MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Roseburia intestinalis M50/1 draft genome

Total Repeats: 20945

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_021040	AG	3	6	1983416	1983421	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10002	NC_021040	CT	3	6	1983430	1983435	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10003	NC_021040	AGG	2	6	1983467	1983472	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10004	NC_021040	GGA	2	6	1985323	1985328	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10005	NC_021040	AG	4	8	1990820	1990827	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10006	NC_021040	ATG	2	6	1990856	1990861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10007	NC_021040	GGT	2	6	1990978	1990983	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10008	NC_021040	T	6	6	1991036	1991041	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10009	NC_021040	ATC	3	9	1991089	1991097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10010	NC_021040	CAAA	2	8	1991109	1991116	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
10011	NC_021040	AGG	2	6	1991118	1991123	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10012	NC_021040	ATT	2	6	1992843	1992848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10013	NC_021040	GAGAAA	2	12	1992871	1992882	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10014	NC_021040	TTA	2	6	1993566	1993571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10015	NC_021040	ATT	2	6	1993603	1993608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10016	NC_021040	CAG	2	6	1993692	1993697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10017	NC_021040	TA	4	8	1993729	1993736	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10018	NC_021040	GAAAA	2	10	1993809	1993818	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
10019	NC_021040	CCA	2	6	1993829	1993834	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10020	NC_021040	ATT	2	6	1993853	1993858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10021	NC_021040	ATG	2	6	1993914	1993919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10022	NC_021040	TA	3	6	1993950	1993955	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10023	NC_021040	GACT	2	8	1993959	1993966	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10024	NC_021040	GAA	2	6	1993970	1993975	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10025	NC_021040	GCA	2	6	1994081	1994086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10026	NC_021040	ATA	2	6	1994127	1994132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10027	NC_021040	AGAA	2	8	1994153	1994160	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
10028	NC_021040	GAA	2	6	1994250	1994255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10029	NC_021040	TGAAC	2	10	1994265	1994274	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
10030	NC_021040	AGA	2	6	1994282	1994287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10031	NC_021040	CTTT	2	8	1994298	1994305	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
10032	NC_021040	TGA	2	6	1994307	1994312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10033	NC_021040	AGT	2	6	1994356	1994361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10034	NC_021040	A	6	6	1994382	1994387	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10035	NC_021040	TTG	3	9	1994446	1994454	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10036	NC_021040	A	6	6	1994461	1994466	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10037	NC_021040	GCT	2	6	1994916	1994921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10038	NC_021040	T	6	6	1994956	1994961	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10039	NC_021040	ATG	2	6	1995006	1995011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10040	NC_021040	ATTT	2	8	1995017	1995024	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10041	NC_021040	AGC	2	6	1995704	1995709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10042	NC_021040	ATAA	2	8	1995712	1995719	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10043	NC_021040	A	6	6	1996846	1996851	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10044	NC_021040	ACC	2	6	1996858	1996863	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10045	NC_021040	ATT	2	6	1996886	1996891	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10046	NC_021040	A	6	6	1996913	1996918	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10047	NC_021040	GGC	2	6	1996928	1996933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10048	NC_021040	CA	3	6	1996990	1996995	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10049	NC_021040	TTTGT	2	10	1997005	1997014	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
10050	NC_021040	GAA	2	6	1997060	1997065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10051	NC_021040	N	354	354	1997074	1997427	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10052	NC_021040	GAA	2	6	1997428	1997433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10053	NC_021040	GGA	2	6	1997446	1997451	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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10055	NC_021040	CAAT	2	8	1997480	1997487	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10056	NC_021040	AGA	2	6	1998122	1998127	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10057	NC_021040	A	6	6	1998134	1998139	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10058	NC_021040	GTAT	2	8	1998183	1998190	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10059	NC_021040	A	6	6	1998194	1998199	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10060	NC_021040	AAGA	2	8	1998205	1998212	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
10061	NC_021040	GCTG	2	8	1998253	1998260	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10062	NC_021040	GAG	2	6	1998385	1998390	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10063	NC_021040	GAG	2	6	1998408	1998413	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10064	NC_021040	AT	3	6	2000200	2000205	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10065	NC_021040	T	6	6	2000248	2000253	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10066	NC_021040	ACCTT	2	10	2000311	2000320	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
10067	NC_021040	TTAT	2	8	2000355	2000362	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10068	NC_021040	TGTT	2	8	2000370	2000377	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
10069	NC_021040	A	6	6	2000451	2000456	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10070	NC_021040	AT	3	6	2000500	2000505	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10071	NC_021040	CA	3	6	2000528	2000533	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10072	NC_021040	AG	3	6	2000588	2000593	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10073	NC_021040	GGA	2	6	2000616	2000621	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10074	NC_021040	AT	3	6	2000623	2000628	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10075	NC_021040	TCA	2	6	2000705	2000710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10080	NC_021040	A	6	6	2001323	2001328	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10081	NC_021040	AAT	2	6	2001407	2001412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10083	NC_021040	GTG	2	6	2001575	2001580	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10084	NC_021040	GCAC	2	8	2001743	2001750	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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10089	NC_021040	T	7	7	2001873	2001879	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10090	NC_021040	GTA	2	6	2001906	2001911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10092	NC_021040	TTA	2	6	2001934	2001939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10094	NC_021040	GCAG	2	8	2002012	2002019	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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10096	NC_021040	AAC	2	6	2002135	2002140	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10097	NC_021040	GA	3	6	2002188	2002193	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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10099	NC_021040	ACTT	2	8	2002321	2002328	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10100	NC_021040	GACA	2	8	2002387	2002394	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10101	NC_021040	CAA	2	6	2002417	2002422	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10102	NC_021040	A	6	6	2002421	2002426	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10103	NC_021040	TGG	2	6	2002441	2002446	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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10108	NC_021040	CA	3	6	2002697	2002702	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10109	NC_021040	GAA	2	6	2002728	2002733	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10110	NC_021040	AGG	2	6	2002735	2002740	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10111	NC_021040	GCT	2	6	2002751	2002756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10112	NC_021040	GCG	2	6	2002786	2002791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10113	NC_021040	GGA	2	6	2002792	2002797	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10114	NC_021040	AAATGG	2	12	2002827	2002838	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10115	NC_021040	GCA	2	6	2010380	2010385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10116	NC_021040	ATAA	2	8	2010388	2010395	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10117	NC_021040	A	6	6	2010411	2010416	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10118	NC_021040	A	7	7	2010450	2010456	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10119	NC_021040	A	6	6	2010483	2010488	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10120	NC_021040	A	7	7	2010739	2010745	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10121	NC_021040	T	6	6	2010772	2010777	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10122	NC_021040	GGC	2	6	2010839	2010844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10123	NC_021040	GCG	3	9	2010884	2010892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10124	NC_021040	AGA	2	6	2010925	2010930	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10125	NC_021040	CAG	2	6	2010969	2010974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10126	NC_021040	GAA	2	6	2011009	2011014	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10127	NC_021040	TGC	2	6	2011035	2011040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10129	NC_021040	A	6	6	2011104	2011109	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10130	NC_021040	GAT	2	6	2011133	2011138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10131	NC_021040	ATG	2	6	2011250	2011255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10132	NC_021040	CTGTT	2	10	2011267	2011276	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
10133	NC_021040	GA	4	8	2011291	2011298	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10134	NC_021040	AT	3	6	2011320	2011325	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10135	NC_021040	TCA	2	6	2011343	2011348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10136	NC_021040	TGCA	2	8	2011354	2011361	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10137	NC_021040	A	6	6	2011413	2011418	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10138	NC_021040	AGA	2	6	2011446	2011451	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10139	NC_021040	A	6	6	2011473	2011478	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10140	NC_021040	AC	3	6	2011486	2011491	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10141	NC_021040	AGGA	2	8	2011592	2011599	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10142	NC_021040	AGA	2	6	2011650	2011655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10143	NC_021040	AGC	2	6	2011717	2011722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10144	NC_021040	CTG	2	6	2011761	2011766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10145	NC_021040	T	8	8	2011845	2011852	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10146	NC_021040	GGA	2	6	2011858	2011863	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10147	NC_021040	T	6	6	2012158	2012163	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10148	NC_021040	A	6	6	2012166	2012171	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10149	NC_021040	GTA	2	6	2012184	2012189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10150	NC_021040	ATT	2	6	2012202	2012207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10151	NC_021040	A	6	6	2012210	2012215	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10152	NC_021040	A	6	6	2012222	2012227	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10153	NC_021040	T	7	7	2012234	2012240	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10154	NC_021040	GGAT	2	8	2012280	2012287	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
10155	NC_021040	A	6	6	2012299	2012304	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10156	NC_021040	A	6	6	2012318	2012323	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10157	NC_021040	T	8	8	2012343	2012350	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10158	NC_021040	A	6	6	2012366	2012371	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10159	NC_021040	AT	3	6	2012440	2012445	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10161	NC_021040	T	7	7	2013245	2013251	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10162	NC_021040	TGA	2	6	2013345	2013350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10163	NC_021040	GT	3	6	2013353	2013358	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10164	NC_021040	TAT	2	6	2013376	2013381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10165	NC_021040	A	7	7	2013398	2013404	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10166	NC_021040	AAGAA	2	10	2013432	2013441	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
10167	NC_021040	A	6	6	2013463	2013468	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10171	NC_021040	AGA	2	6	2013684	2013689	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10173	NC_021040	TAA	2	6	2013747	2013752	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10186	NC_021040	TA	3	6	2016555	2016560	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10191	NC_021040	CAGG	2	8	2020639	2020646	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10192	NC_021040	CTGAA	2	10	2020653	2020662	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
10193	NC_021040	GTG	2	6	2020679	2020684	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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10196	NC_021040	TGAT	2	8	2020864	2020871	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10197	NC_021040	GACA	2	8	2020876	2020883	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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10239	NC_021040	CATTT	2	10	2029879	2029888	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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10244	NC_021040	GCA	3	9	2030132	2030140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10247	NC_021040	TG	3	6	2030191	2030196	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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10251	NC_021040	TCTTG	2	10	2030306	2030315	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
10252	NC_021040	TGG	2	6	2030341	2030346	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10253	NC_021040	T	6	6	2030359	2030364	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10254	NC_021040	ATG	2	6	2030386	2030391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10255	NC_021040	ATA	2	6	2030398	2030403	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10256	NC_021040	A	7	7	2030403	2030409	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10257	NC_021040	A	6	6	2030456	2030461	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10258	NC_021040	TG	3	6	2030544	2030549	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10259	NC_021040	CTG	2	6	2030562	2030567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10260	NC_021040	TTTA	2	8	2030592	2030599	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10262	NC_021040	AGAAA	2	10	2030668	2030677	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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10379	NC_021040	TGT	2	6	2059347	2059352	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10389	NC_021040	A	6	6	2061435	2061440	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10391	NC_021040	AGGAA	2	10	2061487	2061496	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
10392	NC_021040	CAGG	2	8	2062288	2062295	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10393	NC_021040	CTGAA	2	10	2062302	2062311	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
10394	NC_021040	GTG	2	6	2062328	2062333	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10395	NC_021040	AAGAT	2	10	2062586	2062595	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
10396	NC_021040	TG	3	6	2062715	2062720	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10397	NC_021040	ATC	2	6	2062864	2062869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10398	NC_021040	AGTA	2	8	2062895	2062902	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10399	NC_021040	GGA	2	6	2062931	2062936	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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10422	NC_021040	AAGAT	2	10	2071985	2071994	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
10423	NC_021040	AAT	2	6	2073512	2073517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10426	NC_021040	A	6	6	2073682	2073687	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10430	NC_021040	AATA	2	8	2075744	2075751	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10496	NC_021040	ATCAT	2	10	2081617	2081626	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
10497	NC_021040	AAAG	2	8	2081636	2081643	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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