MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Roseburia intestinalis M50/1 draft genome

Total Repeats: 20945

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_021040	TTCC	2	8	2618090	2618097	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13002	NC_021040	CAAAA	2	10	2618102	2618111	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
13003	NC_021040	A	7	7	2618108	2618114	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13004	NC_021040	A	6	6	2618149	2618154	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13005	NC_021040	GCC	2	6	2618228	2618233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13006	NC_021040	TCC	2	6	2618243	2618248	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13007	NC_021040	CAG	2	6	2618253	2618258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13008	NC_021040	TTA	2	6	2618380	2618385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13009	NC_021040	ACTTT	2	10	2618398	2618407	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
13010	NC_021040	ATC	2	6	2618438	2618443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13011	NC_021040	GTT	2	6	2618461	2618466	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13012	NC_021040	TA	4	8	2618473	2618480	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13013	NC_021040	CAG	2	6	2618544	2618549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13014	NC_021040	TGT	2	6	2618573	2618578	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13015	NC_021040	ATT	2	6	2618606	2618611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13016	NC_021040	ATG	2	6	2618699	2618704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13017	NC_021040	GCC	2	6	2618755	2618760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13018	NC_021040	TGT	2	6	2618802	2618807	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13019	NC_021040	TGC	2	6	2618847	2618852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13020	NC_021040	TCA	2	6	2618908	2618913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13021	NC_021040	AAT	2	6	2618928	2618933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13022	NC_021040	TGC	2	6	2618970	2618975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13023	NC_021040	CATC	2	8	2618984	2618991	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
13024	NC_021040	ATA	2	6	2619016	2619021	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13025	NC_021040	TACCGA	2	12	2619113	2619124	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
13026	NC_021040	CTG	2	6	2619225	2619230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13027	NC_021040	CTT	2	6	2619246	2619251	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13028	NC_021040	CT	3	6	2619331	2619336	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13029	NC_021040	CAA	2	6	2619449	2619454	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13030	NC_021040	TGC	2	6	2619459	2619464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13031	NC_021040	GTTCCG	2	12	2619469	2619480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13032	NC_021040	CTG	2	6	2619524	2619529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13033	NC_021040	TTC	2	6	2619537	2619542	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13034	NC_021040	TGCTCC	2	12	2619582	2619593	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
13035	NC_021040	TCA	2	6	2619703	2619708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13036	NC_021040	ATT	2	6	2619726	2619731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13037	NC_021040	CTC	2	6	2619737	2619742	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13038	NC_021040	GAT	2	6	2619756	2619761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13039	NC_021040	TGT	2	6	2619783	2619788	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13040	NC_021040	TCC	2	6	2619810	2619815	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13041	NC_021040	A	6	6	2619828	2619833	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13042	NC_021040	A	6	6	2619842	2619847	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13043	NC_021040	TATAA	2	10	2619859	2619868	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
13044	NC_021040	A	6	6	2619899	2619904	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13045	NC_021040	T	8	8	2619913	2619920	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13046	NC_021040	TCT	2	6	2620049	2620054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13047	NC_021040	TTC	2	6	2620120	2620125	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13048	NC_021040	T	6	6	2620141	2620146	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13049	NC_021040	AGT	2	6	2620148	2620153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13050	NC_021040	CAG	2	6	2620177	2620182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13051	NC_021040	CGA	2	6	2620270	2620275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13052	NC_021040	CAA	2	6	2620284	2620289	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13053	NC_021040	ATC	2	6	2620387	2620392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13054	NC_021040	TACA	2	8	2620459	2620466	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13055	NC_021040	AAT	2	6	2620479	2620484	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13056	NC_021040	TTCC	2	8	2620533	2620540	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13057	NC_021040	ACA	2	6	2620596	2620601	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13058	NC_021040	TTC	3	9	2620632	2620640	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13059	NC_021040	T	7	7	2620641	2620647	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13060	NC_021040	TCCAT	2	10	2623217	2623226	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
13061	NC_021040	AT	3	6	2623225	2623230	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13062	NC_021040	ATT	2	6	2624289	2624294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13063	NC_021040	T	6	6	2624309	2624314	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13064	NC_021040	AAC	2	6	2624315	2624320	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13065	NC_021040	TGTTT	2	10	2626130	2626139	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
13066	NC_021040	TC	3	6	2628231	2628236	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13067	NC_021040	TCC	2	6	2628749	2628754	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13068	NC_021040	TCT	2	6	2628763	2628768	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13069	NC_021040	TTC	2	6	2628808	2628813	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13070	NC_021040	AC	4	8	2628881	2628888	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13071	NC_021040	TCT	2	6	2628953	2628958	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13072	NC_021040	AATG	2	8	2628959	2628966	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13073	NC_021040	ATA	2	6	2628974	2628979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13074	NC_021040	TTC	2	6	2628984	2628989	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13075	NC_021040	GATC	2	8	2629005	2629012	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13076	NC_021040	TCT	2	6	2629173	2629178	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13077	NC_021040	T	6	6	2629208	2629213	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13078	NC_021040	ATA	2	6	2629241	2629246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13079	NC_021040	CTGT	2	8	2629300	2629307	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
13080	NC_021040	GGTA	2	8	2629344	2629351	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
13081	NC_021040	AGA	2	6	2629381	2629386	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13082	NC_021040	TTC	2	6	2629441	2629446	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13083	NC_021040	TGC	2	6	2629464	2629469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13084	NC_021040	GCC	2	6	2629514	2629519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13085	NC_021040	TC	3	6	2629563	2629568	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13086	NC_021040	AAT	2	6	2629670	2629675	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13087	NC_021040	AAT	2	6	2629680	2629685	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13088	NC_021040	CCAT	2	8	2629750	2629757	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
13089	NC_021040	GAC	2	6	2629833	2629838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13090	NC_021040	CT	3	6	2629860	2629865	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13091	NC_021040	GGA	2	6	2629873	2629878	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13092	NC_021040	TTC	2	6	2629886	2629891	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13093	NC_021040	GCT	2	6	2629915	2629920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13094	NC_021040	GAA	2	6	2629926	2629931	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13095	NC_021040	A	6	6	2629930	2629935	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13096	NC_021040	TGT	2	6	2629994	2629999	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13097	NC_021040	TTC	2	6	2630004	2630009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13098	NC_021040	CATC	2	8	2630029	2630036	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
13099	NC_021040	A	6	6	2630281	2630286	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13100	NC_021040	TTG	2	6	2630337	2630342	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13101	NC_021040	A	7	7	2630346	2630352	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13102	NC_021040	GTA	2	6	2630358	2630363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13103	NC_021040	ATA	2	6	2630386	2630391	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13104	NC_021040	TCC	2	6	2630586	2630591	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13105	NC_021040	ATCA	2	8	2630699	2630706	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13106	NC_021040	T	6	6	2631465	2631470	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13107	NC_021040	TTC	2	6	2631950	2631955	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13108	NC_021040	TAT	2	6	2631977	2631982	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13109	NC_021040	TC	4	8	2631983	2631990	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13110	NC_021040	ATT	2	6	2632923	2632928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13111	NC_021040	CTG	2	6	2632940	2632945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13112	NC_021040	T	6	6	2632991	2632996	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13113	NC_021040	AAT	2	6	2633014	2633019	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13114	NC_021040	TA	3	6	2633095	2633100	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13115	NC_021040	T	6	6	2633101	2633106	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13116	NC_021040	CTG	2	6	2633107	2633112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13117	NC_021040	N	342	342	2633150	2633491	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13118	NC_021040	T	6	6	2633545	2633550	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13119	NC_021040	AT	3	6	2633619	2633624	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13120	NC_021040	A	6	6	2633685	2633690	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13121	NC_021040	CCA	2	6	2633745	2633750	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13122	NC_021040	CT	3	6	2633762	2633767	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13123	NC_021040	T	6	6	2635817	2635822	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13124	NC_021040	TCC	2	6	2638704	2638709	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13125	NC_021040	TGTGA	2	10	2638714	2638723	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
13126	NC_021040	TGC	2	6	2638755	2638760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13127	NC_021040	T	7	7	2638830	2638836	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13128	NC_021040	AAG	2	6	2638845	2638850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13129	NC_021040	T	6	6	2638880	2638885	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13130	NC_021040	AGC	2	6	2638951	2638956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13131	NC_021040	ATA	2	6	2639032	2639037	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13132	NC_021040	CAG	2	6	2639054	2639059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13133	NC_021040	TTTC	2	8	2639100	2639107	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
13134	NC_021040	TGA	2	6	2639117	2639122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13135	NC_021040	CTGC	2	8	2639204	2639211	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13136	NC_021040	CT	3	6	2639222	2639227	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13137	NC_021040	CTTC	2	8	2639297	2639304	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13138	NC_021040	TCT	2	6	2639333	2639338	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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13141	NC_021040	T	6	6	2639422	2639427	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13142	NC_021040	TCC	2	6	2639431	2639436	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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13144	NC_021040	GTT	2	6	2639515	2639520	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13149	NC_021040	AT	3	6	2639670	2639675	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13162	NC_021040	A	7	7	2642877	2642883	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13163	NC_021040	TTA	2	6	2642940	2642945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13165	NC_021040	AAT	2	6	2642971	2642976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13169	NC_021040	TCC	2	6	2645875	2645880	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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13190	NC_021040	TTG	2	6	2649014	2649019	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13205	NC_021040	AT	3	6	2652067	2652072	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13241	NC_021040	ATT	2	6	2662664	2662669	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13245	NC_021040	TCA	2	6	2665725	2665730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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13247	NC_021040	TAT	2	6	2665811	2665816	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13248	NC_021040	CACT	2	8	2665847	2665854	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
13249	NC_021040	CGG	2	6	2665899	2665904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13250	NC_021040	CTA	2	6	2665908	2665913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13251	NC_021040	GCC	2	6	2665926	2665931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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13253	NC_021040	CAC	2	6	2665972	2665977	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13254	NC_021040	CT	3	6	2665984	2665989	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13255	NC_021040	A	6	6	2665998	2666003	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13256	NC_021040	TAC	2	6	2666008	2666013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13257	NC_021040	AT	3	6	2666050	2666055	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13258	NC_021040	T	6	6	2666077	2666082	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13259	NC_021040	T	6	6	2666100	2666105	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13261	NC_021040	AAAAG	2	10	2666195	2666204	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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13391	NC_021040	TCC	2	6	2688029	2688034	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13392	NC_021040	CTA	2	6	2689076	2689081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13393	NC_021040	T	6	6	2689082	2689087	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13394	NC_021040	T	6	6	2689092	2689097	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13395	NC_021040	CAA	2	6	2689125	2689130	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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13397	NC_021040	TAA	2	6	2689146	2689151	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13407	NC_021040	CCAT	2	8	2690323	2690330	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
13408	NC_021040	GCC	2	6	2690335	2690340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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13451	NC_021040	T	7	7	2695612	2695618	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13452	NC_021040	TCC	2	6	2698805	2698810	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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13499	NC_021040	TCTT	2	8	2704811	2704818	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
13500	NC_021040	ACCAT	2	10	2704870	2704879	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding

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