MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Roseburia intestinalis M50/1 draft genome

Total Repeats: 20945

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_021040	CCA	2	6	2704940	2704945	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13502	NC_021040	CT	3	6	2704954	2704959	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13503	NC_021040	CT	3	6	2704980	2704985	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13504	NC_021040	T	8	8	2705008	2705015	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13505	NC_021040	GTT	2	6	2705018	2705023	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13506	NC_021040	TCC	2	6	2709743	2709748	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13507	NC_021040	T	7	7	2709792	2709798	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13508	NC_021040	CTA	2	6	2711277	2711282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13509	NC_021040	CTTC	2	8	2711283	2711290	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13510	NC_021040	TTTA	2	8	2711302	2711309	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13511	NC_021040	TTTTC	2	10	2711323	2711332	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
13512	NC_021040	TTC	2	6	2711395	2711400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13513	NC_021040	AATGCC	2	12	2711425	2711436	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
13514	NC_021040	ACC	2	6	2711464	2711469	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13515	NC_021040	AAT	2	6	2711503	2711508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13516	NC_021040	ATA	2	6	2711529	2711534	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13517	NC_021040	CAT	2	6	2711604	2711609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13518	NC_021040	TGA	2	6	2711633	2711638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13519	NC_021040	ACC	2	6	2711684	2711689	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13520	NC_021040	T	6	6	2711705	2711710	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13521	NC_021040	CGTC	2	8	2711781	2711788	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13522	NC_021040	AC	3	6	2711832	2711837	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13523	NC_021040	CGC	3	9	2711866	2711874	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13524	NC_021040	AT	3	6	2711882	2711887	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13525	NC_021040	ATC	2	6	2711950	2711955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13526	NC_021040	CTG	2	6	2712145	2712150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13527	NC_021040	CGC	2	6	2712222	2712227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13528	NC_021040	GCATG	2	10	2712327	2712336	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
13529	NC_021040	CA	3	6	2712338	2712343	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13530	NC_021040	TCC	2	6	2712350	2712355	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13531	NC_021040	TGA	2	6	2712399	2712404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13532	NC_021040	T	7	7	2712438	2712444	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13533	NC_021040	GCT	2	6	2712508	2712513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13534	NC_021040	GTCT	2	8	2712539	2712546	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
13535	NC_021040	GTTT	2	8	2712574	2712581	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
13536	NC_021040	TCA	2	6	2712596	2712601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13537	NC_021040	GAT	2	6	2712645	2712650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13538	NC_021040	T	6	6	2712694	2712699	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13539	NC_021040	TGC	2	6	2712719	2712724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13540	NC_021040	TCA	2	6	2712761	2712766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13541	NC_021040	T	6	6	2712931	2712936	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13542	NC_021040	A	7	7	2712962	2712968	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13543	NC_021040	AAAG	2	8	2713094	2713101	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
13544	NC_021040	TCTG	2	8	2713134	2713141	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
13545	NC_021040	CT	3	6	2713159	2713164	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13546	NC_021040	T	7	7	2713190	2713196	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13547	NC_021040	AT	3	6	2713284	2713289	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13548	NC_021040	CCG	2	6	2713340	2713345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13549	NC_021040	CGG	2	6	2713375	2713380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13550	NC_021040	T	6	6	2713444	2713449	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13551	NC_021040	TCT	2	6	2714361	2714366	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13552	NC_021040	TTA	2	6	2714367	2714372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13553	NC_021040	ATC	2	6	2714412	2714417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13554	NC_021040	T	6	6	2714464	2714469	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13555	NC_021040	TTC	2	6	2714476	2714481	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13556	NC_021040	ATTTT	2	10	2714504	2714513	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
13557	NC_021040	A	6	6	2714655	2714660	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13558	NC_021040	TCG	2	6	2714686	2714691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13559	NC_021040	CAA	2	6	2714700	2714705	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13560	NC_021040	A	6	6	2715544	2715549	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13561	NC_021040	ATT	2	6	2715573	2715578	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13562	NC_021040	T	6	6	2717080	2717085	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13563	NC_021040	TTC	2	6	2717104	2717109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13564	NC_021040	TCT	2	6	2717145	2717150	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13565	NC_021040	CTG	2	6	2717157	2717162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13566	NC_021040	TAT	2	6	2717251	2717256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13567	NC_021040	T	6	6	2717298	2717303	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13568	NC_021040	AATAC	2	10	2717325	2717334	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
13569	NC_021040	GAA	2	6	2717366	2717371	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13570	NC_021040	ACGGGA	2	12	2717388	2717399	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
13571	NC_021040	CTGCT	2	10	2717407	2717416	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
13572	NC_021040	G	6	6	2717421	2717426	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
13573	NC_021040	CAA	2	6	2717446	2717451	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13574	NC_021040	A	6	6	2717450	2717455	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13575	NC_021040	T	6	6	2718118	2718123	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13576	NC_021040	ATTT	2	8	2718152	2718159	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13577	NC_021040	TTC	2	6	2718250	2718255	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13578	NC_021040	GC	3	6	2718346	2718351	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13579	NC_021040	A	6	6	2718357	2718362	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13580	NC_021040	CAA	2	6	2718371	2718376	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13581	NC_021040	A	7	7	2719017	2719023	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13582	NC_021040	TCC	2	6	2721033	2721038	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13583	NC_021040	TCC	2	6	2721085	2721090	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13584	NC_021040	T	6	6	2721095	2721100	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13585	NC_021040	GGT	2	6	2721128	2721133	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13586	NC_021040	AT	3	6	2721154	2721159	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13587	NC_021040	CAAAAA	2	12	2721196	2721207	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13588	NC_021040	CCAA	2	8	2721218	2721225	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13589	NC_021040	T	6	6	2721341	2721346	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13590	NC_021040	TGA	2	6	2721366	2721371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13591	NC_021040	T	8	8	2721376	2721383	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13592	NC_021040	TAT	2	6	2721394	2721399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13593	NC_021040	T	6	6	2721424	2721429	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13594	NC_021040	AAATA	2	10	2721573	2721582	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
13595	NC_021040	ATAA	2	8	2721623	2721630	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13596	NC_021040	ATT	2	6	2721634	2721639	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13597	NC_021040	AAT	2	6	2721647	2721652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13598	NC_021040	TAA	2	6	2721714	2721719	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13599	NC_021040	AAT	2	6	2723546	2723551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13600	NC_021040	ATTC	2	8	2723558	2723565	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13601	NC_021040	CTT	2	6	2723571	2723576	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13602	NC_021040	ACA	2	6	2723589	2723594	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13603	NC_021040	AATA	2	8	2723625	2723632	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13604	NC_021040	CAA	2	6	2723633	2723638	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13605	NC_021040	A	7	7	2723667	2723673	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13606	NC_021040	AGC	2	6	2723738	2723743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13607	NC_021040	GT	3	6	2723780	2723785	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13608	NC_021040	A	8	8	2723797	2723804	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13609	NC_021040	A	8	8	2723817	2723824	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13610	NC_021040	TAC	2	6	2723831	2723836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13611	NC_021040	GGAT	2	8	2723839	2723846	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
13612	NC_021040	GGAAA	2	10	2723894	2723903	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
13613	NC_021040	AT	3	6	2723905	2723910	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13614	NC_021040	A	6	6	2723922	2723927	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13615	NC_021040	CGG	2	6	2723963	2723968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13616	NC_021040	GTT	2	6	2724004	2724009	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13617	NC_021040	TCA	2	6	2724013	2724018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13618	NC_021040	TAC	2	6	2724034	2724039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13619	NC_021040	T	6	6	2724049	2724054	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13620	NC_021040	A	6	6	2724145	2724150	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13621	NC_021040	CAT	2	6	2724192	2724197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13622	NC_021040	CTT	2	6	2724217	2724222	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13623	NC_021040	TCT	2	6	2724263	2724268	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13624	NC_021040	AT	3	6	2724273	2724278	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13625	NC_021040	T	6	6	2724356	2724361	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13626	NC_021040	ATT	2	6	2724459	2724464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13627	NC_021040	TAA	2	6	2724465	2724470	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13628	NC_021040	CTTT	2	8	2724477	2724484	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
13629	NC_021040	CAG	2	6	2724501	2724506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13631	NC_021040	TG	3	6	2724555	2724560	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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