MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Roseburia intestinalis M50/1 draft genome

Total Repeats: 20945

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_021040	GTC	2	6	2473920	2473925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12502	NC_021040	T	6	6	2473928	2473933	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12503	NC_021040	ATA	2	6	2474023	2474028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12504	NC_021040	CTTT	2	8	2474035	2474042	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
12505	NC_021040	TCC	2	6	2474208	2474213	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12506	NC_021040	TCC	2	6	2474237	2474242	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12507	NC_021040	CAC	2	6	2474243	2474248	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12508	NC_021040	CGC	2	6	2474360	2474365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12509	NC_021040	CAT	2	6	2474368	2474373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12510	NC_021040	ATA	2	6	2474448	2474453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12511	NC_021040	CTT	2	6	2474611	2474616	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12512	NC_021040	CT	3	6	2474654	2474659	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12513	NC_021040	TTC	2	6	2474723	2474728	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12514	NC_021040	TTC	2	6	2474780	2474785	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12515	NC_021040	CCA	2	6	2474800	2474805	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12516	NC_021040	AC	3	6	2474814	2474819	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12517	NC_021040	AT	3	6	2474847	2474852	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12518	NC_021040	TTA	2	6	2474917	2474922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12519	NC_021040	T	6	6	2476372	2476377	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12520	NC_021040	AT	3	6	2477612	2477617	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12521	NC_021040	A	6	6	2477633	2477638	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12522	NC_021040	GT	3	6	2477710	2477715	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12523	NC_021040	CGC	2	6	2479167	2479172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12524	NC_021040	TGT	2	6	2479180	2479185	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12525	NC_021040	TCCCGC	2	12	2479242	2479253	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
12526	NC_021040	CTC	2	6	2479298	2479303	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12527	NC_021040	TTC	2	6	2479332	2479337	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12528	NC_021040	TTC	2	6	2479373	2479378	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12529	NC_021040	GATA	2	8	2479430	2479437	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
12530	NC_021040	GTC	2	6	2479440	2479445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12531	NC_021040	AAT	2	6	2479450	2479455	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12532	NC_021040	AGC	2	6	2479516	2479521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12533	NC_021040	CG	3	6	2479552	2479557	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12534	NC_021040	TGC	2	6	2479638	2479643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12535	NC_021040	TTC	2	6	2479667	2479672	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12536	NC_021040	TAA	2	6	2479695	2479700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12537	NC_021040	A	6	6	2479699	2479704	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12538	NC_021040	CAG	2	6	2479761	2479766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12539	NC_021040	GCA	3	9	2479771	2479779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12540	NC_021040	T	6	6	2479806	2479811	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12541	NC_021040	TCC	2	6	2481525	2481530	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12542	NC_021040	CTC	2	6	2481996	2482001	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12543	NC_021040	ATAA	2	8	2482024	2482031	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12544	NC_021040	AGT	2	6	2482092	2482097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12545	NC_021040	CT	3	6	2482601	2482606	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12546	NC_021040	T	6	6	2482632	2482637	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12547	NC_021040	T	6	6	2484646	2484651	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12548	NC_021040	TAT	2	6	2487276	2487281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12549	NC_021040	ATT	2	6	2490724	2490729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12550	NC_021040	ATT	2	6	2490735	2490740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12551	NC_021040	TCT	2	6	2490752	2490757	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12552	NC_021040	T	6	6	2490780	2490785	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12553	NC_021040	T	6	6	2492579	2492584	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12554	NC_021040	ACT	2	6	2494164	2494169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12555	NC_021040	T	6	6	2494174	2494179	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12556	NC_021040	TCC	2	6	2496976	2496981	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12557	NC_021040	TCC	2	6	2498968	2498973	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12558	NC_021040	TCCCTT	2	12	2501472	2501483	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12559	NC_021040	T	6	6	2501485	2501490	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12560	NC_021040	A	9	9	2501540	2501548	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12561	NC_021040	TGT	2	6	2501566	2501571	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12562	NC_021040	TAT	2	6	2501575	2501580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12563	NC_021040	GAA	2	6	2501589	2501594	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12564	NC_021040	AAT	2	6	2501610	2501615	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12565	NC_021040	A	6	6	2501660	2501665	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12566	NC_021040	AATA	2	8	2501683	2501690	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12567	NC_021040	ACTT	2	8	2503524	2503531	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12568	NC_021040	ATT	2	6	2503552	2503557	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12569	NC_021040	TAT	2	6	2503587	2503592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12570	NC_021040	AATGA	2	10	2503630	2503639	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
12571	NC_021040	A	6	6	2503689	2503694	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12572	NC_021040	TC	3	6	2505969	2505974	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12573	NC_021040	ATC	2	6	2505979	2505984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12574	NC_021040	TAT	2	6	2506023	2506028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12575	NC_021040	A	6	6	2506045	2506050	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12576	NC_021040	TCT	2	6	2506074	2506079	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12577	NC_021040	TCC	2	6	2507199	2507204	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12578	NC_021040	TTGA	2	8	2507981	2507988	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
12579	NC_021040	T	7	7	2507999	2508005	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12580	NC_021040	TGTC	2	8	2508033	2508040	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
12581	NC_021040	T	6	6	2508042	2508047	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12582	NC_021040	T	6	6	2508062	2508067	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12583	NC_021040	T	6	6	2509923	2509928	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12584	NC_021040	T	6	6	2509955	2509960	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12585	NC_021040	TAT	2	6	2509997	2510002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12586	NC_021040	TCT	2	6	2510066	2510071	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12587	NC_021040	T	7	7	2510856	2510862	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12588	NC_021040	T	7	7	2510882	2510888	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12589	NC_021040	T	7	7	2510919	2510925	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12590	NC_021040	TCC	2	6	2511146	2511151	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12591	NC_021040	GGA	2	6	2511193	2511198	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12592	NC_021040	TAA	2	6	2511224	2511229	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12593	NC_021040	A	6	6	2511228	2511233	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12594	NC_021040	GGT	2	6	2511258	2511263	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12595	NC_021040	ATA	2	6	2511301	2511306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12596	NC_021040	GTG	2	6	2511317	2511322	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12597	NC_021040	CCCT	2	8	2511352	2511359	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
12598	NC_021040	A	8	8	2512711	2512718	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12599	NC_021040	TA	3	6	2512768	2512773	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12600	NC_021040	TC	3	6	2512784	2512789	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12601	NC_021040	CGAA	2	8	2513500	2513507	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
12602	NC_021040	A	6	6	2513506	2513511	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12603	NC_021040	CT	3	6	2513540	2513545	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12604	NC_021040	CATC	2	8	2513546	2513553	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
12605	NC_021040	CGA	2	6	2513594	2513599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12606	NC_021040	GT	3	6	2513654	2513659	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12607	NC_021040	TA	4	8	2513690	2513697	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12608	NC_021040	TA	3	6	2513701	2513706	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12609	NC_021040	A	7	7	2513706	2513712	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12610	NC_021040	T	6	6	2513721	2513726	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12611	NC_021040	T	7	7	2513730	2513736	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12612	NC_021040	AAACA	2	10	2513799	2513808	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
12613	NC_021040	A	6	6	2513827	2513832	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12614	NC_021040	T	6	6	2514468	2514473	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12615	NC_021040	AAG	2	6	2514482	2514487	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12616	NC_021040	TAT	2	6	2517171	2517176	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12617	NC_021040	GTA	2	6	2518268	2518273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12618	NC_021040	TCT	2	6	2518340	2518345	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12619	NC_021040	AGG	2	6	2518385	2518390	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12620	NC_021040	ATT	2	6	2519404	2519409	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12621	NC_021040	A	6	6	2519414	2519419	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12622	NC_021040	TTC	2	6	2520916	2520921	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12623	NC_021040	T	6	6	2520958	2520963	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12624	NC_021040	CCT	2	6	2521782	2521787	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12625	NC_021040	TAT	2	6	2521825	2521830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12626	NC_021040	ATT	2	6	2521836	2521841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12627	NC_021040	TGA	2	6	2521849	2521854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12628	NC_021040	ATT	2	6	2521872	2521877	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12629	NC_021040	GTC	2	6	2521890	2521895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12630	NC_021040	TC	5	10	2524667	2524676	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12631	NC_021040	A	7	7	2524697	2524703	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12632	NC_021040	TAT	2	6	2524733	2524738	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12764	NC_021040	T	6	6	2553274	2553279	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12765	NC_021040	TCC	2	6	2553371	2553376	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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