAT	2	6	2914496	2914501	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14615	NC_021040	CAGG	2	8	2914511	2914518	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
14616	NC_021040	ACA	2	6	2914534	2914539	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14617	NC_021040	GGAA	2	8	2914556	2914563	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14618	NC_021040	GAA	2	6	2914632	2914637	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14619	NC_021040	TGA	2	6	2914640	2914645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14620	NC_021040	GAA	2	6	2914758	2914763	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14621	NC_021040	CAA	2	6	2914796	2914801	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14622	NC_021040	TAT	2	6	2914812	2914817	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14623	NC_021040	CTT	2	6	2914881	2914886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14624	NC_021040	AT	3	6	2914967	2914972	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14625	NC_021040	GAA	2	6	2915001	2915006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14626	NC_021040	AAAGA	2	10	2915085	2915094	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
14627	NC_021040	TTC	2	6	2915135	2915140	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14628	NC_021040	CAGT	2	8	2915149	2915156	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14629	NC_021040	GGC	2	6	2915430	2915435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14630	NC_021040	TGC	2	6	2915542	2915547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14631	NC_021040	TGA	2	6	2915549	2915554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14632	NC_021040	AGC	2	6	2915568	2915573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14633	NC_021040	GCAGA	2	10	2915619	2915628	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
14634	NC_021040	GCT	2	6	2915726	2915731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14635	NC_021040	TGC	2	6	2915803	2915808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14636	NC_021040	AG	3	6	2916026	2916031	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14637	NC_021040	CGG	2	6	2916101	2916106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14638	NC_021040	TGA	2	6	2916181	2916186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14639	NC_021040	CAGG	2	8	2916198	2916205	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
14640	NC_021040	GAA	2	6	2916231	2916236	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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14642	NC_021040	CATATC	2	12	2916276	2916287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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14644	NC_021040	GA	3	6	2916397	2916402	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14645	NC_021040	TGG	2	6	2916431	2916436	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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14651	NC_021040	A	6	6	2916565	2916570	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14652	NC_021040	AAT	2	6	2917332	2917337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14656	NC_021040	A	6	6	2918368	2918373	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14662	NC_021040	A	7	7	2921676	2921682	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14663	NC_021040	AAG	2	6	2922569	2922574	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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14666	NC_021040	TCC	2	6	2925076	2925081	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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14668	NC_021040	TA	3	6	2925147	2925152	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14669	NC_021040	AGAA	2	8	2925156	2925163	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
14670	NC_021040	A	8	8	2925214	2925221	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14741	NC_021040	GTG	2	6	2932610	2932615	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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14744	NC_021040	ATTCTG	2	12	2932859	2932870	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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14751	NC_021040	TGG	2	6	2933406	2933411	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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14753	NC_021040	TCACGG	2	12	2933478	2933489	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14755	NC_021040	GGC	2	6	2933603	2933608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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14887	NC_021040	ATC	2	6	2958889	2958894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14888	NC_021040	GTA	2	6	2958944	2958949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14889	NC_021040	CAA	3	9	2958966	2958974	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14890	NC_021040	GAT	2	6	2958983	2958988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14891	NC_021040	ATC	2	6	2959101	2959106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14892	NC_021040	AG	3	6	2959142	2959147	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14893	NC_021040	AAG	2	6	2959172	2959177	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14894	NC_021040	TGA	2	6	2959306	2959311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14895	NC_021040	TGT	2	6	2959390	2959395	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14896	NC_021040	TGATAC	2	12	2959423	2959434	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
14897	NC_021040	ATG	2	6	2959461	2959466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14898	NC_021040	CAT	2	6	2959468	2959473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14899	NC_021040	AAG	2	6	2959523	2959528	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14900	NC_021040	CTT	2	6	2959559	2959564	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14901	NC_021040	GTTT	2	8	2959585	2959592	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
14902	NC_021040	AAGG	2	8	2959595	2959602	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14903	NC_021040	TGC	2	6	2959633	2959638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14906	NC_021040	ACA	2	6	2960197	2960202	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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14908	NC_021040	GAT	2	6	2960326	2960331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14909	NC_021040	GACA	2	8	2960371	2960378	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
14910	NC_021040	AGA	2	6	2960412	2960417	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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14912	NC_021040	TTA	2	6	2960489	2960494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14914	NC_021040	TGA	2	6	2960529	2960534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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14921	NC_021040	GAG	2	6	2960875	2960880	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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14926	NC_021040	TGA	2	6	2961273	2961278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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14930	NC_021040	GA	3	6	2961499	2961504	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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