MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Roseburia intestinalis M50/1 draft genome

Total Repeats: 20945

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12001	NC_021040	AGC	2	6	2382775	2382780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12002	NC_021040	GCTT	2	8	2382787	2382794	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
12003	NC_021040	TA	4	8	2382796	2382803	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12004	NC_021040	TTTG	2	8	2382817	2382824	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
12005	NC_021040	ATA	2	6	2382885	2382890	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12006	NC_021040	TAT	2	6	2382891	2382896	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12007	NC_021040	GTA	2	6	2382902	2382907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12008	NC_021040	T	7	7	2382980	2382986	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12009	NC_021040	CTTT	2	8	2383046	2383053	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
12010	NC_021040	GTT	2	6	2383136	2383141	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12011	NC_021040	CCT	2	6	2383149	2383154	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12012	NC_021040	TAT	2	6	2383155	2383160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12013	NC_021040	TCG	2	6	2383185	2383190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12014	NC_021040	AAC	2	6	2383213	2383218	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12015	NC_021040	TTA	2	6	2383259	2383264	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12016	NC_021040	TCT	2	6	2383269	2383274	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12017	NC_021040	TGT	2	6	2383288	2383293	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12018	NC_021040	GT	4	8	2383381	2383388	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12019	NC_021040	TATT	2	8	2383415	2383422	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12020	NC_021040	AGGC	2	8	2383431	2383438	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
12021	NC_021040	CT	3	6	2383445	2383450	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12022	NC_021040	TGT	2	6	2383483	2383488	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12023	NC_021040	CCAT	2	8	2383510	2383517	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
12024	NC_021040	ATT	2	6	2383606	2383611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12025	NC_021040	T	8	8	2383610	2383617	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12026	NC_021040	CT	3	6	2383640	2383645	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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12032	NC_021040	TTTA	2	8	2383996	2384003	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12033	NC_021040	T	7	7	2384015	2384021	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12034	NC_021040	TA	3	6	2384026	2384031	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12035	NC_021040	ATCG	2	8	2384032	2384039	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12036	NC_021040	ATCC	2	8	2384085	2384092	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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12042	NC_021040	CTT	2	6	2384457	2384462	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12043	NC_021040	T	6	6	2384578	2384583	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12047	NC_021040	TAA	2	6	2384878	2384883	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12053	NC_021040	T	6	6	2385014	2385019	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12054	NC_021040	CTG	2	6	2385022	2385027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12057	NC_021040	ATT	2	6	2385104	2385109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12058	NC_021040	T	6	6	2385224	2385229	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12059	NC_021040	GAA	2	6	2385249	2385254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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12061	NC_021040	ATA	2	6	2385410	2385415	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12062	NC_021040	TCT	2	6	2385489	2385494	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12063	NC_021040	CCTTTT	2	12	2385510	2385521	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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12065	NC_021040	CCG	2	6	2385547	2385552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12066	NC_021040	TTG	2	6	2385588	2385593	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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12069	NC_021040	CAG	2	6	2386259	2386264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12073	NC_021040	TAC	2	6	2386390	2386395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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12077	NC_021040	GTTCT	2	10	2386472	2386481	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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12083	NC_021040	ACC	2	6	2386794	2386799	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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12088	NC_021040	A	7	7	2387157	2387163	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12089	NC_021040	ATTT	2	8	2387173	2387180	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12090	NC_021040	ATTTT	2	10	2387182	2387191	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
12091	NC_021040	ATTT	2	8	2387202	2387209	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12092	NC_021040	ACAG	2	8	2387269	2387276	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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12101	NC_021040	TGCA	2	8	2390170	2390177	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12102	NC_021040	ATC	2	6	2390185	2390190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12103	NC_021040	AACCA	2	10	2390217	2390226	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
12104	NC_021040	A	7	7	2390235	2390241	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12105	NC_021040	T	7	7	2390277	2390283	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12107	NC_021040	GCT	2	6	2390363	2390368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12110	NC_021040	ATC	2	6	2390492	2390497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12111	NC_021040	CATG	2	8	2390514	2390521	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12112	NC_021040	CTT	2	6	2390628	2390633	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12113	NC_021040	ATA	2	6	2390711	2390716	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12114	NC_021040	TTC	2	6	2390734	2390739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12115	NC_021040	CAA	2	6	2390781	2390786	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12116	NC_021040	TGC	2	6	2390819	2390824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12117	NC_021040	GCG	2	6	2390879	2390884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12118	NC_021040	T	7	7	2390949	2390955	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12119	NC_021040	CTC	2	6	2390970	2390975	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12120	NC_021040	CCA	2	6	2391042	2391047	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12121	NC_021040	AGA	2	6	2391089	2391094	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12122	NC_021040	CTG	2	6	2391117	2391122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12123	NC_021040	TGTT	2	8	2391142	2391149	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
12124	NC_021040	TAC	2	6	2391150	2391155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12125	NC_021040	GT	3	6	2392352	2392357	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12126	NC_021040	TAT	2	6	2392370	2392375	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12127	NC_021040	CA	3	6	2392385	2392390	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12128	NC_021040	TA	3	6	2392415	2392420	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12129	NC_021040	T	6	6	2392437	2392442	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12130	NC_021040	TAT	2	6	2392461	2392466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12131	NC_021040	TTG	2	6	2392537	2392542	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12132	NC_021040	T	6	6	2392557	2392562	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12133	NC_021040	A	6	6	2392566	2392571	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12143	NC_021040	GTT	2	6	2393094	2393099	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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12240	NC_021040	T	7	7	2412255	2412261	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12241	NC_021040	AAT	2	6	2412280	2412285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12242	NC_021040	TA	3	6	2412307	2412312	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12243	NC_021040	CT	3	6	2412335	2412340	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12244	NC_021040	CGA	2	6	2412357	2412362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12247	NC_021040	CTT	2	6	2412530	2412535	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12248	NC_021040	A	6	6	2412553	2412558	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12249	NC_021040	TTAAA	2	10	2412594	2412603	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
12250	NC_021040	GGC	2	6	2414090	2414095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12251	NC_021040	A	6	6	2414275	2414280	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12252	NC_021040	CAAT	2	8	2414308	2414315	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
12253	NC_021040	ATC	2	6	2414316	2414321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12254	NC_021040	TGA	2	6	2414395	2414400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12255	NC_021040	GGA	2	6	2414406	2414411	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12256	NC_021040	TGC	2	6	2414452	2414457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12257	NC_021040	GCA	2	6	2414466	2414471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12258	NC_021040	CAA	2	6	2414578	2414583	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12259	NC_021040	CCT	2	6	2414622	2414627	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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12261	NC_021040	CAA	2	6	2414650	2414655	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12262	NC_021040	T	6	6	2415485	2415490	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12263	NC_021040	TGT	2	6	2415585	2415590	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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12272	NC_021040	T	6	6	2419974	2419979	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12291	NC_021040	TAT	2	6	2431379	2431384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12335	NC_021040	ATCC	2	8	2438582	2438589	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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12374	NC_021040	CAC	2	6	2442486	2442491	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12375	NC_021040	A	6	6	2442521	2442526	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12380	NC_021040	TA	3	6	2447213	2447218	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12384	NC_021040	ATA	2	6	2447382	2447387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12385	NC_021040	ACAAA	2	10	2448338	2448347	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
12386	NC_021040	A	7	7	2448345	2448351	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12388	NC_021040	A	6	6	2450213	2450218	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12389	NC_021040	GT	3	6	2450240	2450245	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12390	NC_021040	CCCGTT	2	12	2450247	2450258	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
12391	NC_021040	T	6	6	2450257	2450262	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12392	NC_021040	TG	4	8	2450269	2450276	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12393	NC_021040	AAC	2	6	2450280	2450285	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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